BACH1 - BACH1

BACH1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 IHC
Identifikátory
Aliasy	BACH1, BACH-1, BTBD24, doména BTB a CNC homolog 1
Externí ID	OMIM: 602751 MGI: 894680 HomoloGene: 916 Genové karty: BACH1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	29,630,751 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	87,733,346 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 Aktivita transkripčního represoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • hem vázání; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Komplex ubikvitin ligázy Cul3-RING; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce podílející se na přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • Oprava DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce zapojené do G2 / M přechodu mitotického buněčného cyklu; • ubikvitinace bílkovin; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	571
	12013
	ENSG00000156273
	ENSMUSG00000025612
	O14867
	P97302
	NM_001011545; NM_001186; NM_206866
	NM_007520
	NP_001177; NP_996749
	NP_031546
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein regulátoru transkripce BACH1 je protein že u lidí je kódován BACH1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje transkripční faktor, který patří do cap'n'collar typu základní oblasti leucinový zip rodina faktorů (CNC-bZip). Kódovaný protein obsahuje doménu širokého komplexu, tramtrack, bric-a-brac / poxvirus a zinkový prst (BTB / POZ), což je pro členy rodiny CNC-bZip atypické. Tyto BTB / POZ domény usnadňují interakce protein-protein a tvorbu homo- a / nebo hetero-oligomerů. C-konec proteinu je leucinový zip bzip_maf rodina. Když tento protein vytvoří s MafK heterodimer, funguje jako represor Maf rozpoznávacího prvku (MARE) a transkripce je potlačena. Pro tento gen bylo identifikováno několik alternativně sestřižených variant transkriptu. Některé exony tohoto genu se překrývají s některými exony z genu C21orf41, který je transkribován v opačné orientaci než tento gen, ale nezdá se, že kóduje protein.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156273 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025612 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Blouin JL, Duriaux Saïl G, Guipponi M, Rossier C, poslanec Pappasavas, Antonarakis SE (březen 1998). „Izolace lidského genu regulátoru transkripce BACH1, který se mapuje na chromozom 21q22.1“. Genetika člověka. 102 (3): 282–8. doi:10,1007 / s004390050692. PMID 9544839. S2CID 9494442.
^ Ohira M, Seki N, Nagase T, Ishikawa K, Nomura N, Ohara O (leden 1998). "Charakterizace lidského homologu (BACH1) myšího genu Bach1 kódujícího transkripční faktor BTB-bazického leucinového zipu a jeho mapování na chromozom 21q22.1". Genomika. 47 (2): 300–6. doi:10.1006 / geno.1997.5080. PMID 9479503.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BACH1 BTB a CNC homologie 1, základní transkripční faktor leucinového zipu 1“.

Další čtení

Ozono R (duben 2006). „Nové biotechnologické metody ke snížení oxidačního stresu v kardiovaskulárním systému: zaměření na dráhu Bach1 / heme oxygenázy-1“. Současná farmaceutická biotechnologie. 7 (2): 87–93. doi:10.2174/138920106776597630. PMID 16724942.
Oyake T, Itoh K, Motohashi H, Hayashi N, Hoshino H, Nishizawa M, Yamamoto M, Igarashi K (listopad 1996). „Bachovy proteiny patří do nové rodiny transkripčních faktorů BTB-základního leucinového zipu, které interagují s MafK a regulují transkripci přes NF-E2 místo“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (11): 6083–95. doi:10.1128 / mcb.16.11.6083. PMC 231611. PMID 8887638.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Kobayashi A, Yamagiwa H, Hoshino H, Muto A, Sato K, Morita M, Hayashi N, Yamamoto M, Igarashi K (březen 2000). „Kombinatorický kód pro genovou expresi generovaný transkripčním faktorem Bach2 a MAZR (faktor související s MAZ) prostřednictvím domény BTB / POZ“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (5): 1733–46. doi:10.1128 / MCB.20.5.1733-1746.2000. PMC 85356. PMID 10669750.
Kanezaki R, Toki T, Yokoyama M, Yomogida K, Sugiyama K, Yamamoto M, Igarashi K, Ito E (březen 2001). „Transkripční faktor BACH1 je získáván do jádra svou novou alternativní sestřiženou izoformou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (10): 7278–84. doi:10,1074 / jbc.M004227200. PMID 11069897.
Cantor SB, Bell DW, Ganesan S, Kass EM, Drapkin R, Grossman S, Wahrer DC, Sgroi DC, Lane WS, Haber DA, Livingston DM (duben 2001). „BACH1, nový protein podobný helikáze, interaguje přímo s BRCA1 a přispívá k jeho opravné funkci DNA“. Buňka. 105 (1): 149–60. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00304-X. PMID 11301010. S2CID 15966253.
Kitamuro T, Takahashi K, Ogawa K, Udono-Fujimori R, Takeda K, Furuyama K, Nakayama M, Sun J, Fujita H, Hida W, Hattori T, Shirato K, Igarashi K, Shibahara S (březen 2003). „Bach1 funguje jako hypoxií indukovatelný represor genu pro hemovou oxygenázu-1 v lidských buňkách“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (11): 9125–33. doi:10,1074 / jbc.M209939200. PMID 12511571.
Suzuki H, Tashiro S, Sun J, Doi H, Satomi S, Igarashi K (prosinec 2003). „Kadmium indukuje jaderný export Bach1, transkripčního represoru genu heme oxygenázy-1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (49): 49246–53. doi:10,1074 / jbc.M306764200. PMID 14504288.
Tahara T, Sun J, Nakanishi K, Yamamoto M, Mori H, Saito T, Fujita H, Igarashi K, Taketani S (únor 2004). "Hem pozitivně reguluje expresi beta-globinu v oblasti kontroly lokusu prostřednictvím transkripčního faktoru Bach1 v erytroidních buňkách". The Journal of Biological Chemistry. 279 (7): 5480–7. doi:10,1074 / jbc.M302733200. PMID 14660636.
Shim KS, Ferrando-Miguel R, Lubec G (2004). Aberantní proteinová exprese transkripčních faktorů BACH1 a ERG kódovaných na chromozomu 21 v mozku pacientů s Downovým syndromem a Alzheimerovou chorobou. Journal of Neural Transmission. Supplementum. Dodatek Journal of Neural Transmission 67. 67. 39–49. doi:10.1007/978-3-7091-6721-2_3. ISBN 978-3-211-40776-9. PMID 15068237.
Ferrando-Miguel R, Cheon MS, Yang JW, Lubec G (2004). "Nadměrná exprese transkripčního faktoru BACH1 v mozku fetálního Downova syndromu". Pokroky ve výzkumu Downova syndromu. Journal of Neural Transmission. Supplementum. Dodatek Journal of Neural Transmission 67. 67. 193–205. doi:10.1007/978-3-7091-6721-2_17. ISBN 978-3-211-40776-9. PMID 15068251.
Suzuki H, Tashiro S, Hira S, Sun J, Yamazaki C, Zenke Y, Ikeda-Saito M, Yoshida M, Igarashi K (červenec 2004). „Hem reguluje genovou expresi spuštěním jaderného exportu Bach1 závislého na Crm1“. Časopis EMBO. 23 (13): 2544–53. doi:10.1038 / sj.emboj.7600248. PMC 449764. PMID 15175654.
Tahara T, Sun J, Igarashi K, Taketani S (listopad 2004). „Hémově závislá up-regulace exprese genu alfa-globinu transkripčním represorem Bach1 v erytroidních buňkách“ (PDF). Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 324 (1): 77–85. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.09.022. PMID 15464985.
Shan Y, Lambrecht RW, Ghaziani T, Donohue SE, Bonkovsky HL (prosinec 2004). „Role Bach-1 v regulaci hemoxygenázy-1 v lidských jaterních buňkách: poznatky ze studií s malými interferujícími RNAS“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (50): 51769–74. doi:10,1074 / jbc.M409463200. PMID 15465821.
Toki T, Katsuoka F, Kanezaki R, Xu G, Kurotaki H, Sun J, Kamio T, Watanabe S, Tandai S, Terui K, Yagihashi S, Komatsu N, Igarashi K, Yamamoto M, Ito E (duben 2005). "Transgenní exprese transkripčního faktoru BACH1 má za následek megakaryocytové poškození". Krev. 105 (8): 3100–8. doi:10.1182 / krev-2004-07-2826. PMID 15613547.

externí odkazy

BACH1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk BACH1 umístění genomu a BACH1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156273 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025612 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9544839-5] Blouin JL, Duriaux Saïl G, Guipponi M, Rossier C, poslanec Pappasavas, Antonarakis SE (březen 1998). „Izolace lidského genu regulátoru transkripce BACH1, který se mapuje na chromozom 21q22.1“. Genetika člověka. 102 (3): 282–8. doi:10,1007 / s004390050692. PMID 9544839. S2CID 9494442.

[pmid9479503-6] Ohira M, Seki N, Nagase T, Ishikawa K, Nomura N, Ohara O (leden 1998). "Charakterizace lidského homologu (BACH1) myšího genu Bach1 kódujícího transkripční faktor BTB-bazického leucinového zipu a jeho mapování na chromozom 21q22.1". Genomika. 47 (2): 300–6. doi:10.1006 / geno.1997.5080. PMID 9479503.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BACH1 BTB a CNC homologie 1, základní transkripční faktor leucinového zipu 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]