Protein podobný retinoblastomu 1 - Retinoblastoma-like protein 1 - Wikipedia

RBL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1H28, 4YOO, 4YOS, 4YOZ
Identifikátory
Aliasy	RBL1, CP107, PRB1, p107, retinoblastom podobný 1, RB transkripční corepresor jako 1
Externí ID	OMIM: 116957 MGI: 103300 HomoloGene: 2172 Genové karty: RBL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	37,095,997 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	157,204,534 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • promotor-specifická chromatinová vazba; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Aktivace transkripčního faktoru aktivující RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • chromatin;
Biologický proces	• regulace buněčného cyklu; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčný cyklus; • GO: virový proces 0022415; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace aktivity lipidové kinázy; • negativní regulace genové exprese; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace buněčné senescence; • organizace chromatinu; • regulace mitotického buněčného cyklu; • diferenciace buněk; • regulace buněčného dělení; • negativní regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5933
	19650
	ENSG00000080839
	ENSMUSG00000027641
	P28749
	Q64701
	NM_002895; NM_183404; NM_001323281; NM_001323282
	NM_001139516; NM_011249
	NP_001310210; NP_001310211; NP_002886; NP_899662
	NP_001132988; NP_035379
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podobný retinoblastomu 1 (p107), také známý jako RBL1, je protein že u lidí je kódován RBL1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem má podobnou sekvenci a pravděpodobně funguje jako produkt z retinoblastom 1 (RB1 ) gen. Produktem genu RB1 je a tumor supresorový protein který se zdá být zapojen do buněčný cyklus regulace, protože je fosforylován ve fázovém přechodu S na M a je defosforylován ve fázi G1 buněčného cyklu. Jak protein RB1, tak produkt tohoto genu mohou tvořit komplex s adenovirus Protein E1A a SV40 Velký T-antigen, s SV40 velký T-antigen se váže pouze na nefosforylovanou formu každého proteinu. Oba proteiny navíc mohou inhibovat transkripci genů buněčného cyklu, které obsahují E2F vazebná místa v jejich promotéři. Vzhledem k sekvenci a biochemickým podobnostem s proteinem RB1 se předpokládá, že protein kódovaný tímto genem může také potlačovat nádor. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein 1 podobný retinoblastomu komunikovat s:

Viz také

Rodina kapesních proteinů

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080839 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027641 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrezův gen: RBL1 podobný retinoblastomu 1 (p107)“.
^ Ewen ME, Xing YG, Lawrence JB, Livingston DM (září 1991). "Molekulární klonování, chromozomální mapování a exprese cDNA pro p107, protein související s produktem genu pro retinoblastom". Buňka. 66 (6): 1155–64. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90038-Z. PMID 1833063. S2CID 27478008.
^ ^A ^b Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Fan S, Yuan R, Ma YX, Xiong J, Meng Q, Erdos M, Zhao JN, Goldberg ID, Pestell RG, Rosen EM (srpen 2001). „Narušení motivu BRCA1 LXCXE mění funkční aktivitu BRCA1 a regulaci rodiny RB, ale ne vazbu RB proteinu“. Onkogen. 20 (35): 4827–41. doi:10.1038 / sj.onc.1204666. PMID 11521194.
^ Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (červen 1999). „Transkripční faktor RNA polymerázy III IIIB je cílem pro represi kapesními proteiny p107 a p130“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (6): 4255–61. doi:10,1128 / mcb.19.6.4255. PMC 104385. PMID 10330166.
^ ^A ^b Dyson N, Dembski M, Fattaey A, Ngwu C, Ewen M, Helin K (prosinec 1993). „Analýza proteinů asociovaných s p107: p107 se asociuje s formou E2F, která se liší od E2F-1 asociovaného s pRB.“. Journal of Virology. 67 (12): 7641–7. doi:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. PMC 238233. PMID 8230483.
^ ^A ^b Joaquin M, Bessa M, Saville MK, Watson RJ (listopad 2002). „B-Myb překonává blok proliferace buněk zprostředkovaný p107 interakcí s N-terminální doménou p107“. Onkogen. 21 (52): 7923–32. doi:10.1038 / sj.onc.1206001. PMID 12439743.
^ Shanahan F, Seghezzi W, Parry D, Mahony D, Lees E (únor 1999). „Cyklin E se asociuje s BAF155 a BRG1, složkami savčího komplexu SWI-SNF a mění schopnost BRG1 indukovat zastavení růstu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (2): 1460–9. doi:10.1128 / mcb.19.2.1460. PMC 116074. PMID 9891079.
^ Leng X, Noble M, Adams PD, Qin J, Harper JW (duben 2002). "Zvrat potlačení růstu p107 přímou fosforylací cyklinem D1 / cyklin-dependentní kinázou 4". Molekulární a buněčná biologie. 22 (7): 2242–54. doi:10.1128 / mcb.22.7.2242-2254.2002. PMC 133692. PMID 11884610.
^ Lai A, Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E, Branton PE (říjen 1999). „RBP1 získává jak na histon-deacetylázu závislé, tak na sobě nezávislé represivní aktivity k proteinům rodiny retinoblastomu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (10): 6632–41. doi:10,1128 / mcb.19.10.6632. PMC 84642. PMID 10490602.
^ Ferreira R, Magnaghi-Jaulin L, Robin P, Harel-Bellan A, Trouche D (září 1998). „Tři členové rodiny kapesních proteinů sdílejí schopnost potlačovat aktivitu E2F prostřednictvím náboru histon-deacetylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (18): 10493–8. Bibcode:1998PNAS ... 9510493F. doi:10.1073 / pnas.95.18.10493. PMC 27922. PMID 9724731.
^ Joaquin M, Watson RJ (listopad 2003). „Transkripční faktor B-Myb regulovaný buněčným cyklem překonává inhibiční aktivitu na cyklin-dependentní kinázu p57 (KIP2) interakcí s jeho doménou vázající cyklin.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (45): 44255–64. doi:10,1074 / jbc.M308953200. PMID 12947099.
^ Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (červenec 2002). „E2F4 / 5 a p107 jako Smad kofaktory spojující receptor TGFbeta s represí c-myc“. Buňka. 110 (1): 19–32. doi:10.1016 / s0092-8674 (02) 00801-2. PMID 12150994. S2CID 8945574.
^ Wang S, Nath N, Adlam M, Chellappan S (červen 1999). „Prohibitin, potenciální supresor nádoru, interaguje s RB a reguluje funkci E2F“. Onkogen. 18 (23): 3501–10. doi:10.1038 / sj.onc.1202684. PMID 10376528.
^ Fusco C, Reymond A, Zervos AS (srpen 1998). "Molekulární klonování a charakterizace nového proteinu vázajícího se na retinoblastom". Genomika. 51 (3): 351–8. doi:10.1006 / geno.1998.5368. PMID 9721205.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Další čtení

Faha B, Ewen ME, Tsai LH, Livingston DM, Harlow E (leden 1992). "Interakce mezi lidským cyklinem A a proteinem p107 asociovaným s adenovirem E1A". Věda. 255 (5040): 87–90. Bibcode:1992Sci ... 255 ... 87F. doi:10.1126 / science.1532458. PMID 1532458.
Ewen ME, Xing YG, Lawrence JB, Livingston DM (září 1991). "Molekulární klonování, chromozomální mapování a exprese cDNA pro p107, protein související s produktem genu pro retinoblastom". Buňka. 66 (6): 1155–64. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90038-Z. PMID 1833063. S2CID 27478008.
Datta PK, Raychaudhuri P, Bagchi S (říjen 1995). „Sdružení p107 s Sp1: geneticky oddělitelné oblasti p107 se podílejí na regulaci transkripce závislé na E2F a Sp1“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (10): 5444–52. doi:10.1128 / mcb.15.10.5444. PMC 230794. PMID 7565695.
Zhu L, Zhu L, Xie E, Chang LS (červenec 1995). „Diferenciální role dvou tandemových E2F míst při represi lidského promotoru p107 retinoblastomem a proteiny p107“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (7): 3552–62. doi:10,1128 / mcb.15.7.3552. PMC 230592. PMID 7791762.
Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (březen 1995). „E2F-4 a E2F-5, dva členové rodiny E2F, jsou exprimováni v raných fázích buněčného cyklu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (6): 2403–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.2403S. doi:10.1073 / pnas.92.6.2403. PMC 42492. PMID 7892279.
Kim YW, Otterson GA, Kratzke RA, Coxon AB, Kaye FJ (listopad 1994). „Diferenciální specificita pro vazbu proteinu vázajícího retinoblastom 2 na RB, p107 a protein vázající TATA“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (11): 7256–64. doi:10,1128 / mcb.14.11.7256. PMC 359260. PMID 7935440.
Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (listopad 1994). „E2F-4, nový člen rodiny transkripčních faktorů E2F, interaguje s p107“. Geny a vývoj. 8 (22): 2665–79. doi:10,1101 / gad.8.22.2665. PMID 7958924.
Beijersbergen RL, Kerkhoven RM, Zhu L, Carlée L, Voorhoeve PM, Bernards R (listopad 1994). „E2F-4, nový člen rodiny genů E2F, má onkogenní aktivitu a asociuje se s p107 in vivo“. Geny a vývoj. 8 (22): 2680–90. doi:10,1101 / gad.8.22.2680. PMID 7958925.
Beijersbergen RL, Hijmans EM, Zhu L, Bernards R (září 1994). „Interakce c-Myc s proteinem p107 souvisejícím s pRb vede k inhibici transaktivace zprostředkované c-Myc“. Časopis EMBO. 13 (17): 4080–6. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06725.x. PMC 395329. PMID 8076603.
Dyson N, Dembski M, Fattaey A, Ngwu C, Ewen M, Helin K (prosinec 1993). „Analýza proteinů asociovaných s p107: p107 se asociuje s formou E2F, která se liší od E2F-1 asociovaného s pRB.“. Journal of Virology. 67 (12): 7641–7. doi:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. PMC 238233. PMID 8230483.
Zhu L, van den Heuvel S, Helin K, Fattaey A, Ewen M, Livingston D, Dyson N, Harlow E (červenec 1993). „Inhibice buněčné proliferace p107, příbuzný proteinu retinoblastomu“. Geny a vývoj. 7 (7A): 1111–25. doi:10,1101 / gad.7.7a.1111. PMID 8319904.
Ikeda MA, Jakoi L, Nevins JR (duben 1996). „Jedinečná role proteinu Rb při řízení akumulace E2F během buněčného růstu a diferenciace“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (8): 3215–20. Bibcode:1996PNAS ... 93.3215I. doi:10.1073 / pnas.93.8.3215. PMC 39585. PMID 8622916.
Xiao ZX, Ginsberg D, Ewen M, Livingston DM (květen 1996). "Regulace proteinu p107 souvisejícího s proteinem retinoblastomu kinázami spojenými s G1 cyklinem". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (10): 4633–7. Bibcode:1996PNAS ... 93,4633X. doi:10.1073 / pnas.93.10.4633. PMC 39330. PMID 8643455.
Vidal M, Brachmann RK, Fattaey A, Harlow E, Boeke JD (září 1996). „Reverzní dvouhybridní a jednohybridní systémy k detekci disociace interakcí protein-protein a DNA-protein“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (19): 10315–20. Bibcode:1996PNAS ... 9310315V. doi:10.1073 / pnas.93.19.10315. PMC 38381. PMID 8816797.
Shao Z, Siegert JL, Ruppert S, Robbins PD (červenec 1997). „Rb interaguje s TAF (II) 250 / TFIID prostřednictvím více domén“. Onkogen. 15 (4): 385–92. doi:10.1038 / sj.onc.1201204. PMID 9242374.
Verona R, Moberg K, Estes S, Starz M, Vernon JP, Lees JA (prosinec 1997). „Aktivita E2F je regulována změnami subcelulární lokalizace závislou na buněčném cyklu“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (12): 7268–82. doi:10,1128 / mcb.17.12.7268. PMC 232584. PMID 9372959.
Trimarchi JM, Fairchild B, Verona R, Moberg K, Andon N, Lees JA (březen 1998). „E2F-6, člen rodiny E2F, který se může chovat jako transkripční represor“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (6): 2850–5. Bibcode:1998PNAS ... 95.2850T. doi:10.1073 / pnas.95.6.2850. PMC 19658. PMID 9501179.
Sterner JM, Dew-Knight S, Musahl C, Kornbluth S, Horowitz JM (květen 1998). „Negativní regulace replikace DNA proteinem retinoblastomu je zprostředkována jeho asociací s MCM7“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (5): 2748–57. doi:10,1128 / mcb.18.5.2748. PMC 110654. PMID 9566894.
Woitach JT, Zhang M, Niu CH, Thorgeirsson SS (srpen 1998). "Protein vázající retinoblastom, který ovlivňuje kontrolu buněčného cyklu a poskytuje transformační schopnost". Genetika přírody. 19 (4): 371–4. doi:10.1038/1258. PMID 9697699. S2CID 11374970.
Telecí maso E, Eisenstein M, Tseng ZH, Gill G (září 1998). „Buněčný represor genů stimulovaných E1A, který inhibuje aktivaci E2F“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (9): 5032–41. doi:10,1128 / mcb.18.9.5032. PMC 109088. PMID 9710587.

externí odkazy

RBL1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000080839 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027641 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrezův gen: RBL1 podobný retinoblastomu 1 (p107)“.

[pmid1833063-6] Ewen ME, Xing YG, Lawrence JB, Livingston DM (září 1991). "Molekulární klonování, chromozomální mapování a exprese cDNA pro p107, protein související s produktem genu pro retinoblastom". Buňka. 66 (6): 1155–64. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90038-Z. PMID 1833063. S2CID 27478008.

[pmid16189514-7] A ^b Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid11521194-8] Fan S, Yuan R, Ma YX, Xiong J, Meng Q, Erdos M, Zhao JN, Goldberg ID, Pestell RG, Rosen EM (srpen 2001). „Narušení motivu BRCA1 LXCXE mění funkční aktivitu BRCA1 a regulaci rodiny RB, ale ne vazbu RB proteinu“. Onkogen. 20 (35): 4827–41. doi:10.1038 / sj.onc.1204666. PMID 11521194.

[pmid10330166-9] Sutcliffe JE, Cairns CA, McLees A, Allison SJ, Tosh K, White RJ (červen 1999). „Transkripční faktor RNA polymerázy III IIIB je cílem pro represi kapesními proteiny p107 a p130“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (6): 4255–61. doi:10,1128 / mcb.19.6.4255. PMC 104385. PMID 10330166.

[pmid8230483-10] A ^b Dyson N, Dembski M, Fattaey A, Ngwu C, Ewen M, Helin K (prosinec 1993). „Analýza proteinů asociovaných s p107: p107 se asociuje s formou E2F, která se liší od E2F-1 asociovaného s pRB.“. Journal of Virology. 67 (12): 7641–7. doi:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. PMC 238233. PMID 8230483.

[pmid12439743-11] A ^b Joaquin M, Bessa M, Saville MK, Watson RJ (listopad 2002). „B-Myb překonává blok proliferace buněk zprostředkovaný p107 interakcí s N-terminální doménou p107“. Onkogen. 21 (52): 7923–32. doi:10.1038 / sj.onc.1206001. PMID 12439743.

[pmid9891079-12] Shanahan F, Seghezzi W, Parry D, Mahony D, Lees E (únor 1999). „Cyklin E se asociuje s BAF155 a BRG1, složkami savčího komplexu SWI-SNF a mění schopnost BRG1 indukovat zastavení růstu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (2): 1460–9. doi:10.1128 / mcb.19.2.1460. PMC 116074. PMID 9891079.

[pmid11884610-13] Leng X, Noble M, Adams PD, Qin J, Harper JW (duben 2002). "Zvrat potlačení růstu p107 přímou fosforylací cyklinem D1 / cyklin-dependentní kinázou 4". Molekulární a buněčná biologie. 22 (7): 2242–54. doi:10.1128 / mcb.22.7.2242-2254.2002. PMC 133692. PMID 11884610.

[pmid10490602-14] Lai A, Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E, Branton PE (říjen 1999). „RBP1 získává jak na histon-deacetylázu závislé, tak na sobě nezávislé represivní aktivity k proteinům rodiny retinoblastomu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (10): 6632–41. doi:10,1128 / mcb.19.10.6632. PMC 84642. PMID 10490602.

[pmid9724731-15] Ferreira R, Magnaghi-Jaulin L, Robin P, Harel-Bellan A, Trouche D (září 1998). „Tři členové rodiny kapesních proteinů sdílejí schopnost potlačovat aktivitu E2F prostřednictvím náboru histon-deacetylázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (18): 10493–8. Bibcode:1998PNAS ... 9510493F. doi:10.1073 / pnas.95.18.10493. PMC 27922. PMID 9724731.

[pmid12947099-16] Joaquin M, Watson RJ (listopad 2003). „Transkripční faktor B-Myb regulovaný buněčným cyklem překonává inhibiční aktivitu na cyklin-dependentní kinázu p57 (KIP2) interakcí s jeho doménou vázající cyklin.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (45): 44255–64. doi:10,1074 / jbc.M308953200. PMID 12947099.

[pmid12150994-17] Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (červenec 2002). „E2F4 / 5 a p107 jako Smad kofaktory spojující receptor TGFbeta s represí c-myc“. Buňka. 110 (1): 19–32. doi:10.1016 / s0092-8674 (02) 00801-2. PMID 12150994. S2CID 8945574.

[pmid10376528-18] Wang S, Nath N, Adlam M, Chellappan S (červen 1999). „Prohibitin, potenciální supresor nádoru, interaguje s RB a reguluje funkci E2F“. Onkogen. 18 (23): 3501–10. doi:10.1038 / sj.onc.1202684. PMID 10376528.

[pmid9721205-19] Fusco C, Reymond A, Zervos AS (srpen 1998). "Molekulární klonování a charakterizace nového proteinu vázajícího se na retinoblastom". Genomika. 51 (3): 351–8. doi:10.1006 / geno.1998.5368. PMID 9721205.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]