ING4 - ING4

ING4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2K1J, 2M1R, 2PNX, 2VNF, 4AFL
Identifikátory
Aliasy	ING4, my036, p29inhibitor člena růstové rodiny 4
Externí ID	OMIM: 608524 MGI: 107307 HomoloGene: 22952 Genové karty: ING4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	6,663,142 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	125,049,265 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba kovových iontů; • vazba methylovaného histonu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• komplex histon-acetyltransferáza; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • cytoskelet s mezivláknem;
Biologický proces	• negativní regulace růstu; • acetylace histonu H4-K5; • replikace DNA; • acetylace histonů; • zástava buněčného cyklu; • acetylace histonu H3; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • acetylace histonu H4-K16; • buněčný cyklus; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • acetylace histonu H4-K8; • acetylace histonu H4-K12; • negativní regulace buněčné proliferace; • acetylace bílkovin; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k transkripci mediátoru třídy p21; • apoptotický proces; • organizace chromatinu; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51147
	28019
	ENSG00000111653
	ENSMUSG00000030330
	Q9UNL4
	Q8C0D7
NM_001127582; NM_001127583; NM_001127584; NM_001127585; NM_001127586;
	NM_016162; NM_198287
	NM_133345; NM_144510; NM_001368695
NP_001121054; NP_001121055; NP_001121056; NP_001121057; NP_001121058;
	NP_057246
	NP_579923; NP_001355624
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor růstového proteinu 4 je protein že u lidí je kódován ING4 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je podobný ING1, tumor supresorovému proteinu, který může interagovat s TP53, inhibovat růst buněk a vyvolávat apoptózu. Tento protein obsahuje PHD-prst, který je běžným motivem proteinů zapojených do remodelace chromatinu. Tento protein může vázat TP53 a EP300 / p300, což je součást komplexu histon-acetyl transferáza, což naznačuje jeho zapojení do regulační dráhy závislé na TP53. Alternativně byly pozorovány sestřižené varianty transkriptu, ale jejich biologická platnost nebyla stanovena.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že ING4 komunikovat s EP300,^[5] RELA^[7] a P53.^[5]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111653 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030330 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Shiseki M, Nagashima M, Pedeux RM, Kitahama-Shiseki M, Miura K, Okamura S, Onogi H, Higashimoto Y, Appella E, Yokota J, Harris CC (květen 2003). "p29ING4 a p28ING5 se vážou na p53 a p300 a zvyšují aktivitu p53". Výzkum rakoviny. 63 (10): 2373–8. PMID 12750254.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ING4 inhibitor růstové rodiny, člen 4“.
^ Garkavtsev I, Kozin SV, Chernova O, Xu L, Winkler F, Brown E, Barnett GH, Jain RK (březen 2004). "Kandidátní tumor supresorový protein ING4 reguluje růst mozkových nádorů a angiogenezi". Příroda. 428 (6980): 328–32. Bibcode:2004 Natur.428..328G. doi:10.1038 / nature02329. PMID 15029197. S2CID 4427531.
^ Tsai KW, Tseng HC, Lin WC (říjen 2008). „Dvě události rozkmitání ovlivňují subnukleární lokalizaci a degradaci proteinu ING4“. Experimentální výzkum buněk. 314 (17): 3130–41. doi:10.1016 / j.yexcr.2008.08.002. PMID 18775696.

Další čtení

Ozer A, Bruick RK (září 2005). „Regulace HIF prolylhydroxylázami: nábor potenciálního tumor supresorového proteinu ING4“. Buněčný cyklus. 4 (9): 1153–6. doi:10,4161 / cc.4.9.2040. PMID 16096374.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (srpen 2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97,9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Garkavtsev I, Kozin SV, Chernova O, Xu L, Winkler F, Brown E, Barnett GH, Jain RK (březen 2004). "Kandidátní tumor supresorový protein ING4 reguluje růst mozkových nádorů a angiogenezi". Příroda. 428 (6980): 328–32. Bibcode:2004 Natur.428..328G. doi:10.1038 / nature02329. PMID 15029197. S2CID 4427531.
Zhang X, Xu LS, Wang ZQ, Wang KS, Li N, Cheng ZH, Huang SZ, Wei DZ, Han ZG (červenec 2004). „ING4 indukuje zastavení buněčného cyklu G2 / M a zvyšuje chemosenzitivitu na látky poškozující DNA v buňkách HepG2“. FEBS Dopisy. 570 (1–3): 7–12. doi:10.1016 / j.febslet.2004.06.010. PMID 15251430. S2CID 12379202.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, Shenmen CM, Grouse LH, Schuler G, Klein SL, Old S, Rasooly R, Good P, Guyer M, Peck AM, Derge JG, Lipman D, Collins FS, Jang W, Sherry S Feolo M, Misquitta L, Lee E, Rotmistrovsky K, Greenhut SF, Schaefer CF, Buetow K, Bonner TI, Haussler D, Kent J, Kiekhaus M, Furey T, Brent M, Prange C, Schreiber K, Shapiro N, Bhat NK, Hopkins RF, Hsie F, Driscoll T, Soares MB, Casavant TL, Scheetz TE, Brown-stein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Piao Y, Dudekula DB, Ko MS, Kawakami K, Suzuki Y, Sugano S, Gruber CE, Smith MR, Simmons B, Moore T, Waterman R, Johnson SL, Ruan Y, Wei CL, Mathavan S, Gunaratne PH, Wu J, Garcia AM, Hulyk SW, Fuh E, Yuan Y, Sneed A, Kowis C, Hodgson A, Muzny DM, McPherson J, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madari A, Young AC, Wetherby KD, Granite SJ, Kwong PN , Brinkley CP, Pearson RL, Bouffard GG, Blakesly RW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, B utterfield YS, Griffith M, Griffith OL, Krzywinski MI, Liao N, Morin R, Morrin R, Palmquist D, Petrescu AS, Skalska U, Smailus DE, Stott JM, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Holt RA, Baross A , Marra MA, Clifton S, Makowski KA, Bosak S, Malek J (říjen 2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kim S, Chin K, Gray JW, Bishop JM (listopad 2004). „Screening genů, které potlačují ztrátu kontaktní inhibice: identifikace ING4 jako kandidátního supresorového genu pro nádor u člověka“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (46): 16251–6. Bibcode:2004PNAS..10116251K. doi:10.1073 / pnas.0407158101. PMC 528940. PMID 15528276.
Zhang X, Wang KS, Wang ZQ, Xu LS, Wang QW, Chen F, Wei DZ, Han ZG (červen 2005). „Signál nukleární lokalizace ING4 hraje klíčovou roli v jeho vazbě na p53“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 331 (4): 1032–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.04.023. PMID 15882981.
Ozer A, Wu LC, Bruick RK (květen 2005). „Kandidát potlačující nádor ING4 potlačuje aktivaci hypoxií indukovatelného faktoru (HIF)“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (21): 7481–6. Bibcode:2005PNAS..102.7481O. doi:10.1073 / pnas.0502716102. PMC 1140452. PMID 15897452.
Gunduz M, Nagatsuka H, Demircan K, Gunduz E, Cengiz B, Ouchida M, Tsujigiwa H, Yamachika E, Fukushima K, Beder L, Hirohata S, Ninomiya Y, Nishizaki K, Shimizu K, Nagai N (srpen 2005). „Častá delece a down-regulace ING4, kandidátního tumor supresorového genu na 12p13, v karcinomech dlaždicových buněk hlavy a krku“. Gen. 356: 109–17. doi:10.1016 / j.gene.2005.02.014. PMID 15935570.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kim SC, Sprung R, Chen Y, Xu Y, Ball H, Pei J, Cheng T, Kho Y, Xiao H, Xiao L, Grishin NV, White M, Yang XJ, Zhao Y (srpen 2006). „Substrátová a funkční rozmanitost acetylace lysinu odhalena proteomickým průzkumem“. Molekulární buňka. 23 (4): 607–18. doi:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID 16916647.
Unoki M, Shen JC, Zheng ZM, Harris CC (listopad 2006). „Nové varianty sestřihu ING4 a jejich možné role v regulaci buněčného růstu a motility“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (45): 34677–86. doi:10,1074 / jbc.M606296200. PMID 16973615.
Raho G, Miranda C, Tamborini E, Pierotti MA, Greco A (srpen 2007). "Detekce nových variant sestřihu mRNA humánního supresorového genu pro ING4". Onkogen. 26 (36): 5247–57. doi:10.1038 / sj.onc.1210335. PMID 17325660.
Zhang X, Lin DH, Jin Y, Wang KS, Zhang Y, Babilonia E, Wang Z, Wang Z, Giebisch G, Han ZG, Wang WH (květen 2007). „Inhibitor růstu 4 (ING4) je nadměrně regulován nízkým příjmem K a potlačuje vnější K mediální kanály (ROMK) stimulací MAPK“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (22): 9517–22. Bibcode:2007PNAS..104,9517Z. doi:10.1073 / pnas.0703383104. PMC 1890526. PMID 17517644.