CUTL1 - CUTL1
Cux1 (CUTL1, CDP, CDP / Cux) je homeodoména protein že u lidí je kódován CUX1 gen.[3][4][5][6]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny homeodomén proteinů vázajících DNA. Reguluje genovou expresi, morfogenezi a diferenciaci a hraje také roli v progresi buněčného cyklu, zejména v S-fázi. Bylo popsáno několik alternativně sestřihaných transkriptových variant tohoto genu, ale nebyla stanovena úplná povaha některých z těchto variant a izoforma p200 Cux1 je proteolyticky zpracována na menší aktivní izoformy, jako je p110.[6] Vazba Cux1 DNA je stimulována aktivací PAR2 / F2RL1 receptor spojený s buněčným povrchem spojený s G-proteinem ve fibroblastech a epiteliálních buňkách rakoviny prsu k regulaci Matricová metaloproteináza 10, Interleukin1-alfa, a Cykloxygenáza 2 (COX2) geny.[7]
Role v růstu nádoru
Genetická data od více než 7600 pacientů s rakovinou ukazují, že více než 1% má deaktivovaný CUX1, který souvisí s progresí růstu nádoru. Vědci z Wellcome Trust Sanger Institute uvádí, že mutace CUX1 snižuje inhibiční účinky biologického inhibitoru, PIK3IP1 (protein 1 interagující s fosfoinositid-3-kinázou) vedl k vyšší aktivitě podporující růst enzym, fosfoinositid 3-kináza (PI3K), která vede k progresi nádoru. Přestože je CUX1 mutován nižší rychlostí ve srovnání s jinými známými genovými mutacemi, které způsobují rakovinu, je v této studii zjištěno, že tento deaktivovaný gen je u mnoha typů rakoviny hlavní příčinou onemocnění.[8][9]
CASP
Tne CGen UX1 Astřídavě Snakrájený na plátky Product byl poprvé zaznamenán v roce 1997.[11][A] Gen CUX1 má až 33 exony. CASP mRNA zahrnuje exony 1 až 14 a 25 až 33.[13] Předpokládá se, že lidský protein CASP obsahuje 678 aminokyseliny, z nichž 400 je sdíleno s CUTL1.[11] CASP protein je přibližně 80 kD.[11] Postrádá vazebnou oblast DNA CUTL1,[11][14] ale místo toho obsahuje trans-membránovou doménu, která mu umožňuje vložit se do lipidových dvojvrstev.[14] Byl lokalizován do Golgiho aparát.[14]
Bylo oznámeno, že CASP je součástí komplexu s Golgin 84 že se provazuje COPI vezikuly a je důležitý pro retrográdní dopravu v Golgi a mezi Golgi a endoplazmatické retikulum.[15] Cílení vezikul zahrnuje tethery a SNARE.[15]
Interakce
Bylo prokázáno, že Cux1 (CUTL1, CDP, CDP / Cux) komunikovat s:
Tyto fyzické interakce jsou uvedeny v BioPlex 2.0
Poznámky
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000257923 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Scherer SW, Neufeld EJ, Lievens PM, Orkin SH, Kim J, Tsui LC (květen 1993). "Regionální lokalizace genu pro vytěsnění proteinu CCAAT (CUTL1) na 7q22 analýzou hybridů somatických buněk". Genomika. 15 (3): 695–6. doi:10.1006 / geno.1993.1130. PMID 8468066.
- ^ Glöckner G, Scherer S, Schattevoy R, Boright A, Weber J, Tsui LC, Rosenthal A (prosinec 1998). „Sekvenování dvou oblastí v lidském chromozomu 7q22 ve velkém měřítku: Analýza 650 kb genomové sekvence kolem EPO a CUTL1 loci odhaluje 17 genů“. Genome Res. 8 (10): 1060–73. doi:10.1101 / gr.8.10.1060. PMC 310788. PMID 9799793.
- ^ Oka T, Ungar D, Hughson FM, Krieger M (duben 2004). „Komplexy COG a COPI interagují za účelem kontroly hojnosti ozubených kol, podmnožiny integrovaných membránových proteinů Golgi“. Mol. Biol. Buňka. 15 (5): 2423–35. doi:10,1091 / mbc.E03-09-0699. PMC 404034. PMID 15004235.
- ^ A b "Entrez Gene: CUTL1 cut-like 1, CCAAT vytěsňovací protein (Drosophila)".
- ^ Wilson BJ, Harada R, LeDuy L, Hollenberg MD, Nepveu A (leden 2009). „Transkripční faktor CUX1 je následným efektorem receptoru 2 aktivovaného proteinázou (PAR2)“. J. Biol. Chem. 284 (1): 36–45. doi:10,1074 / jbc.M803808200. PMID 18952606.
- ^ Tisková zpráva (8. prosince 2013). „Gen podporuje jeden ze sta nádorů“. Wellcome Trust Sanger Institute. Citováno 17. prosince 2013.
- ^ Wong CC, Martincorena I, Rust AG a kol. (2013). „Inaktivace mutací CUX1 podporuje tumorigenezi“. Genetika přírody. 46 (1): 33–8. doi:10,1038 / ng.2846. PMC 3874239. PMID 24316979.
- ^ Sohda M, Misumi Y, Yamamoto A, Nakamura N, Ogata S, Sakisaka S, Hirose S, Ikehara Y, Oda K (2010). „Interakce Golgin-84 s komplexem COG zprostředkovává retrográdní transport uvnitř Golgiho“. Provoz. 11 (12): 1552–66. doi:10.1111 / j.1600-0854.2010.01123.x. PMID 20874812. S2CID 20424336.
- ^ A b C d Lievens PM, Tufarelli C, Donady JJ, Stagg A, Neufeld EJ (1997). „CASP, nový, vysoce konzervovaný alternativní produkt sestřihu genu CDP / cut / cux, postrádá doménu vázající se na repetici a homeo DNA a interaguje s CDP plné délky in vitro.“ Gen. 197 (1–2): 73–81. doi:10.1016 / s0378-1119 (97) 00243-6. PMID 9332351.
- ^ Mansour M, Lee SY, Pohajdak B (2002). „N-koncová navinutá cívková doména rodiny cytohesin / ARNO guaninových nukleotidových výměnných faktorů interaguje s lešenovým proteinem CASP“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (35): 32302–9. doi:10,1074 / jbc.M202898200. PMID 12052827.
- ^ Ramdzan ZM, Nepveu A (2014). „CUX1, nadměrně exprimovaný gen potlačující nádory nadměrně exprimovaný u pokročilých druhů rakoviny“. Nature Reviews Cancer. 14 (10): 673–82. doi:10.1038 / nrc3805. PMID 25190083. S2CID 20468440.
- ^ A b C Gillingham AK, Pfeifer AC, Munro S (2002). „CASP, alternativně sestříhaný produkt genu kódujícího transkripční faktor proteinu vytěsňujícího CCAAT, je Golgiho membránový protein příbuzný gigantinu“. Molekulární biologie buňky. 13 (11): 3761–74. doi:10,1091 / mbc.E02-06-0349. PMC 133590. PMID 12429822.
- ^ A b Malsam J, Satoh A, Pelletier L, Warren G (2005). "Golginovy postroje definují subpopulace vezikul COPI". Věda. 307 (5712): 1095–8. doi:10.1126 / science.1108061. PMID 15718469. S2CID 12601850.
- ^ Li S, Aufiero B, Schiltz RL, Walsh MJ (červen 2000). „Regulace funkce vytěsnění / štěpení funkce homeodomény CCAAT proteinem pomocí faktorů asociovaných s histon acetyltransferázami p300 / CREB-vazebný protein (CBP) a CBP. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (13): 7166–71. doi:10.1073 / pnas.130028697. PMC 16517. PMID 10852958.
- ^ Gupta S, Luong MX, Bleuming SA, Miele A, Luong M, Young D, Knudsen ES, Van Wijnen AJ, Stein JL, Stein GS (září 2003). „Nádorový supresor pRB funguje jako ko-represor CCAAT vytěsňovacího proteinu (CDP / cut) k regulaci transkripce histonu H4 řízené buněčným cyklem“. J. Cell. Physiol. 196 (3): 541–56. doi:10,1002 / jcp.10335. PMID 12891711. S2CID 2287673.
- ^ Liu J, Barnett A, Neufeld EJ, Dudley JP (červenec 1999). „Homeoproteiny CDP a SATB1 interagují: potenciál pro tkáňově specifickou regulaci“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 4918–26. doi:10,1128 / mcb.19.7.4918. PMC 84297. PMID 10373541.
Další čtení
- Ottolenghi S, Mantovani R, Nicolis S, Ronchi A, Giglioni B (1990). "Sekvence DNA regulující transkripci genů lidského globinu v nedestruktivní dědičné perzistenci fetálního hemoglobinu". Hemoglobin. 13 (6): 523–41. doi:10.3109/03630268908993104. PMID 2481658.
- Nepveu A (2001). „Role multifunkčního transkripčního faktoru homeodomény CDP / Cut / Cux při regulaci diferenciace, buněčného růstu a vývoje“. Gen. 270 (1–2): 1–15. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00485-1. PMID 11403998.
- Neufeld EJ, Skalnik DG, Lievens PM, Orkin SH (1993). „Lidský vytěsňovací protein CCAAT je homologní s homeoproteinem Drosophila, štěpeno“. Nat. Genet. 1 (1): 50–5. doi:10.1038 / ng0492-50. PMID 1301999. S2CID 37107643.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Černousov MA, Stahl RC, Carey DJ (1996). „Schwannovy buňky vylučují nový adhezivní protein podobný kolagenu, který váže N-syndekan“. J. Biol. Chem. 271 (23): 13844–53. doi:10.1074 / jbc.271.23.13844. PMID 8662884.
- Lievens PM, Tufarelli C, Donady JJ, Stagg A, Neufeld EJ (1997). „CASP, nový, vysoce konzervovaný alternativní produkt sestřihu genu CDP / cut / cux, postrádá doménu vázající se na repetici a homeo DNA a interaguje s CDP plné délky in vitro.“ Gen. 197 (1–2): 73–81. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00243-6. PMID 9332351.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Chattopadhyay S, Whitehurst CE, Chen J (1998). „Oblast připojení nukleární matrice proti proudu od zesilovače genu beta receptoru T buněk váže Cux / CDP a SATB1 a moduluje expresi reportérového genu závislou na zesilovači, ale nikoli expresi endogenního genu“. J. Biol. Chem. 273 (45): 29838–46. doi:10.1074 / jbc.273.45.29838. PMID 9792700.
- Liu J, Barnett A, Neufeld EJ, Dudley JP (1999). „Interakce homeoproteinů CDP a SATB1: Potenciál regulace specifické pro tkáně“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 4918–26. doi:10,1128 / mcb.19.7.4918. PMC 84297. PMID 10373541.
- Rong Zeng W, Soucie E, Sung Moon N, Martin-Soudant N, Bérubé G, Leduy L, Nepveu A (2000). "Struktura exon / intron a alternativní transkripty genu CUTL1". Gen. 241 (1): 75–85. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00465-5. PMID 10607901.
- Martin-Soudant N, Drachman JG, Kaushansky K, Nepveu A (2000). „Vazebná aktivita CDP / Cut DNA je down-modulována v granulocytech, makrofágech a erytrocytech, ale zůstává zvýšená v diferenciaci megakaryocytů“. Leukémie. 14 (5): 863–73. doi:10.1038 / sj.leu.2401764. PMID 10803519.
- Li S, Aufiero B, Schiltz RL, Walsh MJ (2000). „Regulace funkce vytěsnění / rozštěpení funkce homeodomény CCAAT proteinem pomocí histon-acetyltransferáz s faktorem asociovaným s proteinem vázajícím se na p300 / CREB (CBP) a CBP“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (13): 7166–71. doi:10.1073 / pnas.130028697. PMC 16517. PMID 10852958.
- Nirodi C, Hart J, Dhawan P, Moon NS, Nepveu A, Richmond A (2001). „Role CDP při negativní regulaci genové exprese CXCL1“. J. Biol. Chem. 276 (28): 26122–31. doi:10,1074 / jbc.M102872200. PMC 2665279. PMID 11371564.
- Moon NS, Premdas P, Truscott M, Leduy L, Bérubé G, Nepveu A (2001). „Pro aktivaci stabilního vázání DNA pomocí proteinu homeodomény CDP / Cut je nutné proteolytické štěpení fází S“. Mol. Buňka. Biol. 21 (18): 6332–45. doi:10.1128 / MCB.21.18.6332-6345.2001. PMC 87367. PMID 11509674.
- Santaguida M, Ding Q, Bérubé G, Truscott M, Whyte P, Nepveu A (2002). "Fosforylace CCAAT vytěsňovacího proteinu (CDP) / Cux transkripčního faktoru cyklinem A-Cdk1 moduluje jeho DNA vazebnou aktivitu v G (2)". J. Biol. Chem. 276 (49): 45780–90. doi:10,1074 / jbc.M107978200. PMID 11584018.
- Dintilhac A, Bernués J (2002). „HMGB1 interaguje s mnoha zjevně nesouvisejícími proteiny rozpoznáním krátkých aminokyselinových sekvencí“ (PDF). J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. doi:10,1074 / jbc.M108417200. PMID 11748221. S2CID 39560486.
externí odkazy
- CUTL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
- Člověk CUX1 umístění genomu a CUX1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.