PBX2 - PBX2

PBX2
Identifikátory
Aliasy	PBX2, G17, HOX12, PBX2MHC, PBX homeobox 2
Externí ID	OMIM: 176311 MGI: 1341793 HomoloGene: 48115 Genové karty: PBX2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	32,190,202 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	34,597,400 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • vazba transkripčního faktoru; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce;
Biologický proces	• tvorba proximálního / distálního vzoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • embryonální morfogeneze končetin; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5089
	18515
ENSG00000224952; ENSG00000237344; ENSG00000236353; ENSG00000232005; ENSG00000225987;
	ENSG00000206315; ENSG00000204304
	ENSMUSG00000034673
	P40425
	O35984
	NM_002586
	NM_017463
	NP_002577
	NP_059491
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor pre-B-buněčné leukémie 2 je protein že u lidí je kódován PBX2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje všudypřítomně exprimovaného člena rodiny homeoboxů TALE / PBX. Byl identifikován podle podobnosti s genem homeoboxu, který se podílí na translokaci t (1; 19) u akutních leukémií před B-buňkami. Tento protein je transkripční aktivátor, který se váže na promotor TLX1. Gen se nachází v hlavním histokompatibilním komplexu (MHC) na chromozomu 6.^[6]

Interakce

PBX2 bylo prokázáno komunikovat s HOXA9.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000237344, ENSG00000236353, ENSG00000232005, ENSG00000225987, ENSG00000206315, ENSG00000204304 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000224952, ENSG00000237344, ENSG0000023600, ENSG0000023600, ENSG0000023600, ENSG0000023600, ENSG0000023600 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034673 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sugaya K, Fukagawa T, Matsumoto K, Mita K, Takahashi E, Ando A, Inoko H, Ikemura T (září 1994). „Tři geny v oblasti lidského MHC třídy III poblíž spojení s třídou II: gen pro receptor konečných produktů pokročilé glykosylace, gen PBX2 homeobox a homolog zářezu, lidský protějšek genu myšího nádoru prsu int-3. Genomika. 23 (2): 408–19. doi:10.1006 / geno.1994.1517. PMID 7835890.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PBX2 pre-B-buněčná leukémie homeobox 2".
^ Shen WF, Rozenfeld S, Kwong A, Köm ves LG, Lawrence HJ, Largman C (duben 1999). „HOXA9 tvoří v myeloidních buňkách trojité komplexy s PBX2 a MEIS1“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (4): 3051–61. doi:10,1128 / mcb.19.4.3051. PMC 84099. PMID 10082572.

Další čtení

Monica K, Galili N, Nourse J, Saltman D, Cleary ML (prosinec 1991). „PBX2 a PBX3, nové geny homeoboxu s rozsáhlou homologií s lidskými protoonkogenovými PBX1“. Molekulární a buněčná biologie. 11 (12): 6149–57. doi:10,1128 / mcb.11.12.6149. PMC 361792. PMID 1682799.
Aguado B, Campbell RD (únor 1995). „Nový gen G17, který se nachází v lidském hlavním histokompatibilním komplexu, kóduje PBX2, protein obsahující homeodoménu“. Genomika. 25 (3): 650–9. doi:10.1016/0888-7543(95)80007-9. PMID 7759099.
Lu Q, Wright DD, Kamps MP (červen 1994). „Fúze s E2A konvertuje protein homebdomény Pbx1 na konstitutivní transkripční aktivátor v lidských leukémiích nesoucích translokaci t (1; 19)“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (6): 3938–48. doi:10,1128 / mcb.14.6.3938. PMC 358760. PMID 7910944.
Katsanis N, Fitzgibbon J, Fisher EM (červenec 1996). „Paralogy mapping: identification of region in the human MHC triplicated into human chromozomes 1 and 9 allows the prediction and isolation of new PBX and NOTCH loci“. Genomika. 35 (1): 101–8. doi:10.1006 / geno.1996.0328. PMID 8661110.
Berthelsen J, Zappavigna V, Mavilio F, Blasi F (březen 1998). „Prep1, nový funkční partner proteinů Pbx“. Časopis EMBO. 17 (5): 1423–33. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1423. PMC 1170490. PMID 9482739.
Shen WF, Rozenfeld S, Kwong A, Köm ves LG, Lawrence HJ, Largman C (duben 1999). „HOXA9 tvoří v myeloidních buňkách trojité komplexy s PBX2 a MEIS1“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (4): 3051–61. doi:10.1128 / MCB.19.4.3051. PMC 84099. PMID 10082572.
Fujino T, Yamazaki Y, Largaespada DA, Jenkins NA, Copeland NG, Hirokawa K, Nakamura T (červenec 2001). "Inhibice myeloidní diferenciace pomocí genů homeoboxů Hoxa9, Hoxb8 a Meis". Experimentální hematologie. 29 (7): 856–63. doi:10.1016 / S0301-472X (01) 00655-5. PMID 11438208.
Brzda RL, Kees UR, Watt PM (květen 2002). „Komplex obsahující PBX2 přispívá k aktivaci protoonkogenu HOX11.“ Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 294 (1): 23–34. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00426-6. PMID 12054735.
Okada Y, Nagai R, Sato T, Matsuura E, Minami T, Morita I, Doi T (červen 2003). „Homeodoménové proteiny MEIS1 a PBX regulují liniově specifickou transkripci genu pro trombocytární faktor 4“. Krev. 101 (12): 4748–56. doi:10.1182 / krev-2002-02-0380. PMID 12609849.
Longobardi E, Blasi F (říjen 2003). „Nadměrná exprese PREP-1 v buňkách teratokarcinomu F9 vede k funkčně relevantnímu zvýšení PBX-2 prevencí jeho degradace.“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (40): 39235–41. doi:10,1074 / jbc.M304704200. PMID 12871956.
Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn ME, Madan A, Qin S, Campbell RD, Hood L (prosinec 2003). „Analýza oblasti genově hustého hlavního histokompatibilního komplexu třídy III a její srovnání s myší“. Výzkum genomu. 13 (12): 2621–36. doi:10,1101 / gr. 1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.