Strukturně specifický rozpoznávací protein 1 - Structure specific recognition protein 1

SSRP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4IFS
Identifikátory
Aliasy	SSRP1„FACT, FACT80, T160, strukturně specifický rozpoznávací protein 1
Externí ID	OMIM: 604328 MGI: 107912 HomoloGene: 110735 Genové karty: SSRP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	57,335,877 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	85,047,109 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba nukleosomů; • histonová vazba;
Buněčná složka	• jádro; • nukleoplazma; • chromozóm; • buněčné jádro; • nukleární chromatin; • FACT komplex;
Biologický proces	• replikace DNA; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Oprava DNA; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6749
	20833
	ENSG00000149136
	ENSMUSG00000027067
	Q08945
	Q08943
	NM_003146
	NM_001136081; NM_182990
	NP_003137
	NP_001129553; NP_892035
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

FACT komplexní podjednotka SSRP1 také známý jako strukturně specifický rozpoznávací protein 1 je protein že u lidí je kódován SSRP1 gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou heterodimeru, který spolu s SUPT16H tvoří faktor prodlužování transkripce chromatinu SKUTEČNOST. FACT interaguje specificky s histony H2A / H2B za účelem rozložení nukleosomů a prodloužení transkripce. FACT a DNA poškozená cisplatinou mohou být rozhodující pro protinádorový mechanismus cisplatiny. Tento kódovaný protein obsahuje a skupina s vysokou mobilitou rámeček, který s největší pravděpodobností představuje prvek rozpoznávající strukturu pro DNA modifikovanou cisplatinou. Tento protein také funguje jako koaktivátor transkripčního aktivátoru p63.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že strukturně specifický rozpoznávací protein 1 komunikovat s NEK9.^[6]SSRP1 dále interaguje s transkripčním aktivátorem p63.^[7] SSRP1 zvyšuje aktivitu p63 o plné délce, ale nemá žádný účinek na variantu p63 (DeltaN-p63) s deletovaným N-koncem.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000149136 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027067 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SSRP1 strukturně specifický rozpoznávací protein 1".
^ Tan BC, Lee SC (březen 2004). „Nek9, nový protein spojený s FACT, moduluje postup mezi fázemi“. J. Biol. Chem. 279 (10): 9321–30. doi:10,1074 / jbc.M311477200. PMID 14660563.
^ Zeng SX, Dai MS, Keller DM, Lu H (15. října 2002). „SSRP1 funguje jako koaktivátor transkripčního aktivátoru p63“. EMBO J.. 21 (20): 5487–97. doi:10.1093 / emboj / cdf540. PMC 129072. PMID 12374749.

Další čtení

Bruhn SL, Pil PM, Essigmann JM, Housman DE, Lippard SJ (1992). „Izolace a charakterizace lidských klonů cDNA kódujících boxový protein skupiny s vysokou mobilitou, který rozpoznává strukturální zkreslení DNA způsobená vazbou protinádorové látky cisplatiny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (6): 2307–11. Bibcode:1992PNAS ... 89,2307B. doi:10.1073 / pnas.89.6.2307. PMC 48646. PMID 1372440.
Toney JH, Donahue BA, Kellett PJ, Bruhn SL, Essigmann JM, Lippard SJ (1989). „Izolace cDNA kódujících lidský protein, který se selektivně váže na DNA modifikovanou protirakovinným léčivem cis-diamminedichloroplatina (II)“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (21): 8328–32. Bibcode:1989PNAS ... 86.8328T. doi:10.1073 / pnas.86.21.8328. PMC 298274. PMID 2530581.
Nagulapalli S, Pongubala JM, Atchison ML (1995). "Více proteinů fyzicky interaguje s PU.1. Transkripční synergie s NF-IL6 beta (C / EBP delta, CRP3)". J. Immunol. 155 (9): 4330–8. PMID 7594592.
Orphanides G, LeRoy G, Chang CH, Luse DS, Reinberg D (1998). „FAKT, faktor, který usnadňuje prodloužení transkriptu nukleosomy“. Buňka. 92 (1): 105–16. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80903-4. PMID 9489704. S2CID 11248520.
Dyer MA, Hayes PJ, Baron MH (1998). „Protein domény HMG SSRP1 / PREIIBF se podílí na aktivaci lidského embryonálního beta-podobného globinového genu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2617–28. doi:10.1128 / MCB.18.5.2617. PMC 110641. PMID 9566881.
LeRoy G, Orphanides G, Lane WS, Reinberg D (1998). "Požadavek RSF a FACT na transkripci templátů chromatinu in vitro". Věda. 282 (5395): 1900–4. doi:10.1126 / science.282.5395.1900. PMID 9836642.
Kelley DE, Stokes DG, Perry RP (1999). "CHD1 interaguje s SSRP1 a pro správnou asociaci s chromatinem závisí jak na jeho chromodoméně, tak na její doméně podobné ATPázě / helikáze." Chromozom. 108 (1): 10–25. doi:10.1007 / s004120050347. PMID 10199952. S2CID 12945778.
Spencer JA, Baron MH, Olson EN (1999). „Kooperativní transkripční aktivace sérovým faktorem odezvy a proteinem SSRP1 s vysokou mobilitou“. J. Biol. Chem. 274 (22): 15686–93. doi:10.1074 / jbc.274.22.15686. PMID 10336466.
Orphanides G, Wu WH, Lane WS, Hampsey M, Reinberg D (1999). „Faktor chromatinu specifického transkripčního elongačního faktoru FACT zahrnuje lidské proteiny SPT16 a SSRP1“. Příroda. 400 (6741): 284–8. Bibcode:1999 Natur.400..284O. doi:10.1038/22350. PMID 10421373. S2CID 4300397.
Wada T, Orphanides G, Hasegawa J, Kim DK, Shima D, Yamaguchi Y, Fukuda A, Hisatake K, Oh S, Reinberg D, Handa H (2000). „FACT zmírňuje inhibici transkripčního prodloužení zprostředkovanou DSIF / NELF a odhaluje funkční rozdíly mezi P-TEFb a TFIIH.“ Mol. Buňka. 5 (6): 1067–72. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80272-5. PMID 10912001.
Keller DM, Zeng X, Wang Y, Zhang QH, Kapoor M, Shu H, Goodman R, Lozano G, Zhao Y, Lu H (2001). „Komplex kinázy p53 serin 392 kinázy indukovaný poškozením DNA obsahuje CK2, hSpt16 a SSRP1“. Mol. Buňka. 7 (2): 283–92. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00176-9. PMID 11239457.
Yarnell AT, Oh S, Reinberg D, Lippard SJ (2001). „Interakce FACT, SSRP1 a domény skupiny s vysokou mobilitou (HMG) SSRP1 s DNA poškozenou protinádorovým léčivem cisplatinou“. J. Biol. Chem. 276 (28): 25736–41. doi:10,1074 / jbc.M101208200. PMID 11344167.
Santoro P, De Andrea M, Migliaretti G, Trapani C, Landolfo S, Gariglio M (2002). „Vysoká prevalence autoprotilátek proti proteinu SSRP1 skupiny nukleární vysoké mobility (HMG) v séru od pacientů se systémovým lupus erythematodes, ale nikoli s jinými revmatickými chorobami“. J. Rheumatol. 29 (1): 90–3. PMID 11824977.
Roig J, Mikhailov A, Belham C, Avruch J (2002). „Nercc1, savčí kináza rodiny NIMA, váže Ran GTPázu a reguluje mitotickou progresi“. Genes Dev. 16 (13): 1640–58. doi:10,1101 / gad. 972202. PMC 186374. PMID 12101123.
Zeng SX, Dai MS, Keller DM, Lu H (2002). „SSRP1 funguje jako koaktivátor transkripčního aktivátoru p63“. EMBO J.. 21 (20): 5487–97. doi:10.1093 / emboj / cdf540. PMC 129072. PMID 12374749.
Keller DM, Lu H (2003). „fosforylace serinu 392 p53 se zvyšuje po UV záření indukcí montáže komplexu CK2.hSPT16.SSRP1“. J. Biol. Chem. 277 (51): 50206–13. doi:10,1074 / jbc.M209820200. PMID 12393879.
Belotserkovskaya R, Oh S, Bondarenko VA, Orphanides G, Studitsky VM, Reinberg D (2003). „FACT usnadňuje transkripci závislou změnu nukleosomu“. Věda. 301 (5636): 1090–3. Bibcode:2003Sci ... 301.1090B. doi:10.1126 / science.1085703. PMID 12934006. S2CID 26667338.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Tan BC, Lee SC (2004). „Nek9, nový protein spojený s FACT, moduluje postup mezi fázemi“. J. Biol. Chem. 279 (10): 9321–30. doi:10,1074 / jbc.M311477200. PMID 14660563.

externí odkazy

SSRP1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000149136 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027067 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: SSRP1 strukturně specifický rozpoznávací protein 1".

[pmid14660563-6] Tan BC, Lee SC (březen 2004). „Nek9, nový protein spojený s FACT, moduluje postup mezi fázemi“. J. Biol. Chem. 279 (10): 9321–30. doi:10,1074 / jbc.M311477200. PMID 14660563.

[pmid12374749-7] Zeng SX, Dai MS, Keller DM, Lu H (15. října 2002). „SSRP1 funguje jako koaktivátor transkripčního aktivátoru p63“. EMBO J.. 21 (20): 5487–97. doi:10.1093 / emboj / cdf540. PMC 129072. PMID 12374749.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]