CREB3 - CREB3

CREB3
Identifikátory
Aliasy	CREB3, LUMAN, LZIP, sLZIP, cAMP reagující na prvek vázající protein 3
Externí ID	OMIM: 606443 MGI: 99946 HomoloGene: 31375 Genové karty: CREB3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	35,736,999 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita dimerizace bílkovin; • cAMP vazebný prvek vazby na protein; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba na chemokinový receptor CCR1; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba chromatinu; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci proximální oblasti RNA polymerázy II; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba prvku odezvy cAMP; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • integrální součást membrány; • jaderné těleso; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • tělo neuronových buněk; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • cytosol; • Golgiho membrána; • nukleoplazma; • Golgiho aparát;
Biologický proces	• negativní regulace endoplazmatického retikula vnitřní apoptotické signální dráhy vyvolané stresem; • negativní regulace aktivity ligand-dependentního transkripčního nukleárního receptoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • uvolnění z virové latence; • pozitivní regulace buněčné migrace; • cytoplazmatické sekvestrace transkripčního faktoru; • negativní regulace buněčného cyklu; • pozitivní regulace chemotaxe monocytů; • transkripce, chráněná DNA; • reakce na stres endoplazmatického retikula; • indukce pozitivní chemotaxe; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • chemotaxe; • reakce na rozvinutý protein; • regulace buněčné proliferace; • regulace buněčného růstu; • stanovení virové latence; • pozitivní regulace aktivity deacetylázy; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do rozvinuté proteinové odpovědi; • GO: virový proces 0022415; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace obranné reakce na virus hostitelem; • pozitivní regulace transportu iontů vápníku; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • endoplazmatické retikulum rozložilo proteinovou odpověď; • regulace apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10488
	12913
	ENSG00000107175
	ENSMUSG00000028466
	O43889
	Q61817
	NM_006368
	NM_013497
	NP_006359
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyklický protein vázající se na AMP 3 je protein že u lidí je kódován CREB3 gen.^[4]^[5]

Tento gen kóduje transkripční faktor, který je členem rodiny leucinových zipů proteinů vázajících DNA. Tento protein se váže na prvek reagující na cAMP, oktamerický palindrom. Protein interaguje s faktorem C1 hostitelské buňky, který se také asociuje s proteinem VP16 viru herpes simplex (HSV), který indukuje transkripci HSV okamžitých genů. Tento protein i VP16 se vážou na stejné místo na faktoru C1 hostitelské buňky. Předpokládá se, že interakce mezi tímto proteinem a faktorem C1 hostitelské buňky hraje roli při stanovení latence během infekce HSV. Byla identifikována další varianta transkriptu, ale její biologická platnost nebyla stanovena.^[5]

Viz také

CREB

Interakce

CREB3 bylo prokázáno komunikovat s Faktor hostitelské buňky C1.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000107175 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lu R, Yang P, O'Hare P, Misra V (září 1997). „Luman, nový člen rodiny CREB / ATF, se váže na buněčný faktor hostitele souvisejícího s VP16 virem herpes simplex“. Mol Cell Biol. 17 (9): 5117–26. doi:10.1128 / MCB.17.9.5117. PMC 232362. PMID 9271389.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CREB3 cAMP responzivní prvek vázající protein 3".
^ Lu, R; Yang P; Padmakumar S; Misra V (srpen 1998). „Herpesvirový transaktivátor VP16 napodobuje lidský leucinový zipový protein lidské domény, lumán, v interakci s HCF“. J. Virol. 72 (8): 6291–7. doi:10.1128 / JVI.72.8.6291-6297.1998. ISSN 0022-538X. PMC 109766. PMID 9658067.
^ Freiman, RN; Herr W (prosinec 1997). „Virová mimika: běžný způsob asociace s HCF pomocí VP16 a buněčného proteinu LZIP“. Genes Dev. 11 (23): 3122–7. doi:10.1101 / gad.11.23.3122. ISSN 0890-9369. PMC 316754. PMID 9389645.

Další čtení

Freiman RN, Herr W (1998). „Virová mimika: běžný způsob asociace s HCF pomocí VP16 a buněčného proteinu LZIP“. Genes Dev. 11 (23): 3122–7. doi:10.1101 / gad.11.23.3122. PMC 316754. PMID 9389645.
Lu R, Yang P, Padmakumar S, Misra V (1998). „Herpesvirový transaktivátor VP16 napodobuje lidský leucinový zipový protein lidské domény, lumán, v interakci s HCF“. J. Virol. 72 (8): 6291–7. doi:10.1128 / JVI.72.8.6291-6297.1998. PMC 109766. PMID 9658067.
Lu R, Misra V (2000). „Potenciální role lumana, buněčného homologu viru herpes simplex VP16 (transindukující faktor genu alfa), v latenci herpesviru“. J. Virol. 74 (2): 934–43. doi:10.1128 / JVI.74.2.934-943.2000. PMC 111614. PMID 10623756.
Mahajan SS, Wilson AC (2000). „Mutace v hostitelském buněčném faktoru 1 oddělují jeho roli v buněčné proliferaci od náboru VP16 a LZIP“. Mol. Buňka. Biol. 20 (3): 919–28. doi:10.1128 / MCB.20.3.919-928.2000. PMC 85209. PMID 10629049.
Jin DY, Wang HL, Zhou Y a kol. (2000). „Ztráta funkce LZIP vyvolaná jádrovým proteinem viru hepatitidy C koreluje s buněčnou transformací“. EMBO J.. 19 (4): 729–40. doi:10.1093 / emboj / 19.4.729. PMC 305611. PMID 10675342.
Luciano RL, Wilson AC (2000). „N-terminální transkripční aktivační doména LZIP obsahuje dva motivy LxxLL a motiv vazby faktoru 1 hostitelské buňky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (20): 10757–62. Bibcode:2000PNAS ... 9710757L. doi:10.1073 / pnas.190062797. PMC 27096. PMID 10984507.
Raggo C, Rapin N, Stirling J a kol. (2002). „Luman, buněčný protějšek viru herpes simplex VP16, je zpracováván regulovanou intramembránovou proteolýzou“. Mol. Buňka. Biol. 22 (16): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.22.16.5639-5649.2002. PMC 133973. PMID 12138176.
Mahajan SS, Malý MM, Vazquez R, Wilson AC (2003). „Interakce HCF-1 s buněčným jaderným exportním faktorem“. J. Biol. Chem. 277 (46): 44292–9. doi:10,1074 / jbc.M205440200. PMC 4291127. PMID 12235138.
Luciano RL, Wilson AC (2002). „Aktivační doména v C-terminální podjednotce HCF-1 je důležitá pro transaktivaci pomocí VP16 a LZIP“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (21): 13403–8. Bibcode:2002PNAS ... 9913403L. doi:10.1073 / pnas.202200399. PMC 129685. PMID 12271126.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ko J, Jang SW, Kim YS a kol. (2004). „Lidský LZIP se váže na CCR1 a odlišně ovlivňuje chemotaktické aktivity chemokinů závislých na CCR1“. FASEB J.. 18 (7): 890–2. doi:10.1096 / fj.03-0867fje. PMID 15001559. S2CID 24742296.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Misra V, Rapin N, Akhova O a kol. (2005). „Zhangfei je silný a specifický inhibitor transkripčního faktoru vázajícího faktor hostitelské buňky Luman“. J. Biol. Chem. 280 (15): 15257–66. doi:10,1074 / jbc.M500728200. PMID 15705566.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Liang G, Audas TE, Li Y a kol. (2007). „Luman / CREB3 indukuje transkripci proteinu stresové reakce endoplazmatického retikula (ER) Herp prostřednictvím prvku reakce na stres ER“. Mol. Buňka. Biol. 26 (21): 7999–8010. doi:10.1128 / MCB.01046-06. PMC 1636730. PMID 16940180.
Blot G, Lopez-Vergès S, Treand C a kol. (2007). „Luman, nový partner HIV-1 TMgp41, interferuje s Tatem zprostředkovanou transkripci HIV-1 LTR“. J. Mol. Biol. 364 (5): 1034–47. doi:10.1016 / j.jmb.2006.09.080. PMID 17054986.
Jang SW, Kim YS, Lee YH, Ko J (2007). „Role lidského LZIP v diferenciální aktivaci dráhy NF-kappaB, která je indukována chemokiny závislými na CCR1“. J. Cell. Physiol. 211 (3): 630–7. doi:10.1002 / jcp.20968. PMID 17192849. S2CID 40274182.
Jang SW, Kim YS, Kim YR a kol. (2007). „Regulace exprese lidského LZIP pomocí NF-kappaB a jeho zapojení do migrace monocytových buněk indukované Lkn-1“. J. Biol. Chem. 282 (15): 11092–100. doi:10,1074 / jbc.M607962200. PMID 17296613.

externí odkazy

CREB3 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CREB3 umístění genomu a CREB3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000107175 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9271389-4] Lu R, Yang P, O'Hare P, Misra V (září 1997). „Luman, nový člen rodiny CREB / ATF, se váže na buněčný faktor hostitele souvisejícího s VP16 virem herpes simplex“. Mol Cell Biol. 17 (9): 5117–26. doi:10.1128 / MCB.17.9.5117. PMC 232362. PMID 9271389.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: CREB3 cAMP responzivní prvek vázající protein 3".

[pmid9658067-6] Lu, R; Yang P; Padmakumar S; Misra V (srpen 1998). „Herpesvirový transaktivátor VP16 napodobuje lidský leucinový zipový protein lidské domény, lumán, v interakci s HCF“. J. Virol. 72 (8): 6291–7. doi:10.1128 / JVI.72.8.6291-6297.1998. ISSN 0022-538X. PMC 109766. PMID 9658067.

[pmid9389645-7] Freiman, RN; Herr W (prosinec 1997). „Virová mimika: běžný způsob asociace s HCF pomocí VP16 a buněčného proteinu LZIP“. Genes Dev. 11 (23): 3122–7. doi:10.1101 / gad.11.23.3122. ISSN 0890-9369. PMC 316754. PMID 9389645.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]