Receptor kyseliny retinové alfa - Retinoic acid receptor alpha

RARA
Protein RARA PDB 1dkf.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRARA, NR1B1, RAR, receptor kyseliny retinové alfa
Externí IDOMIM: 180240 MGI: 97856 HomoloGene: 20262 Genové karty: RARA
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro RARA
Genomické umístění pro RARA
Kapela17q21.2Start40,309,180 bp[1]
Konec40,357,643 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RARA 203750 s na fs.png

PBB GE RARA 211605 s na fs.png

PBB GE RARA 203749 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5914

19401

Ensembl

ENSG00000131759

ENSMUSG00000037992

UniProt

P10276
Q6I9R7

P11416

RefSeq (mRNA)

NM_000964
NM_001024809
NM_001033603
NM_001145301
NM_001145302

NM_001176528
NM_001177302
NM_001177303
NM_009024
NM_001361954

RefSeq (protein)

NP_001169999
NP_001170773
NP_001170774
NP_033050
NP_001348883

Místo (UCSC)Chr 17: 40,31 - 40,36 MbChr 11: 98,93 - 98,97 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Receptor kyseliny retinové alfa (RAR-α), také známý jako NR1B1 (podrodina jaderného receptoru 1, skupina B, člen 1) je a jaderný receptor že u lidí je kódován RARA gen.[5][6]

Funkce

Retinoid signalizace je přenášena 2 rodinami nukleárních receptorů, receptorem kyseliny retinové (RAR ) a retinoidový X receptor (RXR ), které tvoří heterodimery RXR / RAR. V nepřítomnosti ligandu RXR / RARA vázaná na DNA potlačuje transkripci náborem korepresorů NCOR1, SMRT (NCOR2 ), a histon deacetyláza. Když se ligand váže na komplex, indukuje to konformační změnu umožňující nábor koaktivátorů, histon acetyltransferáz a základního transkripčního aparátu.[7]

Klinický význam

Translokace, které vždy zahrnují přeskupení genu RARA, jsou hlavním rysem akutní promyelocytární leukémie (APL; MIM 612376). Nejčastější translokací je t (15,17) (q21; q22), který spojuje gen RARA s PML gen.[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že alfa receptor receptoru retinové komunikovat s:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131759 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037992 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Giguere V, Ong ES, Segui P, Evans RM (1987). "Identifikace receptoru pro kyselinu morfogen retinovou". Příroda. 330 (6149): 624–9. Bibcode:1987 Natur.330..624G. doi:10.1038 / 330624a0. PMID  2825036. S2CID  4308015.
  6. ^ Anderson LA, Friedman L, Osborne-Lawrence S, Lynch E, Weissenbach J, Bowcock A, King MC (září 1993). „Genetická mapa s vysokou hustotou oblasti BRCA1 chromozomu 17q12-q21“. Genomika. 17 (3): 618–23. doi:10.1006 / geno.1993.1381. PMID  8244378.
  7. ^ "Entrez Gene: receptor kyseliny retinové".
  8. ^ Vitoux D, Nasr R, de The H (2007). „Akutní promyelocytární leukémie: nové problémy v patogenezi a reakci na léčbu“. Int. J. Biochem. Cell Biol. 39 (6): 1063–70. doi:10.1016 / j.biocel.2007.01.028. PMID  17468032.
  9. ^ Liu R, Takayama S, Zheng Y, Froesch B, Chen GQ, Zhang X, Reed JC, Zhang XK (červenec 1998). „Interakce BAG-1 s receptorem kyseliny retinové a její inhibice apoptózy vyvolané kyselinou retinovou v rakovinných buňkách“. J. Biol. Chem. 273 (27): 16985–92. doi:10.1074 / jbc.273.27.16985. PMID  9642262.
  10. ^ A b McNamara P, Seo SB, Rudic RD, Sehgal A, Chakravarti D, FitzGerald GA (červen 2001). "Regulace hodin a MOP4 nukleárními receptory hormonů ve vaskulatuře: humorální mechanismus k resetování periferních hodin". Buňka. 105 (7): 877–89. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9. PMID  11439184. S2CID  6251321.
  11. ^ Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (únor 2003). „Cyklin D3 je kofaktorem receptorů kyseliny retinové, který moduluje jejich aktivitu v přítomnosti buněčného proteinu vázajícího kyselinu retinovou II“. J. Biol. Chem. 278 (8): 6355–62. doi:10,1074 / jbc.M210697200. PMID  12482873.
  12. ^ Lee SK, Jung SY, Kim YS, Na SY, Lee YC, Lee JW (únor 2001). „Dvě odlišné domény interakce s jaderným receptorem a funkce CREB-vázající se na protein závislá na transaktivační funkci aktivujícího signálního kointegrátoru-2“. Mol. Endokrinol. 15 (2): 241–54. doi:10.1210 / me.15.2.241. PMID  11158331.
  13. ^ Lee SK, Anzick SL, Choi JE, Bubendorf L, Guan XY, Jung YK, Kallioniemi OP, Kononen J, Trent JM, Azorsa D, Jhun BH, Cheong JH, Lee YC, Meltzer PS, Lee JW (listopad 1999). „Jaderný faktor, ASC-2, jako rakovinou zesílený transkripční koaktivátor nezbytný pro ligand-dependentní transaktivaci jadernými receptory in vivo“. J. Biol. Chem. 274 (48): 34283–93. doi:10.1074 / jbc.274.48.34283. PMID  10567404.
  14. ^ Ko L, Cardona GR, Chin WW (květen 2000). „Protein vázající na hormony štítné žlázy, protein obsahující motiv LXXLL, funguje jako obecný koaktivátor“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (11): 6212–7. Bibcode:2000PNAS ... 97,6212K. doi:10.1073 / pnas.97.11.6212. PMC  18584. PMID  10823961.
  15. ^ Dowell P, Ishmael JE, Avram D, Peterson VJ, Nevrivy DJ, Leid M (květen 1999). „Identifikace jádrového receptoru jaderného receptoru jako proteinu interagujícího s receptorem aktivovaným proliferátorem peroxisomu“. J. Biol. Chem. 274 (22): 15901–7. doi:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID  10336495.
  16. ^ Guidez F, Ivins S, Zhu J, Söderström M, Waxman S, Zelent A (duben 1998). "Snížená citlivost na kyselinu retinovou na vazebný korepresor jaderných receptorů na PML a PLZF-RARalfa je základem molekulární patogeneze a léčby akutní promyelocytární leukémie". Krev. 91 (8): 2634–42. doi:10,1182 / krev. V91.8.2634.2634_2634_2642. PMID  9531570.
  17. ^ Dong S, Tweardy DJ (duben 2002). „Interakce STAT5b-RARalfa, nového fúzního proteinu akutní promyelocytární leukémie, s receptorem kyseliny retinové a signálními cestami STAT3“. Krev. 99 (8): 2637–46. doi:10,1182 / krev. V99.8.2637. PMID  11929748.
  18. ^ Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML (srpen 1997). „Korpresor SMRT interaguje s PLZF a s receptorem kyseliny PML-retinové alfa alfa (RARalpha) a onkoproteiny PLZF-RARalfa spojenými s akutní promyelocytární leukemií“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (17): 9028–33. Bibcode:1997PNAS ... 94.9028H. doi:10.1073 / pnas.94.17.9028. PMC  23013. PMID  9256429.
  19. ^ Hu X, Chen Y, Farooqui M, Thomas MC, Chiang CM, Wei LN (leden 2004). „Supresivní účinek proteinu 140 interagujícího s receptorem na vazbu koregulátoru na komplexy receptoru kyseliny retinové, aktivitu enzymu modifikujícího histon a aktivaci genu“. J. Biol. Chem. 279 (1): 319–25. doi:10,1074 / jbc.M307621200. PMID  14581481.
  20. ^ Farooqui M, Franco PJ, Thompson J, Kagechika H, ​​Chandraratna RA, Banaszak L, Wei LN (únor 2003). "Účinky retinoidních ligandů na RIP140: molekulární interakce s retinoidovými receptory a biologická aktivita". Biochemie. 42 (4): 971–9. doi:10.1021 / bi020497k. PMID  12549917.
  21. ^ L'Horset F, Dauvois S, Heery DM, Cavaillès V, Parker MG (listopad 1996). „RIP-140 interaguje s více jadernými receptory prostřednictvím dvou odlišných míst“. Mol. Buňka. Biol. 16 (11): 6029–36. doi:10.1128 / MCB.16.11.6029. PMC  231605. PMID  8887632.
  22. ^ Seol W, Choi HS, Moore DD (květen 1996). „Sirotčí jaderný hormonový receptor, kterému chybí doména vázající DNA a heterodimerizuje se s jinými receptory“. Věda. 272 (5266): 1336–9. Bibcode:1996Sci ... 272.1336S. doi:10.1126 / science.272.5266.1336. PMID  8650544. S2CID  32853062.
  23. ^ Seol W, Hanstein B, Brown M, Moore DD (říjen 1998). „Inhibice působení estrogenového receptoru na osiřelý receptor SHP (krátký heterodimerový partner)“. Mol. Endokrinol. 12 (10): 1551–7. doi:10.1210 / me.12.10.1551. PMID  9773978.
  24. ^ Perlmann T, Jansson L (duben 1995). „Nová cesta pro signalizaci vitaminu A zprostředkovanou heterodimerizací RXR s NGFI-B a NURR1“. Genes Dev. 9 (7): 769–82. doi:10,1101 / gad. 9.7 769. PMID  7705655.
  25. ^ Zhong S, Delva L, Rachez C, Cenciarelli C, Gandini D, Zhang H, Kalantry S, Freedman LP, Pandolfi PP (listopad 1999). „RA závislý, transkripční komplex potlačující růst nádoru je cílem onkoproteinů PML-RARalfa a T18“. Nat. Genet. 23 (3): 287–95. doi:10.1038/15463. PMID  10610177. S2CID  23613492.
  26. ^ Benkoussa M, značka C, Delmotte MH, Formstecher P, Lefebvre P (červenec 2002). „Receptory kyseliny retinové inhibují aktivaci AP1 regulací extracelulární signálně regulované kinázy a náboru CBP na promotor reagující na AP1“. Mol. Buňka. Biol. 22 (13): 4522–34. doi:10.1128 / MCB.22.13.4522-4534.2002. PMC  133906. PMID  12052862.
  27. ^ Bugge TH, Pohl J, Lonnoy O, Stunnenberg HG (duben 1992). „RXR alfa, promiskuitní partner receptorů kyseliny retinové a hormonů štítné žlázy“. EMBO J.. 11 (4): 1409–18. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05186.x. PMC  556590. PMID  1314167.
  28. ^ Kim HJ, Yi JY, Sung HS, Moore DD, Jhun BH, Lee YC, Lee JW (září 1999). „Aktivační signální kointegrátor 1, nový transkripční koaktivátor jaderných receptorů a jeho cytosolická lokalizace za podmínek deprivace séra“. Mol. Buňka. Biol. 19 (9): 6323–32. doi:10,1128 / mcb.19,9.6323. PMC  84603. PMID  10454579.
  29. ^ He B, Wilson EM (březen 2003). „Elektrostatická modulace při náboru steroidních receptorů motivů LXXLL a FXXLF“. Mol. Buňka. Biol. 23 (6): 2135–50. doi:10.1128 / MCB.23.6.2135-2150.2003. PMC  149467. PMID  12612084.
  30. ^ Zeng M, Kumar A, Meng G, Gao Q, Dimri G, Wazer D, skupina H, skupina V (listopad 2002). „Onkoprotein lidského papilomaviru 16 E6 inhibuje transaktivaci zprostředkovanou retinovým X receptorem cílením na lidský koaktivátor ADA3“. J. Biol. Chem. 277 (47): 45611–8. doi:10,1074 / jbc.M208447200. PMID  12235159.
  31. ^ Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P, Lefebvre P (září 2003). „PLZF je negativní regulátor transkripční aktivity receptoru kyseliny retinové“. Nucl. Přijměte. 1 (1): 6. doi:10.1186/1478-1336-1-6. PMC  212040. PMID  14521715.

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.