Receptor kyseliny retinové gama - Retinoic acid receptor gamma

RARG
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1EXA, 1EXX, 1FCX, 1FCY, 1FCZ, 1FD0, 2 libry, 3LBD, 4LBD
Identifikátory
Aliasy	RARGNR1B3, RARC, gama receptor kyseliny retinové
Externí ID	OMIM: 180190 MGI: 97858 HomoloGene: 20263 Genové karty: RARG
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	53,232,980 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	102,257,517 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • aktivita receptoru steroidních hormonů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • vazba na retinoid X receptor; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • transkripční regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba transkripčního faktoru; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu; • aktivita signálního receptoru; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 aktivita jaderného receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • nukleoplazma; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• regulace velikosti buněk; • vývoj chrupavky růstové ploténky; • buněčná odpověď na kyselinu retinovou; • vývoj žláz; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace vývoje chrupavky; • reakce na kyselinu retinovou; • růst mnohobuněčných organismů; • negativní regulace buněčné diferenciace; • morfogeneze kostí; • vývoj chondrocytů; • negativní regulace apoptotického procesu; • vývoj pigmentového epitelu sítnice; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj epitelu; • embryonální vývoj očí typu kamery; • vývoj reprodukční struktury; • vývoj končetin; • vývoj obličeje; • uzavření neurální trubice; • negativní regulace diferenciace chondrocytů; • Harderiánský vývoj žláz; • morfogeneze epitelu prostaty; • regulace myelinizace; • pozitivní regulace genové exprese; • vývoj sítnice v oku kamerového typu; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • růst chondrocytů chondrocytů růst; • kanonická signální cesta Wnt; • regulace genové exprese; • vývoj očí typu kamery; • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace diferenciace myeloidních buněk; • vývoj kostí; • vývoj chrupavky průdušnice; • specifikace předního / zadního vzoru; • vývoj žlázových epiteliálních buněk; • steroidní hormon zprostředkovaná signální dráha; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • embryonální morfogeneze zadní končetiny; • signální dráha pro receptor kyseliny retinové; • negativní regulace buněčné proliferace; • embryonální morfogeneze očí; • pozitivní regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace programované buněčné smrti; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii; • vývoj mnohobuněčných organismů; • hormonálně zprostředkovaná signální dráha; • diferenciace buněk; • reakce na lipid;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5916
	19411
	ENSG00000172819
	ENSMUSG00000001288
	P13631
	P18911
	NM_000966; NM_001042728; NM_001243730; NM_001243731; NM_001243732
	NM_001042727; NM_011244
	NP_000957; NP_001036193; NP_001230659; NP_001230660; NP_001230661
	NP_001036192; NP_035374
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptor kyseliny retinové gama (RAR-y), také známý jako NR1B3 (podrodina jaderného receptoru 1, skupina B, člen 3) je a jaderný receptor kódováno RARG gen.^[5]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že gama receptoru kyseliny retinové komunikovat s NCOR1.^[7]

Viz také

Receptor kyseliny retinové

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172819 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001288 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: RARG receptor kyseliny retinové, gama".
^ Lehmann JM, Hoffmann B, Pfahl M (únor 1991). "Genomická organizace genu pro receptor pro kyselinu retinovou". Výzkum nukleových kyselin. 19 (3): 573–8. doi:10.1093 / nar / 19.3.573. PMC 333650. PMID 1849262.
^ Dowell P, Ishmael JE, Avram D, Peterson VJ, Nevrivy DJ, Leid M (květen 1999). „Identifikace jádrového receptoru jaderného receptoru jako proteinu interagujícího s receptorem aktivovaným proliferátorem peroxisomu“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (22): 15901–7. doi:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID 10336495.

Další čtení

Leid M, Kastner P, Lyons R, Nakshatri H, Saunders M, Zacharewski T, Chen JY, Staub A, Garnier JM, Mader S (leden 1992). "Čištění, klonování a RXR identita buněčného faktoru HeLa, se kterým se RAR nebo TR heterodimerizuje, aby se efektivně navázaly na cílové sekvence". Buňka. 68 (2): 377–95. doi:10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-U. PMID 1310259. S2CID 40617478.
Vollberg TM, Nervi C, George MD, Fujimoto W, Krust A, Jetten AM (květen 1992). "Receptory kyseliny retinové jako regulátory diferenciace lidských epidermálních keratinocytů". Molekulární endokrinologie. 6 (5): 667–76. doi:10.1210 / me.6.5.667. PMID 1318502.
Lehmann JM, Zhang XK, Pfahl M (červenec 1992). „Exprese RAR gama 2 je regulována prostřednictvím prvku reakce s kyselinou retinovou zabudovanou do míst Sp1“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (7): 2976–85. doi:10,1128 / mcb.12.7.2976. PMC 364511. PMID 1320193.
Mattei MG, Rivière M, Krust A, Ingvarsson S, Vennström B, Islam MQ, Levan G, Kautner P, Zelent A, Chambon P (srpen 1991). „Chromozomální přiřazení genů receptoru kyseliny retinové (RAR) v genomech člověka, myší a potkanů“ (PDF). Genomika. 10 (4): 1061–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90199-O. hdl:1946/20678. PMID 1655630.
Kastner P, Krust A, Mendelsohn C, Garnier JM, Zelent A, Leroy P, Staub A, Chambon P (duben 1990). „Myší izoformy gama receptoru kyseliny retinové se specifickými vzory exprese“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (7): 2700–4. Bibcode:1990PNAS ... 87,2700 tis. doi:10.1073 / pnas.87.7.2700. PMC 53758. PMID 2157210.
Giguère V, Shago M, Zirngibl R, Tate P, Rossant J, Varmuza S (květen 1990). "Identifikace nové izoformy gama receptoru kyseliny retinové exprimované v myším embryu". Molekulární a buněčná biologie. 10 (5): 2335–40. doi:10.1128 / mcb.10.5.2335. PMC 360581. PMID 2157970.
Ishikawa T, Umesono K, Mangelsdorf DJ, Aburatani H, Stanger BZ, Shibasaki Y, Imawari M, Evans RM, Takaku F (červen 1990). „Funkční receptor kyseliny retinové kódovaný genem na lidském chromozomu 12“. Molekulární endokrinologie. 4 (6): 837–44. doi:10.1210 / oprava-4-6-837. PMID 2172793.
Krust A, Kastner P, Petkovich M, Zelent A, Chambon P (červenec 1989). „Třetí lidský receptor kyseliny retinové, hRAR-gama“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 86 (14): 5310–4. Bibcode:1989PNAS ... 86,5310K. doi:10.1073 / pnas.86.14.5310. PMC 297611. PMID 2546152.
Renaud JP, Rochel N, Ruff M, Vivat V, Chambon P, Gronemeyer H, Moras D (prosinec 1995). "Krystalová struktura domény vázající ligand RAR-gama vázaná na all-trans retinovou kyselinu". Příroda. 378 (6558): 681–9. Bibcode:1995 Natur.378..681R. doi:10.1038 / 378681a0. PMID 7501014. S2CID 4259376.
Zhou L, Pang J, Munroe DG, Lau C (květen 1993). „Izoforma gama lidského receptoru kyseliny retinové je homologní s myším receptorem kyseliny retinové gama 7“. Výzkum nukleových kyselin. 21 (10): 2520. doi:10.1093 / nar / 21.10.2520. PMC 309563. PMID 7685085.
Zitnik RJ, Kotloff RM, Latifpour J, Zheng T, Whiting NL, Schwalb J, Elias JA (únor 1994). "Inhibice kyseliny retinové IL-1-indukované produkce IL-6 lidskými plicními fibroblasty". Journal of Immunology. 152 (3): 1419–27. PMID 8301142.
Botling J, Castro DS, Oberg F, Nilsson K, Perlmann T (duben 1997). „Heterodimery receptoru kyseliny retinové / receptoru retinoidu X lze aktivovat prostřednictvím obou podjednotek, což poskytuje základ pro synergickou transaktivaci a buněčnou diferenciaci.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (14): 9443–9. doi:10.1074 / jbc.272.14.9443. PMID 9083083.
Lømo J, Smeland EB, Ulven S, Natarajan V, Blomhoff R, Gandhi U, Dawson MI, Blomhoff HK (duben 1998). „RAR-, nikoli RXR, ligandy inhibují aktivaci buněk a zabraňují apoptóze v B-lymfocytech“. Journal of Cellular Physiology. 175 (1): 68–77. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4652 (199804) 175: 1 <68 :: AID-JCP8> 3.0.CO; 2-A. PMID 9491782.
Klaholz BP, Renaud JP, Mitschler A, Zusi C, Chambon P, Gronemeyer H, Moras D (březen 1998). "Konformační adaptace agonistů na lidský jaderný receptor RAR gama". Přírodní strukturní biologie. 5 (3): 199–202. doi:10.1038 / nsb0398-199. PMID 9501913. S2CID 30471226.
Zhang ZP, Gambone CJ, Gabriel JL, Wolfgang CL, Soprano KJ, Soprano DR (prosinec 1998). „Arg278, ale ne Lys229 nebo Lys236, hraje důležitou roli ve vazbě kyseliny retinové pomocí gama receptoru kyseliny retinové“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (51): 34016–21. doi:10.1074 / jbc.273.51.34016. PMID 9852056.
Yang C, Zhou D, Chen S (prosinec 1998). "Modulace exprese aromatázy v prsní tkáni ERR alfa-1 osiřelým receptorem". Výzkum rakoviny. 58 (24): 5695–700. PMID 9865725.
Nagpal S, Ghosn C, DiSepio D, Molina Y, Sutter M, Klein ES, Chandraratna RA (srpen 1999). "Retinoid-dependentní nábor aktivity vytěsnění histonu H1 receptorem kyseliny retinové". The Journal of Biological Chemistry. 274 (32): 22563–8. doi:10.1074 / jbc.274.32.22563. PMID 10428834.
Egea PF, Mitschler A, Rochel N, Ruff M, Chambon P, Moras D (červen 2000). „Krystalová struktura lidské vazebné domény pro ligand RXRalpha vázaná na její přirozený ligand: kyselina 9-cis retinová“. Časopis EMBO. 19 (11): 2592–601. doi:10.1093 / emboj / 19.11.2592. PMC 212755. PMID 10835357.
Boudjelal M, Voorhees JJ, Fisher GJ (březen 2002). „Signalizace retinoidů je oslabena proteazomem zprostředkovanou degradací retinoidových receptorů v lidských buňkách HaCaT keratinocytů“. Experimentální výzkum buněk. 274 (1): 130–7. doi:10.1006 / excr.2001.5450. PMID 11855864.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172819 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001288 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: RARG receptor kyseliny retinové, gama".

[pmid1849262-6] Lehmann JM, Hoffmann B, Pfahl M (únor 1991). "Genomická organizace genu pro receptor pro kyselinu retinovou". Výzkum nukleových kyselin. 19 (3): 573–8. doi:10.1093 / nar / 19.3.573. PMC 333650. PMID 1849262.

[pmid10336495-7] Dowell P, Ishmael JE, Avram D, Peterson VJ, Nevrivy DJ, Leid M (květen 1999). „Identifikace jádrového receptoru jaderného receptoru jako proteinu interagujícího s receptorem aktivovaným proliferátorem peroxisomu“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (22): 15901–7. doi:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID 10336495.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Retinoidní receptor modulátory
RAR	Agonisté: 9CDHRA 9-cis-Kyselina retinová (alitretinoin) AC-261066 AC-55649 Acitretin Adapalen Všechno-trans-Kyselina retinová (tretinoin) AM-580 BMS-493 BMS-753 BMS-961 CD-1530 CD-2314 CD-437 Ch-55 EC 23 Etretinát Fenretinid Isotretinoin Palovaroten Kyselina retinová Retinol (vitamin A. ) Tamibaroten Tazaroten Kyselina tazarotenová TTNPB Antagonisté: BMS-195614 BMS-493 CD-2665 ER-50891 LE-135 MM-11253 Inhibitory metabolismu kyseliny retinové: Liarozol
RXR	Agonisté: 9CDHRA 9-cis-Kyselina retinová (alitretinoin) Všechno-trans-Kyselina retinová (tretinoin) Bexaroten CD 3254 Kyselina dokosahexaenová Fluorobexaroten Isotretinoin LG-100268 LG-101506 LG-100754 Kyselina retinová Retinol (vitamin A. ) SR-11237 Antagonisté: HX-531 HX-630 LG-100754 PA-452 UVI-3003 HX-603 LE135 (RAR beta selektivní) LE-540 CD3254 PA-451 PA-452 Rhein HX-711 6- (N-ethyl-N- (5-isobutoxy-4-isopropyl-2- (E) -styrylfenyl) amino) nikotinová kyselina
Viz také Receptorové / signalizační modulátory