SPIB - SPIB

SPIB
Identifikátory
Aliasy	SPIB, SPI-B, transkripční faktor Spi-B
Externí ID	OMIM: 606802 MGI: 892986 HomoloGene: 79220 Genové karty: SPIB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	50,431,314 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	44,532,071 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6689
	272382
	ENSG00000269404
	ENSMUSG00000008193
	Q01892
	O35906
	NM_003121; NM_001243998; NM_001243999; NM_001244000
	NM_019866
	NP_001230927; NP_001230928; NP_001230929; NP_003112
	NP_063919
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor Spi-B je protein že u lidí je kódován SPIB gen.^[5]^[6]

Funkce

SPI1 (MIM 165170) a SPIB jsou členy podrodiny transkripčních faktorů ETS (viz ETS1; MIM 164720). Proteiny ETS sdílejí konzervovanou doménu ETS, která zprostředkovává specifickou vazbu DNA. SPIB a SPI1 se vážou na sekvenci bohatou na puriny, PU box (5-prime-GAGGAA-3-prime). [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Interakce

SPIB bylo prokázáno komunikovat s MAPK3^[7] a MAPK8.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000269404 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000008193 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ray D, Bosselut R, Ghysdael J, Mattei MG, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (říjen 1992). „Charakterizace Spi-B, transkripčního faktoru souvisejícího s domnělým onkoproteinem Spi-1 / PU.1“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (10): 4297–304. doi:10.1128 / mcb.12.10.4297. PMC 360353. PMID 1406622.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SPIB Spi-B transkripční faktor (související se Spi-1 / PU.1)".
^ ^A ^b Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (únor 1996). "Diferenciální fosforylace transkripčních faktorů Spi-B a Spi-1". Onkogen. 12 (4): 863–73. PMID 8632909.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (únor 1996). "Diferenciální fosforylace transkripčních faktorů Spi-B a Spi-1". Onkogen. 12 (4): 863–73. PMID 8632909.
Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (červen 1996). "Alternativně sestříhaná izoforma transkripčního faktoru Spi-B". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 223 (2): 257–63. doi:10.1006 / bbrc.1996.0881. PMID 8670269.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (duben 1999). „SPI-B aktivuje transkripci prostřednictvím jedinečné prolinové, serinové a threoninové domény a vykazuje rozdíly vazebné afinity k DNA od PU.1“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (16): 11115–24. doi:10.1074 / jbc.274.16.11115. PMID 10196196.
Nagy M, Chapuis B, Matthes T (únor 2002). "Exprese transkripčních faktorů Pu.1, Spi-B, Blimp-1, BSAP a oct-2 v normálních lidských plazmatických buňkách a v buňkách mnohočetného myelomu". British Journal of Hematology. 116 (2): 429–35. doi:10.1046 / j.1365-2141.2002.03271.x. PMID 11841448. S2CID 22132659.
Yamamoto H, Kihara-Negishi F, Yamada T, Suzuki M, Nakano T, Oikawa T (únor 2002). „Interakce mezi hematopoetickým transkripčním faktorem Ets Spi-B a koaktivátorem CREB-vázajícím proteinem spojeným s negativním vzájemným rozhovorem s c-Myb“. Růst a diferenciace buněk. 13 (2): 69–75. PMID 11864910.
Schotte R, Rissoan MC, Bendriss-Vermare N, Bridon JM, Duhen T, Weijer K, Brière F, Spits H (únor 2003). „Transkripční faktor Spi-B je exprimován v plazmacytoidních DC prekurzorech a inhibuje vývoj T-, B- a NK buněk“. Krev. 101 (3): 1015–23. doi:10.1182 / krev-2002-02-0438. PMID 12393575.
Schotte R, Nagasawa M, Weijer K, Spits H, Blom B (prosinec 2004). „ETS transkripční faktor Spi-B je vyžadován pro vývoj lidských plazmacytoidních dendritických buněk“ (PDF). The Journal of Experimental Medicine. 200 (11): 1503–9. doi:10.1084 / jem.20041231. PMC 2211952. PMID 15583020.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Geng CD, Vedeckis WV (prosinec 2005). „c-Myb a členové rodiny transkripčních faktorů c-Ets fungují jako molekulární přepínače pro zprostředkování opačné regulace steroidů lidského promotoru 1A glukokortikoidního receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (52): 43264–71. doi:10,1074 / jbc.M508245200. PMID 16263717.
Dontje W, Schotte R, Cupedo T, Nagasawa M, Scheeren F, Gimeno R, Spits H, Blom B (březen 2006). „Signalizace Notch1 vyvolaná deltou like1 reguluje rozhodnutí lidské plazmacytoidní dendritické buňky versus linie T-buněk prostřednictvím kontroly GATA-3 a Spi-B“. Krev. 107 (6): 2446–52. doi:10.1182 / krev-2005-05-2090. PMID 16317090.

externí odkazy

SPIB + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000269404 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000008193 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1406622-5] Ray D, Bosselut R, Ghysdael J, Mattei MG, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (říjen 1992). „Charakterizace Spi-B, transkripčního faktoru souvisejícího s domnělým onkoproteinem Spi-1 / PU.1“. Molekulární a buněčná biologie. 12 (10): 4297–304. doi:10.1128 / mcb.12.10.4297. PMC 360353. PMID 1406622.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: SPIB Spi-B transkripční faktor (související se Spi-1 / PU.1)".

[pmid8632909-7] A ^b Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (únor 1996). "Diferenciální fosforylace transkripčních faktorů Spi-B a Spi-1". Onkogen. 12 (4): 863–73. PMID 8632909.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]