Rodina transkripčních faktorů ETS - ETS transcription factor family

ETS doména
PDB 1r36 EBI.jpg
Struktura autoinhibice vázající DNA na Ets-1.[1]
Identifikátory
SymbolEts
PfamPF00178
Pfam klanCL0123
InterProIPR000418
CHYTRÝSM00413
STRÁNKAPDOC00374
SCOP21r36 / Rozsah / SUPFAM

V oblasti molekulární biologie, ETS (Specifické pro transformaci E26[2] nebo E-dvacet šest. (Specifické pro transformaci erytroblastů)[3]) rodina je jednou z největších rodin transkripční faktory a je pro něj jedinečný zvířata. Existuje 29 geny u lidí, 28 u myší, 10 palců Caenorhabditis elegans a 9 palců Drosophila. Zakládající člen této rodiny byl identifikován jako gen transdukovaný virem leukémie E26. Členové rodiny se podílejí na vývoji různých tkání a na progresi rakoviny.

Podskupiny

Rodina ETS (Erythroblast Transformation Specific) je rozdělena do 12 podskupin, které jsou uvedeny níže:[4]

PodčeleďČlenové rodiny savcůBezobratlí ortology
ELFELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF)
ELGGABPαELG
ERGERG, FLI1, FEV
ERFERF (PE2), ETV3 (PE1)
ESEELF3 (ESE1 / ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF)
ETSETS1, ETS2ŠPIČATÝ
PDEFSPDEF (PDEF / PSE)
PEA3ETV4 (PEA3 / E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81)
ER71ETV2 (ER71)
SPISPI1 (PU.1), SPIB, SPIC
TCFELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET / SAP2)LIN
TELETV6 (TEL), ETV7 (TEL2)YAN

Struktura

Všichni členové rodiny ETS (Erythroblast Transformation Specific) jsou identifikováni pomocí vysoce konzervovaných DNA vazebná doména, ETS doména, což je okřídlený helix-turn-helix struktura, která se váže na místa DNA s centrální GGA (A / T) Sekvence DNA. Kromě vazebných funkcí DNA důkazy naznačují, že je také zapojena doména ETS interakce protein-protein Mimo doménu vázající DNA ETS je omezená podobnost.

K dispozici jsou také další domény, které se mezi jednotlivými členy ETS a ETS liší, včetně domény Pointed, podtřídy rodiny domén SAM.

Funkce

Rodina ETS je přítomna v celém těle a je zapojena do celé řady funkcí, včetně regulace buněčná diferenciace, buněčný cyklus řízení, migrace buněk, proliferace buněk, apoptóza (programovaná buněčná smrt) a angiogeneze.

Bylo zjištěno, že více faktorů ETS je spojeno s rakovinou, například prostřednictvím genová fúze. Například ERG Transkripční faktor ETS je spojen s EWS gen, což má za následek stav zvaný Ewingův sarkom.[5] Fúze TEL do JAK2 Výsledkem proteinu je časná pre-B akutní lymfoidní leukémie.[6] ERG a ETV1 jsou známé fúze genů nalezené v rakovina prostaty.[7]

Kromě toho faktory ETS, např. Ukázalo se, že obratlovci Etv1 a Ast-1 bezobratlí jsou důležitými hráči ve specifikaci a rozlišení dopaminergní neurony v obou C. elegans a čichové žárovky z myši.[8]

Režim akce

Mezi členy rodiny ETS existuje rozsáhlá konzervace v doméně ETS vázající se na DNA, a proto je ve vazbě DNA velká redundance. Předpokládá se, že interakce s jinými proteiny (např .: Modulátor aktivity Ets zvaný Mae) je jedním ze způsobů, jak je dosaženo specifické vazby na DNA. Transkripční faktor Ets je místem signalizační konvergence.[9]Faktory ETS působí jako transkripční represory, transkripční aktivátory, nebo oboje.[10]

Reference

  1. ^ Lee GM, Donaldson LW, Pufall MA a kol. (Únor 2005). „Strukturální a dynamický základ autoinhibice vázání DNA Ets-1. J. Biol. Chem. 280 (8): 7088–99. doi:10,1074 / jbc.M410722200. PMID  15591056.
  2. ^ Nunn, M.F .; Seeburg, P. H .; Moscovici, C .; Duesberg, P. H. (1983). "Tripartitní struktura transformujícího genu viru erytroblastózy E26". Příroda. 306 (5941): 391–395. Bibcode:1983 Natur.306..391N. doi:10.1038 / 306391a0. PMID  6316155. S2CID  4302399.
  3. ^ Leprince, D .; Gegonne, A .; Coll, J .; De Taisne, C .; Schneeberger, A .; Lagrou, C .; Stehelin, D. (1983). „Předpokládaný onkogen odvozený z druhé buňky ptačí leukemie retroviru E26“. Příroda. 306 (5941): 395–397. Bibcode:1983 Natur.306..395L. doi:10.1038 / 306395a0. PMID  6316156. S2CID  4318034.
  4. ^ Gutierrez-Hartman A, Duval DL, Bradford AP (2007). "Transkripční faktory ETS v endokrinních systémech". Trendy Endocrinol Metab. 18 (4): 150–8. doi:10.1016 / j.tem.2007.03.002. PMID  17387021. S2CID  24617218.
  5. ^ Ida K, Kobayashi S, Taki T, Hanada R, Bessho F, Yamamori S, Sugimoto T, Ohki M, Hayashi Y (1995). „EWS-FLI-1 a EWS-ERG chimérické mRNA v Ewingově sarkomu a primitivním neuroektodermálním nádoru“. Int J Cancer. 63 (4): 500–4. doi:10.1002 / ijc.2910630407. PMID  7591257.
  6. ^ Peeters P, Raynaud SD, Cools J, Wlodarska I, Grosgeorge J, Philip P, Monpoux F, Van Rompaey L, Baens M, Van den Berghe H, Marynen P (1997). „Fúze TEL, genu varianty ETS 6 (ETV6), s kinázou JAK2 asociovanou s receptorem v důsledku t (9; 12) v lymfoidním prostředí a t (9; 15; 12) v myeloidní leukemii. Krev. 90 (7): 2535–40. doi:10,1182 / krev. V90.7.2535. PMID  9326218.
  7. ^ Tomlins SA, Rhodes DR, Perner S, Dhanasekaran SM, Mehra R, Sun XW, Varambally S, Cao X, Tchinda J, Kuefer R, Lee C, Montie JE, Shah RB, Pienta KJ, Rubin MA, Chinnaiyan AM (říjen 2005 ). "Opakovaná fúze genů transkripčního faktoru TMPRSS2 a ETS u rakoviny prostaty". Věda. 310 (5748): 644–8. Bibcode:2005Sci ... 310..644T. doi:10.1126 / science.1117679. PMID  16254181. S2CID  85788789.
  8. ^ Flames N, Hobert O (2009). „Genová regulační logika diferenciace dopaminergních neuronů“. Příroda. 458 (7240): 885–890. doi:10.1038 / nature07929. PMC  2671564. PMID  19287374.
  9. ^ Verger A, Duterque-Coquillaud M (2002). "Když se transkripční faktory Ets setkají se svými partnery". BioEssays. 24 (4): 362–70. doi:10.1002 / bies.10068. PMID  11948622.
  10. ^ Sharrocks AD (2001). "Rodina transkripčních faktorů domény ETS". Nat Rev Mol Cell Biol. 2 (11): 827–37. doi:10.1038/35099076. PMID  11715049. S2CID  5407789.

Další čtení