Zinkový prst a protein obsahující BTB doménu 16 - Zinc finger and BTB domain-containing protein 16 - Wikipedia

ZBTB16
Protein ZBTB16 PDB 1buo.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyZBTB16, PLZF, ZNF145, zinkový prst a doména BTB obsahující 16
Externí IDOMIM: 176797 MGI: 103222 HomoloGene: 21214 Genové karty: ZBTB16
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro ZBTB16
Genomické umístění pro ZBTB16
Kapela11q23.2Start114,059,711 bp[1]
Konec114,256,765 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ZBTB16 205883 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

7704

235320

Ensembl

ENSG00000109906

ENSMUSG00000066687

UniProt

Q05516

Q3UQ17

RefSeq (mRNA)

NM_001018011
NM_006006
NM_001354750
NM_001354751
NM_001354752

NM_001033324
NM_001364543

RefSeq (protein)

NP_001018011
NP_005997
NP_001341679
NP_001341680
NP_001341681

NP_001028496
NP_001351472

Místo (UCSC)Chr 11: 114,06 - 114,26 MbChr 9: 48,65 - 48,84 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Zinkový prst a protein obsahující BTB doménu 16 je protein že u lidí je kódován ZBTB16 gen.

Funkce

Tento gen je členem rodiny proteinů typu Zruk-prst typu Krueppel C2H2 a kóduje a zinkový prst transkripční faktor který obsahuje devět domén zinkového prstu typu Kruppel na karboxylovém konci. Tento protein se nachází v jádru, podílí se na něm buněčný cyklus postup a interaguje s a histon deacetyláza. Byly spojeny specifické případy aberantního přeskupení genu v tomto místě akutní promyelocytární leukémie (APL)[5] a fyziologické role byly identifikovány u myší Přírodní zabijácké T buňky[6][7] a gama-delta T buňky.[8] U člověka byly charakterizovány alternativní transkripční sestřihové varianty.[9][10]

Interakce

Bylo prokázáno, že protein 16 se zinkovým prstem a BTB doménou obsahující komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000109906 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000066687 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Chen Z, Brand NJ, Chen A, Chen SJ, Tong JH, Wang ZY, Waxman S, Zelent A (1993). „Fúze mezi novým genem zinkového prstu podobným Krüppel a lokusem alfa-receptoru kyseliny retinové v důsledku translokace varianty t (11; 17) spojené s akutní promyelocytární leukemií“. Časopis EMBO. 12 (3): 1161–7. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05757.x. PMC  413318. PMID  8384553.
  6. ^ Kovalovsky D, Uche OU, Eladad S, Hobbs RM, Yi W, Alonzo E, Chua K, Eidson M a kol. (2008). „BTB-zinkový prstový transkripční regulátor, PLZF, řídí vývoj funkcí efektoru buněk iNKT“. Přírodní imunologie. 9 (9): 1055–64. doi:10.1038 / ni.1641. PMC  2662733. PMID  18660811.
  7. ^ Savage AK, Constantinides MG, Han J, Picard D, Martin E, Li B, Lantz O, Bendelac A (2008). „Transkripční faktor PLZF (Zbtb16) řídí efektorový program buněčné linie NKT“. Imunita. 29 (3): 391–403. doi:10.1016 / j.immuni.2008.07.011. PMC  2613001. PMID  18703361.
  8. ^ Kreslavsky T, Savage AK, Hobbs R, Gounari F, Bronson R, Pereira P, Pandolfi PP, Bendelac A, von Boehmer H (2009). "TCR-indukovatelný transkripční faktor PLZF požadovaný pro vrozený fenotyp podskupiny γδ T buněk s omezenou rozmanitostí TCR". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 106 (30): 12453–8. Bibcode:2009PNAS..10612453K. doi:10.1073 / pnas.0903895106. PMC  2718370. PMID  19617548.
  9. ^ Zhang T, Xiong H, Kan LX, Zhang CK, Jiao XF, Fu G, Zhang QH, Lu L a kol. (1999). „Genomická sekvence, strukturní organizace, molekulární evoluce a aberantní přesmyk genu pro zinkový prst promyelocytární leukémie“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (20): 11422–7. Bibcode:1999PNAS ... 9611422Z. doi:10.1073 / pnas.96.20.11422. PMC  18049. PMID  10500192.
  10. ^ „ZBTB16 zinkový prst a doména BTB obsahující 16“. Entrez. 4. října 2009. Citováno 10. října 2009.
  11. ^ Senbonmatsu T, Saito T, Landon EJ, Watanabe O, Price E, Roberts RL, Imboden H, Fitzgerald TG a kol. (2003). „Nová signální dráha receptoru pro angiotensin II typu 2: možná role při srdeční hypertrofii“. EMBO J.. 22 (24): 6471–82. doi:10.1093 / emboj / cdg637. PMC  291832. PMID  14657020.
  12. ^ Dhordain P, Albagli O, Honore N, Guidez F, Lantoine D, Schmid M, The HD, Zelent A, Koken MH (2000). „Kolokalizace a heteromerizace mezi dvěma lidskými proteiny onkogenu POZ / zinku, LAZ3 (BCL6) a PLZF“. Onkogen. 19 (54): 6240–50. doi:10.1038 / sj.onc.1203976. PMID  11175338.
  13. ^ Barna M, Merghoub T, Costoya JA, Ruggero D, Branford M, Bergia A, Samori B, Pandolfi PP (2002). „Plzf zprostředkovává transkripční represi exprese genu HoxD prostřednictvím remodelace chromatinu“. Dev. Buňka. 3 (4): 499–510. doi:10.1016 / s1534-5807 (02) 00289-7. PMID  12408802.
  14. ^ A b Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP (2001). „Akutní protein spojený s akutní promyelocytární leukemií, promyelocytární leukémie, zinek, reguluje monocytovou diferenciaci buněk U937 indukovanou 1,25-dihydroxyvitaminem D (3) fyzickou interakcí s receptorem vitaminu D (3).“ Krev. 98 (12): 3290–300. doi:10.1182 / krev.v98.12.3290. PMID  11719366.
  15. ^ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D a kol. (2002). „Produkty translokace spojené s AML blokují diferenciaci indukovanou vitaminem D (3) sekvestrací receptoru vitaminu D (3)“. Cancer Res. 62 (23): 7050–8. PMID  12460926.
  16. ^ McLoughlin P, Ehler E, Carlile G, Licht JD, Schäfer BW (2002). „Protein DRAL / FHL2 obsahující pouze LIM interaguje s a je jádrovým represorem proteinu zinkových prstů promyelocytární leukémie“. J. Biol. Chem. 277 (40): 37045–53. doi:10,1074 / jbc.M203336200. PMID  12145280.
  17. ^ Labbaye C, Quaranta MT, Pagliuca A, Militi S, Licht JD, Testa U, Peschle C (2002). „PLZF indukuje megakaryocytový vývoj, aktivuje expresi Tpo receptoru a interaguje s proteinem GATA1“. Onkogen. 21 (43): 6669–79. doi:10.1038 / sj.onc.1205884. PMID  12242665.
  18. ^ Tsuzuki S, Enver T (2002). „Interakce GATA-2 s proteinem promyelocytární leukemie se zinkovým prstem (PLZF), jeho homologem FAZF a receptorem alfa-onkoproteinu generovaným receptorem PLZF-retinové kyseliny t (11; 17)“. Krev. 99 (9): 3404–10. doi:10.1182 / krev.v99.9.3404. PMID  11964310.
  19. ^ A b C d Chauchereau A, Mathieu M, de Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z, Dejean A, Harel-Bellan A (2004). „HDAC4 zprostředkovává transkripční represi proteinem PLZF spojeným s akutní promyelocytární leukémií“. Onkogen. 23 (54): 8777–84. doi:10.1038 / sj.onc.1208128. PMID  15467736.
  20. ^ A b C David G, Alland L, Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A (1998). „Histon-deacetyláza spojená s mSin3A zprostředkovává represi pomocí PLZF proteinu spojeného s akutní promyelocytární leukémií“. Onkogen. 16 (19): 2549–56. doi:10.1038 / sj.onc.1202043. PMID  9627120.
  21. ^ A b C Wong CW, Privalsky ML (1998). „Komponenty komplexu SMRT corepressor vykazují výrazné interakce s onkoproteiny v doméně POZ PLZF, PLZF-RARalpha a BCL-6“. J. Biol. Chem. 273 (42): 27695–702. doi:10.1074 / jbc.273.42.27695. PMID  9765306.
  22. ^ A b Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (2002). „Histonové deacetylázy třídy II jsou přímo přijímány transkripčním represorem BCL6“ (PDF). J. Biol. Chem. 277 (24): 22045–52. doi:10,1074 / jbc.M201736200. PMID  11929873. S2CID  19024903.
  23. ^ Nanba D, Mammoto A, Hashimoto K, Higashiyama S (2003). „Proteolytické uvolňování karboxyterminálního fragmentu proHB-EGF způsobuje nukleární export PLZF“. J. Cell Biol. 163 (3): 489–502. doi:10.1083 / jcb.200303017. PMC  2173632. PMID  14597771.
  24. ^ Nanba D, Toki F, Higashiyama S (2004). "Role nabitých aminokyselinových zbytků v cytoplazmatické doméně proHB-EGF". Biochem. Biophys. Res. Commun. 320 (2): 376–82. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.05.176. PMID  15219838.
  25. ^ Takahashi S, McConnell MJ, Harigae H, Kaku M, Sasaki T, Melnick AM, Licht JD (2004). „Interní mutant duplikace tandemu Flt3 inhibuje funkci transkripčních represorů blokováním interakcí s SMRT“. Krev. 103 (12): 4650–8. doi:10.1182 / krev-2003-08-2759. PMID  14982881.
  26. ^ Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML (1997). „Korpresor SMRT interaguje s PLZF a s receptorem kyseliny PML-retinové alfa alfa (RARalpha) a onkoproteiny PLZF-RARalfa spojenými s akutní promyelocytární leukemií“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (17): 9028–33. Bibcode:1997PNAS ... 94.9028H. doi:10.1073 / pnas.94.17.9028. PMC  23013. PMID  9256429.
  27. ^ Koken MH, Reid A, Quignon F, Chelbi-Alix MK, Davies JM, Kabarowski JH, Zhu J, Dong S a kol. (1997). „Partneři fúze alfa-receptorů s kyselinou retinovou asociovaných s leukémií, PML a PLZF, heterodimerizují a kolokalizují do jaderných těl“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (19): 10255–60. Bibcode:1997PNAS ... 9410255K. doi:10.1073 / pnas.94.19.10255. PMC  23349. PMID  9294197.
  28. ^ Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A, Carlile GW, Arai S, Ball HJ, Lutterbach B, Hiebert SW, Licht JD (2000). „Protein ETO narušený v akutní myeloidní leukémii asociované s t (8; 21) je jádrovým represorem proteinu zinkových prstů promyelocytární leukémie“. Mol. Buňka. Biol. 20 (6): 2075–86. doi:10.1128 / mcb.20.6.2075-2086.2000. PMC  110824. PMID  10688654.
  29. ^ Melnick A, Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A, Hiebert SW, Licht JD (2000). „Fúzní protein AML-1 / ETO je dominantním negativním inhibitorem transkripční represe promyelocytární leukemií se zinkovým prstem“. Krev. 96 (12): 3939–47. doi:10.1182 / krev. V96.12.3939. PMID  11090081.
  30. ^ Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P, Lefebvre P (2003). „PLZF je negativní regulátor transkripční aktivity receptoru kyseliny retinové“. Nucl. Přijměte. 1 (1): 6. doi:10.1186/1478-1336-1-6. PMC  212040. PMID  14521715.
  31. ^ Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N a kol. (1999). „Nový BTB / POZ transkripční represorový protein interaguje s Fanconiho anemickým proteinem skupiny C a PLZF“. Krev. 94 (11): 3737–47. doi:10,1182 / krev. V94.11.3737. PMID  10572087.

Další čtení

externí odkazy

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.