GATA5 - GATA5

GATA5
Identifikátory
Aliasy	GATA5, GATAS, bB379O24.1, GATA vázající protein 5, CHTD5
Externí ID	OMIM: 611496 MGI: 109497 HomoloGene: 32031 Genové karty: GATA5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	62,475,995 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	180,334,699 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • Vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba iontů zinku; • vazba chromatinu; • vazba kovových iontů; • GO: 0001158 jádrový promotor vázání sekvenčně specifické DNA pro sekvenci proximální oblasti; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci proximální oblasti RNA polymerázy II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • nukleární chromatin;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčná odpověď na stimul BMP; • srážení krve; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • diferenciace střevních epiteliálních buněk; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • morfogeneze aortální chlopně; • fúze endokardiálního polštáře; • negativní regulace hypertrofie srdečního svalu; • pozitivní regulace genové exprese; • negativní regulace genové exprese; • pozitivní regulace signální dráhy Notch zapojené do indukce srdce; • pozitivní regulace srdečního endoteliálního k mezenchymálnímu přechodu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II zapojeného do vývoje srdce; • vývoj srdce; • morfogeneze zvířecích orgánů; • histogeneze; • vývoj buněk; • tvorba anatomické struktury podílející se na morfogenezi; • vývoj trávicího traktu; • vývoj srdeční svalové tkáně; • vývoj oběhového systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	140628
	14464
	ENSG00000130700
	ENSMUSG00000015627
	Q9BWX5
	P97489
	NM_080473
	NM_008093
	NP_536721
	NP_032119
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor GATA-5 je protein že u lidí je kódován GATA5 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je transkripční faktor, který obsahuje dva zinkové prsty typu GATA. Je známo, že kódovaný protein se váže na hepatocytový nukleární faktor-1alfa (HNF-1alfa) a tato interakce je nezbytná pro kooperativní aktivaci intestinálního promotoru laktázy-florizinové hydrolázy. V jiných organismech mohou být podobné proteiny zapojeny do vytváření rozmanitosti buněk hladkého svalstva srdce.^[6]

Role ve vývoji

Gata5 je transkripční faktor. Gata5 reguluje správný vývoj srdce. Na začátku vývoje embryí pomáhá Gata5 zajistit, aby bylo vytvořeno dostatek prekurzorových buněk srdečního svalu k diferenciaci na konečné buňky myokardu. Reguluje také další geny, které jsou zásadní pro úspěšný vývoj srdce.^[7] Jak těhotenství postupuje, Gata 5 se podílí na specifikaci srdeční tkáně, která se stává komorami. Při nadměrné expresi Gata5 mohou nastat problémy. Tato nadměrná exprese může vést k ektopickým ložiskům. Ektopické ohniska jsou také známé jako ektopické kardiostimulátory. Jsou to svazky buněk, které mohou způsobit srdeční stimulaci, které se nacházejí na místech v srdci, kde by neměly být. Tyto buňky se mohou vzrušit dříve, než se předpokládá, že bude vzrušeno srdce. To způsobí, že srdce bije, a tím se stahuje, než by mělo. Často to není velký problém a srdce se přirozeně vrátí ke své normální stimulaci. Pokud je to však způsobeno problémy s vývojem v srdci - pokud se Gata5 nevyjádřila správně v embryu - pak to může vést k neustálým problémům s ektopickými ložisky. Mezi tyto problémy patří tachykardie (srdce bije příliš rychle), bradykardie (srdce bije příliš pomalu) nebo komorová fibrilace^[8] což je vážný stav, kdy srdeční komory nečerpají důsledně a nemohou dostat krev do těla.

Viz také

Faktor transkripce GATA

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130700 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015627 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gao X, Sedgwick T, Shi YB, Evans T (květen 1998). „Odlišné funkce se podílejí na transkripčních faktorech GATA-4, -5 a -6 při regulaci diferenciace epiteliálních buněk střeva“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (5): 2901–11. doi:10,1128 / mcb.18.5.2901. PMC 110669. PMID 9566909.
^ ^A ^b „Entrez Gene: GATA5 GATA binding protein 5“.
^ Reiter JF, Alexander J, Rodaway A, Yelon D, Patient R, Holder N, Stainier DY (listopad 1999). „Gata5 je nutná pro vývoj srdce a endodermu u zebrafish“. Geny a vývoj. 13 (22): 2983–95. doi:10.1101 / gad.13.22.2983. PMC 317161. PMID 10580005.
^ „Komorová fibrilace“. Klinika Mayo.

Další čtení

Kakita T, Hasegawa K, Morimoto T, Kaburagi S, Wada H, Sasayama S (listopad 1999). „protein p300 jako koaktivátor GATA-5 při transkripci genu srdečně omezeného atriálního natriuretického faktoru“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (48): 34096–102. doi:10.1074 / jbc.274.48.34096. PMID 10567378.
Krasinski SD, Van Wering HM, Tannemaat MR, Grand RJ (červenec 2001). „Diferenciální aktivace promotorů intestinálního genu: funkční interakce mezi GATA-5 a HNF-1 alfa“. American Journal of Physiology. Fyziologie gastrointestinálního traktu a jater. 281 (1): G69–84. doi:10.1152 / ajpgi.2001.281.1.g69. PMID 11408257.
van Wering HM, Huibregtse IL, van der Zwan SM, de Bie MS, Dowling LN, Boudreau F, Rings EH, Grand RJ, Krasinski SD (srpen 2002). „Fyzická interakce mezi GATA-5 a hepatocytovým jaderným faktorem-1alfa vede k synergické aktivaci promotoru lidské laktázy-florizinové hydrolázy“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (31): 27659–67. doi:10,1074 / jbc.M203645200. PMID 12011060.
Benchabane H, Wrana JL (září 2003). „Zesilovače závislé na GATA a Smad1 v genu Smad7 odlišně interpretují koncentrace morfogenetického proteinu v kostech“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (18): 6646–61. doi:10.1128 / MCB.23.18.6646-6661.2003. PMC 193708. PMID 12944489.
Akiyama Y, Watkins N, Suzuki H, Jair KW, van Engeland M, Esteller M, Sakai H, Ren CY, Yuasa Y, Herman JG, Baylin SB (Prosinec 2003). „Geny transkripčních faktorů GATA-4 a GATA-5 a potenciální protinádorové cílové geny jsou epigeneticky umlčeny u kolorektálního karcinomu a rakoviny žaludku“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (23): 8429–39. doi:10.1128 / MCB.23.23.8429-8439.2003. PMC 262684. PMID 14612389.
Divine JK, Staloch LJ, Haveri H, Jacobsen CM, Wilson DB, Heikinheimo M, Simon TC (listopad 2004). „GATA-4, GATA-5 a GATA-6 aktivují gen proteinu vázajícího mastnou kyselinu potkaních jater ve shodě s HNF-1alfa“. American Journal of Physiology. Fyziologie gastrointestinálního traktu a jater. 287 (5): G1086–99. doi:10.1152 / ajpgi.00421.2003. PMID 14715527.
Guo M, Akiyama Y, House MG, Hooker CM, Heath E, Gabrielson E, Yang SC, Han Y, Baylin SB, Herman JG, Brock MV (prosinec 2004). „Hypermethylace genů GATA u rakoviny plic“. Klinický výzkum rakoviny. 10 (23): 7917–24. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-1140. PMID 15585625.
Wakana K, Akiyama Y, Aso T, Yuasa Y (září 2006). "Zapojení transkripčních faktorů GATA-4 / -5 do karcinogeneze vaječníků". Dopisy o rakovině. 241 (2): 281–8. doi:10.1016 / j.canlet.2005.10.039. PMID 16337738.
Guo M, House MG, Akiyama Y, Qi Y, Capagna D, Harmon J, Baylin SB, Brock MV, Herman JG (listopad 2006). „Hypermethylace rodiny genů GATA u rakoviny jícnu“. International Journal of Cancer. 119 (9): 2078–83. doi:10.1002 / ijc.22092. PMID 16823849.

externí odkazy

GATA5 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130700 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015627 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9566909-5] Gao X, Sedgwick T, Shi YB, Evans T (květen 1998). „Odlišné funkce se podílejí na transkripčních faktorech GATA-4, -5 a -6 při regulaci diferenciace epiteliálních buněk střeva“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (5): 2901–11. doi:10,1128 / mcb.18.5.2901. PMC 110669. PMID 9566909.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: GATA5 GATA binding protein 5“.

[7] Reiter JF, Alexander J, Rodaway A, Yelon D, Patient R, Holder N, Stainier DY (listopad 1999). „Gata5 je nutná pro vývoj srdce a endodermu u zebrafish“. Geny a vývoj. 13 (22): 2983–95. doi:10.1101 / gad.13.22.2983. PMC 317161. PMID 10580005.

[8] „Komorová fibrilace“. Klinika Mayo.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]