TOX3 - TOX3

Člen rodiny TOX s vysokou mobilitou ve skupinovém boxu 3
Identifikátory
SymbolTOX3
Alt. symbolyTNRC9, CAGF9
Gen NCBI27324
HGNC11972
OMIM611416
RefSeqXM_049037
UniProtO15405
Další údaje
MístoChr. 16 q12.1

Člen rodiny TOX s vysokou mobilitou ve skupině 3, také známý jako TOX3, je člověk gen.[1][2]

The protein kódovaný tímto genem je členem podčeledi transkripční faktory to také zahrnuje TOX, TOX2, a TOX4 které mají téměř totožný podíl HMG-box Domény vázající DNA kterou funkci upravit chromatin struktura odvíjením a ohýbáním DNA.[3] Protein TOX3 má C-konec bohatý na glutamin kvůli opakování CAG.[4] TOX3 se nachází v lidském chromozomovém pásmu 16q12.1.[5] Gen se skládá ze sedmi exonů a je vysoce exprimován jak v mozku, tak v luminální epiteliální prsní tkáni.[6] Mutace v genu jsou spojeny se zvýšenou náchylností k rakovině prsu.[2] TOX3 hraje roli v regulaci transkripce závislé na vápníku a interaguje s proteinem vázajícím cAMP-odezva na prvek (CREB ) a protein vázající CREB (CBP ).[7] Rovněž zvyšuje transkripci prostřednictvím interakce s Cited1, transkripční koregulátor, který zvyšuje aktivitu transkripčního faktoru.[7]

Vazba nemoci

Mutace v TOX3 geny jsou spojeny se zvýšeným rizikem rakovina prsu.[1][2][8][9]

Riziková alela rs3803662 má nízkou penetraci SNP (polymorfismus jednoho nukleotidu) spojený se sníženou expresí TOX3 a zvýšení rizika rakoviny prsu.[7] Bylo hlášeno, že rizikový lokus reguluje afinitu k FOXA1 vazba na chromatin, potenciálně ovlivňující TOX3 výraz.[6] Tento lokus také interaguje s mutacemi s vysokou penetrací BRCA1 a BRCA2 zvýšit riziko.[10] Varianta rs3803662 má v populaci vysokou frekvenci s malou frekvencí alel 0,25.[11]

Málo je známo o transkripčních mechanismech a proteinových interakcích TOX3. Byla však identifikována publikace z roku 2019 TOX3 jako gen potlačující rakovinu v jasný karcinom ledvinových buněk (ccRCC) a oznámil, že downregulace TOX3 usnadňuje epiteliální mezenchymální přechod snížením represí vůči SNAI1 a SNAI2, což má za následek růst nádoru a metastázy.[12] Stejně jako rakovina prsu, downregulace TOX3 je spojena s horší prognózou u pacientů s ccRCC.[12]

Reference

  1. ^ A b Smid M, Wang Y, Klijn JG, Sieuwerts AM, Zhang Y, Atkins D a kol. (Květen 2006). "Geny spojené s rakovinou prsu metastázují do kostí". Journal of Clinical Oncology. 24 (15): 2261–7. doi:10.1200 / JCO.2005.03.8802. PMID  16636340.
  2. ^ A b C Easton DF, Pooley KA, Dunning AM, Pharoah PD, Thompson D, Ballinger DG a kol. (Červen 2007). „Studie asociace v rámci celého genomu identifikuje nové lokusy náchylnosti k rakovině prsu“. Příroda. 447 (7148): 1087–93. Bibcode:2007 Natur.447.1087E. doi:10.1038 / nature05887. PMC  2714974. PMID  17529967.
  3. ^ O'Flaherty E, Kaye J (duben 2003). „TOX definuje konzervovanou podrodinu proteinů HMG-boxu“. BMC Genomics. 4 (1): 13. doi:10.1186/1471-2164-4-13. PMC  155677. PMID  12697058.
  4. ^ „TOX3 Člen skupiny TOX s vysokou mobilitou ve skupinové krabici 3 [Homo sapiens (člověk)]“ “. Gene - NCBI. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine.
  5. ^ „TOX3 (TOX high mobility group box family member 3)“. Atlas genetiky a cytogenetiky v onkologii a hematologii.
  6. ^ A b Jones JO, Chin SF, Wong-Taylor LA, Leaford D, Ponder BA, Caldas C, Maia AT (2013). „Mutace TOX3 u rakoviny prsu“. PLOS ONE. 8 (9): e74102. Bibcode:2013PLoSO ... 874102J. doi:10.1371 / journal.pone.0074102. PMC  3777980. PMID  24069272.
  7. ^ A b C Gudmundsdottir ET, Barkardottir RB, Arason A, Gunnarsson H, Amundadottir LT, Agnarsson BA a kol. (Prosinec 2012). „Riziková alela SNP rs3803662 a hladina mRNA jeho nejbližších genů TOX3 a LOC643714 předpovídají nepříznivý výsledek pro pacientky s rakovinou prsu“. Rakovina BMC. 12: 621. doi:10.1186/1471-2407-12-621. PMC  3553017. PMID  23270421.
  8. ^ Stacey SN, Manolescu A, Sulem P, Rafnar T, Gudmundsson J, Gudjonsson SA a kol. (Červenec 2007). „Běžné varianty chromozomů 2q35 a 16q12 propůjčují náchylnost k rakovině prsu s pozitivním účinkem na estrogenové receptory“. Genetika přírody. 39 (7): 865–9. doi:10.1038 / ng2064. PMID  17529974. S2CID  7346190.
  9. ^ Antoniou AC, Spurdle AB, Sinilnikova OM, Healey S, Pooley KA, Schmutzler RK a kol. (Duben 2008). „Běžné alely predispozice k rakovině prsu jsou spojeny s rizikem rakoviny prsu u nosičů mutací BRCA1 a BRCA2“. American Journal of Human Genetics. 82 (4): 937–48. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.02.008. PMC  2427217. PMID  18355772.
  10. ^ „Vstup OMIM - * 611416 - TOX VYSOKÁ MOBILITA SKUPINA RODINA RODINA 3. ČLEN; TOX3“. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM).
  11. ^ Mavaddat N, Antoniou AC, Easton DF, Garcia-Closas M (červen 2010). „Genetická náchylnost k rakovině prsu“. Molekulární onkologie. 4 (3): 174–91. doi:10.1016 / j.molonc.2010.04.011. PMC  5527934. PMID  20542480.
  12. ^ A b Jiang B, Chen W, Qin H, Diao W, Li B, Cao W a kol. (Květen 2019). „TOX3 inhibuje migraci a invazi rakovinných buněk transkripční regulací SNAI1 a SNAI2 v jasném buněčném karcinomu ledvinových buněk“. Dopisy o rakovině. 449: 76–86. doi:10.1016 / j.canlet.2019.02.020. PMID  30772441.