SMURF2 - SMURF2 - Wikipedia

SMURF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ZVD, 2DJY, 2JQZ, 2KXQ, 2LTZ
Identifikátory
Aliasy	SMURF2, SMAD specifická E3 ubikvitinová proteinová ligáza 2
Externí ID	OMIM: 605532 MGI: 1913563 HomoloGene: 41490 Genové karty: SMURF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	64,662,307 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	106,920,715 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba transformujícího růstového faktoru beta na receptory; • SMAD vazba;
Buněčná složka	• cytosol; • membrána; • komplex ubikvitin ligázy; • buněčná membrána; • nukleoplazma; • membránový vor; • jaderná skvrna; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • Signální dráha BMP; • pozitivní regulace migrace buněk trofoblastu; • na ubikvitinu závislý katabolický proces proteinu SMAD; • regulace signální dráhy transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • polyubikvitinace bílkovin; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • deubikvitinace bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • negativní regulace signální dráhy BMP; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • pozitivní regulace proteinového katabolického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64750
	66313
	ENSG00000108854
	ENSMUSG00000018363
	Q9HAU4
	A2A5Z6
	NM_022739
	NM_025481; NM_001362894
	NP_073576
	NP_079757; NP_001349823
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza SMURF2 je enzym že u lidí je kódován SMURF2 gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že SMURF2 komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108854 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018363 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C ^d Lin X, Liang M, Feng XH (listopad 2000). „Smurf2 je ubikvitin E3 ligáza zprostředkující degradaci Smad2 závislou na proteazomu při transformaci signalizace růstového faktoru-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36818–22. doi:10,1074 / jbc.C000580200. PMID 11016919.
^ „Entrez Gene: SMURF2 SMAD specifická E3 ubikvitinová proteinová ligáza 2“.
^ ^A ^b Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (červen 2001). „TGF-beta indukuje sestavení komplexu ubikvitin ligázy Smad2-Smurf2, který je zaměřen na degradaci SnoN“. Přírodní buněčná biologie. 3 (6): 587–95. doi:10.1038/35078562. PMID 11389444. S2CID 23270947.
^ ^A ^b Nakano A, Koinuma D, Miyazawa K, Uchida T, Saitoh M, Kawabata M, Hanai J, Akiyama H, Abe M, Miyazono K, Matsumoto T, Imamura T (březen 2009). „Pin1 down-reguluje signalizaci transformujícího růstového faktoru beta (TGF-beta) indukcí degradace proteinů Smad“. The Journal of Biological Chemistry. 284 (10): 6109–15. doi:10,1074 / jbc.M804659200. PMID 19122240.
^ Asano Y, Ihn H, Yamane K, Kubo M, Tamaki K (leden 2004). „Porucha Smad7-Šmoula zprostředkovaná negativní regulace signalizace TGF-beta ve sklerodermických fibroblastech“. The Journal of Clinical Investigation. 113 (2): 253–64. doi:10,1172 / JCI16269. PMC 310747. PMID 14722617.
^ Kavsak P, Rasmussen RK, Causing CG, Bonni S, Zhu H, Thomsen GH, Wrana JL (prosinec 2000). „Smad7 se váže na Smurf2 za vzniku ubikvitinové ligázy E3, která je zaměřena na degradaci TGF beta receptoru“. Molekulární buňka. 6 (6): 1365–75. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 00134-9. PMID 11163210.
^ ^A ^b ^C Lee YS, Han JM, Son SH, Choi JW, Jeon EJ, Bae SC, Park YI, Kim S (červenec 2008). „AIMP1 / p43 downregulates TGF-beta signaling through stabilisation of smurf2“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 371 (3): 395–400. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.04.099. PMID 18448069.
^ Fukunaga E, Inoue Y, Komiya S, Horiguchi K, Goto K, Saitoh M, Miyazawa K, Koinuma D, Hanyu A, Imamura T (prosinec 2008). „Smurf2 indukuje degradaci Smurf1 závislou na ubikvitinu, aby se zabránilo migraci buněk rakoviny prsu“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (51): 35660–7. doi:10,1074 / jbc.M710496200. PMID 18927080.
^ Carpentier I, Coornaert B, Beyaert R (říjen 2008). „Smurf2 je protein vázající TRAF2, který spouští ubikvitinaci TNF-R2 a aktivaci JNK vyvolanou TNF-R2“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 374 (4): 752–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.07.103. PMID 18671942.

Další čtení

Zhang Y, Chang C, Gehling DJ, Hemmati-Brivanlou A, Derynck R (leden 2001). „Regulace degradace a aktivity Smad pomocí Smurf2, ubikvitin ligázy E3“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (3): 974–9. doi:10.1073 / pnas.98.3.974. PMC 14694. PMID 11158580.
Kavsak P, Rasmussen RK, Causing CG, Bonni S, Zhu H, Thomsen GH, Wrana JL (prosinec 2000). „Smad7 se váže na Smurf2 za vzniku ubikvitinové ligázy E3, která je zaměřena na degradaci TGF beta receptoru“. Molekulární buňka. 6 (6): 1365–75. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00134-9. PMID 11163210.
Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (červen 2001). „TGF-beta indukuje sestavení komplexu ubikvitin ligázy Smad2-Smurf2, který je zaměřen na degradaci SnoN“. Přírodní buněčná biologie. 3 (6): 587–95. doi:10.1038/35078562. PMID 11389444. S2CID 23270947.
Subramaniam V, Li H, Wong M, Kitching R, Attisano L, Wrana J, Zubovits J, Burger AM, Seth A (říjen 2003). „Protein RING-H2 RNF11 je nadměrně exprimován u rakoviny prsu a je cílem ligázy Smurf2 E3“. British Journal of Cancer. 89 (8): 1538–44. doi:10.1038 / sj.bjc.6601301. PMC 2394340. PMID 14562029.
Asano Y, Ihn H, Yamane K, Kubo M, Tamaki K (leden 2004). „Porucha Smad7-Šmoula zprostředkovaná negativní regulace signalizace TGF-beta ve sklerodermických fibroblastech“. The Journal of Clinical Investigation. 113 (2): 253–64. doi:10,1172 / JCI16269. PMC 310747. PMID 14722617.
Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
Jin YH, Jeon EJ, Li QL, Lee YH, Choi JK, Kim WJ, Lee KY, Bae SC (červenec 2004). „Transformující růstový faktor-beta stimuluje acetylaci RUNX3 závislou na p300, která inhibuje degradaci zprostředkovanou ubikvitinací“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (28): 29409–17. doi:10,1074 / jbc.M313120200. PMID 15138260.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Zhang H, Cohen SN (prosinec 2004). „Smurf2 up-regulace aktivuje stárnutí závislé na telomerách“. Geny a vývoj. 18 (24): 3028–40. doi:10.1101 / gad.1253004. PMC 535914. PMID 15574587.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (březen 2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Ohashi N, Yamamoto T, Uchida C, Togawa A, Fukasawa H, Fujigaki Y, Suzuki S, Kitagawa K, Hattori T, Oda T, Hayashi H, Hishida A, Kitagawa M (květen 2005). "Transkripční indukce uburitin ligázy Smurf2 pomocí TGF-beta". FEBS Dopisy. 579 (12): 2557–63. doi:10.1016 / j.febslet.2005.03.069. hdl:10271/283. PMID 15862290. S2CID 38498506.
Ogunjimi AA, Briant DJ, Pece-Barbara N, Le Roy C, Di Guglielmo GM, Kavsak P, Rasmussen RK, Seet BT, Sicheri F, Wrana JL (srpen 2005). "Regulace aktivity uburitin ligázy Smurf2 kotvením E2 k doméně HECT". Molekulární buňka. 19 (3): 297–308. doi:10.1016 / j.molcel.2005.06.028. PMID 16061177.
Chong PA, Lin H, Wrana JL, Forman-Kay JD (červen 2006). „Rozšířený motiv rozpoznávání WW domén odhalený interakcí mezi Smad7 a E3 ubikvitin ligázou Smurf2“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (25): 17069–75. doi:10,1074 / jbc.M601493200. PMID 16641086.
Wiesner S, Ogunjimi AA, Wang HR, Rotin D, Sicheri F, Wrana JL, Forman-Kay JD (srpen 2007). "Autoinhibice ubikvitin ligázy typu HECT Smurf2 prostřednictvím její domény C2". Buňka. 130 (4): 651–62. doi:10.1016 / j.cell.2007.06.050. PMID 17719543. S2CID 16684837.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108854 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018363 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11016919-5] A ^b ^C ^d Lin X, Liang M, Feng XH (listopad 2000). „Smurf2 je ubikvitin E3 ligáza zprostředkující degradaci Smad2 závislou na proteazomu při transformaci signalizace růstového faktoru-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36818–22. doi:10,1074 / jbc.C000580200. PMID 11016919.

[entrez-6] „Entrez Gene: SMURF2 SMAD specifická E3 ubikvitinová proteinová ligáza 2“.

[pmid11389444-7] A ^b Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (červen 2001). „TGF-beta indukuje sestavení komplexu ubikvitin ligázy Smad2-Smurf2, který je zaměřen na degradaci SnoN“. Přírodní buněčná biologie. 3 (6): 587–95. doi:10.1038/35078562. PMID 11389444. S2CID 23270947.

[pmid19122240-8] A ^b Nakano A, Koinuma D, Miyazawa K, Uchida T, Saitoh M, Kawabata M, Hanai J, Akiyama H, Abe M, Miyazono K, Matsumoto T, Imamura T (březen 2009). „Pin1 down-reguluje signalizaci transformujícího růstového faktoru beta (TGF-beta) indukcí degradace proteinů Smad“. The Journal of Biological Chemistry. 284 (10): 6109–15. doi:10,1074 / jbc.M804659200. PMID 19122240.

[pmid14722617-9] Asano Y, Ihn H, Yamane K, Kubo M, Tamaki K (leden 2004). „Porucha Smad7-Šmoula zprostředkovaná negativní regulace signalizace TGF-beta ve sklerodermických fibroblastech“. The Journal of Clinical Investigation. 113 (2): 253–64. doi:10,1172 / JCI16269. PMC 310747. PMID 14722617.

[pmid11163210-10] Kavsak P, Rasmussen RK, Causing CG, Bonni S, Zhu H, Thomsen GH, Wrana JL (prosinec 2000). „Smad7 se váže na Smurf2 za vzniku ubikvitinové ligázy E3, která je zaměřena na degradaci TGF beta receptoru“. Molekulární buňka. 6 (6): 1365–75. doi:10.1016 / s1097-2765 (00) 00134-9. PMID 11163210.

[pmid18448069-11] A ^b ^C Lee YS, Han JM, Son SH, Choi JW, Jeon EJ, Bae SC, Park YI, Kim S (červenec 2008). „AIMP1 / p43 downregulates TGF-beta signaling through stabilisation of smurf2“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 371 (3): 395–400. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.04.099. PMID 18448069.

[pmid18927080-12] Fukunaga E, Inoue Y, Komiya S, Horiguchi K, Goto K, Saitoh M, Miyazawa K, Koinuma D, Hanyu A, Imamura T (prosinec 2008). „Smurf2 indukuje degradaci Smurf1 závislou na ubikvitinu, aby se zabránilo migraci buněk rakoviny prsu“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (51): 35660–7. doi:10,1074 / jbc.M710496200. PMID 18927080.

[pmid18671942-13] Carpentier I, Coornaert B, Beyaert R (říjen 2008). „Smurf2 je protein vázající TRAF2, který spouští ubikvitinaci TNF-R2 a aktivaci JNK vyvolanou TNF-R2“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 374 (4): 752–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.07.103. PMID 18671942.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]