E2F3 - E2F3

E2F3
Identifikátory
Aliasy	E2F3, E2F-3, E2F transkripční faktor 3
Externí ID	OMIM: 600427 MGI: 1096340 HomoloGene: 74413 Genové karty: E2F3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	20,493,714 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	29,986,063 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita dimerizace bílkovin; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001158 promotor jádra promotoru vázaný na sekvenci proximální oblasti DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • nukleoplazma;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace množení tukových buněk; • buněčný cyklus; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace apoptotického procesu s buňkami hladkého svalstva spojeného s cévami; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1871
	13557
	ENSG00000112242
	ENSMUSG00000016477
	O00716
	O35261
	NM_001243076; NM_001949
	NM_001289920; NM_010093; NM_001359994
	NP_001230005; NP_001940
	NP_001276849; NP_034223; NP_001346923
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor E2F3 je protein že u lidí je kódován E2F3 gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny transkripčních faktorů E2F. Rodina E2F hraje klíčovou roli v řízení buněčného cyklu a působení nádorových supresorových proteinů a je také terčem transformujících se proteinů malých nádorových virů DNA. Proteiny E2F obsahují několik evolučně konzervovaných domén nalezených u většiny členů rodiny. Tyto domény zahrnují doménu vázající DNA, dimerizační doménu, která určuje interakci s proteiny diferenciačně regulovaného transkripčního faktoru (DP), transaktivační doménu obohacenou o kyselé aminokyseliny a doménu asociace tumor-supresorového proteinu, která je zabudována do transaktivační domény. Tento protein a další 2 členové, E2F1 a E2F2, mají další doménu vázající cyklin. Tento protein se specificky váže na protein pRB retinoblastomu způsobem závislým na buněčném cyklu. Alternativní genové sestřih se nachází v myším homologu, ale dosud nebyl hlášen u člověka.^[6]

Interakce

E2F3 bylo prokázáno komunikovat s TFE3^[7] a RYBP.^[8]

Viz také

E2F

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112242 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016477 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lees JA, Saito M, Vidal M, Valentine M, Look T, Harlow E, Dyson N, Helin K (prosinec 1993). „Protein retinoblastomu se váže na rodinu transkripčních faktorů E2F“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (12): 7813–25. doi:10.1128 / mcb.13.12.7813. PMC 364853. PMID 8246996.
^ „Entrez Gene: E2F3 E2F transkripční faktor 3“.
^ Giangrande PH, Hallstrom TC, Tunyaplin C, Calame K, Nevins JR (červen 2003). „Identifikace faktoru E-box TFE3 jako funkčního partnera transkripčního faktoru E2F3“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (11): 3707–20. doi:10.1128 / MCB.23.11.3707-3720.2003. PMC 155231. PMID 12748276.
^ Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. Časopis EMBO. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.

Další čtení

Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
Wu CL, Zukerberg LR, Ngwu C, Harlow E, Lees JA (květen 1995). „In vivo asociace proteinů rodiny E2F a DP“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (5): 2536–46. doi:10,1128 / mcb.15.5.2536. PMC 230484. PMID 7739537.
Karlseder J, Rotheneder H, Wintersberger E (duben 1996). „Interakce Sp1 s transkripčním faktorem E2F regulovaným růstovým a buněčným cyklem“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (4): 1659–67. doi:10,1128 / mcb.16.4.1659. PMC 231152. PMID 8657141.
Rogers KT, Higgins PD, Milla MM, Phillips RS, Horowitz JM (červenec 1996). „DP-2, heterodimerní partner E2F: identifikace a charakterizace proteinů DP-2 exprimovaných in vivo“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (15): 7594–9. Bibcode:1996PNAS ... 93.7594R. doi:10.1073 / pnas.93.15.7594. PMC 38791. PMID 8755520.
Magae J, Wu CL, Illenye S, Harlow E, Heintz NH (červenec 1996). „Nukleární lokalizace transkripčních faktorů DP a E2F heterodimerními partnery a členy rodiny proteinů retinoblastomu“. Journal of Cell Science. 109 (7): 1717–26. PMID 8832394.
Hofmann F, Livingston DM (duben 1996). "Diferenciální účinky cdk2 a cdk3 na řízení funkcí pRb a E2F během výstupu z G1". Geny a vývoj. 10 (7): 851–61. doi:10,1101 / gad.10.7.851. PMID 8846921.
Lindeman GJ, Gaubatz S, Livingston DM, Ginsberg D (květen 1997). „Subcelulární lokalizace E2F-4 je závislá na buněčném cyklu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (10): 5095–100. Bibcode:1997PNAS ... 94.5095L. doi:10.1073 / pnas.94.10.5095. PMC 24637. PMID 9144196.
Dynlacht BD, Moberg K, Lees JA, Harlow E, Zhu L (červenec 1997). „Specifická regulace členů rodiny E2F pomocí cyklin-dependentních kináz“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (7): 3867–75. doi:10,1128 / mcb.17.7.3867. PMC 232239. PMID 9199321.
Pierce AM, Schneider-Broussard R, Philhower JL, Johnson DG (červenec 1998). "Diferenciální aktivity členů rodiny E2F: jedinečné funkce při regulaci transkripce". Molekulární karcinogeneze. 22 (3): 190–8. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199807) 22: 3 <190 :: AID-MC7> 3.0.CO; 2-P. PMID 9688145.
Humbert PO, Verona R, Trimarchi JM, Rogers C, Dandapani S, Lees JA (březen 2000). „E2f3 je kritický pro normální buněčnou proliferaci“. Geny a vývoj. 14 (6): 690–703. PMC 316459. PMID 10733529.
Takahashi Y, Rayman JB, Dynlacht BD (duben 2000). „Analýza vazby promotoru rodinami E2F a pRB in vivo: odlišné proteiny E2F zprostředkovávají aktivaci a represi“. Geny a vývoj. 14 (7): 804–16. doi:10,1101 / gad.14.7.804 (neaktivní 11. 10. 2020). PMC 316494. PMID 10766737.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)
Leone G, Nuckolls F, Ishida S, Adams M, Sears R, Jakoi L, Miron A, Nevins JR (květen 2000). „Identifikace nového produktu E2F3 naznačuje mechanismus pro stanovení specificity represe proteiny Rb“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (10): 3626–32. doi:10.1128 / MCB.20.10.3626-3632.2000. PMC 85655. PMID 10779352.
He Y, Armanious MK, Thomas MJ, Cress WD (červenec 2000). „Identifikace E2F-3B, alternativní forma E2F-3 bez konzervované N-koncové oblasti“. Onkogen. 19 (30): 3422–33. doi:10.1038 / sj.onc.1203682. PMID 10918599.
Yamochi T, Semba K, Tsuji K, Mizumoto K, Sato H, Matsuura Y, Nishimoto I, Matsuoka M (prosinec 2001). „ik3-1 / Cables je substrát pro cyklin-dependentní kinázu 3 (cdk 3)“. European Journal of Biochemistry / FEBS. 268 (23): 6076–82. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02555.x. PMID 11733001.
Weinmann AS, Yan PS, Oberley MJ, Huang TH, Farnham PJ (leden 2002). „Izolace cílů lidského transkripčního faktoru spojením imunoprecipitace chromatinu a analýzy mikročipů na ostrově CpG“. Geny a vývoj. 16 (2): 235–44. doi:10,1101 / gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066.
Ren B, Cam H, Takahashi Y, Volkert T, Terragni J, Young RA, Dynlacht BD (leden 2002). „E2F integruje progresi buněčného cyklu s opravou DNA, replikací a kontrolními body G (2) / M“. Geny a vývoj. 16 (2): 245–56. doi:10,1101 / gad. 949802. PMC 155321. PMID 11799067.
He Y, Cress WD (červen 2002). „E2F-3B je fyziologický cíl cyklinu A“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (26): 23493–9. doi:10,1074 / jbc.M202629200. PMID 11980909.
Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. Časopis EMBO. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.

externí odkazy

E2F3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112242 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016477 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8246996-5] Lees JA, Saito M, Vidal M, Valentine M, Look T, Harlow E, Dyson N, Helin K (prosinec 1993). „Protein retinoblastomu se váže na rodinu transkripčních faktorů E2F“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (12): 7813–25. doi:10.1128 / mcb.13.12.7813. PMC 364853. PMID 8246996.

[entrez-6] „Entrez Gene: E2F3 E2F transkripční faktor 3“.

[pmid12748276-7] Giangrande PH, Hallstrom TC, Tunyaplin C, Calame K, Nevins JR (červen 2003). „Identifikace faktoru E-box TFE3 jako funkčního partnera transkripčního faktoru E2F3“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (11): 3707–20. doi:10.1128 / MCB.23.11.3707-3720.2003. PMC 155231. PMID 12748276.

[pmid12411495-8] Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. Časopis EMBO. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]