ZNF300 - ZNF300

ZNF300
Identifikátory
Aliasy	ZNF300, protein zinkového prstu 300
Externí ID	OMIM: 612429 HomoloGene: 56531 Genové karty: ZNF300
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	150,904,983 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• intracelulární; • buněčné jádro; • jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	91975
	n / a
	ENSG00000145908
	n / a
	Q96RE9
	n / a
	NM_001172831; NM_001172832; NM_052860
	n / a
	NP_001166302; NP_001166303; NP_443092
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Protein se zinkovým prstem 300 je protein že u lidí je kódován ZNF300 gen.^[3]^[4] Protein kódovaný tímto genem je typu C2H2 zinkový prst DNA vázající protein a pravděpodobně transkripční faktor.

Je to antisense vůči lidskému genu, C16orf71, což naznačuje možnost regulovaného alternativního výrazu.^[5]

Klinický význam

Je spojena s Crohnovou chorobou.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145908 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gou D, Wang J, Gao L, Sun Y, Peng X, Huang J, Li W (leden 2004). "Identifikace a funkční analýza nového lidského genu ZNF300 pro lidský KRAB / C2H2 se zinkovým prstem". Biochim. Biophys. Acta. 1676 (2): 203–9. doi:10.1016 / j.bbaexp.2003.11.011. PMID 14746915.
^ "Entrez Gene: protein se zinkovým prstem 300".
^ [email protected], Danielle Thierry-Mieg a Jean Thierry-Mieg, NCBI / NLM / NIH. „AceView: Gene: C16orf71, komplexní anotace genů člověka, myši a červů s mRNA nebo ESTsAceView“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2017-05-20.
^ Prescott NJ, Dominy KM, Kubo M, Lewis CM, Fisher SA, Redon R, Huang N, Stranger BE, Blaszczyk K, Hudspith B, Parkes G, Hosono N, Yamazaki K, Onnie CM, Forbes A, Dermitzakis ET, Nakamura Y , Mansfield JC, Sanderson J, Hurles ME, Roberts RG, Mathew CG (květen 2010). „Nezávislá a populačně specifická asociace rizikových variant v lokusu IRGM s Crohnovou chorobou“ (PDF). Hučení. Mol. Genet. 19 (9): 1828–39. doi:10,1093 / hmg / ddq041. PMC 2850616. PMID 20106866.

Další čtení

Feng T, Zhu X (2010). „Prohledávání vzácných genetických variant v datech WTCCC v celém genomu“. Hučení. Genet. 128 (3): 269–80. doi:10.1007 / s00439-010-0849-9. PMC 2922446. PMID 20549515.
Qiu H, Xue L, Gao L a kol. (2008). "Identifikace prvku vázajícího DNA lidského proteinu ZNF300". Buňka. Mol. Biol. Lett. 13 (3): 391–403. doi:10.2478 / s11658-008-0005-x. PMC 6275660. PMID 18350257.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Xu JH, Wang T, Wang XG a kol. (2010). „PU.1 může regulovat promotor ZNF300 v promyelocytech HL-60 odvozených od APL“. Leuku. Res. 34 (12): 1636–46. doi:10.1016 / j.leukres.2010.04.009. PMID 20471086.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Xue L, Qiu H, Ma J a kol. (2010). „ZNF300, nedávno identifikovaný lidský transkripční faktor, aktivuje lidský promotor IL-2RÎ2 přes překrývající se vazebné místo ZNF300 / EGR1“. Buňka. Mol. Biol. Lett. 15 (4): 530–40. doi:10.2478 / s11658-010-0025-1. PMC 6275642. PMID 20585888.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2005). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cao Y, Li JX, Ji CN a kol. (2007). "Molekulární klonování a charakterizace nové sestřihové varianty humánního genu ZNF300, která se vysoce exprimuje ve varlatech". DNA sekv. 18 (4): 312–5. doi:10.1080/10425170701243393. PMID 17541838. S2CID 12932222.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Wellcome Trust Case Control Consortium; Clayton, David G .; Cardon, Lon R .; Craddock, Nick; Deloukas, Panos; Duncanson, Audrey; Kwiatkowski, Dominic P .; McCarthy, Mark I .; Ouwehand, Willem H .; Samani, Nilesh J .; Todd, John A .; Donnelly, Peter; Barrett, Jeffrey C .; Burton, Paul R .; Davison, Dan; Donnelly, Peter; Easton, Doug; Evans, David; Leung, Hin-Tak; Marchini, Jonathan L .; Morris, Andrew P .; Spencer, Chris C. A .; Tobin, Martin D .; Cardon, Lon R .; Clayton, David G .; Attwood, Antony P .; Boorman, James P .; Cant, Barbara; Everson, Ursula; et al. (2007). „Celomanomová asociační studie 14 000 případů sedmi běžných onemocnění a 3 000 sdílených kontrol“. Příroda. 447 (7145): 661–78. Bibcode:2007 Natur.447..661B. doi:10.1038 / nature05911. PMC 2719288. PMID 17554300.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145908 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid14746915-3] Gou D, Wang J, Gao L, Sun Y, Peng X, Huang J, Li W (leden 2004). "Identifikace a funkční analýza nového lidského genu ZNF300 pro lidský KRAB / C2H2 se zinkovým prstem". Biochim. Biophys. Acta. 1676 (2): 203–9. doi:10.1016 / j.bbaexp.2003.11.011. PMID 14746915.

[entrez-4] "Entrez Gene: protein se zinkovým prstem 300".

[5] [email protected], Danielle Thierry-Mieg a Jean Thierry-Mieg, NCBI / NLM / NIH. „AceView: Gene: C16orf71, komplexní anotace genů člověka, myši a červů s mRNA nebo ESTsAceView“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2017-05-20.

[pmid20106866-6] Prescott NJ, Dominy KM, Kubo M, Lewis CM, Fisher SA, Redon R, Huang N, Stranger BE, Blaszczyk K, Hudspith B, Parkes G, Hosono N, Yamazaki K, Onnie CM, Forbes A, Dermitzakis ET, Nakamura Y , Mansfield JC, Sanderson J, Hurles ME, Roberts RG, Mathew CG (květen 2010). „Nezávislá a populačně specifická asociace rizikových variant v lokusu IRGM s Crohnovou chorobou“ (PDF). Hučení. Mol. Genet. 19 (9): 1828–39. doi:10,1093 / hmg / ddq041. PMC 2850616. PMID 20106866.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]