ATF5 - ATF5 - Wikipedia

ATF5
Identifikátory
Aliasy	ATF5, ATFX, HMFN0395, aktivující transkripční faktor 5
Externí ID	OMIM: 606398 MGI: 2141857 HomoloGene: 32142 Genové karty: ATF5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	49,933,935 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	44,816,658 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • tubulinová vazba; • vazba kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• centrosome; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • cytoskelet; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace buněčného cyklu G2 / M fázový přechod; • regulace transkripce, DNA-šablony; • čichová cibule interneuronová diferenciace; • růst mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace apoptotického procesu; • post-embryonální vývoj; • transkripce, chráněná DNA; • proliferace prekurzorů cerebelárních granulárních buněk; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace cyklu centrosomu; • cirkadiánní rytmus; • vývoj interneuronu čichové žárovky; • regulace genové exprese; • vývoj čichového laloku; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • diferenciace tukových buněk; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace buněčné proliferace; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	22809
	107503
	ENSG00000169136
	ENSMUSG00000038539
	Q9Y2D1
	O70191
	NM_001193646; NM_001290746; NM_012068
	NM_030693
	NP_001180575; NP_001277675; NP_036200
	NP_109618
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivace transkripčního faktoru 5, také známý jako ATF5, je protein který je u lidí kódován ATF5 gen.^[5]

Funkce

Nejprve popsali Nishizawa a Nagata,^[6] ATF5 byl klasifikován jako člen aktivačního transkripčního faktoru (ATF ) / cAMP protein vázající se na prvek odezvy (CREB ) rodina.^[7]^[8]

Transkripty a protein ATF5 jsou exprimovány v široké škále tkání, zejména ve vysoké expresi transkriptů v játrech. Je také přítomen v různých typech nádorových buněk.

Exprese ATF5 je regulována jak na transkripční, tak na translační úrovni.

ATF5 je během vývoje mozku vyjádřen ve VZ a SVZ.

Lidský protein ATF5 je tvořen 282 aminokyselinami.

ATF5 je transkripční faktor, který obsahuje doménu bZip.

Viz také

Aktivující transkripční faktor

Interakce

Bylo prokázáno, že ATF5 komunikovat s DISC1^[9] a TRIB3.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169136 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038539 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ATF5 aktivující transkripční faktor 5“.
^ Pati D, Meistrich ML, Plon SE (červenec 1999). „Lidské enzymy konjugující s ubikvitinem Cdc34 a Rad6B cílí na represory cyklické transkripce indukované AMP pro proteolýzu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 5001–13. doi:10,1128 / mcb.19.7.5001. PMC 84326. PMID 10373550.
^ Hai T, Hartman MG (červenec 2001). „Molekulární biologie a názvosloví vazebné rodiny transkripčních faktorů reagujících na transkripční faktor / cAMP: aktivující proteiny transkripčního faktoru a homeostáza“. Gen. 273 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00551-0. PMID 11483355.
^ Vinson C, Myakishev M, Acharya A, Mir AA, Moll JR, Bonovich M (září 2002). "Klasifikace lidských proteinů B-ZIP na základě dimerizačních vlastností". Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6321–6335. doi:10.1128 / MCB.22.18.6321-6335.2002. PMC 135624. PMID 12192032.
^ Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–1608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
^ Zhou Y, Li L, Liu Q, Xing G, Kuai X, Sun J, Yin X, Wang J, Zhang L, He F (květen 2008). „E3 ubikvitinová ligáza SIAH1 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci TRB3“. Buňka. Signál. 20 (5): 942–948. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. PMID 18276110.

Další čtení

Pati D, Meistrich ML, Plon SE (1999). „Lidské enzymy konjugující s ubikvitinem Cdc34 a Rad6B cílí na represory cyklické transkripce indukované AMP pro proteolýzu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 5001–13. doi:10,1128 / mcb.19.7.5001. PMC 84326. PMID 10373550.
White JH, McIllhinney RA, Wise A, Ciruela F, Chan WY, Emson PC, Billinton A, Marshall FH (2001). „Receptor GABAB interaguje přímo se souvisejícími transkripčními faktory CREB2 a ATFx“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (25): 13967–13972. doi:10.1073 / pnas.240452197. PMC 17684. PMID 11087824.
Peters CS, Liang X, Li S, Kannan S, Peng Y, Taub R, Diamond RH (2001). „ATF-7, nový protein bZIP, interaguje s proteinem PRL-1-tyrosin fosfatáza“. J. Biol. Chem. 276 (17): 13718–26. doi:10,1074 / jbc.M011562200. PMID 11278933.
Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (2004). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–1608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.
Yamada S, Ohira M, Horie H, Ando K, Takayasu H, Suzuki Y, Sugano S, Hirata T, Goto T, Matsunaga T, Hiyama E, Hayashi Y, Ando H, Suita S, Kaneko M, Sasaki F, Hashizume K Ohnuma N, Nakagawara A (2004). „Profily exprese a diferenciální screening mezi hepatoblastomy a odpovídajícími normálními játry: identifikace vysoké exprese onkogenu PLK1 jako špatně prognostického indikátoru hepatoblastomů“. Onkogen. 23 (35): 5901–5911. doi:10.1038 / sj.onc.1207782. PMID 15221005.
Liu W, Sun M, Jiang J, Shen X, Sun Q, Liu W, Shen H, Gu J (2004). „Cyklin D3 interaguje s lidským aktivačním transkripčním faktorem 5 a potencuje jeho transkripční aktivitu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (4): 954–960. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.07.053. PMID 15358120.
Forgacs E, Gupta SK, Kerry JA, Semmes OJ (2005). „Transkripční faktor bZIP ATFx váže daň z viru lidské leukémie T-buněk typu 1 (HTLV-1) a potlačuje transkripci zprostředkovanou dlouhým terminálním opakováním HTLV-1“. J. Virol. 79 (11): 6932–6939. doi:10.1128 / JVI.79.11.6932-6939.2005. PMC 1112100. PMID 15890932.
Al Sarraj J, Vinson C, Thiel G (2005). "Regulace transkripce genu asparagin syntetázy pomocí transkripčních faktorů leucinového zipu základní oblasti ATF5 a CHOP". Biol. Chem. 386 (9): 873–879. doi:10.1515 / BC.2005.102. PMID 16164412. S2CID 24061972.
Angelastro JM, Canoll PD, Kuo J, Weicker M, Costa A, Bruce JN, Greene LA (2006). „Selektivní destrukce buněk glioblastomu interferencí s aktivitou nebo expresí ATF5“. Onkogen. 25 (6): 907–916. doi:10.1038 / sj.onc.1209116. PMID 16170340.
Wei Y, Jiang J, Sun M, Chen X, Wang H, Gu J (2006). „ATF5 zvyšuje apoptózu vyvolanou cisplatinou zvýšenou regulací transkripce cyklinu D3 v buňkách HeLa“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339 (2): 591–596. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.11.054. PMID 16300731.
Kakiuchi C, Ishiwata M, Nanko S, Kunugi H, Minabe Y, Nakamura K, Mori N, Fujii K, Yamada K, Yoshikawa T, Kato T (2007). „Asociační analýza ATF4 a ATF5, genů pro interagující proteiny DISC1, u bipolární poruchy“. Neurosci. Lett. 417 (3): 316–321. doi:10.1016 / j.neulet.2007.02.054. PMID 17346882. S2CID 7488805.
Watatani Y, Ichikawa K, Nakanishi N, Fujimoto M, Takeda H, Kimura N, Hirose H, Takahashi S, Takahashi Y (2008). „Stresem indukovaná translace mRNA ATF5 je regulována 5'-nepřekládanou oblastí“. J. Biol. Chem. 283 (5): 2543–2553. doi:10,1074 / jbc.M707781200. PMID 18055463.

externí odkazy

ATF5 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ATF5 umístění genomu a ATF5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169136 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038539 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: ATF5 aktivující transkripční faktor 5“.

[pmid10373550-6] Pati D, Meistrich ML, Plon SE (červenec 1999). „Lidské enzymy konjugující s ubikvitinem Cdc34 a Rad6B cílí na represory cyklické transkripce indukované AMP pro proteolýzu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 5001–13. doi:10,1128 / mcb.19.7.5001. PMC 84326. PMID 10373550.

[pmid11483355-7] Hai T, Hartman MG (červenec 2001). „Molekulární biologie a názvosloví vazebné rodiny transkripčních faktorů reagujících na transkripční faktor / cAMP: aktivující proteiny transkripčního faktoru a homeostáza“. Gen. 273 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00551-0. PMID 11483355.

[pmid12192032-8] Vinson C, Myakishev M, Acharya A, Mir AA, Moll JR, Bonovich M (září 2002). "Klasifikace lidských proteinů B-ZIP na základě dimerizačních vlastností". Mol. Buňka. Biol. 22 (18): 6321–6335. doi:10.1128 / MCB.22.18.6321-6335.2002. PMC 135624. PMID 12192032.

[pmid12812986-9] Morris JA, Kandpal G, Ma L, Austin CP (červenec 2003). „DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) je protein související s centrosomy, který interaguje s MAP1A, MIPT3, ATF4 / 5 a NUDEL: regulace a ztráta interakce s mutací“. Hučení. Mol. Genet. 12 (13): 1591–1608. doi:10,1093 / hmg / ddg162. PMID 12812986.

[pmid18276110-10] Zhou Y, Li L, Liu Q, Xing G, Kuai X, Sun J, Yin X, Wang J, Zhang L, He F (květen 2008). „E3 ubikvitinová ligáza SIAH1 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci TRB3“. Buňka. Signál. 20 (5): 942–948. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. PMID 18276110.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

Regulome
Inhibuje	NGF