Transkripční faktor antagonizující apoptózu - Apoptosis-antagonizing transcription factor

AATF
Identifikátory
Aliasy	AATF, BFR2, CHE-1, CHE1, DED, transkripční faktor antagonizující apoptózu, transkripční faktor antagonizující apoptózu
Externí ID	OMIM: 608463 MGI: 1929608 HomoloGene: 40811 Genové karty: AATF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	37,056,871 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	84,513,522 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba domény leucinového zipu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba tau proteinu; • Vazba RNA; • vazba protein kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Golgiho aparát; • buněčné jádro; • jádro;
Biologický proces	• embryonální štěpení; • ribozomální biogeneze; • negativní regulace apoptotického procesu; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • buněčná adheze; • negativní regulace procesu biosyntézy proteinu amyloidního prekurzoru; • regulace mitotického buněčného cyklu; • negativní regulace tvorby superoxidových aniontů; • negativní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26574
	56321
	ENSG00000275700; ENSG00000276072
	ENSMUSG00000018697
	Q9NY61
	Q9JKX4
	NM_012138
	NM_019816
	NP_036270
	NP_062790
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein AATF je protein že u lidí je kódován AATF gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem byl identifikován na základě jeho interakce s MAP3K12 / DLK, proteinovou kinázou, o které je známo, že se účastní indukce buněčné apoptózy. Tento genový produkt obsahuje leucinový zip, který je charakteristickým motivem transkripčních faktorů, a bylo prokázáno, že vykazuje silnou transaktivační aktivitu při fúzi s doménou vázající Gal4 DNA. Nadměrná exprese tohoto genu interferovala s apoptózou indukovanou MAP3K12.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že transkripční faktor antagonizující apoptózu komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000276072 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275700, ENSG00000276072 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018697 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lindfors K, Halttunen T, Huotari P, Nupponen N, Vihinen M, Visakorpi T, Mäki M, Kainulainen H (září 2000). "Identifikace nového genu podobného transkripčnímu faktoru z lidských střevních buněk". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 276 (2): 660–6. doi:10,1006 / bbrc.2000.3480. PMID 11027528.
^ ^A ^b ^C Fanciulli M, Bruno T, Di Padova M, De Angelis R, Iezzi S, Iacobini C, Floridi A, Passananti C (květen 2000). "Identifikace nového partnera RNA polymerázy II podjednotky 11, Che-1, který interaguje s a ovlivňuje funkci potlačení růstu Rb". FASEB Journal. 14 (7): 904–12. doi:10.1096 / fasebj.14.7.904. PMID 10783144. S2CID 43175069.
^ ^A ^b „Entrez Gene: transkripční faktor antagonizující apoptózu AATF“.
^ Guo Q, Xie J (únor 2004). „AATF inhibuje aberantní produkci peptidu amyloidu beta 1-42 přímou interakcí s Par-4“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (6): 4596–603. doi:10,1074 / jbc.M309811200. PMID 14627703.
^ Bruno T, De Angelis R, De Nicola F, Barbato C, Di Padova M, Corbi N, Libri V, Benassi B, Mattei E, Chersi A, Soddu S, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (listopad 2002). „Che-1 ovlivňuje buněčný růst interferencí s náborem HDAC1 Rb“. Rakovinová buňka. 2 (5): 387–99. doi:10.1016 / s1535-6108 (02) 00182-4. PMID 12450794.
^ Di Padova M, Bruno T, De Nicola F, Iezzi S, D'Angelo C, Gallo R, Nicosia D, Corbi N, Biroccio A, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (září 2003). „Che-1 zastavuje proliferaci buněk lidského karcinomu tlustého střeva vytěsněním HDAC1 z promotoru p21WAF1 / CIP1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (38): 36496–504. doi:10,1074 / jbc.M306694200. PMID 12847090.

Další čtení

Strana G, Lödige I, Kögel D, Scheidtmann KH (listopad 1999). "AATF, nový transkripční faktor, který interaguje s Dlk / ZIP kinázou a interferuje s apoptózou". FEBS Dopisy. 462 (1–2): 187–91. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01529-X. PMID 10580117. S2CID 6061613.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (leden 2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Aktuální biologie. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (listopad 2002). "Funkční proteomická analýza lidského nukleolu". Molekulární biologie buňky. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Bruno T, De Angelis R, De Nicola F, Barbato C, Di Padova M, Corbi N, Libri V, Benassi B, Mattei E, Chersi A, Soddu S, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (listopad 2002). „Che-1 ovlivňuje buněčný růst interferencí s náborem HDAC1 Rb“. Rakovinová buňka. 2 (5): 387–99. doi:10.1016 / S1535-6108 (02) 00182-4. PMID 12450794.
Di Padova M, Bruno T, De Nicola F, Iezzi S, D'Angelo C, Gallo R, Nicosia D, Corbi N, Biroccio A, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (září 2003). „Che-1 zastavuje proliferaci buněk lidského karcinomu tlustého střeva vytěsněním HDAC1 z promotoru p21WAF1 / CIP1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (38): 36496–504. doi:10,1074 / jbc.M306694200. PMID 12847090.
Guo Q, Xie J (únor 2004). „AATF inhibuje aberantní produkci peptidu amyloidu beta 1-42 přímou interakcí s Par-4“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (6): 4596–603. doi:10,1074 / jbc.M309811200. PMID 14627703.
Barbato C, Corbi N, Canu N, Fanciulli M, Serafino A, Ciotti M, Libri V, Bruno T, Amadoro G, De Angelis R, Calissano P, Passananti C (prosinec 2003). "Rb vazebný protein Che-1 interaguje s Tau v neuronech cerebelárních granulí. Modulace během neuronální apoptózy". Molekulární a buněčné neurovědy. 24 (4): 1038–50. doi:10.1016 / j.mcn.2003.08.002. hdl:2108/56917. PMID 14697667. S2CID 35111183.
Burgdorf S, Leister P, Scheidtmann KH (duben 2004). „TSG101 interaguje s transkripčním faktorem antagonizujícím apoptózu a zvyšuje transkripci zprostředkovanou androgenním receptorem podporou jeho monoubikvitinace“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (17): 17524–34. doi:10,1074 / jbc.M313703200. PMID 14761944.
Xie J, Guo Q (červen 2004). „AATF chrání nervové buňky před oxidačním poškozením vyvolaným amyloidním beta-peptidem“. Neurobiologie nemocí. 16 (1): 150–7. doi:10.1016 / j.nbd.2004.02.003. PMID 15207272. S2CID 53204920.
Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (duben 2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Kaul D, Mehrotra A (březen 2007). "Funkční charakterizace transkriptomu AATF v lidských leukemických buňkách". Molekulární a buněčná biochemie. 297 (1–2): 215–20. doi:10.1007 / s11010-006-9317-1. PMID 17006618. S2CID 8612000.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

externí odkazy

AATF + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
AATF umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
AATF podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000276072 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275700, ENSG00000276072 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018697 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11027528-5] Lindfors K, Halttunen T, Huotari P, Nupponen N, Vihinen M, Visakorpi T, Mäki M, Kainulainen H (září 2000). "Identifikace nového genu podobného transkripčnímu faktoru z lidských střevních buněk". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 276 (2): 660–6. doi:10,1006 / bbrc.2000.3480. PMID 11027528.

[pmid10783144-6] A ^b ^C Fanciulli M, Bruno T, Di Padova M, De Angelis R, Iezzi S, Iacobini C, Floridi A, Passananti C (květen 2000). "Identifikace nového partnera RNA polymerázy II podjednotky 11, Che-1, který interaguje s a ovlivňuje funkci potlačení růstu Rb". FASEB Journal. 14 (7): 904–12. doi:10.1096 / fasebj.14.7.904. PMID 10783144. S2CID 43175069.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: transkripční faktor antagonizující apoptózu AATF“.

[pmid14627703-8] Guo Q, Xie J (únor 2004). „AATF inhibuje aberantní produkci peptidu amyloidu beta 1-42 přímou interakcí s Par-4“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (6): 4596–603. doi:10,1074 / jbc.M309811200. PMID 14627703.

[pmid12450794-9] Bruno T, De Angelis R, De Nicola F, Barbato C, Di Padova M, Corbi N, Libri V, Benassi B, Mattei E, Chersi A, Soddu S, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (listopad 2002). „Che-1 ovlivňuje buněčný růst interferencí s náborem HDAC1 Rb“. Rakovinová buňka. 2 (5): 387–99. doi:10.1016 / s1535-6108 (02) 00182-4. PMID 12450794.

[pmid12847090-10] Di Padova M, Bruno T, De Nicola F, Iezzi S, D'Angelo C, Gallo R, Nicosia D, Corbi N, Biroccio A, Floridi A, Passananti C, Fanciulli M (září 2003). „Che-1 zastavuje proliferaci buněk lidského karcinomu tlustého střeva vytěsněním HDAC1 z promotoru p21WAF1 / CIP1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (38): 36496–504. doi:10,1074 / jbc.M306694200. PMID 12847090.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]