MXD1 - MXD1

MXD1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E91, 1G1E, 1NLW, 1PD7, 1S5Q
Identifikátory
Aliasy	MXD1, BHLHC58, MAD, MAD1, MAX dimerizační protein 1
Externí ID	OMIM: 600021 MGI: 96908 HomoloGene: 1767 Genové karty: MXD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	69,942,945 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	86,669,161 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• nukleární chromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • mitochondrie; • cytosol;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • buněčná proliferace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4084
	17119
	ENSG00000059728
	ENSMUSG00000001156
	Q05195
	P50538
	NM_002357; NM_001202513; NM_001202514
	NM_010751
	NP_001189442; NP_001189443; NP_002348
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

MAD protein je protein že u lidí je kódován MXD1 gen.^[5]^[6]

Dimerizační protein MAD-MAX patří do podrodiny proteinů interagujících s MAX. Tento protein soutěží s MYC o vazbu na MAX, aby vytvořil sekvenčně specifický DNA-vazebný komplex, působí jako transkripční represor (zatímco se zdá, že MYC funguje jako aktivátor) a je kandidátem potlačujícím nádor.^[6]

Interakce

MXD1 bylo prokázáno komunikovat s Histon deacetyláza 2,^[7]^[8] SMC3,^[9] MLX,^[10]^[11] SIN3A^[12]^[13]^[14] a MAX.^[9]^[15]^[16]^[17]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000059728 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001156 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Shapiro DN, Valentine V, Eagle L, Yin X, Morris SW, Prochownik EV (únor 1995). "Přiřazení lidských genů MAD a MXI1 k chromozomům 2p12-p13 a 10q24-q25". Genomika. 23 (1): 282–5. doi:10.1006 / geno.1994.1496. PMID 7829091.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MXD1 MAX dimerization protein 1“.
^ Laherty, C D; Yang W M; Sun J M; Davie J R; Seto E; Eisenman R N (květen 1997). "Histonové deacetylázy spojené s mSin3 corepressorem zprostředkovávají šílenou transkripční represi". Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 89 (3): 349–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9. ISSN 0092-8674. PMID 9150134. S2CID 13490886.
^ Spronk, CA; Tessari M; Kaan A M; Jansen J F; Vermeulen M; Stunnenberg H G; Vuister G W (prosinec 2000). „Interakce Mad1-Sin3B zahrnuje nový šroubovicový záhyb“. Nat. Struct. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 7 (12): 1100–4. doi:10.1038/81944. ISSN 1072-8368. PMID 11101889. S2CID 12451972.
^ ^A ^b Gupta, K; Anand G; Yin X; Grove L; Prochownik E V (březen 1998). „Mmip1: nový protein leucinového zipu, který ruší potlačující účinky členů rodiny Mad na c-myc“. Onkogen. ANGLIE. 16 (9): 1149–59. doi:10.1038 / sj.onc.1201634. ISSN 0950-9232. PMID 9528857.
^ Káhira, S; Merla G; Urbinati F; Ballabio A; Reymond A (březen 2001). „WBSCR14, gen mapující oblast s odstraněnou oblastí Williams-Beurenova syndromu, je novým členem sítě transkripčních faktorů Mlx“. Hučení. Mol. Genet. Anglie. 10 (6): 617–27. doi:10,1093 / hmg / 10,6,617. ISSN 0964-6906. PMID 11230181.
^ Meroni, G; Cairo S; Merla G; Messali S; Brent R; Ballabio A; Reymond A (červenec 2000). „Mlx, nový člen rodiny bHLHZip podobný Maxovi: hlavní fáze nové regulační cesty transkripčních faktorů?“. Onkogen. ANGLIE. 19 (29): 3266–77. doi:10.1038 / sj.onc.1203634. ISSN 0950-9232. PMID 10918583.
^ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar (srpen 2004). "HBP1 a Mad1 represory váží doménu Sin3 corepressor PAH2 s opačnou spirálovou orientací". Nat. Struct. Mol. Biol. Spojené státy. 11 (8): 738–46. doi:10.1038 / nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594. S2CID 44324333.
^ Brubaker, K; Cowley S M; Huang K; Loo L; Yochum GS; Ayer D E; Eisenman RN; Radhakrishnan I (listopad 2000). „Struktura řešení interagujících domén komplexu Mad-Sin3: důsledky pro nábor komplexu modifikujícího chromatin“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 103 (4): 655–65. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00168-9. ISSN 0092-8674. PMID 11106735. S2CID 17476603.
^ Ayer, DE; Lawrence Q A; Eisenman R N (březen 1995). „Transkripční represe Mad-Max je zprostředkována tvorbou ternárních komplexů se savčími homology kvasinkového represoru Sin3“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 80 (5): 767–76. doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. ISSN 0092-8674. PMID 7889570. S2CID 8749951.
^ Lee, Clement M; Onésime Djamila; Reddy C Damodara; Dhanasekaran N; Reddy E Premkumar (říjen 2002). „JLP: Lešenový protein, který svazuje signalizační moduly JNK / p38MAPK a transkripční faktory“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 99 (22): 14189–94. Bibcode:2002PNAS ... 9914189L. doi:10.1073 / pnas.232310199. ISSN 0027-8424. PMC 137859. PMID 12391307.
^ Ayer, DE; Kretzner L; Eisenman R N (leden 1993). "Mad: heterodimerní partner pro Maxe, který antagonizuje transkripční aktivitu Myc". Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 72 (2): 211–22. doi:10.1016/0092-8674(93)90661-9. ISSN 0092-8674. PMID 8425218. S2CID 13317223.
^ Nair, Satish K; Burley Stephen K (leden 2003). "Rentgenové struktury Myc-Max a Mad-Max rozpoznávající DNA. Molekulární základy regulace protoonkogenními transkripčními faktory". Buňka. Spojené státy. 112 (2): 193–205. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01284-9. ISSN 0092-8674. PMID 12553908. S2CID 16142388.

Další čtení

Grandori C, Cowley SM, James LP, Eisenman RN (2001). "Síť Myc / Max / Mad a transkripční kontrola chování buněk". Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 16 (1): 653–99. doi:10.1146 / annurev.cellbio.16.1.653. PMID 11031250.
Lüscher B (2001). "Funkce a regulace transkripčních faktorů sítě Myc / Max / Mad". Gen. 277 (1–2): 1–14. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00697-7. PMID 11602341.
Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (1995). „Transkripční represe Mad-Max je zprostředkována tvorbou ternárních komplexů se savčími homology kvasinkového represoru Sin3“. Buňka. 80 (5): 767–76. doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. PMID 7889570. S2CID 8749951.
Edelhoff S, Ayer DE, Zervos AS a kol. (1994). "Mapování dvou genů kódujících členy odlišné podrodiny MAX interagujících proteinů: MAD na lidský chromozom 2 a myší chromozom 6 a MXI1 na lidský chromozom 10 a myší chromozom 19". Onkogen. 9 (2): 665–8. PMID 8290278.
Ayer DE, Kretzner L, Eisenman RN (1993). "Mad: heterodimerní partner pro Maxe, který antagonizuje transkripční aktivitu Myc". Buňka. 72 (2): 211–22. doi:10.1016/0092-8674(93)90661-9. PMID 8425218. S2CID 13317223.
Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN a kol. (1997). "Aktivita histon-deacetylázy je vyžadována pro úplnou transkripční represi mSin3A." Buňka. 89 (3): 341–7. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80214-7. PMID 9150133. S2CID 14233219.
Laherty CD, Yang WM, Sun JM a kol. (1997). "Histonové deacetylázy spojené s mSin3 corepressorem zprostředkovávají šílenou transkripční represi". Buňka. 89 (3): 349–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9. PMID 9150134. S2CID 13490886.
Gupta K, Anand G, Yin X a kol. (1998). „Mmip1: nový protein leucinového zipu, který ruší potlačující účinky členů rodiny Mad na c-myc“. Onkogen. 16 (9): 1149–59. doi:10.1038 / sj.onc.1201634. PMID 9528857.
FitzGerald MJ, Arsura M, Bellas RE a kol. (1999). „Diferenciální účinky široce exprimované dMax sestřihové varianty Maxe na E-box vs iniciátorem zprostředkovanou regulaci pomocí c-Myc“. Onkogen. 18 (15): 2489–98. doi:10.1038 / sj.onc.1202611. PMID 10229200.
Khan MM, Nomura T, Kim H a kol. (2001). "Role PML a PML-RARalfa v šíření zprostředkovaném transkripční represí". Mol. Buňka. 7 (6): 1233–43. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00257-X. PMID 11430826.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nikiforov MA, Popov N, Kotenko I a kol. (2003). „Základní domény Mad a Myc jsou funkčně ekvivalentní“. J. Biol. Chem. 278 (13): 11094–9. doi:10,1074 / jbc.M212298200. PMID 12538578.
Nair SK, Burley SK (2003). "Rentgenové struktury Myc-Max a Mad-Max rozpoznávající DNA. Molekulární základy regulace protoonkogenními transkripčními faktory". Buňka. 112 (2): 193–205. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01284-9. PMID 12553908. S2CID 16142388.
Siegel PM, Shu W, Massagué J (2003). „Šílená upregulace a represi Id2 doprovázejí potlačení růstu epiteliálních buněk zprostředkované transformujícím růstovým faktorem (TGF)“. J. Biol. Chem. 278 (37): 35444–50. doi:10,1074 / jbc.M301413200. PMID 12824180.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Zada AA, Pulikkan JA, Bararia D a kol. (2007). „Proteomický objev Maxe jako nového interagujícího partnera C / EBPalpha: odkaz Myc / Max / Mad“. Leukémie. 20 (12): 2137–46. doi:10.1038 / sj.leu.2404438. PMID 17082780.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q05195 (Max. Dimerizační protein 1) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000059728 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001156 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7829091-5] Shapiro DN, Valentine V, Eagle L, Yin X, Morris SW, Prochownik EV (únor 1995). "Přiřazení lidských genů MAD a MXI1 k chromozomům 2p12-p13 a 10q24-q25". Genomika. 23 (1): 282–5. doi:10.1006 / geno.1994.1496. PMID 7829091.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: MXD1 MAX dimerization protein 1“.

[pmid9150134-7] Laherty, C D; Yang W M; Sun J M; Davie J R; Seto E; Eisenman R N (květen 1997). "Histonové deacetylázy spojené s mSin3 corepressorem zprostředkovávají šílenou transkripční represi". Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 89 (3): 349–56. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9. ISSN 0092-8674. PMID 9150134. S2CID 13490886.

[pmid11101889-8] Spronk, CA; Tessari M; Kaan A M; Jansen J F; Vermeulen M; Stunnenberg H G; Vuister G W (prosinec 2000). „Interakce Mad1-Sin3B zahrnuje nový šroubovicový záhyb“. Nat. Struct. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 7 (12): 1100–4. doi:10.1038/81944. ISSN 1072-8368. PMID 11101889. S2CID 12451972.

[pmid9528857-9] A ^b Gupta, K; Anand G; Yin X; Grove L; Prochownik E V (březen 1998). „Mmip1: nový protein leucinového zipu, který ruší potlačující účinky členů rodiny Mad na c-myc“. Onkogen. ANGLIE. 16 (9): 1149–59. doi:10.1038 / sj.onc.1201634. ISSN 0950-9232. PMID 9528857.

[pmid11230181-10] Káhira, S; Merla G; Urbinati F; Ballabio A; Reymond A (březen 2001). „WBSCR14, gen mapující oblast s odstraněnou oblastí Williams-Beurenova syndromu, je novým členem sítě transkripčních faktorů Mlx“. Hučení. Mol. Genet. Anglie. 10 (6): 617–27. doi:10,1093 / hmg / 10,6,617. ISSN 0964-6906. PMID 11230181.

[pmid10918583-11] Meroni, G; Cairo S; Merla G; Messali S; Brent R; Ballabio A; Reymond A (červenec 2000). „Mlx, nový člen rodiny bHLHZip podobný Maxovi: hlavní fáze nové regulační cesty transkripčních faktorů?“. Onkogen. ANGLIE. 19 (29): 3266–77. doi:10.1038 / sj.onc.1203634. ISSN 0950-9232. PMID 10918583.

[pmid15235594-12] Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar (srpen 2004). "HBP1 a Mad1 represory váží doménu Sin3 corepressor PAH2 s opačnou spirálovou orientací". Nat. Struct. Mol. Biol. Spojené státy. 11 (8): 738–46. doi:10.1038 / nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594. S2CID 44324333.

[pmid11106735-13] Brubaker, K; Cowley S M; Huang K; Loo L; Yochum GS; Ayer D E; Eisenman RN; Radhakrishnan I (listopad 2000). „Struktura řešení interagujících domén komplexu Mad-Sin3: důsledky pro nábor komplexu modifikujícího chromatin“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 103 (4): 655–65. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00168-9. ISSN 0092-8674. PMID 11106735. S2CID 17476603.

[pmid7889570-14] Ayer, DE; Lawrence Q A; Eisenman R N (březen 1995). „Transkripční represe Mad-Max je zprostředkována tvorbou ternárních komplexů se savčími homology kvasinkového represoru Sin3“. Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 80 (5): 767–76. doi:10.1016/0092-8674(95)90355-0. ISSN 0092-8674. PMID 7889570. S2CID 8749951.

[pmid12391307-15] Lee, Clement M; Onésime Djamila; Reddy C Damodara; Dhanasekaran N; Reddy E Premkumar (říjen 2002). „JLP: Lešenový protein, který svazuje signalizační moduly JNK / p38MAPK a transkripční faktory“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 99 (22): 14189–94. Bibcode:2002PNAS ... 9914189L. doi:10.1073 / pnas.232310199. ISSN 0027-8424. PMC 137859. PMID 12391307.

[pmid8425218-16] Ayer, DE; Kretzner L; Eisenman R N (leden 1993). "Mad: heterodimerní partner pro Maxe, který antagonizuje transkripční aktivitu Myc". Buňka. SPOJENÉ STÁTY. 72 (2): 211–22. doi:10.1016/0092-8674(93)90661-9. ISSN 0092-8674. PMID 8425218. S2CID 13317223.

[pmid12553908-17] Nair, Satish K; Burley Stephen K (leden 2003). "Rentgenové struktury Myc-Max a Mad-Max rozpoznávající DNA. Molekulární základy regulace protoonkogenními transkripčními faktory". Buňka. Spojené státy. 112 (2): 193–205. doi:10.1016 / S0092-8674 (02) 01284-9. ISSN 0092-8674. PMID 12553908. S2CID 16142388.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]