ASCL1 - ASCL1

ASCL1
Identifikátory
Aliasy	ASCL1, ASH1, HASH1, MASH1, bHLHa46, rodina achaete-scute bHLH transkripční faktor 1
Externí ID	OMIM: 100790 MGI: 96919 HomoloGene: 31234 Genové karty: ASCL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	102,960,513 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	87,493,660 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba chromatinu; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru bHLH; • Vazba e-boxu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • dvouřetězcová vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba transkripčního faktoru;
Buněčná složka	• tělo neuronových buněk; • buněčné jádro; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• Signální dráha zářezu; • závazek neuronové buňky ke specifickému typu neuronu v předním mozku; • vývoj sympatického ganglia; • proces specifikace vzoru; • vývoj noradrenergních neuronů; • mozková kůra GABAergní diferenciace interneuronů; • neurogeneze; • diferenciace buněk; • diferenciace neuroendokrinních buněk žaludku; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace neuronové diferenciace; • reakce na kyselinu retinovou; • asociace míchy neuronová diferenciace; • vývoj sympatického nervového systému; • stanovení osudu neuroblastů; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • specifikace osudu buněk oligodendrocytů míchy; • pohybový aparát, míšní reflexní akce; • negativní regulace apoptotického procesu; • migrace neuronů; • diferenciace gliových buněk; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • zrání buněk; • buněčná reakce na magnetismus; • diferenciace oligodendrocytů; • vývoj čichové jámy; • transkripce, chráněná DNA; • diferenciace plicních neuroendokrinních buněk; • vývoj nervového systému; • generace neuronů; • reakce na lithiový iont; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace proliferace nervových prekurzorů; • diferenciace chromafinových buněk nadledvin; • pozitivní regulace neurogeneze; • pozitivní regulace neuronového apoptotického procesu; • ventrální mícha interneuron osud závazek; • vývoj neuronů centrálního nervového systému; • pozitivní regulace buněčného cyklu; • reakce na epidermální růstový faktor; • regulace buněčné proliferace; • vývoj vestibulárního jádra; • pozitivní regulace neuronové diferenciace; • regulace mitotického buněčného cyklu; • diferenciace neuronů předního mozku; • vývoj mozkové kůry; • regulace genové exprese; • proliferace neuroblastů; • subpallium neuron osud závazek; • regulace načasování diferenciace neuronů subpallia; • vývoj oligodendrocytů; • diferenciace buněk plicního epitelu; • diferenciace buněk glomus karotického těla; • reakce na kyselinu listovou; • diferenciace buněk oligodendrocytů míchy; • regulace diferenciace epiteliálních buněk; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • závazek osudu noradrenergních neuronů; • regulace signalizační dráhy Notch; • regulace neurogeneze; • pozitivní regulace signální dráhy Notch; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • závazek osudu oligodendrocytových buněk; • neuronová diferenciace; • neuronový osudový závazek; • specifikace neuronového osudu; • vývoj neuronů; • vývoj srdce; • vývoj smyslových orgánů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	429
	17172
	ENSG00000139352
	ENSMUSG00000020052
	P50553
	Q02067
	NM_004316
	NM_008553
	NP_004307
	NP_032579
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog Achaete-scute 1 je protein že u lidí je kódován ASCL1 gen.^[5]^[6] Protože to bylo objeveno po studiích na jeho homologu v Drosophila, Achaete-scute komplex, původně byl pojmenován MASH-1 pro savčí achátový scute homolog-1.^[7]

Funkce

Tento gen zakóduje člena souboru základní šroubovice-smyčka-šroubovice (BHLH) rodina transkripčních faktorů. Protein aktivuje transkripci vazbou na E box (5'-CANNTG-3 '). Dimerizace s jinými proteiny BHLH je pro účinnost vyžadován DNA vazba. Tento protein hraje roli v neuronálním závazku a diferenciaci a při generování čichového a autonomního neurony. To je vysoce vyjádřeno v medulární rakovina štítné žlázy a malobuněčný karcinom plic a může být užitečným markerem pro tyto druhy rakoviny. Přítomnost CAG repetice v genu naznačuje, že může také hrát roli při tvorbě nádoru.^[6]

Role v neuronálním závazku

Vývoj nervového systému obratlovců začíná, když neurální trubice formy na počátku embryo. Nervová trubice nakonec vede k celku nervový systém, ale nejdřív neuroblasty se musí odlišovat od neuroepitel trubice. Neuroblasty jsou buňky, které procházejí mitotické dělení a vyrábět neurony.^[7] Asc je ústřední pro diferenciaci neuroblastů a boční inhibice mechanismus, který ze své podstaty vytváří záchrannou síť pro případ poškození nebo smrti v těchto neuvěřitelně důležitých buňkách.^[7]

Diferenciace neuroblastů začíná, když buňky neurální trubice exprimují Asc a tím upregulují expresi Delta, protein nezbytný pro laterální inhibiční dráhu neuronového závazku.^[7] Delta může difundovat do sousedních buněk a vázat se na Receptor zářezu, velký transmembránový protein, který po aktivaci prochází proteolytické štěpení k uvolnění intracelulární domény (Notch-ICD).^[7] Notch-ICD pak může volně cestovat do jádra a tvořit komplex s Suppressorem z Bez srsti (SuH) a Duchovní otec.^[7] Tento komplex funguje jako regulátor transkripce Asc a splní dva důležité úkoly. Za prvé, brání expresi faktorů potřebných pro diferenciaci buňky na neuroblast.^[7] Za druhé, inhibuje produkci delty sousední buňky.^[7] Budoucím neuroblastem tedy bude buňka, která má největší aktivaci Asc v blízkém okolí a následně největší produkci Delta, která bude inhibovat diferenciaci sousedních buněk. Vybraná skupina neuroblastů, které se pak diferencují v neurální trubici, je tedy vyměnitelná, protože schopnost neuroblastů potlačovat diferenciaci sousedních buněk závisí na jeho vlastní schopnosti produkovat Asc.^[7]Tento proces diferenciace neuroblastů pomocí Asc je společný pro všechna zvířata.^[7] Ačkoli tento mechanismus byl původně studován u Drosophila, byly nalezeny homology ke všem proteinům v dráze u obratlovců, kteří mají stejné bHLH struktura.^[7]

Vývoj autonomního nervového systému

Kromě své důležité role při tvorbě neuroblastů funguje Asc také jako zprostředkovatel autonomní nervový systém (ANS) formace.^[8] Asc bylo původně podezřelé, že hraje roli v ANS, když byl nalezen ASCL1 exprimovaný v buňkách obklopujících hřbet aorta, nadledviny a ve vývoji sympatický řetězec během určité fáze vývoje.^[8] Následné studie myší geneticky pozměněných na nedostatek MASH-1 odhalily defektní vývoj sympatiku i parasympatiku ganglia, dvě složky ANS.^[8]

Interakce

ASCL1 bylo prokázáno komunikovat s Faktor 2A specifický pro myocyty.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139352 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020052 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ball DW, Azzoli CG, Baylin SB, Chi D, Dou S, Donis-Keller H a kol. (Červen 1993). "Identifikace lidského achaete-scute homologu vysoce exprimovaného v neuroendokrinních nádorech". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (12): 5648–52. Bibcode:1993PNAS ... 90.5648B. doi:10.1073 / pnas.90.12.5648. PMC 46778. PMID 8390674.
^ ^A ^b "Entrez Gene: ASCL1 achaete-scute komplexní homolog 1 (Drosophila)".
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k Sanes DH (2011). Vývoj nervového systému. Elsevier. ISBN 978-0-12-374539-2.
^ ^A ^b ^C Axelson H (únor 2004). „Signální kaskáda Notch v neuroblastomu: role základních proteinů helix-loop-helix HASH-1 a HES-1“. Dopisy o rakovině. 204 (2): 171–8. doi:10.1016 / s0304-3835 (03) 00453-1. PMID 15013216.
^ Mao Z, Nadal-Ginard B (červen 1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.

Další čtení

Chen H, Kunnimalaiyaan M, Van Gompel JJ (červen 2005). "Medulární rakovina štítné žlázy: funkce raf-1 a humánního achaete-scute homologu-1". Štítná žláza. 15 (6): 511–21. doi:10.1089 / tv. 2005.15.511. PMID 16029117.
Renault B, Lieman J, Ward D, Krauter K, Kucherlapati R (listopad 1995). „Lokalizace lidského genu achaete-scute homologu (ASCL1) distálně od fenylalaninhydroxylázy (PAH) a proximálně k antigenu odmítnutí tumoru (TRA1) na chromozomu 12q22-q23“. Genomika. 30 (1): 81–3. doi:10.1006 / geno.1995.0012. PMID 8595908.
Mao Z, Nadal-Ginard B (červen 1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.
Borges M, Linnoila RI, van de Velde HJ, Chen H, Nelkin BD, Mabry M a kol. (Duben 1997). „Homolog achátového scutu nezbytný pro neuroendokrinní diferenciaci v plicích“. Příroda. 386 (6627): 852–5. Bibcode:1997 Natur.386..852B. doi:10.1038 / 386852a0. PMID 9126746. S2CID 4336900.
Chen H, Biel MA, Borges MW, Thiagalingam A, Nelkin BD, Baylin SB, Ball DW (červen 1997). "Tkáňově specifická exprese humánního achaete-scute homologu-1 v neuroendokrinních nádorech: transkripční regulace duálními inhibičními oblastmi". Růst a diferenciace buněk. 8 (6): 677–86. PMID 9186001.
Lo L, Sommer L, Anderson DJ (červen 1997). „MASH1 udržuje kompetence pro diferenciaci neuronů indukovanou BMP2 v post-migračních buňkách neurálního lišty“. Aktuální biologie. 7 (6): 440–50. doi:10.1016 / S0960-9822 (06) 00191-6. PMID 9197246. S2CID 15594664.
Rozovskaia T, Rozenblatt-Rosen O, Sedkov Y, Burakov D, Yano T, Nakamura T a kol. (Leden 2000). „Vlastní asociace domén SET lidského ALL-1 a proteinů Drosophila TRITHORAX a ASH1“. Onkogen. 19 (3): 351–7. doi:10.1038 / sj.onc.1203307. PMID 10656681. S2CID 43415797.
Persson P, Jögi A, Grynfeld A, Påhlman S, Axelson H (červenec 2000). „HASH-1 a E2-2 jsou exprimovány v buňkách lidského neuroblastomu a tvoří funkční komplex“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 274 (1): 22–31. doi:10,1006 / bbrc.2000.3090. PMID 10903890.
Long RM, Gu W, Meng X, Gonsalvez G, Singer RH, Chartrand P (duben 2001). „Exkluzivně protein vázající nukleovou RNA ovlivňuje asymetrickou lokalizaci ASH1 mRNA a Ash1p v kvasinkách“. The Journal of Cell Biology. 153 (2): 307–18. doi:10.1083 / jcb.153.2.307. PMC 2169461. PMID 11309412.
Parras CM, Schuurmans C, Scardigli R, Kim J, Anderson DJ, Guillemot F (únor 2002). „Divergentní funkce náchylných genů Mash1 a Ngn2 ve specifikaci identity neuronového podtypu“. Geny a vývoj. 16 (3): 324–38. doi:10,1101 / gad. 940902. PMC 155336. PMID 11825874.
Sriuranpong V, Borges MW, Strock CL, Nakakura EK, Watkins DN, Blaumueller CM a kol. (Květen 2002). „Signalizace zářezem indukuje rychlou degradaci homologu achaete-scute 1“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (9): 3129–39. doi:10.1128 / MCB.22.9.3129-3139.2002. PMC 133746. PMID 11940670.
Westerman BA, Neijenhuis S, Poutsma A, Steenbergen RD, Breuer RH, Egging M, et al. (Duben 2002). „Kvantitativní měření reverzní transkripční-polymerázové řetězové reakce HASH1 (ASCL1), markeru pro malobuněčné plicní karcinomy s neuroendokrinními rysy“. Klinický výzkum rakoviny. 8 (4): 1082–6. PMID 11948117.
Letinic K, Zoncu R, Rakic P (červen 2002). "Původ GABAergních neuronů v lidském neokortexu". Příroda. 417 (6889): 645–9. Bibcode:2002 Natur.417..645L. doi:10.1038 / nature00779. PMID 12050665. S2CID 4349070.
de Pontual L, Népote V, Attié-Bitach T, Al Halabiah H, Trang H, Elghouzzi V a kol. (Prosinec 2003). „Noradrenergní vývoj neuronů je narušen mutací náchylného genu HASH-1 u vrozeného syndromu centrální hypoventilace (Ondinova kletba)“. Lidská molekulární genetika. 12 (23): 3173–80. doi:10,1093 / hmg / ddg339. PMID 14532329.
Sippel RS, Carpenter JE, Kunnimalaiyaan M, Chen H (prosinec 2003). "Role lidského achaete-scute homologu-1 v dřeňových buňkách rakoviny štítné žlázy". Chirurgická operace. 134 (6): 866–71, diskuse 871-3. doi:10.1016 / s0039-6060 (03) 00418-5. PMID 14668716.
Ferretti E, Di Stefano D, Zazzeroni F, Gallo R, Fratticci A, Carfagnini R a kol. (Říjen 2003). „Lidské nádory hypofýzy exprimují transkripční faktory bHLH NeuroD1 a ASH1“. Journal of Endocrinological Investigation. 26 (10): 957–65. doi:10.1007 / bf03348192. PMID 14759067. S2CID 7358739.
Mhawech P, Berczy M, Assaly M, Herrmann F, Bouzourene H, Allal AS a kol. (Červenec 2004). „Hladina mRNA lidského achaete-scute homologu (hASH1) jako diagnostického markeru pro rozlišení esthezeeuroblastomu od špatně diferencovaných nádorů vznikajících v sinonasálním traktu“. American Journal of Clinical Pathology. 122 (1): 100–5. doi:10.1309 / QD0K-9Q1J-BH6B-5GQQ. PMID 15272537.

externí odkazy

ASCL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ASCL1 umístění genomu a ASCL1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139352 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020052 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8390674-5] Ball DW, Azzoli CG, Baylin SB, Chi D, Dou S, Donis-Keller H a kol. (Červen 1993). "Identifikace lidského achaete-scute homologu vysoce exprimovaného v neuroendokrinních nádorech". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (12): 5648–52. Bibcode:1993PNAS ... 90.5648B. doi:10.1073 / pnas.90.12.5648. PMC 46778. PMID 8390674.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: ASCL1 achaete-scute komplexní homolog 1 (Drosophila)".

[Sanes-7] A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k Sanes DH (2011). Vývoj nervového systému. Elsevier. ISBN 978-0-12-374539-2.

[Axelson-8] A ^b ^C Axelson H (únor 2004). „Signální kaskáda Notch v neuroblastomu: role základních proteinů helix-loop-helix HASH-1 a HES-1“. Dopisy o rakovině. 204 (2): 171–8. doi:10.1016 / s0304-3835 (03) 00453-1. PMID 15013216.

[pmid8662987-9] Mao Z, Nadal-Ginard B (červen 1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Regulome
Inhibuje	Zářez