HIVEP1 - HIVEP1

HIVEP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1BBO, 4ZNF
Identifikátory
Aliasy	HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, vazebný protein pro zesilovač viru lidské imunodeficience typu I, protein 1, HIVEP zinkový prst 1
Externí ID	OMIM: 194540 MGI: 96100 HomoloGene: 1596 Genové karty: HIVEP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	12,164,999 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	42,192,537 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondrie; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • jaderné těleso;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • signální transdukce; • transkripce, chráněná DNA; • Signální dráha BMP; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3096
	110521
	ENSG00000095951
	ENSMUSG00000021366
	P15822
	Q03172
	NM_002114
	NM_007772
	NP_002105
	NP_031798
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem 40 je protein že u lidí je kódován HIVEP1 gen.^[5]^[6]

Členy rodiny ZAS, jako je ZAS1 (HIVEP1), jsou velké proteiny, které obsahují doménu ZAS, modulární proteinovou strukturu skládající se z páru zinkových prstů C2H2 s oblastí bohatou na kyselinu a sekvencí bohatou na serin / threonin. Tyto proteiny vážou specifické sekvence DNA, včetně motivu kappa-B (GGGACTTTCC), v promotorech a enhancerových oblastech několika genů a virů, včetně viru lidské imunodeficience (HIV). Geny ZAS pokrývají více než 150 kb a obsahují alespoň 10 exonů, z nichž jeden je delší než 5,5 kb (Allen a Wu, 2004). [Dodáno společností OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095951 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021366 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gaynor RB, Muchardt C, Diep A, Mohandas TK, Sparkes RS, Lusis AJ (červenec 1991). „Lokalizace proteinu HIV-EP1 / MBP-1 / PRDII-BF1 vázajícího DNA na zinkový prst na lidský chromozom 6p22.3-p24“. Genomika. 9 (4): 758–61. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90371-K. PMID 2037300.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIVEP1 virus lidské imunodeficience typu I enhancer vázající protein 1“.

Další čtení

Omichinski JG, Clore GM, Robien M a kol. (1992). "Struktura řešení s vysokým rozlišením dvojitého zinkového prstu Cys2His2 z lidského zesilovače vázajícího protein MBP-1". Biochemie. 31 (16): 3907–17. doi:10.1021 / bi00131a004. PMID 1567844.
Nakamura T, Donovan DM, Hamada K a kol. (1990). „Regulace myšího genu pro alfa-A-krystalin: izolace cDNA kódující protein, který se váže na motiv sekvence cis sdílený s hlavním genem třídy histokompatibility třídy I a dalšími geny“. Mol. Buňka. Biol. 10 (7): 3700–8. doi:10,1128 / mcb 10.7.3700. PMC 360816. PMID 1694016.
Muchardt C, Seeler JS, Nirula A a kol. (1992). „Regulace funkce zesilovače viru lidské imunodeficience pomocí genových produktů PRDII-BF1 a c-rel“. J. Virol. 66 (1): 244–50. doi:10.1128 / JVI.66.1.244-250.1992. PMC 238281. PMID 1727488.
Fan CM, Maniatis T (1990). „Protein vázající DNA obsahující dva široce oddělené motivy zinkového prstu, které rozpoznávají stejnou sekvenci DNA“. Genes Dev. 4 (1): 29–42. doi:10,1101 / gad. 4.1.19. PMID 2106471.
Baldwin AS, LeClair KP, Singh H, Sharp PA (1990). „Velký protein obsahující zinkové prstové domény se váže na příbuzné sekvenční prvky v zesilovačích hlavního histokompatibilního komplexu třídy I a genů kappa imunoglobulinu“. Mol. Buňka. Biol. 10 (4): 1406–14. doi:10.1128 / mcb.10.4.1406. PMC 362243. PMID 2108316.
Omichinski JG, Clore GM, Appella E a kol. (1991). "Vysoké rozlišení trojrozměrné struktury jediného zinkového prstu z lidského zesilovače vázajícího protein v roztoku". Biochemie. 29 (40): 9324–34. doi:10.1021 / bi00492a004. PMID 2248949.
Maekawa T, Sakura H, Sudo T, Ishii S (1989). „Předpokládaná kovová struktura prstu viru lidské imunodeficience typu 1 enhancer vázající protein HIV-EP1“. J. Biol. Chem. 264 (25): 14591–3. PMID 2504707.
Otsuka M, Fujita M, Aoki T a kol. (1995). „Nové chelátory zinku s dvojitou aktivitou při inhibici proteinů vázajících místo kappa B HIV-EP1 a NF-kappa B“. J. Med. Chem. 38 (17): 3264–70. doi:10.1021 / jm00017a011. PMID 7650680.
Seeler JS, Muchardt C, Suessle A, Gaynor RB (1994). „Transkripční faktor PRDII-BF1 aktivuje genovou expresi viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Virol. 68 (2): 1002–9. doi:10.1128 / JVI.68.2.1002-1009.1994. PMC 236538. PMID 8289330.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Wissmüller S, Kosian T, Wolf M a kol. (2006). „Doména skupiny Sox proteinů s vysokou mobilitou interaguje s doménami vázajícími DNA mnoha transkripčních faktorů“. Nucleic Acids Res. 34 (6): 1735–44. doi:10.1093 / nar / gkl105. PMC 1421504. PMID 16582099.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.

externí odkazy

HIVEP1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095951 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021366 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2037300-5] Gaynor RB, Muchardt C, Diep A, Mohandas TK, Sparkes RS, Lusis AJ (červenec 1991). „Lokalizace proteinu HIV-EP1 / MBP-1 / PRDII-BF1 vázajícího DNA na zinkový prst na lidský chromozom 6p22.3-p24“. Genomika. 9 (4): 758–61. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90371-K. PMID 2037300.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HIVEP1 virus lidské imunodeficience typu I enhancer vázající protein 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]