CSDA (gen) - CSDA (gene)

YBX3
Identifikátory
Aliasy	YBX3, CSDA, CSDA1, DBPA, ZONAB, protein vázající Y-box 3
Externí ID	OMIM: 603437 MGI: 2137670 HomoloGene: 2708 Genové karty: YBX3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	10,723,323 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	131,388,476 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • mRNA 3'-UTR vazba; • jednořetězcová vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba Rho GTPázy; • dvouřetězcová vazba DNA; • Vazba RNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • polysomová vazba;
Buněčná složka	• polysome; • dvoubuněčný těsný spoj; • perinukleární oblast cytoplazmy; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• vývoj mužských pohlavních žláz; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na osmotický stres; • negativní regulace nekroptotického procesu; • pozitivní regulace cytoplazmatického překladu; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • pozitivní regulace růstu orgánů; • negativní regulace apoptotického procesu; • v embryonálním vývoji dělohy; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná hyperosmotická odpověď; • negativní regulace vývoje tkáně kosterního svalstva; • spermatogeneze; • reakce na chlad; • oplodnění; • Stabilizace mRNA zprostředkovaná 3'-UTR;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8531
	56449
	ENSG00000060138
	ENSMUSG00000030189
	P16989
	Q9JKB3
	NM_001145426; NM_003651
	NM_011733; NM_139117
	NP_001138898; NP_003642
	NP_035863; NP_620817
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající DNA je protein že u lidí je kódován CSDA gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000060138 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030189 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sakura H, Maekawa T, Imamoto F, Yasuda K, Ishii S (červen 1989). „Dva lidské geny izolované novou metodou kódují proteiny vázající DNA obsahující společnou oblast homologie“. Gen. 73 (2): 499–507. doi:10.1016/0378-1119(88)90514-8. PMID 2977358.
^ Coles LS, Diamond P, Occhiodoro F, Vadas MA, Shannon MF (září 1996). „Proteiny domény studeného šoku potlačují transkripci z promotoru GM-CSF“. Nucleic Acids Res. 24 (12): 2311–7. doi:10.1093 / nar / 24.12.2311. PMC 145951. PMID 8710501.
^ „Entrez Gene: protein CSDA se studeným šokem v doméně A“.

Další čtení

Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). "Represní mechanismy I-A beta genu hlavního histokompatibilního komplexu". Imunobiologie. 198 (1–3): 249–63. doi:10.1016 / s0171-2985 (97) 80045-9. PMID 9442396.
Kudo S, Mattei MG, Fukuda M (1995). "Charakterizace genu pro dbpA, člena rodiny proteinů vázajících nukleové kyseliny, které obsahují doménu šokového chladu". Eur. J. Biochem. 231 (1): 72–82. doi:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20672.x. PMID 7628487.
Funke B, Zuleger B, Benavente R a kol. (1996). „Myší protein vázající poly (C) existuje ve více izoformách a interaguje s několika proteiny vázajícími RNA“. Nucleic Acids Res. 24 (19): 3821–8. doi:10.1093 / nar / 24.19.3821. PMC 146158. PMID 8871564.
Weinmann AS, Yan PS, Oberley MJ a kol. (2002). „Izolace cílů lidského transkripčního faktoru spojením imunoprecipitace chromatinu a analýzy mikročipů ostrova CpG“. Genes Dev. 16 (2): 235–44. doi:10,1101 / gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066.
Hayashi J, Kajino K, Umeda T a kol. (2003). "Somatická mutace a SNP v promotoru dbpA a lidské hepatocarcinogenesis". Int. J. Oncol. 21 (4): 847–50. doi:10,3892 / ijo.21.4.847. PMID 12239625.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Coles LS, Bartley MA, Bert A a kol. (2004). „Na mRNA vaskulárního endoteliálního růstového faktoru se tvoří multiproteinový komplex obsahující doménu chladného šoku (Y-box) a proteiny vázající polypyrimidinový trakt. Potenciální role při stabilizaci mRNA“. Eur. J. Biochem. 271 (3): 648–60. doi:10.1111 / j.1432-1033.2003.03968.x. PMID 14728692.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Frankel P, Aronheim A, Kavanagh E a kol. (2005). „RalA interaguje se ZONAB způsobem závislým na hustotě buněk a reguluje jeho transkripční aktivitu“. EMBO J.. 24 (1): 54–62. doi:10.1038 / sj.emboj.7600497. PMC 544910. PMID 15592429.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R a kol. (2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Nat. Metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Sourisseau T, Georgiadis A, Tsapara A a kol. (2006). „Regulace exprese PCNA a cyklinu D1 a morfogeneze epitelu transkripčním faktorem ZONAB / DbpA regulovaným ZO-1“. Mol. Buňka. Biol. 26 (6): 2387–98. doi:10.1128 / MCB.26.6.2387-2398.2006. PMC 1430269. PMID 16508013.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

externí odkazy

CSDA + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk YBX3 umístění genomu a YBX3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000060138 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030189 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2977358-5] Sakura H, Maekawa T, Imamoto F, Yasuda K, Ishii S (červen 1989). „Dva lidské geny izolované novou metodou kódují proteiny vázající DNA obsahující společnou oblast homologie“. Gen. 73 (2): 499–507. doi:10.1016/0378-1119(88)90514-8. PMID 2977358.

[pmid8710501-6] Coles LS, Diamond P, Occhiodoro F, Vadas MA, Shannon MF (září 1996). „Proteiny domény studeného šoku potlačují transkripci z promotoru GM-CSF“. Nucleic Acids Res. 24 (12): 2311–7. doi:10.1093 / nar / 24.12.2311. PMC 145951. PMID 8710501.

[entrez-7] „Entrez Gene: protein CSDA se studeným šokem v doméně A“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]