Faktor transkripce GATA - GATA transcription factor - Wikipedia

Soubor: Dedifferentiation-and-Proliferation-of-Mammalian-Cardiomyocytes-pone.0012559.s007.ogv

Přehrát média

Koule ve tvaru MDC volně přiléhající k kultivační vrstvě bije spontánně.

Faktor transkripce GATAs jsou rodina transkripční faktory charakterizované jejich schopností vázat se na DNA sekvence "GATA".^[1]

Geny

U lidí:

GATA1 (viz také GATA1 )
GATA2 (viz také GATA2 )
GATA3 (viz také GATA3 )
GATA4 (viz také GATA4 )
GATA5 (viz také GATA5 )
GATA6 (viz také GATA6 )

V droždí:

GLN3 (viz také GLN3 )
GAT1 (viz také GAT1 )
DAL80 (viz také DAL80 )
GZF3 (viz také GZF3 )

Reference

^ Ko LJ, Engel JD (1993). „Specifičnosti rodiny transkripčních faktorů GATA vázajících DNA“. Mol. Buňka. Biol. 13 (7): 4011–22. doi:10,1128 / mcb.13.7.4011. PMC 359950. PMID 8321208.

externí odkazy

GATA + transkripce + faktory v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Transkripční faktory a intracelulární receptory

(1) Základní domény

(1.1) Základní leucinový zip (bZIP )

Aktivující transkripční faktor
- AATF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
AP-1
BACH
- 1
- 2
BATF
BLZF1
C / EBP
- α
- β
- y
- δ
- ε
- ζ
CREB
- 1
- 3
- L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
- B
- F
- G
- K.
NFE
- 2
- L1
- L2
- L3
NFIL3
NRL
NRF
- 1
- 2
- 3
XBP1

(1.2) Základní šroubovice-smyčka-šroubovice (bHLH )

Skupina A	ASC ASCL1 ASCL2 ATOH1 RUKA 1 2 MESP2 Myogenní regulační faktory MyoD Myogenin MYF5 MYF6 NeuroD 1 2 Neurogeniny 1 2 3 OLIG 1 2 Paraxis TCF15 Scleraxis SLC LYL1 TAL 1 2 Kroutit
Skupina B	FIGLA Moje C c-Myc l-Myc n-Myc MXD4 TCF4
Skupina C bHLH-PAS	AhR AHRR ARNT ARNTL ARNTL2 HODINY HIF 1A EPAS1 3A NPAS 1 2 3 SIM 1 2
Skupina D	BHLH 2 3 9 Pho4 ID 1 2 3 4
Skupina E	ON JE 1 2 3 4 5 6 7 AHOJ 1 2 L
Skupina F bHLH-COE	EBF1

(1.3) bHLH-ZIP

(1.4) NF-1

NFI
- A
- B
- C
- X
SMAD
- R-SMAD
  - 1
  - 2
  - 3
  - 5
  - 9
- JE ŠÍLENÝ
  - 6
  - 7
- 4 )

(1.5) RF-X

RFX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- ANK

(1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)

AP-2
- α
- β
- y
- δ
- ε

(2) Zinkový prst Domény vázající DNA

(2.1) Jaderný receptor (Cys₄)

podčeleď 1	Hormon štítné žlázy α β AUTO FXR LXR α β PPAR α β / δ y PXR RAR α β y ROR α β y Rev-ErbA α β VDR
podčeleď 2	COUP-TF (Já II Ucho-2 HNF4 α y PNR RXR α β y Testikulární receptor 2 4 TLX
podčeleď 3	Steroidní hormon Androgen Estrogen α β Glukokortikoid Mineralokortikoid Progesteron Související s estrogenem α β y
podčeleď 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
podčeleď 5	LRH-1 SF1
podčeleď 6	GCNF
podčeleď 0	DAX1 SHP

(2.2) Ostatní Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂Jeho₂

Obecné transkripční faktory
- TFIIA
- TFIIB
- TFIID
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
- 1
- 2
  - TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 6
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI-Krüppel rodina
- 1
- 2
- 3
- ZBYTEK
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
zinkový prst
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655
- 804A

(2.4) Cys₆

HIVEP1

(2.5) Střídavé složení

UŽ
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 4
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) NEBEZPEČNÉ

WRKY

(3) Helix-turn-helix domén

(3.1) Homeodomain

protoHOX	ParaHox GSX 1 2 Xlox PDX1 Cdx 1 2 4 prodloužený Hox: Evx1 Evx2 MEOX1 MEOX2 Homeobox A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 GBX1 GBX2 MNX1
metaHOX	BARHL1 BARHL2 BARX1 BARX2 BSX DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 HEX HLX LBX1 LBX2 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 HMX1 HMX2 HMX3 6-1 6-2 NATO TLX1 TLX2 TLX3 VAX1 VAX2
jiný	ARX CRX CUTL1 FHL 1 2 3 HESX1 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B NOBOX PŘÍBĚH MEIS 1 2 telefonní ústředna 1 2 3 PKNOX 1 2 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 Doména POU PIT-1 BRN-3: A B C Faktor transkripce oktameru: 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 SATB2 SHOX2 ŠEST 1 2 3 4 5 ZEB 1 2

(3.2) Spárovaná krabice

PAX
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
PRRX
- 1
- 2
RAX

(3.3) Hlava vidlice / okřídlená spirála

E2F
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
FOX proteiny
- A1
- A2
- A3
- C1
- C2
- D3
- D4
- E1
- E3
- F1
- G1
- H1
- I1
- J1
- J2
- K1
- K2
- L2
- M1
- N1
- N3
- O1
- O3
- O4
- P1
- P2
- P3
- P4

(3.4) Faktory tepelných šoků

HSF
- 1
- 2
- 4

(3.5) Tryptofanové klastry

ELF
- 2
- 4
- 5
EGF
ELK
- 1
- 3
- 4
ERF
ETS
- 1
- 2
- ERG
- SPIB
ETV
- 1
- 4
- 5
- 6
FLI1
Interferonové regulační faktory
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
MYB
MYBL2

(3.6) doména TEA

transkripční enhancerový faktor
- 1
- 2
- 3
- 4

(4) Faktory β-lešení s malými kontakty drážky

(4.1) Rel homologická oblast	NF-kB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT 1 2 3 4 5 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS box	Mef2 A B C D SRF
(4.6) Proteiny vázající TATA	TBP TBPL1
(4.7) Skupina s vysokou mobilitou	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B SOX 1 2 3 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14 15 18 21 SRY SSRP1 TCF / LEF TCF 1 3 4 LEF1 TOX 1 2 3 4
(4,9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Doména studeného šoku	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Další transkripční faktory

(0,2) HMGI (Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Kapesní doména	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP-2/EREBPsouvisející faktory	Apetala 2 EREBP B3
(0,6) Různé	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A VÍČKO KDYBYCH 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Rho /Sigma

viz také nedostatky transkripčního faktoru / koregulátoru

Tento biochemie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.