GTF2F1 - GTF2F1

GTF2F1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1F3U, 1I27, 1J2X, 1NHA, 1 NEV, 2K7L, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5YYD, 5IY6
Identifikátory
Aliasy	GTF2F1, obecný transkripční faktor IIF, polypeptid 1, 74 kDa, BTF4, RAP74, TF2F1, TFIIF, obecná transkripční faktor IIF podjednotka 1
Externí ID	OMIM: 189968 MGI: 1923848 HomoloGene: 1585 Genové karty: GTF2F1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	6,393,981 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	57,011,288 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita aktivátoru fosfatázy; • Vazba RNA; • vázání proteinové fosfatázy; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0000983 Obecná aktivita iniciačního transkripčního faktoru RNA polymerázy II; • promotor-specifická chromatinová vazba;
Buněčná složka	• intracelulární membránou vázaná organela; • nukleoplazma; • transkripční faktor TFIIF komplex; • buněčné spojení; • transkripční faktor TFIID komplex; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • reakce na virus; • Uzávěr mRNA 7-methylguanosinu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace virové transkripce; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II; • signální dráha receptoru pro fibroblastový růstový faktor; • GO: 0048554 pozitivní regulace katalytické aktivity; • RNA metabolický proces; • negativní regulace vazby na bílkoviny;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2962
	98053
	ENSG00000125651
	ENSMUSG00000002658
	P35269
	Q3THK3
	NM_002096
	NM_133801
	NP_002087
	NP_598562
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Obecná podjednotka transkripčního faktoru IIF 1 je protein že u lidí je kódován GTF2F1 gen.^[5]^[6]

Interakce

GTF2F1 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Transkripční faktor II F

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125651 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002658 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Finkelstein A, Kostrub CF, Li J, Chavez DP, Wang BQ, Fang SM, Greenblatt J, Burton ZF (březen 1992). "CDNA kódující RAP74, obecný iniciační faktor pro transkripci RNA polymerázou II". Příroda. 355 (6359): 464–7. Bibcode:1992 Natur.355..464F. doi:10.1038 / 355464a0. PMID 1734284. S2CID 1241044.
^ „Entrez Gene: GTF2F1 obecný transkripční faktor IIF, polypeptid 1, 74 kDa“.
^ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. J. Biol. Chem. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (květen 1997). „BRCA1 je součástí holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS ... 94.5605S. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
^ Kim MK, Nikodem VM (říjen 1999). „hnRNP U inhibuje fosforylaci karboxyterminální domény pomocí TFIIH a potlačuje prodloužení RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 19 (10): 6833–44. doi:10.1128 / MCB.19.10.6833. PMC 84680. PMID 10490622.
^ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (říjen 1997). „CA150, jaderný protein spojený s holoenzymem RNA polymerázy II, je zapojen do transkripce viru lidské imunodeficience typu 1 aktivovaného Tat“. Mol. Buňka. Biol. 17 (10): 6029–39. doi:10.1128 / MCB.17.10.6029. PMC 232452. PMID 9315662.
^ Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (září 1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které modifikují strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.
^ Joliot V, Demma M, Prywes R (únor 1995). "Interakce s podjednotkou RAP74 TFIIF je vyžadována pro transkripční aktivaci faktorem odezvy séra". Příroda. 373 (6515): 632–5. Bibcode:1995 Natur.373..632J. doi:10.1038 / 373632a0. PMID 7854423. S2CID 47196160.
^ Zhu H, Joliot V, Prywes R (únor 1994). "Role transkripčního faktoru TFIIF v transkripci aktivované sérovým reakčním faktorem". J. Biol. Chem. 269 (5): 3489–97. PMID 8106390.
^ Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (březen 1996). „TAFII250 je bipartitová protein kináza, která fosforyluje základní transkripční faktor RAP74“. Buňka. 84 (5): 781–90. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81055-7. PMID 8625415. S2CID 18490534.
^ ^A ^b Ruppert S, Tjian R (listopad 1995). „Lidský TAFII250 interaguje s RAP74: důsledky pro iniciaci RNA polymerázy II“. Genes Dev. 9 (22): 2747–55. doi:10,1101 / gad. 9.22.2747. PMID 7590250.
^ Siegert JL, Robbins PD (leden 1999). „Rb inhibuje aktivitu vnitřní kinázy faktoru TAFII250 spojeného s proteinem spojujícím TATA“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 846–54. doi:10.1128 / MCB.19.1.846. PMC 83941. PMID 9858607.
^ ^A ^b Malik S, Guermah M, Roeder RG (březen 1998). „Dynamický model pro funkci koaktivátoru PC4 v transkripci RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (5): 2192–7. Bibcode:1998PNAS ... 95,2192M. doi:10.1073 / pnas.95.5.2192. PMC 19292. PMID 9482861.
^ Fang SM, Burton ZF (květen 1996). „RNA polymeráza II asociovaný protein (RAP) 74 váže transkripční faktor (TF) IIB a blokuje vazbu TFIIB-RAP30“. J. Biol. Chem. 271 (20): 11703–9. doi:10.1074 / jbc.271.20.11703. PMID 8662660.

Další čtení

Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). „HIV-1 Tat působí in vitro ve spojení s faktory prodlužování buněk jako faktor procesivity“. Genes Dev. 6 (4): 655–66. doi:10,1101 / gad. 6.4.455. PMID 1559613.
Aso T, Vasavada HA, Kawaguchi T, Germino FJ, Ganguly S, Kitajima S, Weissman SM, Yasukochi Y (1992). "Charakterizace cDNA pro velkou podjednotku transkripčního iniciačního faktoru TFIIF". Příroda. 355 (6359): 461–4. Bibcode:1992 Natur.355..461A. doi:10.1038 / 355461a0. PMID 1734283. S2CID 4312708.
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). "Počáteční hodnocení diverzity lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA". Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Ruppert S, Tjian R. (1995). „Lidský TAFII250 interaguje s RAP74: důsledky pro iniciaci RNA polymerázy II“. Genes Dev. 9 (22): 2747–55. doi:10,1101 / gad. 9.22.2747. PMID 7590250.
Hisatake K, Ohta T, Takada R, Guermah M, Horikoshi M, Nakatani Y, Roeder RG (1995). "Evoluční ochrana lidských faktorů spojených s TATA vázajícími se na polypeptid TAFII31 a TAFII80 a interakce TAFII80 s jinými TAF a s obecnými transkripčními faktory". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (18): 8195–9. Bibcode:1995PNAS ... 92.8195H. doi:10.1073 / pnas.92.18.8195. PMC 41123. PMID 7667268.
Joliot V, Demma M, Prywes R (1995). "Interakce s podjednotkou RAP74 TFIIF je vyžadována pro transkripční aktivaci faktorem odezvy séra". Příroda. 373 (6515): 632–5. Bibcode:1995 Natur.373..632J. doi:10.1038 / 373632a0. PMID 7854423. S2CID 47196160.
Zhu H, Joliot V, Prywes R (1994). "Role transkripčního faktoru TFIIF v transkripci aktivované sérovým reakčním faktorem". J. Biol. Chem. 269 (5): 3489–97. PMID 8106390.
Yonaha M, Aso T, Kobayashi Y, Vasavada H, Yasukochi Y, Weissman SM, Kitajima S (1993). "Doménová struktura lidského obecného faktoru iniciace transkripce, TFIIF". Nucleic Acids Res. 21 (2): 273–9. doi:10.1093 / nar / 21.2.273. PMC 309103. PMID 8441635.
Aso T, Tsai P, Kawaguchi T, Menninger JC, Kitajima S, Yasukochi Y, Ward DC, Weissman SM (1993). "Přiřazení lidského genu GTF2F1 k chromozomu 19p13.3". Genomika. 16 (1): 252–3. doi:10.1006 / geno.1993.1168. PMID 8486367.
Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (1996). „TAFII250 je bipartitová protein kináza, která fosforyluje základní transkripční faktor RAP74“. Buňka. 84 (5): 781–90. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81055-7. PMID 8625415. S2CID 18490534.
Fang SM, Burton ZF (1996). „RNA polymeráza II asociovaný protein (RAP) 74 váže transkripční faktor (TF) IIB a blokuje vazbu TFIIB-RAP30“. J. Biol. Chem. 271 (20): 11703–9. doi:10.1074 / jbc.271.20.11703. PMID 8662660.
McEwan IJ, Dahlman-Wright K, Ford J, Wright AP (1996). „Funkční interakce transaktivační domény c-Myc s proteinem vázajícím TATA: důkazy pro model indukovaného přizpůsobení skládání transaktivační domény“. Biochemie. 35 (29): 9584–93. doi:10.1021 / bi960793v. PMID 8755740.
Zhou Q, Sharp PA (1996). „Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení HIV-1 Tat“. Věda. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. doi:10.1126 / science.274.5287.605. PMID 8849451. S2CID 13266489.
Parada CA, Roeder RG (1996). „Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-vyvolaná fosforylace její karboxy-terminální domény“. Příroda. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996 Natur.384..375P. doi:10.1038 / 384375a0. PMID 8934526. S2CID 4278432.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). „Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 1817–23. doi:10.1128 / mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (1997). „BRCA1 je složkou holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS ... 94.5605S. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
McEwan IJ, Gustafsson J (1997). "Interakce funkce transaktivace lidského androgenního receptoru s obecným transkripčním faktorem TFIIF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (16): 8485–90. Bibcode:1997PNAS ... 94,8485 mil. doi:10.1073 / pnas.94.16.8485. PMC 22967. PMID 9238003.
Newberry EP, Latifi T, Battaile JT, Towler DA (1997). "Strukturně-funkční analýza transkripční suprese zprostředkované Msx2". Biochemie. 36 (34): 10451–62. doi:10.1021 / bi971008x. PMID 9265625.
O'Brien T, Tjian R (1998). "Funkční analýza lidské TAFII250 N-terminální kinázové domény". Mol. Buňka. 1 (6): 905–11. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80089-1. PMID 9660973.

externí odkazy

GTF2F1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook GTF2F1

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125651 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000002658 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1734284-5] Finkelstein A, Kostrub CF, Li J, Chavez DP, Wang BQ, Fang SM, Greenblatt J, Burton ZF (březen 1992). "CDNA kódující RAP74, obecný iniciační faktor pro transkripci RNA polymerázou II". Příroda. 355 (6359): 464–7. Bibcode:1992 Natur.355..464F. doi:10.1038 / 355464a0. PMID 1734284. S2CID 1241044.

[entrez-6] „Entrez Gene: GTF2F1 obecný transkripční faktor IIF, polypeptid 1, 74 kDa“.

[pmid9765293-7] Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (říjen 1998). „FCP1, podjednotka interagující s RAP74 lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxylterminální doménu RNA polymerázy IIO“. J. Biol. Chem. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID 9765293.

[pmid9159119-8] A ^b ^C ^d ^E ^F Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (květen 1997). „BRCA1 je součástí holoenzymu RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS ... 94.5605S. doi:10.1073 / pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.

[pmid10490622-9] Kim MK, Nikodem VM (říjen 1999). „hnRNP U inhibuje fosforylaci karboxyterminální domény pomocí TFIIH a potlačuje prodloužení RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 19 (10): 6833–44. doi:10.1128 / MCB.19.10.6833. PMC 84680. PMID 10490622.

[pmid9315662-10] Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (říjen 1997). „CA150, jaderný protein spojený s holoenzymem RNA polymerázy II, je zapojen do transkripce viru lidské imunodeficience typu 1 aktivovaného Tat“. Mol. Buňka. Biol. 17 (10): 6029–39. doi:10.1128 / MCB.17.10.6029. PMC 232452. PMID 9315662.

[pmid9710619-11] Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (září 1998). „Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které modifikují strukturu chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 18 (9): 5355–63. doi:10.1128 / MCB.18.9.5355. PMC 109120. PMID 9710619.

[pmid7854423-12] Joliot V, Demma M, Prywes R (únor 1995). "Interakce s podjednotkou RAP74 TFIIF je vyžadována pro transkripční aktivaci faktorem odezvy séra". Příroda. 373 (6515): 632–5. Bibcode:1995 Natur.373..632J. doi:10.1038 / 373632a0. PMID 7854423. S2CID 47196160.

[pmid8106390-13] Zhu H, Joliot V, Prywes R (únor 1994). "Role transkripčního faktoru TFIIF v transkripci aktivované sérovým reakčním faktorem". J. Biol. Chem. 269 (5): 3489–97. PMID 8106390.

[pmid8625415-14] Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (březen 1996). „TAFII250 je bipartitová protein kináza, která fosforyluje základní transkripční faktor RAP74“. Buňka. 84 (5): 781–90. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81055-7. PMID 8625415. S2CID 18490534.

[pmid7590250-15] A ^b Ruppert S, Tjian R (listopad 1995). „Lidský TAFII250 interaguje s RAP74: důsledky pro iniciaci RNA polymerázy II“. Genes Dev. 9 (22): 2747–55. doi:10,1101 / gad. 9.22.2747. PMID 7590250.

[pmid9858607-16] Siegert JL, Robbins PD (leden 1999). „Rb inhibuje aktivitu vnitřní kinázy faktoru TAFII250 spojeného s proteinem spojujícím TATA“. Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 846–54. doi:10.1128 / MCB.19.1.846. PMC 83941. PMID 9858607.

[pmid9482861-17] A ^b Malik S, Guermah M, Roeder RG (březen 1998). „Dynamický model pro funkci koaktivátoru PC4 v transkripci RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (5): 2192–7. Bibcode:1998PNAS ... 95,2192M. doi:10.1073 / pnas.95.5.2192. PMC 19292. PMID 9482861.

[pmid8662660-18] Fang SM, Burton ZF (květen 1996). „RNA polymeráza II asociovaný protein (RAP) 74 váže transkripční faktor (TF) IIB a blokuje vazbu TFIIB-RAP30“. J. Biol. Chem. 271 (20): 11703–9. doi:10.1074 / jbc.271.20.11703. PMID 8662660.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]