PHF1 - PHF1

PHF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2E5P, 2M0O, 4HCZ
Identifikátory
Aliasy	PHF1, MTF2L2, PCL1, PHF2, TDRD19C, hPHD prstový protein 1
Externí ID	OMIM: 602881 MGI: 98647 HomoloGene: 7567 Genové karty: PHF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	33,416,453 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	26,937,908 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba kovových iontů; • vazba methylovaného histonu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba chromatinu; • vazba nukleosomů; • sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • místo dvouvláknového zlomu; • ESC / E (Z) komplex; • nukleoplazma; • organizační centrum mikrotubulů; • cytoskelet; • buněčné jádro; • centrosome;
Biologický proces	• negativní regulace methylace histonu H3-K27; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • regulace methylace histonu; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • pozitivní regulace methylace histonu H3-K27; • organizace chromatinu; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5252
	21652
	ENSG00000112511; ENSG00000225553; ENSG00000239756
	ENSMUSG00000024193
	O43189
	Q9Z1B8
	NM_002636; NM_024165
	NM_009343; NM_001302397
	NP_002627; NP_077084
	NP_001289326; NP_033369
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Prstový protein PHD 1 je protein že u lidí je kódován PHF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje protein s významnou sekvenční podobností s Drosophila Polycomblike. Kódovaný protein obsahuje a zinkový prst -jako PHD (rostlinná homeodoména) prst, který je odlišný od jiných tříd motivů zinkových prstů a který ukazuje typické uspořádání Cys4-His-Cys3. Předpokládá se, že geny prstů PHD patří do rozmanité skupiny transkripčních regulátorů, které mohou ovlivňovat expresi eukaryotických genů chromatin struktura. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000225553, ENSG00000239756 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112511, ENSG00000225553, ENSG00000239756 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024193 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Coulson M, Robert S, Eyre HJ, Saint R (březen 1998). "Identifikace a lokalizace lidského genu se sekvenční podobností s Polycomblike Drosophila melanogaster". Genomika. 48 (3): 381–3. doi:10.1006 / geno.1997.5201. PMID 9545646.
^ Hong Z, Jiang J, Lan L, Nakajima S, Kanno S, Koseki H, Yasui A (květen 2008). „Polycomb group protein, PHF1, se podílí na reakci na DNA dvouřetězcové zlomy v lidské buňce“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (9): 2939–47. doi:10.1093 / nar / gkn146. PMC 2396414. PMID 18385154.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PHF1 PHD finger protein 1“.

Další čtení

Cao R, Wang H, He J, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (březen 2008). „Role hPHF1 v methylaci H3K27 a umlčení genu Hox“. Molekulární a buněčná biologie. 28 (5): 1862–72. doi:10.1128 / MCB.01589-07. PMC 2258785. PMID 18086877.
O'Connell S, Wang L, Robert S, Jones CA, Saint R, Jones RS (listopad 2001). „Polycomblike PHD prsty zprostředkovávají konzervovanou interakci se zesilovačem proteinu zeste“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (46): 43065–73. doi:10,1074 / jbc.M104294200. PMID 11571280.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

externí odkazy

PHF1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000225553, ENSG00000239756 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112511, ENSG00000225553, ENSG00000239756 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024193 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9545646-5] Coulson M, Robert S, Eyre HJ, Saint R (březen 1998). "Identifikace a lokalizace lidského genu se sekvenční podobností s Polycomblike Drosophila melanogaster". Genomika. 48 (3): 381–3. doi:10.1006 / geno.1997.5201. PMID 9545646.

[pmid18385154-6] Hong Z, Jiang J, Lan L, Nakajima S, Kanno S, Koseki H, Yasui A (květen 2008). „Polycomb group protein, PHF1, se podílí na reakci na DNA dvouřetězcové zlomy v lidské buňce“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (9): 2939–47. doi:10.1093 / nar / gkn146. PMC 2396414. PMID 18385154.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PHF1 PHD finger protein 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]