MTA2 - MTA2
Protein MTA2 spojený s metastázami je protein že u lidí je kódován MTA2 gen.[5][6]
MTA2 je druhým členem rodiny genů MTA.[5][7][8] Protein MTA2 se lokalizuje v jádru a je součástí remodelace nukleosomu a deacetylačního komplexu (NuRD ).[8] Podobně jako zakládající člen rodiny MTA1, MTA2 funguje jako faktor remodelace chromatinu a reguluje genovou expresi.[9][10] MTA2 je nadměrně exprimován u lidské rakoviny a jeho dysregulovaná hladina dobře koreluje s invazivitou rakoviny a agresivními fenotypy.[11]
Objev
MTA2 byl původně rozpoznán jako gen MTA1 jako 1, pojmenovaný MTA1-L1, z rozsáhlého sekvenování náhodně vybraných klonů z člověka cDNA knihovny v roce 1999.[5] Náznaky o roli MTA2 v genové expresi pocházejí z asociace MTA2 polypeptidů v komplexu NuRD v proteomické studii[7] Následovalo cílené klonování myší Mta2 v roce 2001.[12]
Genové a sestříhané varianty
MTA2 je lokalizován na chromozomu 11q12-q13.1 u člověka a na 19B u myší. 8,6 kb dlouhý lidský gen MTA2 obsahuje 20 exonů a sedm transkriptů včetně tří transkriptů kódujících protein, ale předpokládá se, že kóduje dva polypeptidy o 688 aminokyselinách a 495 aminokyselinách.[13] Zbývající čtyři MTA2 transkripty jsou nekódující RNA transkripty v rozmezí od 532-bp do 627-bp. Myší Mta2 se skládá z 3,1 kb transkriptu kódujícího protein kódujícího protein o 668 aminokyselinách a pěti transkriptů nekódujících RNA v rozsahu od 620 bp do 839 bp.
Struktura
Aminokyselinová sekvence MTA2 sdílí 68,2% homologii s MTA1 Sekvence. MTA2 domény zahrnují, a BAH (Bromo-Adjacent Homology), an ELM2 (homologie egl-27 a MTA1), a SANT doména (SWI, ADA2, N-CoR, TFIIIB-B) a podobné GATA zinkový prst.[14][15][16] MTA2 je acetylován na lysinu 152 v doméně BAH[17]
Funkce
Tento gen kóduje protein, který byl identifikován jako součást NuRD, nukleosom remodelační komplex deacetylázy identifikovaný v jádru lidských buněk. Vykazuje velmi široký vzor exprese a je silně exprimován v mnoha tkáních. Může představovat jednoho člena malé genové rodiny, který kóduje různé, ale příbuzné proteiny, které se přímo nebo nepřímo účastní transkripční regulace. Jejich nepřímé účinky na regulaci transkripce mohou zahrnovat remodelace chromatinu.[6]
MTA2 inhibuje estrogenový receptor -transaktivace funguje a podílí se na vývoji hormonů nezávisle na buňkách rakoviny prsu.[11] MTA2 se účastní cirkadiánního rytmu prostřednictvím komplexu CLOCK-BMAL1. MTA2 inhibuje expresi cílových genů díky své schopnosti interagovat s komplexy remodelace chromatinu a moduluje dráhy podílející se na buněčných funkcích, včetně invaze, apoptózy, přechodu epitelu na mezenchymální buňky a růstu normálních a rakovinných buněk[9][11]
Nařízení
Exprese MTA2 je stimulována Transkripční faktor Sp1 [12][18] a potlačen Kaiso.[19] Růstová regulační aktivita MTA2 je modulována jeho acetylací histonacetylázou p300 [12]. Exprese MTA2 je inhibována Rho GDIa v buňkách rakoviny prsu[20] a člověkem β-defensiny v buňkách rakoviny tlustého střeva.[21] MicroRNA-146a a miR-34a také regulují hladiny MTA2 mRNA prostřednictvím post-transkripčního mechanismu.[22][23][24]
Cíle
MTA2 deacetyluje estrogenový receptor alfa a p53 a inhibuje jejich transaktivační funkce.[25][26] MTA2 potlačuje expresi E-kadherinu v nemalobuněčných buňkách rakoviny plic.[27] ale stimuluje výraz IL-11 v buňkách rakoviny žaludku.[28] Komplexní cíle remodelace chromatinu obsahující MTA2 HODINY -BMAL1 komplex.[29]
Interakce
MTA2 bylo prokázáno komunikovat s:
Poznámky
Verze tohoto článku z roku 2016 byla aktualizována externím odborníkem na základě modelu dvojího publikace. Korespondence akademický recenzent článek byl publikován v Gen a lze jej citovat jako: Rakesh Kumar; Rui-An Wang (15. května 2016), „Struktura, exprese a funkce genů MTA“, Gen, 582 (2): 112–21, doi:10.1016 / J.GENE.2016.02.012, ISSN 0378-1119, PMC 4785049, PMID 26869315, Wikidata Q28273245 |
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000149480 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071646 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Futamura M, Nishimori H, Shiratsuchi T, Saji S, Nakamura Y, Tokino T (1999). „Molekulární klonování, mapování a charakterizace nového lidského genu, MTA1-L1, ukazující homologii s genem spojeným s metastázami, MTA1“. Journal of Human Genetics. 44 (1): 52–6. doi:10,1007 / s100380050107. PMID 9929979.
- ^ A b „Entrez Gene: MTA2 metastasis associated 1 family, member 2“.
- ^ A b Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (srpen 1999). „Analýza podjednotek NuRD odhalila jádrový komplex histon-deacetylázy a souvislost s methylací DNA.“. Geny a vývoj. 13 (15): 1924–35. doi:10.1101 / gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
- ^ A b Li DQ, Kumar R (2015). Odhalení složitosti a funkcí MTA Coregulators v rakovině člověka. Pokroky ve výzkumu rakoviny. 127. s. 1–47. doi:10.1016 / bs.acr.2015.04.005. ISBN 9780128029206. PMID 26093897.
- ^ A b Sen N, Gui B, Kumar R (prosinec 2014). "Fyziologické funkce rodiny proteinů MTA". Recenze metastázy rakoviny. 33 (4): 869–77. doi:10.1007 / s10555-014-9514-4. PMC 4245464. PMID 25344801.
- ^ Kumar R (prosinec 2014). „Funkce a klinický význam proteinů MTA u lidské rakoviny. Předmluva“. Recenze metastázy rakoviny. 33 (4): 835. doi:10.1007 / s10555-014-9509-1. PMC 4245326. PMID 25348751.
- ^ A b C Covington KR, Fuqua SA (prosinec 2014). „Role MTA2 u lidské rakoviny“. Recenze metastázy rakoviny. 33 (4): 921–8. doi:10.1007 / s10555-014-9518-0. PMC 4425804. PMID 25394532.
- ^ A b Xia L, Zhang Y (květen 2001). "Transkripční faktory rodiny Sp1 a ETS regulují expresi myšího genu Mta2". Gen. 268 (1–2): 77–85. doi:10.1016 / s0378-1119 (01) 00429-2. PMID 11368903.
- ^ Kumar R, Wang RA (květen 2016). "Struktura, exprese a funkce genů MTA". Gen. 582 (2): 112–21. doi:10.1016 / j.gene.2016.02.02.012. PMC 4785049. PMID 26869315.
- ^ Millard CJ, Watson PJ, Celardo I, Gordiyenko Y, Cowley SM, Robinson CV, Fairall L, Schwabe JW (červenec 2013). „Třídy HDAC sdílejí společný mechanismus regulace inositolfosfáty“. Molekulární buňka. 51 (1): 57–67. doi:10.1016 / j.molcel.2013.05.020. PMC 3710971. PMID 23791785.
- ^ Alqarni SS, Murthy A, Zhang W, Przewloka MR, Silva AP, Watson AA, Lejon S, Pei XY, Smits AH, Kloet SL, Wang H, Shepherd NE, Stokes PH, Blobel GA, Vermeulen M, Glover DM, Mackay JP , Laue ED (srpen 2014). „Pohled do architektury komplexu NuRD: struktura subkomplexu RbAp48-MTA1“. The Journal of Biological Chemistry. 289 (32): 21844–55. doi:10,1074 / jbc.M114,558940. PMC 4139204. PMID 24920672.
- ^ Millard CJ, Fairall L, Schwabe JW (prosinec 2014). „Směrem k pochopení struktury a funkce MTA1“. Recenze metastázy rakoviny. 33 (4): 857–67. doi:10.1007 / s10555-014-9513-5. PMC 4244562. PMID 25352341.
- ^ Zhou J, Zhan S, Tan W, Cheng R, Gong H, Zhu Q (únor 2014). „P300 se váže na acetyláty MTA2 a podporuje růst buněk kolorektálního karcinomu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 444 (3): 387–90. doi:10.1016 / j.bbrc.2014.01.062. PMID 24468085.
- ^ Zhou C, Ji J, Cai Q, Shi M, Chen X, Yu Y, Liu B, Zhu Z, Zhang J (8. září 2013). „MTA2 podporuje invazi rakovinných buněk žaludku a je transkripčně regulován Sp1“. Molekulární rakovina. 12 (1): 102. doi:10.1186/1476-4598-12-102. PMC 3851872. PMID 24010737.
- ^ Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Molekulární buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
- ^ Barone I, Brusco L, Gu G, Selever J, Beyer A, Covington KR, Tsimelzon A, Wang T, Hilsenbeck SG, Chamness GC, Andò S, Fuqua SA (duben 2011). „Ztráta Rho GDIα a rezistence na tamoxifen prostřednictvím účinků na estrogenový receptor α“. Journal of the National Cancer Institute. 103 (7): 538–52. doi:10.1093 / jnci / djr058. PMC 3071355. PMID 21447808.
- ^ Uraki S, Sugimoto K, Shiraki K, Tameda M, Inagaki Y, Ogura S, Kasai C, Nojiri K, Yoneda M, Yamamoto N, Takei Y, Nobori T, Ito M (září 2014). „Lidský β-defensin-3 inhibuje migraci buněk rakoviny tlustého střeva prostřednictvím downregulace 1 rodiny spojené s metastázami, exprese člena 2“. International Journal of Oncology. 45 (3): 1059–64. doi:10.3892 / ijo.2014.2507. PMID 24969834.
- ^ Li Y, Vandenboom TG, Wang Z, Kong D, Ali S, Philip PA, Sarkar FH (únor 2010). „miR-146a potlačuje invazi rakovinných buněk pankreatu“. Výzkum rakoviny. 70 (4): 1486–95. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2792. PMC 2978025. PMID 20124483.
- ^ Kaller M, Liffers ST, Oeljeklaus S, Kuhlmann K, Röh S, Hoffmann R, Warscheid B, Hermeking H (srpen 2011). „Charakterizace změn exprese proteinu a mRNA v celém genomu miR-34a kombinovanou pulzní analýzou SILAC a microarray“. Molekulární a buněčná proteomika. 10 (8): M111.010462. doi:10,1074 / mcp.M111.010462. PMC 3149097. PMID 21566225.
- ^ Zhang Y, Wang XF (prosinec 2014). „Post-transkripční regulace rodiny MTA mikroRNA v kontextu rakoviny“. Recenze metastázy rakoviny. 33 (4): 1011–6. doi:10.1007 / s10555-014-9526-0. PMC 4245459. PMID 25332146.
- ^ Cui Y, Niu A, Pestell R, Kumar R, Curran EM, Liu Y, Fuqua SA (září 2006). „Protein 2 spojený s metastázami je represorem estrogenového receptoru alfa, jehož nadměrná exprese vede k estrogenně nezávislému růstu lidských buněk rakoviny prsu“. Molekulární endokrinologie. 20 (9): 2020–35. doi:10.1210 / me.2005-0063. PMC 4484605. PMID 16645043.
- ^ Luo J, Su F, Chen D, Shiloh A, Gu W (listopad 2000). „Deacetylace p53 moduluje jeho účinek na růst buněk a apoptózu“. Příroda. 408 (6810): 377–81. Bibcode:2000Natur.408..377L. doi:10.1038/35042612. PMID 11099047. S2CID 4300392.
- ^ Lu X, Kovalev GI, Chang H, Kallin E, Knudsen G, Xia L, Mishra N, Ruiz P, Li E, Su L, Zhang Y (květen 2008). „Inaktivace složky NuRD Mta2 způsobuje abnormální aktivaci T buněk a autoimunitní onemocnění podobné lupusu u myší“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (20): 13825–33. doi:10,1074 / jbc.M801275200. PMC 2376246. PMID 18353770.
- ^ Zhou C, Ji J, Cai Q, Shi M, Chen X, Yu Y, Zhu Z, Zhang J (2. května 2015). „MTA2 zvyšuje tvorbu kolonií a růst nádorů buněk rakoviny žaludku prostřednictvím IL-11“. Rakovina BMC. 15: 343. doi:10,1186 / s12885-015-1366-r. PMC 4419442. PMID 25929737.
- ^ Kim JY, Kwak PB, Weitz CJ (prosinec 2014). "Specifičnost zpětné vazby cirkadiánních hodin z cílené rekonstituce NuRD corepressoru". Molekulární buňka. 56 (6): 738–48. doi:10.1016 / j.molcel.2014.10.017. PMID 25453762.
- ^ A b C d E F Yao YL, Yang WM (říjen 2003). „Proteiny spojené s metastázami 1 a 2 tvoří odlišné proteinové komplexy s aktivitou histon-deacetylázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (43): 42560–8. doi:10,1074 / jbc.M302955200. PMID 12920132.
- ^ You A, Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL (únor 2001). „CoREST je nedílnou součástí komplexu CoREST - lidská histon-deacetyláza“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (4): 1454–8. Bibcode:2001PNAS ... 98.1454Y. doi:10.1073 / pnas.98.4.1454. PMC 29278. PMID 11171972.
- ^ A b C d E Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (srpen 1999). „Analýza podjednotek NuRD odhalila jádrový komplex histon-deacetylázy a souvislost s methylací DNA.“. Geny a vývoj. 13 (15): 1924–35. doi:10.1101 / gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.
- ^ A b Yasui D, Miyano M, Cai S, Varga-Weisz P, Kohwi-Shigematsu T (říjen 2002). „SATB1 cílí na remodelaci chromatinu, aby reguloval geny na velké vzdálenosti“. Příroda. 419 (6907): 641–5. Bibcode:2002 Natur.419..641Y. doi:10.1038 / nature01084. PMID 12374985. S2CID 25822700.
- ^ Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.
- ^ Sakai H, Urano T, Ookata K, Kim MH, Hirai Y, Saito M, Nojima Y, Ishikawa F (prosinec 2002). „MBD3 a HDAC1, dvě složky komplexu NuRD, jsou lokalizovány v centrosomech pozitivních na Aurora-A v M fázi“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (50): 48714–23. doi:10,1074 / jbc.M208461200. PMID 12354758.
- ^ Saito M, Ishikawa F (září 2002). „Doména vázající mCpG lidského MBD3 se neváže na mCpG, ale interaguje se složkami NuRD / Mi2 HDAC1 a MTA2“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (38): 35434–9. doi:10,1074 / jbc.M203455200. PMID 12124384.
externí odkazy
- MTA2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.