ZBTB33 - ZBTB33

ZBTB33
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LT7, 3 FKC, 3M4T, 3M8V, 4F6M, 4F6N
Identifikátory
Aliasy	ZBTB33, ZNF-kaiso, ZNF348, zinkový prst a doména BTB obsahující 33
Externí ID	OMIM: 300329 MGI: 1927290 HomoloGene: 4931 Genové karty: ZBTB33
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	120,258,398 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	38,197,046 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba methyl-CpG; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Wnt signální cesta; • transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10009
	56805
	ENSG00000177485
	ENSMUSG00000048047
	Q86T24
	Q8BN78
	NM_006777; NM_001184742
	NM_001079513; NM_020256
	NP_001171671; NP_006768
	NP_001072981; NP_064652
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Regulátor transkripce Kaiso je protein že u lidí je kódován ZBTB33 gen.^[5] Tento gen kóduje transkripční regulátor s bimodální specificitou vázání DNA, který se váže na methylovaný CGCG a také na nemetylované konsensuální místo vazby KAISO TCCTGCNA. Protein obsahuje N-koncovou POZ / BTB doménu a 3 C-koncové motivy zinkových prstů. Přijímá represorový komplex N-CoR, aby podporoval deacetylaci histonů a tvorbu represivních chromatinových struktur v promotorech cílového genu. Může přispívat k represi cílových genů signální dráhy Wnt a může také aktivovat transkripci podmnožiny cílových genů náborem catenin delta-2 (CTNND2). Jeho interakce s cateninem delta-1 (CTNND1) inhibuje vazbu na methylovanou i nemetylovanou DNA. Rovněž interaguje přímo s nukleárním importním receptorem Importin-α2 (také známý jako karyoferin alfa2 nebo RAG kohorta 1), který může zprostředkovat jaderný import tohoto proteinu. Alternativně byly identifikovány sestřihové varianty transkriptu kódující stejný protein.^[6]

Interakce

ZBTB33 bylo prokázáno komunikovat s HDAC3,^[7] Korepresor jaderného receptoru 1^[7] a CTNND1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000177485 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048047 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ZBTB33 zinkový prst a doména BTB obsahující 33“.
^ „ZBTB33 zinkový prst a doména BTB obsahující 33 [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2016-03-22.
^ ^A ^b Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Molekulární buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
^ Daniel JM, Reynolds AB (květen 1999). „Katenin p120 (ctn) interaguje s Kaiso, novým transkripčním faktorem zinkového prstu v doméně BTB / POZ“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (5): 3614–23. doi:10,1128 / mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID 10207085.

Další čtení

Daniel JM, Reynolds AB (květen 1999). „Katenin p120 (ctn) interaguje s Kaiso, novým transkripčním faktorem zinkového prstu v doméně BTB / POZ“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (5): 3614–23. doi:10,1128 / mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID 10207085.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Prokhortchouk A, Hendrich B, Jørgensen H, Ruzov A, Wilm M, Georgiev G, Bird A, Prokhortchouk E (červenec 2001). „Partner Katen p120 Kaiso je transkripční represor závislý na methylaci DNA“. Geny a vývoj. 15 (13): 1613–8. doi:10.1101 / gad.198501. PMC 312733. PMID 11445535.
Daniel JM, Ireton RC, Reynolds AB (červen 2001). "Monoklonální protilátky proti Kaiso: nový transkripční faktor a protein vázající p120ctn". Hybridom. 20 (3): 159–66. doi:10.1089/027245701750293484. PMID 11461664.
Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Molekulární buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
Kondapalli J, Flozak AS, Albuquerque ML (březen 2004). „Laminární smykové napětí odlišně moduluje genovou expresi p120 kateninu, transkripčního faktoru Kaiso a vaskulárního endoteliálního kadherinu v endoteliálních buňkách lidské koronární arterie“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (12): 11417–24. doi:10,1074 / jbc.M306057200. PMID 14699141.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Kim SW, Park JI, Spring CM, Sater AK, Ji H, Otchere AA, Daniel JM, McCrea PD (prosinec 2004). „Nekanonické signály Wnt jsou modulovány transkripčním represorem Kaiso a p120-kateninem.“ Přírodní buněčná biologie. 6 (12): 1212–20. doi:10.1038 / ncb1191. PMID 15543138. S2CID 19404686.
Ruzov A, Dunican DS, Prokhortchouk A, Pennings S, Stancheva I, Prokhortchouk E, Meehan RR (prosinec 2004). „Kaiso je genomový represor transkripce, který je nezbytný pro vývoj obojživelníků“. Rozvoj. 131 (24): 6185–94. doi:10.1242 / dev.01549. PMID 15548582.
Kelly KF, Otchere AA, Graham M, Daniel JM (prosinec 2004). „Jaderný dovoz transkripčního regulátoru BTB / POZ Kaiso“. Journal of Cell Science. 117 (Pt 25): 6143–52. doi:10.1242 / jcs.01541. PMID 15564377.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Soubry A, van Hengel J, Parthoens E, Colpaert C, Van Marck E, Waltregny D, Reynolds AB, van Roy F (březen 2005). „Exprese a nukleární umístění transkripčního represoru Kaiso je regulováno mikroprostředím nádoru“. Výzkum rakoviny. 65 (6): 2224–33. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-2020. PMID 15781635.
Spring CM, Kelly KF, O'Kelly I, Graham M, Crawford HC, Daniel JM (květen 2005). „Katenin p120ctn inhibuje transkripční represi zprostředkovanou Kaiso beta-katenin / TCF cílového genu matrilysinu“. Experimentální výzkum buněk. 305 (2): 253–65. doi:10.1016 / j.yexcr.2005.01.007. PMID 15817151.
Arányi T, Faucheux BA, Khalfallah O, Vodjdani G, Biguet NF, Mallet J, Meloni R (červenec 2005). „Tkáňově specifická methylace genu lidské tyrosinhydroxylázy odhaluje nové regulační prvky v prvním exonu“. Journal of Neurochemistry. 94 (1): 129–39. doi:10.1111 / j.1471-4159.2005.03173.x. PMID 15953356.
Defossez PA, Kelly KF, Filion GJ, Pérez-Torrado R, Magdinier F, Menoni H, Nordgaard CL, Daniel JM, Gilson E (prosinec 2005). „CTC-vazebný faktor blokátoru lidského zesilovače interaguje s transkripčním faktorem Kaiso“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (52): 43017–23. doi:10,1074 / jbc.M510802200. PMID 16230345.

externí odkazy

ZBTB33 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook ZBTB33
ZBTB33 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
ZBTB33 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000177485 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048047 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: ZBTB33 zinkový prst a doména BTB obsahující 33“.

[6] „ZBTB33 zinkový prst a doména BTB obsahující 33 [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2016-03-22.

[pmid14527417-7] A ^b Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (září 2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Molekulární buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.

[pmid10207085-8] Daniel JM, Reynolds AB (květen 1999). „Katenin p120 (ctn) interaguje s Kaiso, novým transkripčním faktorem zinkového prstu v doméně BTB / POZ“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (5): 3614–23. doi:10,1128 / mcb.19.5.3614. PMC 84161. PMID 10207085.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]