RFX2 - RFX2

RFX2
Identifikátory
Aliasy	RFX2, regulační faktor X2
Externí ID	OMIM: 142765 MGI: 106583 HomoloGene: 30980 Genové karty: RFX2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	6,199,572 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	56,831,013 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • diferenciace buněk; • spermatogeneze; • sestava akrozomu; • vývoj spermatidů; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • organizace projekce buněk; • cilium morfogeneze; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5990
	19725
	ENSG00000087903
	ENSMUSG00000024206
	P48378
	P48379
	NM_000635; NM_134433
	NM_009056; NM_027787
	NP_000626; NP_602309
	NP_033082; NP_082063
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA vázající protein RFX2 je protein že u lidí je kódován RFX2 gen.^[5]^[6]

Tento gen je členem rodiny genů regulačního faktoru X, která kóduje transkripční faktory které obsahují vysoce konzervovanou křídlovou helixovou DNA vazebnou doménu. Protein kódovaný tímto genem strukturálně souvisí s regulačními faktory X1, X3, X4 a X5. Je to transkripční aktivátor které se mohou vázat DNA jako monomer nebo jako heterodimer s dalšími členy rodiny RFX. Tento protein se může vázat na cis prvky v promotoru IL-5 gen alfa receptoru. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly pro tento gen popsány a obě varianty využívají alternativní polyadenylační místa.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000087903 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024206 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pugliatti L, Derre J, Berger R, Ucla C, Reith W, Mach B (září 1992). „Geny pro regulační faktory MHC třídy II RFX1 a RFX2 jsou umístěny na krátkém rameni chromozomu 19“. Genomika. 13 (4): 1307–10. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90052-T. PMID 1505960.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RFX2 regulační faktor X, 2 (ovlivňuje expresi HLA třídy II)“.

Další čtení

Reith W, Ucla C, Barras E a kol. (1994). „RFX1, transaktivátor zesilovače I viru hepatitidy B, patří do nové rodiny homodimerních a heterodimerních proteinů vázajících DNA“. Mol. Buňka. Biol. 14 (2): 1230–44. doi:10.1128 / MCB.14.2.1230. PMC 358479. PMID 8289803.
Doyle J, Hoffman S, Ucla C a kol. (1996). „Umístění lidských a myších genů kódujících proteiny transkripčního faktoru RFX1 a RFX2“. Genomika. 35 (1): 227–30. doi:10.1006 / geno.1996.0343. PMID 8661125.
Hillier LD, Lennon G, Becker M a kol. (1997). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Iwama A, Pan J, Zhang P a kol. (1999). „Dimerní RFX proteiny přispívají k aktivitě a liniové specificitě promotoru alfa receptoru interleukinu-5 prostřednictvím aktivačních a represivních domén“. Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 3940–50. doi:10.1128 / MCB.19.6.3940. PMC 104353. PMID 10330134.
Morotomi-Yano K, Yano K, Saito H a kol. (2002). „Lidský regulační faktor X 4 (RFX4) je varlat specifický dimerní protein vázající DNA, který spolupracuje s dalšími lidskými členy RFX“. J. Biol. Chem. 277 (1): 836–42. doi:10,1074 / jbc.M108638200. PMID 11682486.
Sengupta PK, Fargo J, Smith BD (2002). „Rodina RFX interaguje na počátečním místě kolagenu (COL1A2) a potlačuje transkripci“. J. Biol. Chem. 277 (28): 24926–37. doi:10,1074 / jbc.M111712200. PMID 11986307.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Maijgren S, Sur I, Nilsson M, Toftgård R (2004). "Zapojení proteinů RFX do transkripční aktivace z prvku zesilovače reagujícího na Ras". Oblouk. Dermatol. Res. 295 (11): 482–9. doi:10.1007 / s00403-004-0456-5. PMID 15024578. S2CID 2408607.
Horvath GC, Kistler WS, Kistler MK (2005). „RFX2 je potenciální transkripční regulační faktor pro histon H1t a další geny exprimované během meiotické fáze spermatogeneze“. Biol. Reprod. 71 (5): 1551–9. doi:10.1095 / biolreprod.104.032268. PMID 15229132.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

externí odkazy

RFX2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000087903 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024206 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1505960-5] Pugliatti L, Derre J, Berger R, Ucla C, Reith W, Mach B (září 1992). „Geny pro regulační faktory MHC třídy II RFX1 a RFX2 jsou umístěny na krátkém rameni chromozomu 19“. Genomika. 13 (4): 1307–10. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90052-T. PMID 1505960.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RFX2 regulační faktor X, 2 (ovlivňuje expresi HLA třídy II)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]