EGR2 - EGR2

EGR2
Identifikátory
Aliasy	EGR2, AT591, CMT1D, CMT4E, KROX20, časná růstová reakce 2, CHN1
Externí ID	OMIM: 129010 MGI: 95296 HomoloGene: 20123 Genové karty: EGR2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	62,919,900 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	67,542,188 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba domény HMG boxu; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • vazba kovových iontů; • Aktivace transkripčního faktoru aktivující RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Aktivita SUMO ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• buněčná odpověď na organickou látku; • rytmické chování; • vývoj periferního nervového systému; • regulace transkripce, DNA-šablony; • vývoj kosočtverce 3; • segmentace mozku; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proteinová sumoylace; • tvorba kosočtverce 3; • transkripce, chráněná DNA; • reakce na inzulín; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj mozku; • tvorba kosočtverce 5; • export bílkovin z jádra; • učení nebo paměť; • diferenciace buněk kosterního svalstva; • Diferenciace Schwannových buněk; • regulace neuronální synaptické plasticity; • myelinizace; • strukturální organizace lícního nervu; • regulace osifikace; • vedení motorických neuronů axonem; • diferenciace tukových buněk; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1959
	13654
	ENSG00000122877
	ENSMUSG00000037868
	P11161
	P08152
	NM_000399; NM_001136177; NM_001136178; NM_001136179; NM_001321037
	NM_010118; NM_001347458
	NP_000390; NP_001129649; NP_001129650; NP_001129651; NP_001307966
NP_001334387; NP_034248; NP_001360912; NP_001360914; NP_001360915;
	NP_001360916
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Včasný růstový protein 2 je protein že u lidí je kódován EGR2 gen. EGR2 (také nazývaný Krox20) je transkripční regulační faktor, který obsahuje tři vazebná místa pro DNA se zinkovým prstem, a je vysoce exprimován v populaci migrujících buněk nervového hřebenu.^[5]^[6]^[7] Později se exprimuje v buňkách kraniálního ganglia odvozených z neurální lišty. Protein kódovaný Krox20 obsahuje dva zinkové prsty typu cys2his2. Exprese genu Krox20 je omezena na časný vývoj zadního mozku.^[6]^[8] Evolučně je konzervován u obratlovců, lidí, myší, kuřat a ryb zebry.^[9] Kromě toho je u obratlovců zachována aminokyselinová sekvence a většina aspektů embryonálního genového vzorce, což dále implikuje její roli ve vývoji zadního mozku.^[7]^[10]^[11]^[12] Když je Krox20 odstraněn u myší, je snížena schopnost kódování proteinu genu Krox20 (včetně domény vázající DNA na zinkový prst). Tyto myši nejsou schopné přežít po narození a vykazují závažné defekty zadního mozku.^[6]^[8] Tyto vady zahrnují, ale nejsou omezeny na vady tvorby lebečních senzorických ganglií, částečné fúze trigeminálního nervu (V) s obličejovými (VII) a sluchovými (VII) nervy, kořeny proximálních nervů vycházející z těchto ganglií byly dezorganizované a při vstupu do mozkového kmene se navzájem propletly a došlo k fúzi glossofaryngeálního (IX) nervového komplexu.^[13]^[14]^[15]

Funkce

Protein 2 pro časnou růstovou reakci je transkripční faktor se třemi tandemovými zinkovými prsty typu C2H2. Mutace v tomto genu jsou spojeny s autozomálně dominantním Charcot-Marie-Tooth nemoc, typ 1D,^[16] Dejerine – Sottasova choroba,^[17] a vrozená hypomelinizační neuropatie.^[18] Propojily se dvě studie EGR2 exprese k proliferaci osteoprogenitorů ^[19] a buněčné linie odvozené od Ewingova sarkomu, což je vysoce agresivní rakovina spojená s kostmi.^[20]

Nový výzkum naznačuje, že Krox20 - nebo jeho nedostatek - je příčinou mužské plešatosti.^[21]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000122877 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037868 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chavrier P, Janssen-Timmen U, Mattéi MG, Zerial M, Bravo R, Charnay P (únor 1989). "Struktura, umístění chromozomů a exprese genu myšího zinkového prstu Krox-20: více genových produktů a korelace s protoonkogenem c-fos". Molekulární a buněčná biologie. 9 (2): 787–97. doi:10,1128 / mcb. 9.2.787. PMC 362656. PMID 2496302.
^ ^A ^b ^C Swiatek PJ, Gridley T (listopad 1993). „Perinatální letalita a defekty vývoje zadního mozku u myší homozygotních pro cílenou mutaci genu pro zinkový prst Krox20“. Geny a vývoj. 7 (11): 2071–84. doi:10.1101 / gad.7.11.2071. PMID 8224839.
^ ^A ^b Wilkinson DG, Bhatt S, Chavrier P, Bravo R, Charnay P (únor 1989). "Segmentově specifická exprese genu se zinkovým prstem ve vyvíjejícím se nervovém systému myši". Příroda. 337 (6206): 461–4. Bibcode:1989 Natur.337..461W. doi:10.1038 / 337461a0. PMID 2915691. S2CID 4336310.
^ ^A ^b Bradley LC, Snape A, Bhatt S, Wilkinson DG (leden 1993). "Struktura a exprese genu Xenopus Krox-20: konzervované a divergentní vzorce exprese v kosočtvercích a neurálním hřebenu". Mechanismy rozvoje. 40 (1–2): 73–84. doi:10.1016 / 0925-4773 (93) 90089-g. PMID 8443108. S2CID 20347966.
^ Bhat RV, Worley PF, Cole AJ, Baraban JM (duben 1992). "Aktivace genu kódujícího zinkový prst krox-20 v mozku dospělých potkanů: srovnání se zif268". Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 13 (3): 263–6. doi:10.1016 / 0169-328x (92) 90034-9. PMID 1317498.
^ Wilkinson DG, Bhatt S, Cook M, Boncinelli E, Krumlauf R (říjen 1989). "Segmentální exprese genů obsahujících homoeobox Hox-2 ve vyvíjejícím se zadním mozku myší". Příroda. 341 (6241): 405–9. Bibcode:1989 Natur.341..405 W.. doi:10.1038 / 341405a0. PMID 2571936. S2CID 4324322.
^ Hunt P, Gulisano M, Cook M, Sham MH, Faiella A, Wilkinson D, Boncinelli E, Krumlauf R (říjen 1991). Msgstr "Zřetelný kód Hox pro větevní oblast hlavy obratlovců". Příroda. 353 (6347): 861–4. Bibcode:1991 Natur.353..861H. doi:10.1038 / 353861a0. PMID 1682814. S2CID 4312466.
^ Oxtoby E, Jowett T (březen 1993). "Klonování genu zebrafish krox-20 (krx-20) a jeho exprese během vývoje zadního mozku". Výzkum nukleových kyselin. 21 (5): 1087–95. doi:10.1093 / nar / 21.5.1087. PMC 309267. PMID 8464695.
^ Frohman MA, Boyle M, Martin GR (říjen 1990). „Izolace myšího genu Hox-2.9; analýza embryonální exprese naznačuje, že informace o poloze podél předozadní osy je specifikována mezodermem“. Rozvoj. 110 (2): 589–607. PMID 1983472.
^ Murphy P, Davidson DR, Hill RE (září 1989). "Segmentově specifická exprese genu obsahujícího homoeobox v myším zadním mozku". Příroda. 341 (6238): 156–9. Bibcode:1989 Natur.341..156M. doi:10.1038 / 341156a0. PMID 2571087. S2CID 4371764.
^ Nieto MA, Bradley LC, Wilkinson DG (1991). "Konzervovaná segmentová exprese Krox-20 v zadním mozku obratlovců a jeho vztah k omezení linie". Rozvoj. Suppl 2: 59–62. PMID 1688180.
^ „Entrez Gene: EGR2 časná růstová reakce 2 (Krox-20 homolog, Drosophila)“.
^ Boerkoel CF, Takashima H, Bacino CA, Daentl D, Lupski JR (červenec 2001). „Mutace EGR2 R359W způsobuje spektrum neuropatie Dejerine-Sottas“. Neurogenetika. 3 (3): 153–7. doi:10,1007 / s100480100107. PMID 11523566. S2CID 32746701.
^ Warner LE, Mancias P, Butler IJ, McDonald CM, Keppen L, Koob KG, Lupski JR (duben 1998). „Mutace v genu pro časnou růstovou reakci 2 (EGR2) jsou spojeny s dědičnými myelinopatiemi“. Genetika přírody. 18 (4): 382–4. doi:10.1038 / ng0498-382. PMID 9537424. S2CID 25550479.
^ Chandra A, Lan S, Zhu J, Siclari VA, Qin L (červenec 2013). „Signalizace receptoru epidermálního růstového faktoru (EGFR) podporuje proliferaci a přežití u osteoprogenitorů zvýšením exprese časné růstové reakce 2 (EGR2)“. The Journal of Biological Chemistry. 288 (28): 20488–98. doi:10,1074 / jbc.M112.447250. PMC 3711314. PMID 23720781.
^ Grünewald TG, Bernard V, Gilardi-Hebenstreit P, Raynal V, Surdez D, Aynaud MM a kol. (Září 2015). „Chimerická EWSR1-FLI1 reguluje gen náchylnosti k Ewingovu sarkomu EGR2 prostřednictvím mikrosatelitu GGAA“. Genetika přírody. 47 (9): 1073–8. doi:10,1038 / ng.3363. PMC 4591073. PMID 26214589.
^ Le, Lu. „Vědci najdou kožní buňky u kořene plešatějících šedivých vlasů“. UT Southwestern Medical Center. Citováno 9. května 2017.

Další čtení

Rangnekar VM, Aplin AC, Sukhatme VP (květen 1990). „Sérum a promotor reagující na TPA a struktura intron-exon EGR2, lidský gen reakce časného růstu kódující protein se zinkovým prstem“. Výzkum nukleových kyselin. 18 (9): 2749–57. doi:10.1093 / nar / 18.9.2749. PMC 330760. PMID 2111009.
Chavrier P, Janssen-Timmen U, Mattéi MG, Zerial M, Bravo R, Charnay P (únor 1989). "Struktura, umístění chromozomů a exprese genu myšího zinkového prstu Krox-20: více genových produktů a korelace s proto-onkogenem c-fos". Molekulární a buněčná biologie. 9 (2): 787–97. doi:10,1128 / mcb. 9.2.787. PMC 362656. PMID 2496302.
Joseph LJ, Le Beau MM, Jamieson GA, Acharya S, Shows TB, Rowley JD, Sukhatme VP (říjen 1988). „Molekulární klonování, sekvenování a mapování EGR2, lidského genu pro časnou růstovou reakci kódujícího protein se strukturou„ prstu vázajícího zinek “. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 85 (19): 7164–8. Bibcode:1988PNAS ... 85.7164J. doi:10.1073 / pnas.85.19.7164. PMC 282144. PMID 3140236.
Topilko P, Schneider-Maunoury S, Levi G, Baron-Van Evercooren A, Chennoufi AB, Seitanidou T, Babinet C, Charnay P (říjen 1994). „Krox-20 řídí myelinaci v periferním nervovém systému“. Příroda. 371 (6500): 796–9. Bibcode:1994Natur.371..796T. doi:10.1038 / 371796a0. PMID 7935840. S2CID 4333028.
Předstíraný MH, Vesque C, Nonchev S, Marshall H, Frain M, Gupta RD, Whiting J, Wilkinson D, Charnay P, Krumlauf R (leden 1993). "Gen zinkového prstu Krox20 reguluje HoxB2 (Hox2.8) během segmentace zadního mozku". Buňka. 72 (2): 183–96. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90659-E. PMID 8093858. S2CID 3205209.
Levi G, Topilko P, Schneider-Maunoury S, Lasagna M, Mantero S, Pesce B, Ghersi G, Cancedda R, Charnay P (červen 1996). "Role Krox-20 při tvorbě endochondrální kosti". Annals of the New York Academy of Sciences. 785 (1): 288–91. Bibcode:1996NYASA.785..288L. doi:10.1111 / j.1749-6632.1996.tb56286.x. PMID 8702157. S2CID 27761983.
Warner LE, Mancias P, Butler IJ, McDonald CM, Keppen L, Koob KG, Lupski JR (duben 1998). „Mutace v genu pro časnou růstovou reakci 2 (EGR2) jsou spojeny s dědičnými myelinopatiemi“. Genetika přírody. 18 (4): 382–4. doi:10.1038 / ng0498-382. PMID 9537424. S2CID 25550479.
Warner LE, Svaren J, Milbrandt J, Lupski JR (červenec 1999). „Funkční důsledky mutací genu pro časnou růstovou reakci 2 (EGR2) korelují se závažností lidských myelinopatií.“. Lidská molekulární genetika. 8 (7): 1245–51. doi:10,1093 / hmg / 8.7.1245. PMID 10369870.
Timmerman V, De Jonghe P, Ceuterick C, De Vriendt E, Löfgren A, Nelis E, Warner LE, Lupski JR, Martin JJ, Van Broeckhoven C (červen 1999). „Nová mutace missense v genu časné růstové odezvy 2 spojená s fenotypem syndromu Dejerine-Sottas“. Neurologie. 52 (9): 1827–32. doi:10.1212 / týden 522.9.1827. PMID 10371530. S2CID 11569651.
Bellone E, Di Maria E, Soriani S, Varese A, Doria LL, Ajmar F, Mandich P (říjen 1999). „Nová mutace (D305V) v genu pro časnou růstovou reakci 2 je spojena s těžkou nemocí typu 1 Charcot-Marie-Tooth“. Lidská mutace. 14 (4): 353–4. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (199910) 14: 4 <353 :: AID-HUMU17> 3.0.CO; 2-4. PMID 10502832.
Pareyson D, Taroni F, Botti S, Morbin M, Baratta S, Lauria G, Ciano C, Sghirlanzoni A (duben 2000). „Zapojení lebečních nervů u CMT onemocnění typu 1 v důsledku genové mutace časné růstové reakce 2“. Neurologie. 54 (8): 1696–8. doi:10.1212 / ml. 54.8.1696. hdl:2434/531868. PMID 10762521. S2CID 28404231.
Gambardella L, Schneider-Maunoury S, Voiculescu O, Charnay P, Barrandon Y (září 2000). "Vzor exprese transkripčního faktoru Krox-20 ve vlasovém folikulu myší". Mechanismy rozvoje. 96 (2): 215–8. doi:10.1016 / S0925-4773 (00) 00398-1. PMID 10960786. S2CID 18000564.
Yoshihara T, Kanda F, Yamamoto M, Ishihara H, Misu K, Hattori N, Chihara K, Sobue G (březen 2001). „Nová missense mutace v genu pro časnou růstovou reakci 2 spojená s pozdním nástupem Charcot-Marie-Toothovy choroby typu 1“. Časopis neurologických věd. 184 (2): 149–53. doi:10.1016 / S0022-510X (00) 00504-9. PMID 11239949. S2CID 19693658.
Boerkoel CF, Takashima H, Bacino CA, Daentl D, Lupski JR (červenec 2001). „Mutace EGR2 R359W způsobuje spektrum neuropatie Dejerine-Sottas“. Neurogenetika. 3 (3): 153–7. doi:10,1007 / s100480100107. PMID 11523566. S2CID 32746701.
Yang Y, Dong B, Mittelstadt PR, Xiao H, Ashwell JD (květen 2002). „HIV Tat váže proteiny Egr a zvyšuje na Egr závislou transaktivaci promotoru ligandu Fas“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (22): 19482–7. doi:10,1074 / jbc.M201687200. PMID 11909874.
Vandenberghe N, Upadhyaya M, Gatignol A, Boutrand L, Boucherat M, Chazot G, Vandenberghe A, Latour P (prosinec 2002). "Frekvence mutací v genu pro časnou růstovou reakci 2 spojená s periferními demyelinizačními neuropatiemi". Journal of Medical Genetics. 39 (12): 81e – 81. doi:10,1136 / jmg.39.12.e81. PMC 1757229. PMID 12471219.
Musso M, Balestra P, Taroni F, Bellone E, Mandich P (únor 2003). "Různé důsledky mutantů EGR2 na transaktivaci lidského promotoru Cx32". Neurobiologie nemocí. 12 (1): 89–95. doi:10.1016 / S0969-9961 (02) 00018-9. PMID 12609493. S2CID 29600641.
Unoki M, Nakamura Y (duben 2003). „EGR2 indukuje apoptózu v různých rakovinných buněčných liniích přímou transaktivací BNIP3L a BAK“. Onkogen. 22 (14): 2172–85. doi:10.1038 / sj.onc.1206222. PMID 12687019.
Numakura C, Shirahata E, Yamashita S, Kanai M, Kijima K, Matsuki T, Hayasaka K (červen 2003). "Screening genu pro časnou růstovou reakci 2 u japonských pacientů s Charcot-Marie-Toothovou chorobou typu 1". Časopis neurologických věd. 210 (1–2): 61–4. doi:10.1016 / S0022-510X (03) 00028-5. PMID 12736090. S2CID 36723641.