PHF21A - PHF21A

PHF21A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 KOUPIT, 2YQL
Identifikátory
Aliasy	PHF21A, BHC80, BM-006, prstový protein PHD 21A, NEDMS, IDDBCS
Externí ID	OMIM: 608325 MGI: 2384756 HomoloGene: 9597 Genové karty: PHF21A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	46,121,178 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	92,364,666 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • histonová vazba; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba chromatinu; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita histon-deacetylázy;
Buněčná složka	• komplex histon-deacetylázy; • DNA opravný komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• srážení krve; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • histonová deacetylace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51317
	192285
	ENSG00000135365
	ENSMUSG00000058318
	Q96BD5
	Q6ZPK0
NM_001101802; NM_016621; NM_001352025; NM_001352026; NM_001352027;
	NM_001352028; NM_001352029; NM_001352030; NM_001352031; NM_001352032
NM_001109690; NM_001109691; NM_138755; NM_001346704; NM_001362829;
	NM_001362830; NM_001362831; NM_001362832; NM_001362833
NP_001095272; NP_057705; NP_001338954; NP_001338955; NP_001338956;
	NP_001338957; NP_001338958; NP_001338959; NP_001338960; NP_001338961
NP_001103160; NP_001103161; NP_001333633; NP_620094; NP_001349758;
	NP_001349759; NP_001349760; NP_001349761; NP_001349762
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Prstový protein PHD 21A je protein že u lidí je kódován PHF21A gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

BHC80 je složka komplexu BRAF35 (MIM 605535) / histon-deacetyláza (HDAC; viz MIM 601241) (BHC), která zprostředkovává represi neuronově specifických genů prostřednictvím cis-regulačního prvku známého jako represorový prvek-1 (RE1) nebo neurální omezující tlumič (NRS) (Hakimi et al., 2002). [dodáno společností OMIM]^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že PHF21A komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135365 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058318 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (květen 2002). „Komplex jádro-BRAF35 obsahující histon-deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (11): 7420–5. Bibcode:2002PNAS ... 99.7420H. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A“.
^ ^A ^b ^C ^d Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (září 2004). "Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, podílející se na neuronově specifické genové represi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.
^ Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. J. Biol. Chem. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.

Další čtení

Shi YJ, Matson C, Lan F, Iwase S, Baba T, Shi Y (2005). "Regulace aktivity LSD1 histon demethylázy souvisejícími faktory". Mol. Buňka. 19 (6): 857–64. doi:10.1016 / j.molcel.2005.08.027. PMID 16140033.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Hailesellasse Sene K, Porter CJ, Palidwor G, Perez-Iratxeta C, Muro EM, Campbell PA, Rudnicki MA, Andrade-Navarro MA (2007). "Genová funkce při diferenciaci časných myších embryonálních kmenových buněk". BMC Genomics. 8: 85. doi:10.1186/1471-2164-8-85. PMC 1851713. PMID 17394647.

externí odkazy

PHF21A + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135365 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000058318 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11214970-5] Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.

[pmid12032298-6] A ^b ^C ^d ^E Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J, Lane WS, Mandel G, Shiekhattar R (květen 2002). „Komplex jádro-BRAF35 obsahující histon-deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (11): 7420–5. Bibcode:2002PNAS ... 99.7420H. doi:10.1073 / pnas.112008599. PMC 124246. PMID 12032298.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A“.

[pmid15325272-8] A ^b ^C ^d Iwase S, Januma A, Miyamoto K, Shono N, Honda A, Yanagisawa J, Baba T (září 2004). "Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, podílející se na neuronově specifické genové represi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 322 (2): 601–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.163. PMID 15325272.

[pmid12493763-9] Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (únor 2003). „Kandidátský gen pro mentální retardaci vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon-deacetylázu“. J. Biol. Chem. 278 (9): 7234–9. doi:10,1074 / jbc.M208992200. PMID 12493763.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]