ING1 - ING1

ING1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QIC
Identifikátory
Aliasy	ING1, p24ING1c, p33, p33p33ING1b, p47, p47ING1a, inhibitor růstového člena rodiny 1
Externí ID	OMIM: 601566 MGI: 1349481 HomoloGene: 40119 Genové karty: ING1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	110,723,339 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	11,563,251 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba methylovaného histonu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace buněčné smrti; • buněčný cyklus; • negativní regulace buněčného růstu; • negativní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3621
	26356
	ENSG00000153487
	ENSMUSG00000045969
	Q9UK53
	Q9QXV3
	NM_198219; NM_001267728; NM_005537; NM_198217; NM_198218
NM_011919; NM_001302451; NM_001302457; NM_001302458; NM_001302459;
	NM_001302460
	NP_001254657; NP_005528; NP_937860; NP_937861; NP_937862
NP_001289380; NP_001289386; NP_001289387; NP_001289388; NP_001289389;
	NP_036049
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor růstového proteinu 1 je protein že u lidí je kódován ING1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje tumor supresorový protein, který může vyvolat zastavení buněčného růstu a apoptózu. Kódovaný protein je jaderný protein, který fyzicky interaguje s tumor supresorovým proteinem TP53 a je součástí signální dráhy p53. U různých druhů rakoviny byla zjištěna snížená exprese a přeskupení tohoto genu. Bylo popsáno několik alternativně sestříhaných variant transkriptu kódujících odlišné izoformy.^[7]

Umístění na chromozomu 13

ING1 se nachází v blízkosti následujících genů Chromozom 13

CARKD Protein obsahující doménu karbohydrát kinázy (neznámá funkce)
COL4A2: A2 Podjednotka kolagenu typu IV
RAB20: Potenciální regulátor obchodování s Connexinem 43.
AUTA 2: Mitochondriální cystienyl-tRNA syntetáza 2

Interakce

Bylo prokázáno, že ING1 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000153487 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045969 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Garkavtsev I, Kazarov A, Gudkov A, Riabowol K (prosinec 1996). "Potlačení nového inhibitoru růstu p33ING1 podporuje neoplastickou transformaci". Genetika přírody. 14 (4): 415–20. doi:10.1038 / ng1296-415. PMID 8944021. S2CID 10173092.
^ Garkavtsev I, Demetrick D, Riabowol K (červenec 1997). "Buněčná lokalizace a mapování chromozomů nového kandidátního tumor supresorového genu (ING1)". Cytogenetika a genetika buněk. 76 (3–4): 176–8. doi:10.1159/000134539. PMID 9186514.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ING1 inhibitor růstové rodiny, člen 1“.
^ ^A ^b Vieyra D, Loewith R, Scott M, Bonnefin P, Boisvert FM, Cheema P, Pastyryeva S, Meijer M, Johnston RN, Bazett-Jones DP, McMahon S, Cole MD, Young D, Riabowol K (srpen 2002). „Lidské proteiny ING1 odlišně regulují acetylaci histonů“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 29832–9. doi:10,1074 / jbc.M200197200. PMID 12015309.
^ Xin H, Yoon HG, Singh PB, Wong J, Qin J (březen 2004). "Složky dráhy udržující modifikaci histonu a vazbu heterochromatinového proteinu 1 na pericentrický heterochromatin v buňkách savců". The Journal of Biological Chemistry. 279 (10): 9539–46. doi:10,1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (únor 2002). "Role komplexu Sin3-histon-deacetyláza v regulaci růstu kandidátem potlačujícím nádor p33 (ING1)". Molekulární a buněčná biologie. 22 (3): 835–48. doi:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.
^ Leung KM, Po LS, Tsang FC, Siu WY, Lau A, Ho HT, Poon RY (září 2002). „Kandidát potlačující nádor ING1b může stabilizovat p53 narušením regulace p53 pomocí MDM2.“ Výzkum rakoviny. 62 (17): 4890–3. PMID 12208736.
^ Garkavtsev I, Grigorian IA, Ossovskaya VS, Chernov MV, Chumakov PM, Gudkov AV (leden 1998). "Kandidát potlačující nádor p33ING1 spolupracuje s p53 při kontrole buněčného růstu". Příroda. 391 (6664): 295–8. Bibcode:1998 Natur.391..295G. doi:10.1038/34675. PMID 9440695. S2CID 4429461.
^ Scott M, Bonnefin P, Vieyra D, Boisvert FM, Young D, Bazett-Jones DP, Riabowol K (říjen 2001). „UV-indukovaná vazba ING1 na PCNA reguluje indukci apoptózy“. Journal of Cell Science. 114 (Pt 19): 3455–62. PMID 11682605.

Další čtení

Campos EI, Chin MY, Kuo WH, Li G (říjen 2004). "Biologické funkce nádorových supresorů rodiny ING". Buněčné a molekulární biologické vědy. 61 (19–20): 2597–613. doi:10.1007 / s00018-004-4199-4. PMID 15526165. S2CID 28889915.
Helbing CC, Veillette C, Riabowol K, Johnston RN, Garkavtsev I (duben 1997). „Nový kandidát potlačující nádor, ING1, se podílí na regulaci apoptózy.“ Výzkum rakoviny. 57 (7): 1255–8. PMID 9102209.
Garkavtsev I, Riabowol K (duben 1997). „Prodloužení replikativní délky života lidských diploidních fibroblastů inhibicí potlačujícího tumor kandidujícího p33ING1“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (4): 2014–9. doi:10.1128 / mcb.17.4.2014. PMC 232048. PMID 9121449.
Zeremski M, Horrigan SK, Grigorian IA, Westbrook CA, Gudkov AV (květen 1997). "Lokalizace kandidátního tumor supresorového genu ING1 na lidský chromozom 13q34". Somatická buněčná a molekulární genetika. 23 (3): 233–6. doi:10.1007 / BF02721376. PMID 9330636. S2CID 24132112.
Garkavtsev I, Grigorian IA, Ossovskaya VS, Chernov MV, Chumakov PM, Gudkov AV (leden 1998). "Kandidát potlačující nádor p33ING1 spolupracuje s p53 při kontrole buněčného růstu". Příroda. 391 (6664): 295–8. Bibcode:1998 Natur.391..295G. doi:10.1038/34675. PMID 9440695. S2CID 4429461.
Shinoura N, Muramatsu Y, Nishimura M, Yoshida Y, Saito A, Yokoyama T, Furukawa T, Horii A, Hashimoto M, Asai A, Kirino T, Hamada H (listopad 1999). "Přenos p33ING1 s p53 zprostředkovaný adenovirem drasticky zvyšuje apoptózu v gliomech". Výzkum rakoviny. 59 (21): 5521–8. PMID 10554029.
Jäger D, Stockert E, Scanlan MJ, Güre AO, Jäger E, Knuth A, Old LJ, Chen YT (prosinec 1999). „Antigeny rakoviny varlat a produkt genu potlačujícího nádor ING1 jsou antigeny rakoviny prsu: charakterizace transkriptů ING1 specifických pro tkáň a homologní gen.“ Výzkum rakoviny. 59 (24): 6197–204. PMID 10626813.
Sanchez-Cespedes M, Okami K, Cairns P, Sidransky D (březen 2000). "Molekulární analýza kandidátního tumor supresorového genu ING1 v lidských nádorech hlavy a krku s 13q delecemi". Geny, chromozomy a rakovina. 27 (3): 319–22. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2264 (200003) 27: 3 <319 :: AID-GCC13> 3.0.CO; 2-P. PMID 10679922.
Tokunaga E, Maehara Y, Oki E, Kitamura K, Kakeji Y, Ohno S, Sugimachi K (duben 2000). "Snížená exprese mRNA ING1 a korelace s expresí p53 u karcinomů prsu". Dopisy o rakovině. 152 (1): 15–22. doi:10.1016 / S0304-3835 (99) 00434-6. PMID 10754201.
Baranova AV, Ivanov DV, Makeeva NV, Corcoran M, Nikitin EA, Borodina TA, Poltaraus AB, Glinshchikova OA, Sudarikov AB, Oscier D, Iankovskiĭ NK (2000). "[Genomická organizace supresorového genu pro růst nádoru ING1]". Molekuliarnaia Biologiia. 34 (2): 263–9. PMID 10779953.
Saito A, Furukawa T, Fukushige S, Koyama S, Hoshi M, Hayashi Y, Horii A (2000). „p24 / ING1-ALT1 a p47 / ING1-ALT2, odlišné alternativní přepisy p33 / ING1“. Journal of Human Genetics. 45 (3): 177–81. doi:10,1007 / s100380050206. PMID 10807544.
Gunduz M, Ouchida M, Fukushima K, Hanafusa H, Etani T, Nishioka S, Nishizaki K, Shimizu K (červen 2000). „Genomická struktura lidského genu ING1 a nádorově specifické mutace detekované v karcinomech dlaždicových buněk hlavy a krku“. Výzkum rakoviny. 60 (12): 3143–6. PMID 10866301.
Skowyra D, Zeremski M, Neznanov N, Li M, Choi Y, Uesugi M, Hauser CA, Gu W, Gudkov AV, Qin J (březen 2001). „Diferenciální asociace produktů alternativních transkriptů kandidátního supresoru nádoru ING1 s komplexem transkripčního korpresoru mSin3 / HDAC1“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 8734–9. doi:10,1074 / jbc.M007664200. PMID 11118440.
Nagashima M, Shiseki M, Miura K, Hagiwara K, Linke SP, Pedeux R, Wang XW, Yokota J, Riabowol K, Harris CC (srpen 2001). „Gen p33ING2 indukovatelný poškozením DNA negativně reguluje buněčnou proliferaci prostřednictvím acetylace p53“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (17): 9671–6. Bibcode:2001PNAS ... 98,9671N. doi:10.1073 / pnas.161151798. PMC 55510. PMID 11481424.
Scott M, Bonnefin P, Vieyra D, Boisvert FM, Young D, Bazett-Jones DP, Riabowol K (říjen 2001). „UV-indukovaná vazba ING1 na PCNA reguluje indukci apoptózy“. Journal of Cell Science. 114 (Pt 19): 3455–62. PMID 11682605.
Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (únor 2002). "Role komplexu Sin3-histon-deacetyláza v regulaci růstu kandidátem potlačujícím nádor p33 (ING1)". Molekulární a buněčná biologie. 22 (3): 835–48. doi:10.1128 / MCB.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.
Nouman GS, Angus B, Lunec J, Crosier S, lóže A, Anderson JJ (únor 2002). "Srovnávací hodnocení exprese inhibitoru genu pro růst 1 (ING1) v normálních a neoplastických tkáních". Hybridoma a Hybridomics. 21 (1): 1–10. doi:10.1089/15368590252917584. PMID 11991811.
Bromidge T, Lynas C (červenec 2002). "Relativní hladiny alternativních transkriptů genu ING1 a nedostatek mutací p33 / ING1 v hematologických malignancích". Výzkum leukémie. 26 (7): 631–5. doi:10.1016 / S0145-2126 (01) 00185-0. PMID 12008079.

externí odkazy

ING1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000153487 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045969 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8944021-5] Garkavtsev I, Kazarov A, Gudkov A, Riabowol K (prosinec 1996). "Potlačení nového inhibitoru růstu p33ING1 podporuje neoplastickou transformaci". Genetika přírody. 14 (4): 415–20. doi:10.1038 / ng1296-415. PMID 8944021. S2CID 10173092.

[pmid9186514-6] Garkavtsev I, Demetrick D, Riabowol K (červenec 1997). "Buněčná lokalizace a mapování chromozomů nového kandidátního tumor supresorového genu (ING1)". Cytogenetika a genetika buněk. 76 (3–4): 176–8. doi:10.1159/000134539. PMID 9186514.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ING1 inhibitor růstové rodiny, člen 1“.

[pmid12015309-8] A ^b Vieyra D, Loewith R, Scott M, Bonnefin P, Boisvert FM, Cheema P, Pastyryeva S, Meijer M, Johnston RN, Bazett-Jones DP, McMahon S, Cole MD, Young D, Riabowol K (srpen 2002). „Lidské proteiny ING1 odlišně regulují acetylaci histonů“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 29832–9. doi:10,1074 / jbc.M200197200. PMID 12015309.

[pmid14665632-9] Xin H, Yoon HG, Singh PB, Wong J, Qin J (březen 2004). "Složky dráhy udržující modifikaci histonu a vazbu heterochromatinového proteinu 1 na pericentrický heterochromatin v buňkách savců". The Journal of Biological Chemistry. 279 (10): 9539–46. doi:10,1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.

[pmid11784859-10] A ^b ^C ^d ^E Kuzmichev A, Zhang Y, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (únor 2002). "Role komplexu Sin3-histon-deacetyláza v regulaci růstu kandidátem potlačujícím nádor p33 (ING1)". Molekulární a buněčná biologie. 22 (3): 835–48. doi:10.1128 / mcb.22.3.835-848.2002. PMC 133546. PMID 11784859.

[pmid12208736-11] Leung KM, Po LS, Tsang FC, Siu WY, Lau A, Ho HT, Poon RY (září 2002). „Kandidát potlačující nádor ING1b může stabilizovat p53 narušením regulace p53 pomocí MDM2.“ Výzkum rakoviny. 62 (17): 4890–3. PMID 12208736.

[pmid9440695-12] Garkavtsev I, Grigorian IA, Ossovskaya VS, Chernov MV, Chumakov PM, Gudkov AV (leden 1998). "Kandidát potlačující nádor p33ING1 spolupracuje s p53 při kontrole buněčného růstu". Příroda. 391 (6664): 295–8. Bibcode:1998 Natur.391..295G. doi:10.1038/34675. PMID 9440695. S2CID 4429461.

[pmid11682605-13] Scott M, Bonnefin P, Vieyra D, Boisvert FM, Young D, Bazett-Jones DP, Riabowol K (říjen 2001). „UV-indukovaná vazba ING1 na PCNA reguluje indukci apoptózy“. Journal of Cell Science. 114 (Pt 19): 3455–62. PMID 11682605.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]