PTCH1 - PTCH1

PTCH1
Identifikátory
Aliasy	PTCH1, BCNS, HPE7, NBCCS, PTC, PTC1, PTCH, PTCH11, oprava 1
Externí ID	OMIM: 601309 MGI: 105373 HomoloGene: 223 Genové karty: PTCH1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	95,517,057 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	63,573,598 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na heparin; • vyhlazená vazba; • vazba na cholesterol; • opravená vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita receptoru ježek; • vazba proteinů z rodiny ježků; • cyklinová vazba; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána endocytických váčků; • dendritický růstový kužel; • Golgiho aparát; • intracelulární membránou vázaná organela; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • membrána; • buněčná membrána; • axonální růstový kužel; • střední část těla; • ciliární membrána; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Caveola; • cilium; • buněčné jádro;
Biologický proces	• proces specifikace vzoru; • vývoj ledvinového systému; • neurální osa specifikace osy; • odpověď na estradiol; • morfogeneze končetin; • negativní regulace vyhlazené signální dráhy; • reakce na organickou cyklickou sloučeninu; • reakce na kyselinu retinovou; • homeostáza glukózy; • vývoj embryonálních orgánů; • buněčná proliferace podílející se na vývoji metanefros; • negativní regulace růstu mnohobuněčných organismů; • zpracování bílkovin; • reakce na mechanický podnět; • morfogeneze srdce; • specifikace osudu epidermálních buněk; • v embryonálním vývoji dělohy; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • morfogeneze zadní končetiny; • negativní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • negativní regulace diferenciace osteoblastů; • diferenciace buněk epitelu mléčné žlázy; • vývoj somitů; • buněčná odpověď na cholesterol; • regulace lokalizace proteinů; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • morfogeneze kanálu mléčné žlázy; • vývoj mléčné žlázy; • vzorování neurální trubice; • regulace vyhlazené signální dráhy; • větvení zapojené do morfogeneze ureterálních pupenů; • uzavření neurální trubice; • vývoj mozku; • proliferace keratinocytů; • negativní regulace buněčného dělení; • vyhlazená signální dráha zapojená do vzorování dorální / ventrální neurální trubice; • regulace buněčné proliferace; • embryonální morfogeneze končetin; • pozitivní regulace odtoku cholesterolu; • regulace mitotického buněčného cyklu; • negativní regulace proliferace epiteliálních buněk; • vývoj epidermis; • morfogeneze zvířecích orgánů; • buněčná diferenciace podílející se na vývoji ledvin; • stanovení osudu buňky; • reakce na chlorečnan; • regulace růstu; • vyhlazená signální dráha; • vzorování hřbetní / ventrální neurální trubice; • diferenciace motorických neuronů míchy; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace diferenciace buněk epidermis; • tvorba hřbetní / břišní struktury; • tvorba neurální trubice; • reakce na drogu; • signální transdukce; • negativní regulace buněčné proliferace; • vývoj hltanového systému; • vývoj prostaty; • komisurální neuronové vedení axonu; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • regenerace jater;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5727
	19206
	ENSG00000185920
	ENSMUSG00000021466
	Q13635
	Q61115
NM_000264; NM_001083602; NM_001083603; NM_001083604; NM_001083605;
	NM_001083606; NM_001083607; NM_001354918; NM_001354919
	NM_008957; NM_001328514
NP_000255; NP_001077071; NP_001077072; NP_001077073; NP_001077074;
	NP_001077075; NP_001077076; NP_001341847; NP_001341848
	NP_001315443; NP_032983
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homolog s patchem proteinu 1 je protein to je člen opravený rodiny a u lidí je kódován PTCH1 gen.^[5]^[6]

Funkce

PTCH1 je členem opravený genová rodina a je receptorem pro zvukový ježek, vylučovaná molekula podílející se na tvorbě embryonálních struktur a na tumorigenezi. Tento gen funguje jako a supresor nádoru. Produkt genu PTCH1 je a transmembránový protein který potlačuje uvolňování jiného zvaného proteinu uhlazen, a když se sonický ježek váže na PTCH1, uvolní se vyhlazený a signalizuje buněčnou proliferaci.

Klinický význam

Mutace tohoto genu byly spojeny s syndrom nevoidního bazocelulárního karcinomu (AKA Gorlinův syndrom)^[7]jícnu spinocelulární karcinom, trichoepiteliomy, přechodné buněčné karcinomy močového měchýře, stejně jako holoprosencephaly. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy. Byly popsány další varianty sestřihu, ale jejich plné délky sekvencí a biologickou platnost nelze v současné době určit.^[6]

Mutace v PTCH1 způsobit Gorlinův syndrom a mutace byly také nalezeny v holoprosencephaly pacientů.^[8]^[9]^[10] Někteří z těchto pacientů jsou přítomni rozštěp rtu a patra mezi holoprosencephaly funkce a varianty missense ve Windows PTCH1 byly také nalezeny při sekvenčním screeningu nesyndromických rozštěp rtu a patra pacientů.^[11] Kromě toho spojení mezi SNP v blízkém okolí PTCH1 bylo zjištěno, že jsou spojeny s nesyndromickými rozštěp rtu a patra.^[11]^[12] Mutace v PTCH1 jsou také spojeny s meduloblastom.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185920 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021466 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Johnson RL, Rothman AL, Xie J, Goodrich LV, Bare JW, Bonifas JM, Quinn AG, Myers RM, Cox DR, Epstein EH, Scott MP (srpen 1996). "Lidský homolog patched, kandidátského genu pro syndrom névus bazálních buněk". Věda. 272 (5268): 1668–71. doi:10.1126 / science.272.5268.1668. PMID 8658145. S2CID 9160210.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PTCH1 opravený homolog 1 (Drosophila)“.
^ Cantú-Reyna, Consuelo (2014). "Mutace v PTCH1 tumor supresorovém genu u Gorlinova syndromu. Kazuistika". Acta Pediatr Esp. 72 (11): e407 – e414. Citováno 12. března 2019.
^ Ming JE, Kaupas ME, Roessler E, Brunner HG, Golabi M, Tekin M, Stratton RF, Sujansky E, Bale SJ, Muenke M (duben 2002). „Mutace v PATCHED-1, receptoru pro SONIC HEDGEHOG, jsou spojeny s holoprosencephaly“. Hučení. Genet. 110 (4): 297–301. doi:10.1007 / s00439-002-0695-5. PMID 11941477. S2CID 32865658.
^ Rahimov F, Ribeiro LA, de Miranda E, Richieri-Costa A, Murray JC (prosinec 2006). „Mutace GLI2 u čtyř brazilských pacientů: jak široké je fenotypové spektrum?“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 140 (23): 2571–6. doi:10,1002 / ajmg.a.31370. PMID 17096318. S2CID 21019963.
^ Ribeiro LA, Quiezi RG, Nascimento A, Bertolacini CP, Richieri-Costa A (červenec 2010). „Holoprosencephaly and holoprosencephaly-like phenotype and GAS1 DNA changes changes: Zpráva o čtyřech brazilských pacientech“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 152A (7): 1688–94. doi:10,1002 / ajmg.a.33466. PMID 20583177. S2CID 25445281.
^ ^A ^b Mansilla MA, Cooper ME, Goldstein T, Castilla EE, Lopez Camelo JS, Marazita ML, Murray JC (leden 2006). "Příspěvky variant genů PTCH k izolovanému rozštěpu rtu a patra". Rozštěp paláce Craniofac. J. 43 (1): 21–9. doi:10.1597 / 04-169R.1. PMC 2151847. PMID 16405370.
^ Moreno LM, Mansilla MA, Bullard SA, Cooper ME, Busch TD, Machida J, Johnson MK, Brauer D, Krahn K, Daack-Hirsch S, L'heureux J, Valencia-Ramirez C, Rivera D, López AM, Moreno MA , Hing A, Lammer EJ, Jones M, Christensen K, Lie RT, Jugessur A, Wilcox AJ, Chines P, Pugh E, Doheny K, Arcos-Burgos M, Marazita ML, Murray JC, Lidral AC (prosinec 2009). „Sdružení FOXE1 s izolovaným rozštěpem rtu s rozštěpem patra nebo bez něj a izolovaným rozštěpem patra“. Hučení. Mol. Genet. 18 (24): 4879–96. doi:10,1093 / hmg / ddp444. PMC 2778374. PMID 19779022.
^ Jones DT, Jäger N, Kool M, Zichner T, Hutter B, Sultan M, Cho YJ, Pugh TJ, Hovestadt V, Stütz AM, Rausch T, Warnatz HJ, Ryzhova M, Bender S, Sturm D, Pleier S, Cin H , Pfaff E, Sieber L, Wittmann A, Remke M, Witt H, Hutter S, Tzaridis T, Weischenfeldt J, Raeder B, Avci M, Amstislavskiy V, Zapatka M, Weber UD, Wang Q, Lasitschka B, Bartholomae CC, Schmidt M, von Kalle C, Ast V, Lawerenz C, Eils J, Kabbe R, Benes V, van Sluis P, Koster J, Volckmann R, Shih D, Betts MJ, Russell RB, Coco S, Tonini GP, Schüller U, Hans V, Graf N, Kim YJ, Monoranu C, Roggendorf W, Unterberg A, Herold-Mende C, Milde T, Kulozik AE, von Deimling A, Witt O, Maass E, Rössler J, Ebinger M, Schuhmann MU, Frühwald MC, Hasselblatt M, Jabado N, Rutkowski S, von Bueren AO, Williamson D, Clifford SC, McCabe MG, Collins VP, Wolf S, Wiemann S, Lehrach H, Brors B, Scheurlen W, Felsberg J, Reifenberger G, Northcott PA, Taylor MD, Meyerson M, Pomeroy SL, Yaspo ML, Korbel JO, Korshunov A, Eils R, Pfister SM, Lichter P (srpen 2012). „Disekující genomovou složitost, která je základem meduloblastomu“. Příroda. 488 (7409): 100–5. doi:10.1038 / příroda11284. PMC 3662966. PMID 22832583.

Další čtení

Villavicencio EH, Walterhouse DO, Iannaccone PM (2000). „Cesta sonického ježka-opraveného gli v lidském vývoji a nemocech“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 67 (5): 1047–54. doi:10.1016 / S0002-9297 (07) 62934-6. PMC 1288546. PMID 11001584.
Corcoran RB, Scott MP (2002). "Myší model pro medulloblastom a syndrom névus bazálních buněk". J. Neurooncol. 53 (3): 307–18. doi:10.1023 / A: 1012260318979. PMID 11718263. S2CID 12886219.
Lindström E, Shimokawa T, Toftgård R, Zaphiropoulos PG (2006). "PTCH mutace: distribuce a analýzy". Hučení. Mutat. 27 (3): 215–9. doi:10.1002 / humu.20296. PMID 16419085. S2CID 35694533.
Gailani MR, Bale SJ, Leffell DJ a kol. (1992). „Vývojové vady Gorlinova syndromu související s domnělým tumor supresorovým genem na chromozomu 9“. Buňka. 69 (1): 111–7. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90122-S. PMID 1348213. S2CID 25784843.
Hahn H, Christiansen J, Wicking C a kol. (1996). "Patchovaný homolog savců je exprimován v cílových tkáních sonického ježka a mapuje oblast spojenou s vývojovými abnormalitami". J. Biol. Chem. 271 (21): 12125–8. doi:10.1074 / jbc.271.18.10941. PMID 8647801.
Hahn H, Wicking C, Zaphiropoulous PG a kol. (1996). „Mutace lidského homologu Drosophila patched v syndromu nevoidního bazocelulárního karcinomu“. Buňka. 85 (6): 841–51. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81268-4. PMID 8681379. S2CID 16281524.
Gailani MR, Ståhle-Bäckdahl M, Leffell DJ a kol. (1996). „Role lidského homologu Drosophila patched ve sporadických bazocelulárních karcinomech“. Nat. Genet. 14 (1): 78–81. doi:10.1038 / ng0996-78. PMID 8782823. S2CID 5221628.
Chidambaram A, Goldstein AM, Gailani MR a kol. (1996). „Mutace v lidském homologu genu Drosophila patched u pacientů s kavkazským a afroamerickým syndromem nevoidních bazocelulárních karcinomů“. Cancer Res. 56 (20): 4599–601. PMID 8840969.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Stone DM, Hynes M, Armanini M a kol. (1996). "Patchovaný gen potlačující nádor kóduje kandidátský receptor pro Sonic hedgehog". Příroda. 384 (6605): 129–34. doi:10.1038 / 384129a0. PMID 8906787. S2CID 4342540.
Wicking C, Shanley S, Smyth I a kol. (1997). „Většina mutací zárodečné linie u syndromu nevoidního bazocelulárního karcinomu vede k předčasnému ukončení proteinu PATCHED a nejsou patrné žádné korelace genotyp-fenotyp.“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 60 (1): 21–6. PMC 1712561. PMID 8981943.
Lench NJ, Telford EA, High AS a kol. (1997). "Charakterizace mutací lidské zárodečné linie u syndromu naevoidního bazocelulárního karcinomu". Hučení. Genet. 100 (5–6): 497–502. doi:10,1007 / s004390050541. PMID 9341860. S2CID 944397.
Aszterbaum M, Rothman A, Johnson RL a kol. (1998). "Identifikace mutací v lidském genu PATCHED u sporadických bazocelulárních karcinomů a u pacientů se syndromem bazálních buněk névus". J. Invest. Dermatol. 110 (6): 885–8. doi:10.1046 / j.1523-1747.1998.00222.x. PMID 9620294.
Carpenter D, Stone DM, Brush J a kol. (1998). "Charakterizace dvou opravených receptorů pro rodinu proteinů ježků obratlovců". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (23): 13630–4. doi:10.1073 / pnas.95.23.13630. PMC 24870. PMID 9811851.
Liu JH, Wei S, Burnette PK a kol. (1999). „Funkční asociace TGF-beta receptoru II s cyklinem B.“ Onkogen. 18 (1): 269–75. doi:10.1038 / sj.onc.1202263. PMID 9926943.
Hasenpusch-Theil K, Bataille V, Laehdetie J a kol. (1999). „Gorlinův syndrom: identifikace 4 nových zárodečných mutací genu pro lidský patched (PTCH). Stručné mutace č. 137. Online“. Hučení. Mutat. 11 (6): 480. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 11: 6 <480 :: AID-HUMU9> 3.0.CO; 2-4. PMID 10200051.
Dong J, Gailani MR, Pomeroy SL a kol. (2000). "Identifikace PATCHED mutací v medulloblastomech přímým sekvenováním". Hučení. Mutat. 16 (1): 89–90. doi:10.1002 / 1098-1004 (200007) 16: 1 <89 :: AID-HUMU18> 3.0.CO; 2-7. PMID 10874314.
Reifenberger J, Arnold N, Kiechle M a kol. (2001). „Souběžné mutace zárodečné linie PTCH a BRCA1 u pacientky se syndromem nevoidního bazocelulárního karcinomu a familiárním karcinomem prsu“. J. Invest. Dermatol. 116 (3): 472–4. doi:10.1046 / j.1523-1747.2001.01279-2.x. PMID 11231326.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na syndrom Nevoid Basal Cell Carcinoma Syndrome
GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na 9q22.3 Microdeletion
Drosophila opravený - Interaktivní létání
PTCH1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
PTCH1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185920 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021466 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8658145-5] Johnson RL, Rothman AL, Xie J, Goodrich LV, Bare JW, Bonifas JM, Quinn AG, Myers RM, Cox DR, Epstein EH, Scott MP (srpen 1996). "Lidský homolog patched, kandidátského genu pro syndrom névus bazálních buněk". Věda. 272 (5268): 1668–71. doi:10.1126 / science.272.5268.1668. PMID 8658145. S2CID 9160210.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PTCH1 opravený homolog 1 (Drosophila)“.

[7] Cantú-Reyna, Consuelo (2014). "Mutace v PTCH1 tumor supresorovém genu u Gorlinova syndromu. Kazuistika". Acta Pediatr Esp. 72 (11): e407 – e414. Citováno 12. března 2019.

[pmid11941477-8] Ming JE, Kaupas ME, Roessler E, Brunner HG, Golabi M, Tekin M, Stratton RF, Sujansky E, Bale SJ, Muenke M (duben 2002). „Mutace v PATCHED-1, receptoru pro SONIC HEDGEHOG, jsou spojeny s holoprosencephaly“. Hučení. Genet. 110 (4): 297–301. doi:10.1007 / s00439-002-0695-5. PMID 11941477. S2CID 32865658.

[pmid17096318-9] Rahimov F, Ribeiro LA, de Miranda E, Richieri-Costa A, Murray JC (prosinec 2006). „Mutace GLI2 u čtyř brazilských pacientů: jak široké je fenotypové spektrum?“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 140 (23): 2571–6. doi:10,1002 / ajmg.a.31370. PMID 17096318. S2CID 21019963.

[pmid20583177-10] Ribeiro LA, Quiezi RG, Nascimento A, Bertolacini CP, Richieri-Costa A (červenec 2010). „Holoprosencephaly and holoprosencephaly-like phenotype and GAS1 DNA changes changes: Zpráva o čtyřech brazilských pacientech“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 152A (7): 1688–94. doi:10,1002 / ajmg.a.33466. PMID 20583177. S2CID 25445281.

[pmid16405370-11] A ^b Mansilla MA, Cooper ME, Goldstein T, Castilla EE, Lopez Camelo JS, Marazita ML, Murray JC (leden 2006). "Příspěvky variant genů PTCH k izolovanému rozštěpu rtu a patra". Rozštěp paláce Craniofac. J. 43 (1): 21–9. doi:10.1597 / 04-169R.1. PMC 2151847. PMID 16405370.

[pmid19779022-12] Moreno LM, Mansilla MA, Bullard SA, Cooper ME, Busch TD, Machida J, Johnson MK, Brauer D, Krahn K, Daack-Hirsch S, L'heureux J, Valencia-Ramirez C, Rivera D, López AM, Moreno MA , Hing A, Lammer EJ, Jones M, Christensen K, Lie RT, Jugessur A, Wilcox AJ, Chines P, Pugh E, Doheny K, Arcos-Burgos M, Marazita ML, Murray JC, Lidral AC (prosinec 2009). „Sdružení FOXE1 s izolovaným rozštěpem rtu s rozštěpem patra nebo bez něj a izolovaným rozštěpem patra“. Hučení. Mol. Genet. 18 (24): 4879–96. doi:10,1093 / hmg / ddp444. PMC 2778374. PMID 19779022.

[13] Jones DT, Jäger N, Kool M, Zichner T, Hutter B, Sultan M, Cho YJ, Pugh TJ, Hovestadt V, Stütz AM, Rausch T, Warnatz HJ, Ryzhova M, Bender S, Sturm D, Pleier S, Cin H , Pfaff E, Sieber L, Wittmann A, Remke M, Witt H, Hutter S, Tzaridis T, Weischenfeldt J, Raeder B, Avci M, Amstislavskiy V, Zapatka M, Weber UD, Wang Q, Lasitschka B, Bartholomae CC, Schmidt M, von Kalle C, Ast V, Lawerenz C, Eils J, Kabbe R, Benes V, van Sluis P, Koster J, Volckmann R, Shih D, Betts MJ, Russell RB, Coco S, Tonini GP, Schüller U, Hans V, Graf N, Kim YJ, Monoranu C, Roggendorf W, Unterberg A, Herold-Mende C, Milde T, Kulozik AE, von Deimling A, Witt O, Maass E, Rössler J, Ebinger M, Schuhmann MU, Frühwald MC, Hasselblatt M, Jabado N, Rutkowski S, von Bueren AO, Williamson D, Clifford SC, McCabe MG, Collins VP, Wolf S, Wiemann S, Lehrach H, Brors B, Scheurlen W, Felsberg J, Reifenberger G, Northcott PA, Taylor MD, Meyerson M, Pomeroy SL, Yaspo ML, Korbel JO, Korshunov A, Eils R, Pfister SM, Lichter P (srpen 2012). „Disekující genomovou složitost, která je základem meduloblastomu“. Příroda. 488 (7409): 100–5. doi:10.1038 / příroda11284. PMC 3662966. PMID 22832583.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

Signalizační cesta: ježková signální dráha
Ligandy	Sonic ježek Indický ježek Pouštní ježek
Receptor	Oprava Uhlazen
Transkripční faktor	GLI1 GLI2 GLI3
jiný	HHIP HAT