ZNF238 - ZNF238 - Wikipedia

ZBTB18
Identifikátory
Aliasy	ZBTB18, C2H2-171, MRD22, RP58, TAZ-1, ZNF238, zinkový prst a doména BTB obsahující 18
Externí ID	OMIM: 608433 MGI: 1353609 HomoloGene: 21276 Genové karty: ZBTB18
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	244,057,476 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	177,450,764 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleární chromozom; • buněčné jádro;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj tkáně kosterního svalstva; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10472
	30928
	ENSG00000179456
	ENSMUSG00000063659
	Q99592
	Q9WUK6
	NM_001278196; NM_006352; NM_205768
NM_001012330; NM_013915; NM_001355098; NM_001355099; NM_001355100;
	NM_001355101; NM_001355102; NM_001355103
	NP_001265125; NP_006343; NP_991331
NP_001012330; NP_038943; NP_001342027; NP_001342028; NP_001342029;
	NP_001342030; NP_001342031; NP_001342032
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem 238 (také známý jako RP58 nebo ZBTB18) je a zinkový prst obsahující transkripční faktor že u lidí je kódován ZNF238 gen.^[5]^[6]

Funkce

ZNF238 je gen, který hraje hlavní roli v „podpoře uspořádaného a správně načasovaného neurogeneze vedoucí ke správné tvorbě vrstvy a kortikální růst."^[7] Bylo pozorováno, že způsobuje ztrátu ZNF238 mikrocefalie, ageneze corpus callosum, malformace vrstev v mozková kůra, a hypoplázie mozečku.^[7] Jeho nepřítomnost může navíc způsobit pokles Ngn2 a Neurod1 (v progenitorových buňkách a jejich zvýšení v mutantních neuronech), s výsledkem méně progenitorové buňky a nárůst neuronů diferenciace a gliová buňka růst.^[7] ZNF238 také reguluje potlačen geny, ke kterým může dojít, pokud nebudou zaškrtnuty gliom postup. Kromě toho absence ZNF238 vede k upregulaci epiteliálně-mezenchymální přechod proces.

v nádory jako meduloblastomy ztráta ZNF238 může dezorganizovat buněčné dělící procesy nádoru, což má za následek buněčně různorodý novotvar. Bylo pozorováno, že tato nová rozmanitost zvyšuje invazivitu nádoru a vede k proliferaci do více oblastí mozku než před ztrátou ZNF238.

Typ C2H2 bílkoviny zinkového prstu, jako je ZNF238, působí na molekulární úrovni jako transkripční aktivátory nebo represory a jsou zapojeni do chromatin shromáždění.^[8]

Interakce

ZNF238 bylo prokázáno komunikovat s DNMT3A.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179456 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000063659 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Becker KG, Lee IJ, Nagle JW, Canning RD, Gado AM, Torres R, Polymeropoulos MH, Massa PT, Biddison WE, Drew PD (listopad 1997). „C2H2-171: nová lidská cDNA představující vývojově regulovanou POZ doménu / protein zinkových prstů přednostně exprimovaný v mozku“. International Journal of Developmental Neuroscience. 15 (7): 891–9. doi:10.1016 / S0736-5748 (97) 00034-8. PMID 9568537. S2CID 37032889.
^ Aoki K, Ishida R, Kasai M (leden 1997). „Izolace a charakterizace cDNA kódující protein podobný translinům, TRAX“. FEBS Dopisy. 401 (2–3): 109–12. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01444-5. PMID 9013868. S2CID 46704829.
^ ^A ^b ^C Xiang C, Baubet V, Pal S, Holderbaum L, Tatard V, Jiang P a kol. (Duben 2012). „RP58 / ZNF238 přímo moduluje hladiny predoneurogenního genu a je vyžadován pro neuronální diferenciaci a expanzi mozku“. Buněčná smrt a diferenciace. 19 (4): 692–702. doi:10.1038 / cdd.2011.144. PMC 3307985. PMID 22095278.
^ „Entrez Gene: ZNF238 protein se zinkovým prstem 238“.
^ Fuks F, Burgers WA, Godin N, Kasai M, Kouzarides T (květen 2001). „Dnmt3a váže deacetylázy a je rekrutován represorem specifickým pro sekvenci, aby umlčel transkripci“. Časopis EMBO. 20 (10): 2536–44. doi:10.1093 / emboj / 20.10.2536. PMC 125250. PMID 11350943.

Další čtení

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční posouzení diverzity lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“. Příroda (PDF). 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Becker KG, Nagle JW, Canning RD, Biddison WE, Ozato K, Drew PD (duben 1995). „Rychlá izolace a charakterizace 118 nových cDNA se zinkovým prstem typu C2H2 exprimovaných v lidském mozku“. Lidská molekulární genetika. 4 (4): 685–91. doi:10,1093 / hmg / 4,4 685. PMID 7633419.
Aoki K, Meng G, Suzuki K, Takashi T, Kameoka Y, Nakahara K, Ishida R, Kasai M (říjen 1998). „RP58 se asociuje s kondenzovaným chromatinem a zprostředkovává transkripční represi specifickou pro sekvenci“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (41): 26698–704. doi:10.1074 / jbc.273.41.26698. PMID 9756912.
Ahmad KF, Engel CK, Privé GG (říjen 1998). "Krystalová struktura BTB domény z PLZF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (21): 12123–8. Bibcode:1998PNAS ... 9512123F. doi:10.1073 / pnas.95.21.12123. PMC 22795. PMID 9770450.
Meng G, Inazawa J, Ishida R, Tokura K, Nakahara K, Aoki K, Kasai M (leden 2000). "Strukturní analýza genu kódujícího RP58, sekvenčně specifický transrepresor asociovaný s heterochromatinem". Gen. 242 (1–2): 59–64. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00477-1. PMID 10721697.
Fuks F, Burgers WA, Godin N, Kasai M, Kouzarides T (květen 2001). „Dnmt3a váže deacetylázy a je rekrutován represorem specifickým pro sekvenci, aby umlčel transkripci“. Časopis EMBO. 20 (10): 2536–44. doi:10.1093 / emboj / 20.10.2536. PMC 125250. PMID 11350943.

externí odkazy

ZNF238 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179456 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000063659 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9568537-5] Becker KG, Lee IJ, Nagle JW, Canning RD, Gado AM, Torres R, Polymeropoulos MH, Massa PT, Biddison WE, Drew PD (listopad 1997). „C2H2-171: nová lidská cDNA představující vývojově regulovanou POZ doménu / protein zinkových prstů přednostně exprimovaný v mozku“. International Journal of Developmental Neuroscience. 15 (7): 891–9. doi:10.1016 / S0736-5748 (97) 00034-8. PMID 9568537. S2CID 37032889.

[pmid9013868-6] Aoki K, Ishida R, Kasai M (leden 1997). „Izolace a charakterizace cDNA kódující protein podobný translinům, TRAX“. FEBS Dopisy. 401 (2–3): 109–12. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01444-5. PMID 9013868. S2CID 46704829.

[:0-7] A ^b ^C Xiang C, Baubet V, Pal S, Holderbaum L, Tatard V, Jiang P a kol. (Duben 2012). „RP58 / ZNF238 přímo moduluje hladiny predoneurogenního genu a je vyžadován pro neuronální diferenciaci a expanzi mozku“. Buněčná smrt a diferenciace. 19 (4): 692–702. doi:10.1038 / cdd.2011.144. PMC 3307985. PMID 22095278.

[entrez-8] „Entrez Gene: ZNF238 protein se zinkovým prstem 238“.

[pmid11350943-9] Fuks F, Burgers WA, Godin N, Kasai M, Kouzarides T (květen 2001). „Dnmt3a váže deacetylázy a je rekrutován represorem specifickým pro sekvenci, aby umlčel transkripci“. Časopis EMBO. 20 (10): 2536–44. doi:10.1093 / emboj / 20.10.2536. PMC 125250. PMID 11350943.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]