GABPA - GABPA
Alfa řetězec proteinu vázajícího GA je protein že u lidí je kódován GABPA gen.[5]
Funkce
Tento gen kóduje jednu ze tří podjednotek transkripčního faktoru vázajícího GA, který funguje jako podjednotka vázající DNA. Jelikož tato podjednotka sdílí identitu s podjednotkou kódující gen nukleárního respiračního faktoru 2, je pravděpodobně zapojena do aktivace exprese cytochromoxidázy a jaderné kontroly mitochondriální funkce. Tato podjednotka také sdílí identitu s podjednotkou tvořící transkripční faktor E4TF1, odpovědný za expresi genu adenoviru E4. Vzhledem ke své chromozomální lokalizaci a schopnosti tvořit heterodimery s jinými polypeptidy může tento gen hrát roli ve fenotypu Downova syndromu.[6]
Interakce
GABPA bylo prokázáno komunikovat s Faktor hostitelské buňky C1,[7] Transkripční faktor Sp1[8] a Transkripční faktor Sp3.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154727 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000008976 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Watanabe H, Sawada J, Yano K, Yamaguchi K, Goto M, Handa H (březen 1993). "cDNA klonování transkripčního faktoru E4TF1 podjednotek s Ets a zářezovými motivy". Molekulární a buněčná biologie. 13 (3): 1385–91. doi:10.1128 / MCB.13.3.1385. PMC 359448. PMID 8441384.
- ^ "Entrez Gene: GABPA GA vazebný proteinový transkripční faktor, alfa podjednotka 60 kDa".
- ^ Vogel JL, Kristie TM (únor 2000). „Nový koaktivátor C1 (HCF) koordinuje tvorbu zesilovače multiproteinů a zprostředkovává aktivaci transkripce pomocí GABP“. Časopis EMBO. 19 (4): 683–90. doi:10.1093 / emboj / 19.4.683. PMC 305606. PMID 10675337.
- ^ A b Galvagni F, Capo S, Oliviero S (březen 2001). „Sp1 a Sp3 fyzicky interagují a spolupracují s GABP pro aktivaci promotoru utrofinu“ (PDF). Journal of Molecular Biology. 306 (5): 985–96. doi:10.1006 / jmbi.2000.4335. hdl:2318/141203. PMID 11237613.
Další čtení
- Chrast R, Chen H, Morris MA, Antonarakis SE (červenec 1995). "Mapování genu lidského transkripčního faktoru GABPA (E4TF1-60) na chromozom 21". Genomika. 28 (1): 119–22. doi:10.1006 / geno.1995.1117. PMID 7590737.
- Sawada J, Goto M, Watanabe H, Handa H, Yoshida MC (leden 1995). "Regionální mapování dvou podjednotek transkripčního faktoru E4TF1 na lidský chromozom". Japonský žurnál výzkumu rakoviny. 86 (1): 10–2. doi:10.1111 / j.1349-7006.1995.tb02981.x. PMC 5920589. PMID 7737900.
- Gugneja S, Virbasius JV, Scarpulla RC (leden 1995). „Čtyři strukturně odlišné podjednotky lidského nukleárního respiračního faktoru 2 nevázající DNA sdílejí konzervovanou transkripční aktivační doménu“. Molekulární a buněčná biologie. 15 (1): 102–11. doi:10.1128 / MCB.15.1.102. PMC 231915. PMID 7799916.
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Goto M, Shimizu T, Sawada J, Sawa C, Watanabe H, Ichikawa H, Ohira M, Ohki M, Handa H (prosinec 1995). "Přiřazení genu E4TF1-60 k lidskému chromozomu 21q21.2-q21.3". Gen. 166 (2): 337–8. doi:10.1016/0378-1119(95)00575-7. PMID 8543189.
- Sawa C, Goto M, Suzuki F, Watanabe H, Sawada J, Handa H (prosinec 1996). „Funkční domény transkripčního faktoru hGABP beta1 / E4TF1-53 potřebné pro lokalizaci jader a aktivaci transkripce“. Výzkum nukleových kyselin. 24 (24): 4954–61. doi:10.1093 / nar / 24.24.4954. PMC 146336. PMID 9016666.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Batchelor AH, Piper DE, de la Brousse FC, McKnight SL, Wolberger C (únor 1998). "Struktura GABPalpha / beta: ETS doména - ankyrin opakující se heterodimer vázaný na DNA". Věda. 279 (5353): 1037–41. Bibcode:1998Sci ... 279.1037B. doi:10.1126 / science.279.5353.1037. PMID 9461436.
- Suzuki F, Goto M, Sawa C, Ito S, Watanabe H, Sawada J, Handa H (listopad 1998). "Funkční interakce transkripčního faktoru lidské GA podjednotky vázající protein". The Journal of Biological Chemistry. 273 (45): 29302–8. doi:10.1074 / jbc.273.45.29302. PMID 9792629.
- Itoh K, Wakabayashi N, Katoh Y, Ishii T, Igarashi K, Engel JD, Yamamoto M (leden 1999). „Keap1 potlačuje jadernou aktivaci prvků reagujících na antioxidanty pomocí Nrf2 prostřednictvím vazby na amino-koncovou doménu Neh2“. Geny a vývoj. 13 (1): 76–86. doi:10.1101 / gad.13.1.76. PMC 316370. PMID 9887101.
- Bannert N, Avots A, Baier M, Serfling E, Kurth R (únor 1999). „Faktory vázající protein GA, společně s koaktivátorem CREB vazebný protein / p300, řídí indukci promotoru interleukinu 16 v T lymfocytech.“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (4): 1541–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.1541B. doi:10.1073 / pnas.96.4.1541. PMC 15509. PMID 9990060.
- Sawada J, Simizu N, Suzuki F, Sawa C, Goto M, Hasegawa M, Imai T, Watanabe H, Handa H (prosinec 1999). „Synergická transkripční aktivace hGABP a vybrané členy rodiny proteinů vázajících se na aktivační transkripční faktor / cAMP. The Journal of Biological Chemistry. 274 (50): 35475–82. doi:10.1074 / jbc.274.50.35475. PMID 10585419.
- Guo A, Nie F, Wong-Riley M (únor 2000). "Lidský jaderný respirační faktor 2 alfa podjednotka cDNA: izolace, subklonování, sekvenování a in situ hybridizace transkriptů v normálním a monokulárně zbaveném makakovém vizuálním systému". The Journal of Comparative Neurology. 417 (2): 221–32. doi:10.1002 / (SICI) 1096-9861 (20000207) 417: 2 <221 :: AID-CNE7> 3.0.CO; 2-4. PMID 10660899.
- Vogel JL, Kristie TM (únor 2000). „Nový koaktivátor C1 (HCF) koordinuje tvorbu zesilovače multiproteinů a zprostředkovává aktivaci transkripce pomocí GABP“. Časopis EMBO. 19 (4): 683–90. doi:10.1093 / emboj / 19.4.683. PMC 305606. PMID 10675337.
- Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, Watanabe H, Yada T, Park HS, Toyoda A, Ishii K, Totoki Y, Choi DK, Groner Y, Soeda E, Ohki M, Takagi T, Sakaki Y, Taudien S, Blechschmidt K , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Beck A, Klages S, Hennig S, Riesselmann L, Dagand E, Haaf T, Wehrmeyer S, Borzym K, Gardiner K, Nizetic D, Francis F, Lehrach H, Reinhardt R, Yaspo ML (květen 2000). „Sekvence DNA lidského chromozomu 21“. Příroda. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
- Galvagni F, Capo S, Oliviero S (březen 2001). „Sp1 a Sp3 fyzicky interagují a spolupracují s GABP pro aktivaci promotoru utrofinu“ (PDF). Journal of Molecular Biology. 306 (5): 985–96. doi:10.1006 / jmbi.2000.4335. hdl:2318/141203. PMID 11237613.
- Dhakshinamoorthy S, Porter AG (květen 2004). „Transkripční up-regulace indukovaná oxidem dusnatým pomocí Nrf2 prostřednictvím prvku antioxidační odezvy působí proti apoptóze buněk neuroblastomu“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (19): 20096–107. doi:10,1074 / jbc.M312492200. PMID 14985350.
- Shen G, Hebbar V, Nair S, Xu C, Li W, Lin W, Keum YS, Han J, Gallo MA, Kong AN (květen 2004). „Regulace aktivity transaktivační domény Nrf2. Diferenciální účinky kaskád proteinkináz aktivovaných mitogenem a synergický stimulační účinek proteinu vázajícího Raf a CREB“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (22): 23052–60. doi:10,1074 / jbc.M401368200. PMID 15020583.
externí odkazy
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |