Homeobox A10 - Homeobox A10

HOXA10
Identifikátory
Aliasy	HOXA10, HOX1, HOX1.8, HOX1H, PL, Homeobox A10
Externí ID	OMIM: 142957 MGI: 96171 HomoloGene: 7365 Genové karty: HOXA10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	27,180,261 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	52,240,854 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba histon-deacetylázy; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex regulátoru transkripce; • buněčné jádro;
Biologický proces	• vývoj kosterního systému; • tvorba proximálního / distálního vzoru; • vývoj mužských pohlavních žláz; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • jediné hnojení; • vývoj dělohy; • vývoj mnohobuněčných organismů; • embryonální morfogeneze končetin; • spermatogeneze; • regulace genové exprese; • specifikace předního / zadního vzoru; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3206
	15395
	ENSG00000253293
	ENSMUSG00000000938
	P31260
	P31310
	NM_018951; NM_153715
	NM_001122950; NM_008263
	NP_061824
	NP_001116422; NP_032289
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-A10 je protein že u lidí je kódován HOXA10 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

U obratlovců se geny kódující třídu transkripčních faktorů nazývaných geny homeoboxu nacházejí ve skupinách pojmenovaných A, B, C a D na čtyřech samostatných chromozomech. Exprese těchto proteinů je během embryonálního vývoje regulována prostorově a časově. Tento gen je součástí klastru A na chromozomu 7 a kóduje transkripční faktor vázající DNA, který může regulovat genovou expresi, morfogenezi a diferenciaci. Přesněji řečeno, může fungovat v plodnosti, životaschopnosti embryí a regulaci závazku hematopoetické linie. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]Down -regulace HOXA10 je pozorována u člověka a pavián decidua po implantaci a tato downregulace podporuje trofoblast invaze aktivací STAT3^[8]

Interakce

Homeobox A10 bylo prokázáno, že komunikovat s PTPN6.^[9]

Viz také

Homeobox

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000253293 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000938 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXA10 homeobox A10“.
^ Godbole, Geeta; Suman, Pankaj; Malik, Ankita; Galvankar, Mosami; Joshi, Niraj; Fazleabas, Asgi; Gupta, satish; Modi, Deepak (2017). „Snížení výrazu HOXA10 v decidua po implantaci embrya podporuje invazi trophoblastů“. Endokrinologie. 158 (8): 2618–2633. doi:10.1210 / cs.2017-00032. PMC 6283436. PMID 28520923.
^ Eklund EA, Goldenberg I, Lu Y, Andrejic J, Kakar R (září 2002). „SHP1 protein-tyrosin fosfatáza reguluje aktivitu DNA HoxA10 a transkripční represivní aktivitu v nediferencovaných myeloidních buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (39): 36878–88. doi:10,1074 / jbc.M203917200. PMID 12145285.

Další čtení

Eun Kwon H, Taylor HS (prosinec 2004). "Úloha genů HOX v implantaci člověka". Annals of the New York Academy of Sciences. 1034 (1): 1–18. Bibcode:2004NYASA1034 ... 1E. doi:10.1196 / annals.1335.001. PMID 15731295. S2CID 41501204.
Lowney P, Corral J, Detmer K, LeBeau MM, Deaven L, Lawrence HJ, Largman C (červen 1991). „Lidský gen homeoboxu Hox 1 vykazuje myeloidně specifickou expresi alternativních transkriptů v lidských hematopoetických buňkách.“. Výzkum nukleových kyselin. 19 (12): 3443–9. doi:10.1093 / nar / 19.12.3443. PMC 328346. PMID 1676505.
Shen WF, Largman C, Lowney P, Corral JC, Detmer K, Hauser CA, Simonitch TA, Hack FM, Lawrence HJ (listopad 1989). „Exprese genů obsahujících homeobox v lidských hematopoetických buněčných liniích omezená na počet řádků“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 86 (21): 8536–40. Bibcode:1989PNAS ... 86.8536S. doi:10.1073 / pnas.86.21.8536. PMC 298317. PMID 2573064.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (prosinec 1989). "Lidská genová rodina HOX". Výzkum nukleových kyselin. 17 (24): 10385–402. doi:10.1093 / nar / 17.24.10385. PMC 335308. PMID 2574852.
Sauvageau G, Lansdorp PM, Eaves CJ, Hogge DE, Dragowska WH, Reid DS, Largman C, Lawrence HJ, Humphries RK (prosinec 1994). „Diferenciální exprese genů homeoboxu ve funkčně odlišných subpopulacích CD34 + buněk lidské kostní dřeně“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (25): 12223–7. Bibcode:1994PNAS ... 9112223S. doi:10.1073 / pnas.91.25.12223. PMC 45409. PMID 7527557.
Lawrence HJ, Sauvageau G, Ahmadi N, Lopez AR, LeBeau MM, Link M, Humphries K, Largman C (říjen 1995). „Exprese genu homeoboxu HOXA10 specifická pro jednotlivé fáze a linie v normálních a leukemických hematopoetických buňkách“. Experimentální hematologie. 23 (11): 1160–6. PMID 7556525.
Satokata I, Benson G, Maas R (březen 1995). „Fenotypy pohlavně dimorfní sterility u myší s deficitem Hoxa10“. Příroda. 374 (6521): 460–3. Bibcode:1995 Natur.374..460S. doi:10.1038 / 374460a0. PMID 7700356. S2CID 4337017.
Castronovo V, Kusaka M, Chariot A, Gielen J, Sobel M (leden 1994). „Geny homeoboxu: potenciální kandidáti na transkripční kontrolu transformovaného a invazivního fenotypu“. Biochemická farmakologie. 47 (1): 137–43. doi:10.1016/0006-2952(94)90447-2. PMID 7906121.
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). "Jemné mapování lidských shluků genů HOX". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (1–2): 114–5. doi:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Thorsteinsdottir U, Sauvageau G, Hough MR, Dragowska W, Lansdorp PM, Lawrence HJ, Largman C, Humphries RK (leden 1997). „Nadměrná exprese HOXA10 v myších hematopoetických buňkách perturuje jak myeloidní, tak lymfoidní diferenciaci a vede k akutní myeloidní leukémii.“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (1): 495–505. doi:10,1128 / mcb.17.1.495. PMC 231774. PMID 8972230.
Shen WF, Montgomery JC, Rozenfeld S, Moskow JJ, Lawrence HJ, Buchberg AM, Largman C (listopad 1997). „Proteiny Hox podobné AbdB stabilizují vazbu DNA proteiny homeodomény Meis1“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (11): 6448–58. doi:10.1128 / MCB.17.11.6448. PMC 232497. PMID 9343407.
Taylor HS, Vanden Heuvel GB, Igarashi P (prosinec 1997). „Konzervovaná osa Hox v reprodukčním systému myší a lidských žen: pozdní založení a přetrvávající dospělá exprese genů klastru Hoxa“. Biologie reprodukce. 57 (6): 1338–45. doi:10.1095 / biolreprod57.6.1338. PMID 9408238.
Taylor HS, Arici A, Olive D, Igarashi P (duben 1998). „HOXA10 je vyjádřen v reakci na pohlavní steroidy v době implantace do lidského endometria“. The Journal of Clinical Investigation. 101 (7): 1379–84. doi:10,1172 / JCI1057. PMC 508715. PMID 9525980.
Kawagoe H, Humphries RK, Blair A, Sutherland HJ, Hogge DE (květen 1999). „Exprese HOX genů, HOX kofaktorů a MLL ve fenotypicky a funkčně definovaných subpopulacích leukemických a normálních lidských hematopoetických buněk“. Leukémie. 13 (5): 687–98. doi:10.1038 / sj / leu / 2401410. PMID 10374871.
Eklund EA, Jalava A, Kakar R (červen 2000). „Tyrosinová fosforylace HoxA10 snižuje vazbu na DNA a transkripční represi během diferenciace buněčných linií myeloidní leukémie indukované gama interferonem“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (26): 20117–26. doi:10,1074 / jbc.M907915199. PMID 10766757.
Buske C, Feuring-Buske M, Antonchuk J, Rosten P, Hogge DE, Eaves CJ, Humphries RK (duben 2001). "Nadměrná exprese HOXA10 perturbs lidské lymfomyelopoézy in vitro a in vivo". Krev. 97 (8): 2286–92. doi:10,1182 / krev. V97.8.2286. PMID 11290589.
Cermik D, Karaca M, Taylor HS (červenec 2001). „Exprese HOXA10 je potlačována progesteronem v myometriu: diferenciální tkáňově specifická regulace exprese genu HOX v reprodukčním traktu“. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 86 (7): 3387–92. doi:10.1210 / jc.86.7.3387. PMID 11443215.
Shen WF, Krishnan K, Lawrence HJ, Largman C (listopad 2001). „Homeodoménové proteiny HOX blokují aktivitu histon-acetyltransferázy CBP“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (21): 7509–22. doi:10.1128 / MCB.21.21.7509-7522.2001. PMC 99922. PMID 11585930.

^[1]^[2]

externí odkazy

HOXA10 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

^ Godbole, Geeta; Modi, Deepak (2010). "Regulace decidualizace, interleukin-11 a interleukin-15 homeoboxem A 10 v endometriálních stromálních buňkách". American Journal of Reproductive Immunology. 85 (2): 130–9. doi:10.1016 / j.jri.2010.03.003. PMID 20478621.
^ Godbole, Geeta; Puri, CP; Modi, Deepak (2007). "Regulace exprese homeoboxu A10 v endometriu primátů progesteronem a embryonálními podněty". Reprodukce. 134 (3): 513–23. doi:10.1530 / REP-07-0234. PMID 17709569.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000253293 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000938 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Ukazuje TB (červenec 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Scott MP (listopad 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HOXA10 homeobox A10“.

[8] Godbole, Geeta; Suman, Pankaj; Malik, Ankita; Galvankar, Mosami; Joshi, Niraj; Fazleabas, Asgi; Gupta, satish; Modi, Deepak (2017). „Snížení výrazu HOXA10 v decidua po implantaci embrya podporuje invazi trophoblastů“. Endokrinologie. 158 (8): 2618–2633. doi:10.1210 / cs.2017-00032. PMC 6283436. PMID 28520923.

[pmid12145285-9] Eklund EA, Goldenberg I, Lu Y, Andrejic J, Kakar R (září 2002). „SHP1 protein-tyrosin fosfatáza reguluje aktivitu DNA HoxA10 a transkripční represivní aktivitu v nediferencovaných myeloidních buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (39): 36878–88. doi:10,1074 / jbc.M203917200. PMID 12145285.

[10] Godbole, Geeta; Modi, Deepak (2010). "Regulace decidualizace, interleukin-11 a interleukin-15 homeoboxem A 10 v endometriálních stromálních buňkách". American Journal of Reproductive Immunology. 85 (2): 130–9. doi:10.1016 / j.jri.2010.03.003. PMID 20478621.

[11] Godbole, Geeta; Puri, CP; Modi, Deepak (2007). "Regulace exprese homeoboxu A10 v endometriu primátů progesteronem a embryonálními podněty". Reprodukce. 134 (3): 513–23. doi:10.1530 / REP-07-0234. PMID 17709569.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[1]

[2]