TFCP2 - TFCP2

TFCP2
Identifikátory
Aliasy	TFCP2, LBP1C, LSF, LSF1D, SEF, TFCP2C, transkripční faktor CP2
Externí ID	OMIM: 189889 MGI: 98509 HomoloGene: 4134 Genové karty: TFCP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	51,173,135 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	100,552,008 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001158 jádrový promotor vázání sekvenčně specifické DNA pro sekvenci proximální oblasti; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • cytosol; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce mRNA z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7024
	21422
	ENSG00000135457
	ENSMUSG00000009733
	Q12800
	Q9ERA0
	NM_005653; NM_001173452; NM_001173453
	NM_001289603; NM_033476; NM_001355497
	NP_001166923; NP_001166924; NP_005644
	NP_001276532; NP_258437; NP_001342426
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor transkripce alfa-globinu CP2 je protein že u lidí je kódován TFCP2 gen.^[5]^[6]

TFCP2 se také nazývá Pozdní faktor SV40 (LSF) a je indukován dobře známým onkogenem AEG-1.^[7] Pozdní faktor SV40 (LSF) působí také jako onkogen v hepatocelulární karcinom.^[8] Pozdní faktor SV40 (LSF) se zvyšuje angiogeneze transkripčně up-regulující matrix metaloproteinázou-9 (MMP9 ).^[9]

Spolu s jeho hlavním onkogen funkce v hepatocelulární karcinom (HCC) hraje mnohostrannou roli v chemorezistenci, epiteliálně-mezenchymální přechod (EMT), alergická reakce, zánět a Alzheimerova choroba.^[8]^[10] The malá molekula FQI1 (faktor 1 chinolinonový inhibitor) brání LSF ve vazbě na HCC DNA, což má za následek smrt buněk HCC.^[8]^[10]^[11]

Interakce

Bylo prokázáno, že TFCP2 komunikovat s APBB1^[12] a RNF2.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135457 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009733 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Swendeman SL, Spielholz C, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Sheffery M (duben 1994). "Charakterizace genomové struktury, umístění chromozomů, promotor a vývojová exprese alfa-globinového transkripčního faktoru CP2". The Journal of Biological Chemistry. 269 (15): 11663–71. PMID 8157699.
^ „Entrez Gene: TFCP2 transkripční faktor CP2“.
^ Yoo BK, Gredler R, Vozhilla N, Su ZZ, Chen D, Forcier T, Shah K, Saxena U, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (srpen 2009). "Identifikace genů propůjčujících rezistenci na 5-fluorouracil". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (31): 12938–43. Bibcode:2009PNAS..10612938Y. doi:10.1073 / pnas.0901451106. PMC 2722317. PMID 19622726.
^ ^A ^b ^C Yoo BK, Emdad L, Gredler R, Fuller C, Dumur CI, Jones KH, Jackson-Cook C, Su ZZ, Chen D, Saxena UH, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (květen 2010). „Transkripční faktor Pozdní SV40 faktor (LSF) funguje jako onkogen v hepatocelulárním karcinomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (18): 8357–62. Bibcode:2010PNAS..107,8357Y. doi:10.1073 / pnas.1000374107. PMC 2889542. PMID 20404171.
^ Santhekadur PK, Gredler R, Chen D, Siddiq A, Shen XN, Das SK, Emdad L, Fisher PB, Sarkar D (leden 2012). „Pozdní faktor SV40 (LSF) zvyšuje angiogenezi transkripčně up-regulující matrix metaloproteinázou-9 (MMP-9)“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (5): 3425–32. doi:10,1074 / jbc.M111.298976. PMC 3270996. PMID 22167195.
^ ^A ^b Santhekadur PK, Rajasekaran D, Siddiq A, Gredler R, Chen D, Schaus SC, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (2012). „Transkripční faktor LSF: nový onkogen pro hepatocelulární karcinom“ (PDF). Am J Cancer Res. 2 (3): 269–285. PMC 3365805. PMID 22679558.
^ Grant TJ, Bishop JA, Christadore LM, Barot G, Chin HG, Woodson S, Kavouris J, Siddiq A, Gredler R, Shen XN, Sherman J, Meehan T, Fitzgerald K, Pradhan S, Briggs LA, Andrews WH, Sarkar D , Schaus SE, Hansen U (březen 2012). „Antiproliferativní inhibitory transkripčního faktoru LSF s malou molekulou odhalují onkogenní závislost na LSF u hepatocelulárního karcinomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (12): 4503–8. Bibcode:2012PNAS..109,4503G. doi:10.1073 / pnas.1121601109. PMC 3311344. PMID 22396589. Shrnutí ležel – Vědecký kodex.
^ Zambrano N, Minopoli G, de Candia P, Russo T (srpen 1998). „Adaptérový protein Fe65 interaguje prostřednictvím své domény PID1 s transkripčním faktorem CP2 / LSF / LBP1“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20128–33. doi:10.1074 / jbc.273.32.20128. PMID 9685356.
^ Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (březen 2002). „Vazba proteinů RING polycomb na specifické cílové geny v komplexu s vývojovými transkripčními faktory typu grainyhead“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1936–46. doi:10.1128 / MCB.22.6.1936-1946.2002. PMC 135618. PMID 11865070.

Další čtení

Lim LC, Swendeman SL, Sheffery M (únor 1992). "Molekulární klonování alfa-globinového transkripčního faktoru CP2". Molekulární a buněčná biologie. 12 (2): 828–35. doi:10,1128 / mcb.12.2.828. PMC 364316. PMID 1732747.
Jane SM, Nienhuis AW, Cunningham JM (leden 1995). „Změna hemoglobinu u člověka a kuřat je zprostředkována heteromerním komplexem mezi všudypřítomným transkripčním faktorem CP2 a vývojově specifickým proteinem“. Časopis EMBO. 14 (1): 97–105. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06979.x. PMC 398056. PMID 7828600.
Shirra MK, Zhu Q, Huang HC, Pallas D, Hansen U (srpen 1994). „Jeden exon lidského genu LSF zahrnuje konzervované oblasti zapojené do nových motivů vázajících a dimerizujících DNA“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (8): 5076–87. doi:10,1128 / mcb.14.8.5076. PMC 359026. PMID 8035790.
Yoon JB, Li G, Roeder RG (březen 1994). "Charakterizace rodiny souvisejících buněčných transkripčních faktorů, které mohou modulovat transkripci viru lidské imunodeficience typu 1 in vitro". Molekulární a buněčná biologie. 14 (3): 1776–85. doi:10.1128 / mcb.14.3.1776. PMC 358535. PMID 8114710.
Margolis DM, Somasundaran M, Green MR (únor 1994). „Lidský transkripční faktor YY1 potlačuje transkripci viru lidské imunodeficience typu 1 a produkci virionů“. Journal of Virology. 68 (2): 905–10. doi:10.1128 / JVI.68.2.905-910.1994. PMC 236527. PMID 8289393.
Cunningham JM, Vanin EF, Tran N, Valentine M, Jane SM (listopad 1995). „Lidský transkripční faktor CP2 (TFCP2), součást lidského selektorového proteinu gama-globinového stádia, se mapuje na oblast chromozomu 12q13 a je do 250 kb od genu NF-E2.“ Genomika. 30 (2): 398–9. PMID 8586452.
Romerio F, Gabriel MN, Margolis DM (prosinec 1997). „Represe viru lidské imunodeficience typu 1 prostřednictvím nové spolupráce lidských faktorů YY1 a LSF“. Journal of Virology. 71 (12): 9375–82. doi:10.1128 / JVI.71.12.9375-9382.1997. PMC 230241. PMID 9371597.
Zambrano N, Minopoli G, de Candia P, Russo T (srpen 1998). „Adaptérový protein Fe65 interaguje prostřednictvím své domény PID1 s transkripčním faktorem CP2 / LSF / LBP1“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20128–33. doi:10.1074 / jbc.273.32.20128. PMID 9685356.
Bing Z, Reddy SA, Ren Y, Qin J, Liao WS (srpen 1999). "Čištění a charakterizace faktoru zesilovače amyloidu A3 v séru". The Journal of Biological Chemistry. 274 (35): 24649–56. doi:10.1074 / jbc.274.35.24649. PMID 10455131.
Coull JJ, Romerio F, Sun JM, Volker JL, Galvin KM, Davie JR, Shi Y, Hansen U, Margolis DM (srpen 2000). „Lidské faktory YY1 a LSF potlačují dlouhé terminální opakování viru lidské imunodeficience typu 1 prostřednictvím náboru histon-deacetylázy 1“. Journal of Virology. 74 (15): 6790–9. doi:10.1128 / JVI.74.15.6790-6799.2000. PMC 112196. PMID 10888618.
Zhou W, Clouston DR, Wang X, Cerruti L, Cunningham JM, Jane SM (říjen 2000). „Indukce exprese genu lidského fetálního globinu novým erytroidním faktorem, NF-E4“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (20): 7662–72. doi:10.1128 / MCB.20.20.7662-7672.2000. PMC 86334. PMID 11003662.
Rodda S, Sharma S, Scherer M, Chapman G, Rathjen P (únor 2001). „CRTR-1, vývojově regulovaný transkripční represor související s rodinou transkripčních faktorů CP2“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (5): 3324–32. doi:10,1074 / jbc.M008167200. PMID 11073954.
Zheng JB, Zhou YH, Maity T, Liao WS, Saunders GF (říjen 2001). „Aktivace lidského genu PAX6 prostřednictvím zesilovače exonu 1 transkripčními faktory SEF a Sp1“. Výzkum nukleových kyselin. 29 (19): 4070–8. doi:10.1093 / nar / 29.2.e6. PMC 60230. PMID 11574690.
Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (březen 2002). „Vazba proteinů RING polycomb na specifické cílové geny v komplexu s vývojovými transkripčními faktory typu grainyhead“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1936–46. doi:10.1128 / MCB.22.6.1936-1946.2002. PMC 135618. PMID 11865070.
He G, Margolis DM (květen 2002). „Protiregulace deacetylace chromatinu a obsazení histon-deacetylázy u integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1) pomocí represoru HIV-1 YY1 a aktivátoru HIV-1 Tat“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (9): 2965–73. doi:10.1128 / MCB.22.9.2965-2973.2002. PMC 133763. PMID 11940654.
Peters LM, Anderson DW, Griffith AJ, Grundfast KM, San Agustin TB, Madeo AC, Friedman TB, Morell RJ (listopad 2002). „Mutace transkripčního faktoru, TFCP2L3, způsobuje progresivní autosomálně dominantní ztrátu sluchu, DFNA28“. Lidská molekulární genetika. 11 (23): 2877–85. doi:10,1093 / hmg / 11,23,2877. PMID 12393799.
Luedecking-Zimmer E, DeKosky ST, Nebes R, Kamboh MI (únor 2003). „Sdružení 3 'UTR transkripčního faktoru LBP-1c / CP2 / LSF polymorfismu s Alzheimerovou chorobou s pozdním nástupem“. American Journal of Medical Genetics Part B. 117B (1): 114–7. doi:10,1002 / ajmg.b.10026. PMID 12555245. S2CID 24087609.
Chae JH, Kim CG (únor 2003). „Vazba CP2 na promotor je nezbytná pro zvýšenou transkripci genů globinu v erytroidních buňkách“. Molekuly a buňky. 15 (1): 40–7. PMID 12661759.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000135457 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009733 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8157699-5] Swendeman SL, Spielholz C, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Sheffery M (duben 1994). "Charakterizace genomové struktury, umístění chromozomů, promotor a vývojová exprese alfa-globinového transkripčního faktoru CP2". The Journal of Biological Chemistry. 269 (15): 11663–71. PMID 8157699.

[entrez-6] „Entrez Gene: TFCP2 transkripční faktor CP2“.

[pmid19622726-7] Yoo BK, Gredler R, Vozhilla N, Su ZZ, Chen D, Forcier T, Shah K, Saxena U, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (srpen 2009). "Identifikace genů propůjčujících rezistenci na 5-fluorouracil". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (31): 12938–43. Bibcode:2009PNAS..10612938Y. doi:10.1073 / pnas.0901451106. PMC 2722317. PMID 19622726.

[pmid20404171-8] A ^b ^C Yoo BK, Emdad L, Gredler R, Fuller C, Dumur CI, Jones KH, Jackson-Cook C, Su ZZ, Chen D, Saxena UH, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (květen 2010). „Transkripční faktor Pozdní SV40 faktor (LSF) funguje jako onkogen v hepatocelulárním karcinomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (18): 8357–62. Bibcode:2010PNAS..107,8357Y. doi:10.1073 / pnas.1000374107. PMC 2889542. PMID 20404171.

[pmid22167195-9] Santhekadur PK, Gredler R, Chen D, Siddiq A, Shen XN, Das SK, Emdad L, Fisher PB, Sarkar D (leden 2012). „Pozdní faktor SV40 (LSF) zvyšuje angiogenezi transkripčně up-regulující matrix metaloproteinázou-9 (MMP-9)“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (5): 3425–32. doi:10,1074 / jbc.M111.298976. PMC 3270996. PMID 22167195.

[Santhekadur-10] A ^b Santhekadur PK, Rajasekaran D, Siddiq A, Gredler R, Chen D, Schaus SC, Hansen U, Fisher PB, Sarkar D (2012). „Transkripční faktor LSF: nový onkogen pro hepatocelulární karcinom“ (PDF). Am J Cancer Res. 2 (3): 269–285. PMC 3365805. PMID 22679558.

[pmid22396589-11] Grant TJ, Bishop JA, Christadore LM, Barot G, Chin HG, Woodson S, Kavouris J, Siddiq A, Gredler R, Shen XN, Sherman J, Meehan T, Fitzgerald K, Pradhan S, Briggs LA, Andrews WH, Sarkar D , Schaus SE, Hansen U (březen 2012). „Antiproliferativní inhibitory transkripčního faktoru LSF s malou molekulou odhalují onkogenní závislost na LSF u hepatocelulárního karcinomu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 109 (12): 4503–8. Bibcode:2012PNAS..109,4503G. doi:10.1073 / pnas.1121601109. PMC 3311344. PMID 22396589. Shrnutí ležel – Vědecký kodex.

[pmid9685356-12] Zambrano N, Minopoli G, de Candia P, Russo T (srpen 1998). „Adaptérový protein Fe65 interaguje prostřednictvím své domény PID1 s transkripčním faktorem CP2 / LSF / LBP1“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (32): 20128–33. doi:10.1074 / jbc.273.32.20128. PMID 9685356.

[pmid11865070-13] Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (březen 2002). „Vazba proteinů RING polycomb na specifické cílové geny v komplexu s vývojovými transkripčními faktory typu grainyhead“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (6): 1936–46. doi:10.1128 / MCB.22.6.1936-1946.2002. PMC 135618. PMID 11865070.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]