ZNF638 - ZNF638

ZNF638
Identifikátory
Aliasy	ZNF638, NP220, ZFML, Zfp638, protein se zinkovým prstem 638
Externí ID	OMIM: 614349 MGI: 1203484 HomoloGene: 7447 Genové karty: ZNF638
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	71,435,069 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	83,989,550 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • dvouřetězcová vazba DNA; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • intracelulární membránou vázaná organela; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • Sestřih RNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	27332
	18139
	ENSG00000075292
	ENSMUSG00000030016
	Q14966
	Q61464
	NM_001014972; NM_001252612; NM_001252613; NM_014497
	NM_001166371; NM_008717; NM_001355284; NM_001355285; NM_001355286
	NP_001014972; NP_001239541; NP_001239542; NP_055312
	NP_001159843; NP_032743; NP_001342213; NP_001342214; NP_001342215
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein se zinkovým prstem 638 je protein že u lidí je kódován ZNF638 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je nukleoplazmatický protein. Váže sekvence bohaté na cytidiny v dvouvláknové DNA. Tento protein má tři typy domén: MH1, MH2 (třikrát opakované) a MH3. Je spojena s balením, přenosem nebo zpracováním přepisů. Pro tento gen bylo nalezeno několik alternativně sestřižených variant transkriptu, ale biologická platnost některých variant nebyla stanovena.^[6]

Interakce

ZNF638 bylo prokázáno komunikovat s FHL2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075292 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030016 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Inagaki H, Matsushima Y, Nakamura K, Ohshima M, Kadowaki T, Kitagawa Y (červenec 1996). „Velký nukleární protein vázající DNA s motivem rozpoznávání RNA a doménou bohatou na serin / arginin“. J Biol Chem. 271 (21): 12525–31. doi:10.1074 / jbc.271.21.12525. PMID 8647861.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ZNF638 protein se zinkovým prstem 638“.
^ Ng, Enders Kai On; Chan Kwok Keung; Wong Chi Hang; Křídlo Tsui Stephen Kwok; Ngai Sai Ming; Lee Simon Ming Yuen; Kotaka Masayo; Lee Cheuk Yu; Waye Mary Miu Yee; Fung Kwok Pui (2002). „Interakce srdečně specifického proteinu LIM domény, FHL2, s DNA vázajícím jaderným proteinem, hNP220“. J. Cell. Biochem. Spojené státy. 84 (3): 556–66. doi:10.1002 / jcb.10041. ISSN 0730-2312. PMID 11813260. S2CID 2842198.

Další čtení

Okumara K, Nogami M, Matsushima Y a kol. (1998). „Mapování lidského jaderného proteinu vázajícího DNA (NP220) na pás chromozomu 2p13.1-p13.2 a jeho vztah k matrinu 3“. Biosci. Biotechnol. Biochem. 62 (8): 1640–2. doi:10,1271 / bbb.62.1640. PMID 9757574.
Eichmuller S, Usener D, Dummer R a kol. (2001). „Sérologická detekce antigenů asociovaných s kožními lymfomy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (2): 629–34. doi:10.1073 / pnas.021386498. PMC 14639. PMID 11149944.
Ng EK, Chan KK, Wong CH a kol. (2002). „Interakce srdečně specifického proteinu LIM domény, FHL2, s jaderným proteinem vázajícím DNA, hNP220“. J. Cell. Biochem. 84 (3): 556–66. doi:10.1002 / jcb.10041. PMID 11813260. S2CID 2842198.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Benzinger A, Muster N, Koch HB a kol. (2005). „Cílená proteomická analýza 14-3-3 sigma, efektoru p53 běžně umlčeného při rakovině“. Mol. Buňka. Proteomika. 4 (6): 785–95. doi:10,1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005 Natur.434..724H. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G a kol. (2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

externí odkazy

ZNF638 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075292 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030016 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8647861-5] Inagaki H, Matsushima Y, Nakamura K, Ohshima M, Kadowaki T, Kitagawa Y (červenec 1996). „Velký nukleární protein vázající DNA s motivem rozpoznávání RNA a doménou bohatou na serin / arginin“. J Biol Chem. 271 (21): 12525–31. doi:10.1074 / jbc.271.21.12525. PMID 8647861.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ZNF638 protein se zinkovým prstem 638“.

[pmid11813260-7] Ng, Enders Kai On; Chan Kwok Keung; Wong Chi Hang; Křídlo Tsui Stephen Kwok; Ngai Sai Ming; Lee Simon Ming Yuen; Kotaka Masayo; Lee Cheuk Yu; Waye Mary Miu Yee; Fung Kwok Pui (2002). „Interakce srdečně specifického proteinu LIM domény, FHL2, s DNA vázajícím jaderným proteinem, hNP220“. J. Cell. Biochem. Spojené státy. 84 (3): 556–66. doi:10.1002 / jcb.10041. ISSN 0730-2312. PMID 11813260. S2CID 2842198.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]