SIM1 - SIM1

SIM1
Identifikátory
AliasySIM1, bHLHe14, single-minded family bHLH transkripční faktor 1, SIM bHLH transkripční faktor 1
Externí IDOMIM: 603128 MGI: 98306 HomoloGene: 3715 Genové karty: SIM1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomické umístění pro SIM1
Genomické umístění pro SIM1
Kapela6q16.3Start100,385,015 bp[1]
Konec100,464,929 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SIM1 206876 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6492

20464

Ensembl

ENSG00000112246

ENSMUSG00000019913

UniProt

P81133

Q61045

RefSeq (mRNA)

NM_005068
NM_001374769

NM_011376

RefSeq (protein)

NP_005059
NP_001361698

NP_035506

Místo (UCSC)Chr 6: 100,39 - 100,46 MbChr 10: 50,89 - 50,99 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Jednomyslný homolog 1 také známý jako třída E základní protein helix-smyčka-helix 14 (bHLHe14) je a protein že u lidí je kódován SIM1 gen.[5][6][7]

Funkce

SIM1 a SIM2 geny jsou homology Drosophila melanogaster single-minded (sim), tak pojmenovaný protože buňky ve středové linii sim mutantního embrya se nedokážou správně vyvinout a nakonec zemřít, a tedy spárované podélné axonové svazky, přední a zadní osa embrya (analogicky s míchou embrya) se zhroutí do „jediného“ rudimentárního axonového svazku ve střední linii. Sim je základní šroubovice-smyčka-šroubovice -PAS doména transkripční faktor který reguluje genovou expresi v buňkách střední linie. Vzhledem k tomu, že gen sim hraje důležitou roli ve vývoji Drosophila a má maximální hladiny exprese během období neurogeneze, bylo navrženo, že lidský gen SIM2, který se nachází v kritické oblasti chromozomu 21, je kandidátem na účast v určitých dysmorfních vlastnostech (zejména charakteristikách obličeje a lebky), abnormalitách vývoje mozku a / nebo mentální retardaci Downův syndrom.[7]

Klinický význam

Štěstí nedostatek Bylo prokázáno, že SIM1 způsobuje závažnou obezitu s časným nástupem u lidské dívky s de novo vyváženou translokací mezi chromozomy 1p22.1 a 6q16.2 [8] a bylo navrženo, že způsobí Prader-Williho podobný fenotyp v jiných případech.[9] Studie na myších navíc ukázaly, že haploinsufficieny Sim1 způsobuje obezitu, která je způsobena hyperfágie a nereagují správně na zvýšený obsah tuku v potravě.[6][10] Nadměrná exprese SIM1 chrání před obezitou vyvolanou stravou a zachraňuje hyperfágii aguti žlutých myší,[11] kteří narušili melanokortin signalizace. Obezita a hyperfágie mohou být zprostředkovány zhoršenou aktivací melanokortinu PVN neurony [12] a oxytocin nedostatek těchto myší.[13] Bylo prokázáno, že modulace hladin Sim1 postnatálně také vede k hyperfágii a obezitě,[14][15] což naznačuje fyziologickou roli Sim1 oddělenou od jeho role ve vývoji.

Interakce

SIM1 bylo prokázáno komunikovat s Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor.[16][17]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112246 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019913 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Chrast R, Scott HS, Chen H, Kudoh J, Rossier C, Minoshima S, Wang Y, Shimizu N, Antonarakis SE (červen 1997). „Klonování dvou lidských homologů jednomyslného genu Drosophila SIM1 na chromozomu 6q a SIM2 na 21q v chromozomální oblasti Downova syndromu“. Výzkum genomu. 7 (6): 615–24. doi:10,1101 / gr. 7.6.615. PMC  310662. PMID  9199934.
  6. ^ A b Michaud JL, Boucher F, Melnyk A, Gauthier F, Goshu E, Lévy E, Mitchell GA, Himms-Hagen J, Fan CM (červenec 2001). „Simlo haploinsufficiency způsobuje hyperfágii, obezitu a redukci paraventrikulárního jádra hypotalamu“. Lidská molekulární genetika. 10 (14): 1465–73. doi:10,1093 / hmg / 10,14,1465. PMID  11448938.
  7. ^ A b „Entrez Gene: SIM1 single-minded homolog 1 (Drosophila)“.
  8. ^ Držitel JL, Butte NF, Zinn AR (leden 2000). „Hluboká obezita spojená s vyváženou translokací, která narušuje gen SIM1“. Lidská molekulární genetika. 9 (1): 101–8. doi:10,1093 / hmg / 9.1.101. PMID  10587584.
  9. ^ Faivre L, Cormier-Daire V, Lapierre JM, Colleaux L, Jacquemont S, Geneviéve D, Saunier P, Munnich A, Turleau C, Romana S, Prieur M, De Blois MC, Vekemans M (srpen 2002). „Odstranění genu SIM1 (6q16.2) u pacienta s fenotypem podobným Prader-Williho“. Journal of Medical Genetics. 39 (8): 594–6. doi:10,1136 / jmg. 39,8,594. PMC  1735217. PMID  12161602.
  10. ^ Držitel JL, Zhang L, Kublaoui BM, DiLeone RJ, Oz OK, Bair CH, Lee YH, Zinn AR (červenec 2004). „Dávka genu Sim1 moduluje reakci homeostatického krmení na zvýšený obsah tuku u myší“. American Journal of Physiology. Endokrinologie a metabolismus. 287 (1): E105-13. doi:10.1152 / ajpendo.00446.2003. PMID  14982752.
  11. ^ Kublaoui BM, Holder JL, Tolson KP, Gemelli T, Zinn AR (říjen 2006). „Nadměrná exprese SIM1 částečně zachraňuje aguti žlutou a dietou vyvolanou obezitu normalizací příjmu potravy“. Endokrinologie. 147 (10): 4542–9. doi:10.1210 / en.2006-0453. PMID  16709610.
  12. ^ Kublaoui BM, Holder JL, Gemelli T, Zinn AR (říjen 2006). „Simlo haploinsufficiency zhoršuje melanokortinem zprostředkovanou anorexii a aktivaci neuronů paraventrikulárního jádra“. Molekulární endokrinologie. 20 (10): 2483–92. doi:10.1210 / me.2005-0483. PMID  16728530.
  13. ^ Kublaoui BM, Gemelli T, Tolson KP, Wang Y, Zinn AR (červenec 2008). "Nedostatek oxytocinu zprostředkovává hyperfágovou obezitu myší Sim1 s nedostatkem haploins". Molekulární endokrinologie. 22 (7): 1723–34. doi:10.1210 / me.2008-0067. PMC  2453606. PMID  18451093.
  14. ^ Tolson KP, Gemelli T, Gautron L, Elmquist JK, Zinn AR, Kublaoui BM (březen 2010). „Postnatální nedostatek Sim1 způsobuje hyperfagickou obezitu a sníženou expresi Mc4r a oxytocinu“. The Journal of Neuroscience. 30 (10): 3803–12. doi:10.1523 / JNEUROSCI.5444-09.2010. PMC  3285557. PMID  20220015.
  15. ^ Yang C, Gagnon D, Vachon P, Tremblay A, Levy E, Massie B, Michaud JL (červen 2006). „Adenovirem zprostředkovaná modulace exprese Sim1 v paraventrikulárním jádru ovlivňuje příjem potravy“. The Journal of Neuroscience. 26 (26): 7116–20. doi:10.1523 / JNEUROSCI.0672-06.2006. PMC  6673926. PMID  16807340.
  16. ^ Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (únor 1997). „Dva myší homology jednomyslného proteinu Drosophila, které interagují s nukleárním translokátorovým proteinem myšího arylového uhlovodíkového receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (7): 4451–7. doi:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID  9020169.
  17. ^ Woods SL, Whitelaw ML (březen 2002). „Diferenciální aktivity myší single minded 1 (SIM1) a SIM2 na prvku hypoxické odpovědi. Cross-talk mezi základními transkripčními faktory homologie helix-loop-helix / per-Arnt-Sim“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (12): 10236–43. doi:10,1074 / jbc.M110752200. PMID  11782478.

Další čtení