HOXB13 - HOXB13

HOXB13
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2CRA
Identifikátory
Aliasy	HOXB13, PSGD, homeobox B13, HPC9
Externí ID	OMIM: 604607 MGI: 107730 HomoloGene: 4640 Genové karty: HOXB13
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	48,729,178 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba methyl-CpG;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma;
Biologický proces	• reakce na testosteron; • morfogeneze epitelu; • vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace růstu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • reakce na zranění; • arborizace epitelu prostaty zapojená do morfogeneze prostaty glandulární acinus; • angiogeneze; • transkripce, chráněná DNA; • zrání epiteliálních buněk účastnící se vývoje prostaty; • vývoj epidermis; • vývoj prostaty; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10481
	15408
	ENSG00000159184
	ENSMUSG00000049604
	Q92826
	P70321
	NM_006361
	NM_008267
	NP_006352
	NP_032293
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-B13 je protein že u lidí je kódován HOXB13 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje transkripční faktor, který patří do rodiny genů homeoboxu. Geny této rodiny jsou mezi obratlovci vysoce konzervované a nezbytné pro embryonální vývoj obratlovců. Tento gen se podílí na vývoji kůže plodu a regeneraci kůže. U myší bylo prokázáno, že podobný gen vykazuje časovou a prostorovou kolinearitu v hlavní ose těla embrya, ale nebyl exprimován v sekundárních osách, což naznačuje funkce ve vzorcích těla podél osy. Tento gen a další geny HOXB tvoří genový shluk na chromozomu 17 v oblasti 17q21-22.^[6]Muži, kteří zdědí vzácnou (<0,1% u vybrané skupiny pacientů bez klinických příznaků rakoviny prostaty) genetickou variantu v HOXB13 (G84E nebo rs138213197), mají 10–20krát zvýšené riziko rakoviny prostaty.^[7]

Viz také

Homeobox

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159184 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zeltser L, Desplan C, Heintz N (srpen 1996). „Hoxb-13: nový gen Hox ve vzdálené oblasti klastru HOXB udržuje kolinearitu“. Rozvoj. 122 (8): 2475–84. PMID 8756292.
^ Stelnicki EJ, Arbeit J, Cass DL, Saner C, Harrison M, Largman C (červenec 1998). "Modulace lidských homeoboxových genů PRX-2 a HOXB13 v jizvách plodu bez jizev". The Journal of Investigative Dermatology. 111 (1): 57–63. doi:10.1046 / j.1523-1747.1998.00238.x. PMID 9665387.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXB13 homeobox B13“.
^ Ewing CM, Ray AM, Lange EM, Zuhlke KA, Robbins CM, Tembe WD, Wiley KE, Isaacs SD, Johng D, Wang Y, Bizon C, Yan G, Gielzak M, Partin AW, Shanmugam V, Izatt T, Sinari S „Craig DW, Zheng SL, Walsh PC, Montie JE, Xu J, Carpten JD, Isaacs WB, Cooney KA (leden 2012). „Mutace germline u HOXB13 a riziko rakoviny prostaty“. The New England Journal of Medicine. 366 (2): 141–9. doi:10.1056 / NEJMoa1110000. PMC 3779870. PMID 22236224.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Shen WF, Montgomery JC, Rozenfeld S, Moskow JJ, Lawrence HJ, Buchberg AM, Largman C (listopad 1997). „Proteiny Hox podobné AbdB stabilizují vazbu DNA proteiny homeodomény Meis1“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (11): 6448–58. doi:10.1128 / MCB.17.11.6448. PMC 232497. PMID 9343407.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (únor 2002). "Kompletní panel pro analýzu mutací 39 lidských genů HOX". Teratologie. 65 (2): 50–62. doi:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Kömüves LG, Ma XK, Stelnicki E, Rozenfeld S, Oda Y, Largman C (červen 2003). „Homeodoménový protein HOXB13 je cytoplazmatický během vývoje kůže plodu“. Dynamika vývoje. 227 (2): 192–202. doi:10.1002 / dvdy.10290. PMID 12761847. S2CID 42243036.
Jung C, Kim RS, Lee SJ, Wang C, Jeng MH (květen 2004). „Homeodoménový protein HOXB13 potlačuje růst buněk rakoviny prostaty negativní regulací faktoru T-buněk 4“. Výzkum rakoviny. 64 (9): 3046–51. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-2614. PMID 15126340.
Jung C, Kim RS, Zhang HJ, Lee SJ, Jeng MH (prosinec 2004). „HOXB13 indukuje potlačení růstu buněk rakoviny prostaty jako represor signalizace androgenního receptoru aktivovaného hormony“. Výzkum rakoviny. 64 (24): 9185–92. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-1330. PMID 15604291.
Zhao Y, Yamashita T, Ishikawa M (duben 2005). „Regulace invaze nádoru genem HOXB13 nadměrně exprimovaným u lidské rakoviny endometria“. Zprávy o onkologii. 13 (4): 721–6. doi:10.3892 / nebo 13.4.721. PMID 15756448.
Jung C, Kim RS, Zhang H, Lee SJ, Sheng H, Loehrer PJ, Gardner TA, Jeng MH, Kao C (červen 2005). „HOXB13 je downregulován u kolorektálního karcinomu, aby zajistil transaktivaci zprostředkovanou TCF4“. British Journal of Cancer. 92 (12): 2233–9. doi:10.1038 / sj.bjc.6602631. PMC 2361828. PMID 15928669.
Symmans WF (duben 2006). „Genomické testování citlivosti rakoviny prsu na hormonální terapii“. Klinický výzkum rakoviny. 12 (7 Pt 1): 1954–5. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0289. PMID 16609001.
Goetz MP, Suman VJ, Ingle JN, Nibbe AM, Visscher DW, Reynolds CA, Lingle WL, Erlander M, Ma XJ, Sgroi DC, Perez EA, Couch FJ (duben 2006). „Poměr exprese dvou genů homeoboxu 13 a receptoru interleukinu-17B pro predikci recidivy a přežití u žen užívajících adjuvantní tamoxifen“. Klinický výzkum rakoviny. 12 (7 Pt 1): 2080–7. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-1263. PMID 16609019.
Cazal C, Sobral AP, de Almeida FC, das Graças Silva-Valenzuela M, MD Durazzo, Nunes FD (červenec 2006). „Homeobox HOXB13 je exprimován v lidské slinné žláze“. Orální nemoci. 12 (4): 424–7. doi:10.1111 / j.1601-0825.2005.01218.x. PMID 16792730.
Ma XJ, Hilsenbeck SG, Wang W, Ding L, Sgroi DC, Bender RA, Osborne CK, Allred DC, Erlander MG (říjen 2006). „Index exprese HOXB13: IL17BR je prognostický faktor v časném stadiu rakoviny prsu“. Journal of Clinical Oncology. 24 (28): 4611–9. doi:10.1200 / JCO.2006.06.6944. PMID 17008703.
Muthusamy V, Duraisamy S, Bradbury CM, Hobbs C, Curley DP, Nelson B, Bosenberg M (prosinec 2006). "Epigenetické umlčení nových nádorových supresorů u maligního melanomu". Výzkum rakoviny. 66 (23): 11187–93. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-1274. PMID 17145863.
Miao J, Wang Z, Provencher H, Muir B, Dahiya S, Carney E, Leong CO, Sgroi DC, Orsulic S (říjen 2007). „HOXB13 podporuje progresi rakoviny vaječníků“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (43): 17093–8. Bibcode:2007PNAS..10417093M. doi:10.1073 / pnas.0707938104. PMC 2040435. PMID 17942676.
Ewing CM, Ray AM, Lange EM, Zuhlke KA, Robbins CM, Tembe WD, Wiley KE, Isaacs SD, Johng D, Wang Y, Bizon C, Yan G, Gielzak M, Partin AW, Shanmugam V, Izatt T, Sinari S „Craig DW, Zheng SL, Walsh PC, Montie JE, Xu J, Carpten JD, Isaacs WB, Cooney KA (leden 2012). „Mutace germline u HOXB13 a riziko rakoviny prostaty“. The New England Journal of Medicine. 366 (2): 141–9. doi:10.1056 / NEJMoa1110000. PMC 3779870. PMID 22236224.

externí odkazy

HOXB13 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q92826 (Homeobox protein Hox-B13) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159184 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8756292-4] Zeltser L, Desplan C, Heintz N (srpen 1996). „Hoxb-13: nový gen Hox ve vzdálené oblasti klastru HOXB udržuje kolinearitu“. Rozvoj. 122 (8): 2475–84. PMID 8756292.

[pmid9665387-5] Stelnicki EJ, Arbeit J, Cass DL, Saner C, Harrison M, Largman C (červenec 1998). "Modulace lidských homeoboxových genů PRX-2 a HOXB13 v jizvách plodu bez jizev". The Journal of Investigative Dermatology. 111 (1): 57–63. doi:10.1046 / j.1523-1747.1998.00238.x. PMID 9665387.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HOXB13 homeobox B13“.

[pmid22236224-7] Ewing CM, Ray AM, Lange EM, Zuhlke KA, Robbins CM, Tembe WD, Wiley KE, Isaacs SD, Johng D, Wang Y, Bizon C, Yan G, Gielzak M, Partin AW, Shanmugam V, Izatt T, Sinari S „Craig DW, Zheng SL, Walsh PC, Montie JE, Xu J, Carpten JD, Isaacs WB, Cooney KA (leden 2012). „Mutace germline u HOXB13 a riziko rakoviny prostaty“. The New England Journal of Medicine. 366 (2): 141–9. doi:10.1056 / NEJMoa1110000. PMC 3779870. PMID 22236224.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]