ARNTL2 - ARNTL2

ARNTL2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 kB
Identifikátory
Aliasy	ARNTL2, BMAL2, CLIF, MOP9, PASD9, bHLHe6, nukleární translokátor aryl uhlovodíkových receptorů jako 2
Externí ID	OMIM: 614517 MGI: 2684845 HomoloGene: 10609 Genové karty: ARNTL2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	27,425,289 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	146,833,529 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci proximální oblasti RNA polymerázy II; • Vazba e-boxu; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jádro; • buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace cirkadiánního rytmu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • cirkadiánní rytmus; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • rytmický proces; • strhávání cirkadiánních hodin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	56938
	272322
	ENSG00000029153
	ENSMUSG00000040187
	Q8WYA1
	Q2VPD4
	NM_001248002; NM_001248003; NM_001248004; NM_001248005; NM_020183
	NM_172309; NM_001289679; NM_001289680; NM_001289681
	NP_001234931; NP_001234932; NP_001234933; NP_001234934; NP_064568
	NP_001276608; NP_001276609; NP_001276610; NP_758513
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor podobný 2, také známý jako Mop9,^[5] Bmal2,^[6] Clif,^[7] nebo Arntl2, je gen.

Arntl2 je paralog na Arntl, což jsou oba homology Drosophily Cyklus.^[8] Homologové byli také izolováni v rybách,^[9] ptactvo^[10] a savci, jako jsou myši^[11] a lidé.^[5] Na základě fylogenetických analýz bylo navrženo, že Arntl2 vznikl duplikací genu Arntl na počátku linie obratlovců, následovanou rychlou divergencí kopie genu Arntl.^[11] Proteinový produkt genu interaguje s oběma HODINY a NPAS2 vázat se na sekvence E-boxu v regulovaných promotorech a aktivovat jejich transkripci.^[5] Ačkoli Arntl2 není vyžadován pro normální funkci cirkadiánního oscilátoru savců, může hrát důležitou roli při zprostředkování výstupu cirkadiánní hodiny. Snad z tohoto důvodu existuje relativně málo publikované literatury o úloze Arntl2 v regulaci fyziologie.

Arntl2 je kandidátský gen pro člověka cukrovka 1. typu.^[12]

Ve studiích nad expresí tvoří protein ARNTL2 heterodimer s CLOCK pro regulaci sekvencí E-box v promotoru Pai-1.^[7] Poslední práce naznačují, že tato interakce může být ve shodě s heterodimerními komplexy ARNTL / CLOCK.^[13]

Viz také

Arntl (Bmal1)

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000029153 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040187 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Hogenesch JB, Gu YZ, Moran SM, Shimomura K, Radcliffe LA, Takahashi JS, Bradfield CA (červenec 2000). „Základní protein helix-loop-helix-PAS MOP9 je mozkově specifický heterodimerní partner cirkadiánních a hypoxických faktorů“. The Journal of Neuroscience. 20 (13): RC83. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-13-j0002.2000. PMC 6772280. PMID 10864977.
^ Ikeda M, Yu W, Hirai M, Ebisawa T, Honma S, Yoshimura K, Honma KI, Nomura M (srpen 2000). „cDNA klonování nového genu superrodiny bHLH-PAS transkripčního faktoru, BMAL2: jeho exprese mRNA, subcelulární distribuce a chromozomální lokalizace“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 275 (2): 493–502. doi:10,1006 / bbrc.2000.3248. PMID 10964693.
^ ^A ^b Maemura K, de la Monte SM, Chin MT, Layne MD, Hsieh CM, Yet SF, Perrella MA, Lee ME (listopad 2000). „CLIF, nový faktor podobný cyklu, reguluje cirkadiánní oscilaci exprese genu inhibitoru aktivátoru plazminogenu-1“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36847–51. doi:10,1074 / jbc.C000629200. PMID 11018023.
^ Rutila JE, Suri V, Le M, So WV, Rosbash M, Hall JC (květen 1998). „CYCLE je druhý hodinový protein bHLH-PAS nezbytný pro cirkadiánní rytmus a transkripci období Drosophila a nadčasový“. Buňka. 93 (5): 805–14. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81441-5. PMID 9630224. S2CID 18175560.
^ Cermakian N, Whitmore D, Foulkes NS, Sassone-Corsi P (duben 2000). „Asynchronní oscilace dvou partnerů CLOCK zebrafish odhalují řízení a funkci diferenciálních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (8): 4339–44. Bibcode:2000PNAS ... 97.4339C. doi:10.1073 / pnas.97.8.4339. PMC 18243. PMID 10760301.
^ Okano T, Yamamoto K, Okano K, Hirota T, Kasahara T, Sasaki M, Takanaka Y, Fukada Y (září 2001). "Kuřecí epifýzové geny: implikace BMAL2 jako obousměrného regulátoru v cirkadiánních oscilacích hodin". Geny do buněk. 6 (9): 825–36. doi:10.1046 / j.1365-2443.2001.00462.x. PMID 11554928. S2CID 45261835.
^ ^A ^b Okano T, Sasaki M, Fukada Y (březen 2001). „Klonování myšího BMAL2 a jeho denního profilu exprese v suprachiasmatickém jádru: pozoruhodné zrychlení divergence sekvence Bmal2 po duplikaci genu Bmal“. Neurovědy Dopisy. 300 (2): 111–4. doi:10.1016 / S0304-3940 (01) 01581-6. PMID 11207387. S2CID 27706733.
^ Hung MS, Avner P, Rogner UC (září 2006). "Identifikace transkripčního faktoru ARNTL2 jako kandidátského genu pro lokus Idd6 diabetu typu 1". Lidská molekulární genetika. 15 (18): 2732–42. doi:10,1093 / hmg / ddl209. PMID 16893914.
^ Schoenhard JA, Smith LH, Painter CA, Eren M, Johnson CH, Vaughan DE (květen 2003). "Regulace promotoru PAI-1 pomocí cirkadiánních hodin: diferenční aktivace pomocí BMAL1 a BMAL2". Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 35 (5): 473–81. doi:10.1016 / S0022-2828 (03) 00051-8. PMID 12738229.

externí odkazy

ARNTL2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk ARNTL2 umístění genomu a ARNTL2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8WYA1 (Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor-like protein 2) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000029153 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040187 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10864977-5] A ^b ^C Hogenesch JB, Gu YZ, Moran SM, Shimomura K, Radcliffe LA, Takahashi JS, Bradfield CA (červenec 2000). „Základní protein helix-loop-helix-PAS MOP9 je mozkově specifický heterodimerní partner cirkadiánních a hypoxických faktorů“. The Journal of Neuroscience. 20 (13): RC83. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-13-j0002.2000. PMC 6772280. PMID 10864977.

[pmid10964693-6] Ikeda M, Yu W, Hirai M, Ebisawa T, Honma S, Yoshimura K, Honma KI, Nomura M (srpen 2000). „cDNA klonování nového genu superrodiny bHLH-PAS transkripčního faktoru, BMAL2: jeho exprese mRNA, subcelulární distribuce a chromozomální lokalizace“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 275 (2): 493–502. doi:10,1006 / bbrc.2000.3248. PMID 10964693.

[pmid11018023-7] A ^b Maemura K, de la Monte SM, Chin MT, Layne MD, Hsieh CM, Yet SF, Perrella MA, Lee ME (listopad 2000). „CLIF, nový faktor podobný cyklu, reguluje cirkadiánní oscilaci exprese genu inhibitoru aktivátoru plazminogenu-1“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36847–51. doi:10,1074 / jbc.C000629200. PMID 11018023.

[8] Rutila JE, Suri V, Le M, So WV, Rosbash M, Hall JC (květen 1998). „CYCLE je druhý hodinový protein bHLH-PAS nezbytný pro cirkadiánní rytmus a transkripci období Drosophila a nadčasový“. Buňka. 93 (5): 805–14. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81441-5. PMID 9630224. S2CID 18175560.

[9] Cermakian N, Whitmore D, Foulkes NS, Sassone-Corsi P (duben 2000). „Asynchronní oscilace dvou partnerů CLOCK zebrafish odhalují řízení a funkci diferenciálních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (8): 4339–44. Bibcode:2000PNAS ... 97.4339C. doi:10.1073 / pnas.97.8.4339. PMC 18243. PMID 10760301.

[10] Okano T, Yamamoto K, Okano K, Hirota T, Kasahara T, Sasaki M, Takanaka Y, Fukada Y (září 2001). "Kuřecí epifýzové geny: implikace BMAL2 jako obousměrného regulátoru v cirkadiánních oscilacích hodin". Geny do buněk. 6 (9): 825–36. doi:10.1046 / j.1365-2443.2001.00462.x. PMID 11554928. S2CID 45261835.

[Okano_T,_Sasaki_M,_Fukada_Y_2001_111–4-11] A ^b Okano T, Sasaki M, Fukada Y (březen 2001). „Klonování myšího BMAL2 a jeho denního profilu exprese v suprachiasmatickém jádru: pozoruhodné zrychlení divergence sekvence Bmal2 po duplikaci genu Bmal“. Neurovědy Dopisy. 300 (2): 111–4. doi:10.1016 / S0304-3940 (01) 01581-6. PMID 11207387. S2CID 27706733.

[pmid16893914-12] Hung MS, Avner P, Rogner UC (září 2006). "Identifikace transkripčního faktoru ARNTL2 jako kandidátského genu pro lokus Idd6 diabetu typu 1". Lidská molekulární genetika. 15 (18): 2732–42. doi:10,1093 / hmg / ddl209. PMID 16893914.

[pmid12738229-13] Schoenhard JA, Smith LH, Painter CA, Eren M, Johnson CH, Vaughan DE (květen 2003). "Regulace promotoru PAI-1 pomocí cirkadiánních hodin: diferenční aktivace pomocí BMAL1 a BMAL2". Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 35 (5): 473–81. doi:10.1016 / S0022-2828 (03) 00051-8. PMID 12738229.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]