NFYB - NFYB

NFYB
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Identifikátory
Aliasy	NFYB, CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, nukleární transkripční faktor Y podjednotka beta
Externí ID	OMIM: 189904 MGI: 97317 HomoloGene: 38149 Genové karty: NFYB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	104,138,241 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	82,764,144 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • potlačující vazbu transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• komplex protein-DNA; • nukleoplazma; • Komplex vazebných faktorů CCAAT; • buněčné jádro; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace procesu biosyntézy cholesterolu; • buněčná odpověď na faktor inhibující leukémii; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4801
	18045
	ENSG00000120837
	ENSMUSG00000020248
	P25208
	P63139
	NM_006166
	NM_010914
	NP_006157; NP_006157.1
	NP_035044
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Jaderná transkripční faktor Y podjednotka beta je protein že u lidí je kódován NFYB gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je jednou podjednotkou trimerního komplexu, tvořící vysoce konzervovaný transkripční faktor, který se váže s vysokou specificitou na motivy CCAAT v promotorových oblastech v různých genech. Tento genový produkt, podjednotka B, tvoří těsný dimer s podjednotkou C, což je předpokladem pro asociaci podjednotky A. Výsledný trimer se váže na DNA s vysokou specificitou a afinitou. Každá podjednotka B a C obsahuje motiv podobný histonu. Pozorování histonové povahy těchto podjednotek je podporováno dvěma typy důkazů; srovnání proteinových sekvencí a experimenty s mutanty.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že NFYB komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120837 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020248 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, Hooft van Huijsduijnen R, Figueroa F, Nadeau J, Benoist C, Mathis D (březen 1992). „Jedna podjednotka transkripčního faktoru NF-Y se mapuje v blízkosti hlavního histokompatibilního komplexu v myších a lidských chromozomech“. Genomika. 11 (3): 630–4. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90070-U. PMID 1774067.
^ Maity SN, de Crombrugghe B (červen 1998). "Role CCAAT-vázajícího proteinu CBF / NF-Y v transkripci". Trends Biochem Sci. 23 (5): 174–8. doi:10.1016 / S0968-0004 (98) 01201-8. PMID 9612081.
^ „Entrez Gene: NFYB nukleární transkripční faktor Y, beta“.
^ Imbriano C, Bolognese F, Gurtner A, Piaggio G, Mantovani R (červenec 2001). „HSP-CBF je NF-Y závislý koaktivátor boxů promotorů tepelného šoku CCAAT“. J. Biol. Chem. 276 (28): 26332–9. doi:10,1074 / jbc.M101553200. PMID 11306579.
^ Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (březen 1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lidského lymfotropního viru typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.
^ Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (duben 2001). "Mechanismus transkripční represe pomocí c-Myc na PDGF beta-receptoru". J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID 11282029.
^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (červen 1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.

Další čtení

Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). "Represní mechanismy I-A beta genu hlavního histokompatibilního komplexu". Imunobiologie. 198 (1–3): 249–63. doi:10.1016 / s0171-2985 (97) 80045-9. PMID 9442396.
Mantovani R (1999). "Molekulární biologie CCAAT-vazebného faktoru NF-Y". Gen. 239 (1): 15–27. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6. PMID 10571030.
Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, Andre I, Benoist C, Mathis D (1992). "Evoluční variace CCAAT vázajícího transkripčního faktoru NF-Y". Nucleic Acids Res. 20 (5): 1087–91. doi:10.1093 / nar / 20.5.1087. PMC 312095. PMID 1549471.
Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, Benoist C, Mathis D (1992). "Organizace intron-exon genů NF-Y. Tkáňově specifické sestřih modifikuje aktivační doménu". J. Biol. Chem. 267 (13): 8984–90. PMID 1577736.
Lloberas J, Maki RA, Celada A (1995). „Represe exprese hlavního genu histokompatibilního komplexu I-A beta pomocí proteinů dbpA a dbpB (mYB-1)“. Mol. Buňka. Biol. 15 (9): 5092–9. doi:10,1128 / mcb.15,9,5092. PMC 230756. PMID 7651426.
Chang ZF, Liu CJ (1994). „Lidský thymidinkinázový CCAAT-vazebný protein je NF-Y, jehož exprese podjednotky A je závislá na séru v lidských diploidních fibroblastech IMR-90.“ J. Biol. Chem. 269 (27): 17893–8. PMID 8027044.
Mantovani R, Li XY, Pessara U, Hooft van Huisjduijnen R, Benoist C, Mathis D (1994). "Dominantní negativní analogy NF-YA". J. Biol. Chem. 269 (32): 20340–6. PMID 8051128.
Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lymfomu z lidských T-buněk typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.
Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
Currie RA (1998). „Funkční interakce mezi trimerizační doménou podjednotky vázající DNA NF-Y a proteinem skupiny s vysokou mobilitou HMG-I (Y)“. J. Biol. Chem. 272 (49): 30880–8. doi:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID 9388234.
Currie RA (1998). „NF-Y je spojen s histon acetyltransferázami GCN5 a P / CAF“. J. Biol. Chem. 273 (3): 1430–4. doi:10.1074 / jbc.273.3.1430. PMID 9430679.
Currie RA (1998). „Biochemická charakterizace komplexu transkripčního faktoru NF-Y během vývoje B lymfocytů“. J. Biol. Chem. 273 (29): 18220–9. doi:10.1074 / jbc.273.29.18220. PMID 9660784.
Bemark M, Olsson H, Heinegård D, Leanderson T (1998). „Čištění a charakterizace proteinu vázajícího se na promotor SP6 kappa. Potenciální role CArG-box vazebného faktoru-A v transkripci kappa“. J. Biol. Chem. 273 (30): 18881–90. doi:10.1074 / jbc.273.30.18881. PMID 9668064.
Faniello MC, Bevilacqua MA, Condorelli G, de Crombrugghe B, Maity SN, Avvedimento VE, Cimino F, Costanzo F (1999). „B podjednotka faktoru vazby CAAT NFY váže centrální segment koaktivátoru p300“. J. Biol. Chem. 274 (12): 7623–6. doi:10.1074 / jbc.274.12.7623. PMID 10075648.
Hake SB, Masternak K, Kammerbauer C, Janzen C, Reith W, Steimle V (2000). „Opakování bohaté na leucin CIITA řídí nukleární lokalizaci, nábor in vivo do hlavního zesilujícího histokompatibilního komplexu (MHC) třídy II a transaktivaci genu MHC třídy II“. Mol. Buňka. Biol. 20 (20): 7716–25. doi:10.1128 / MCB.20.20.7716-7725.2000. PMC 86349. PMID 11003667.
Liang F, Schaufele F, Gardner DG (2001). „Funkční interakce NF-Y a Sp1 je vyžadována pro transkripci genu pro receptor typu natriuretického peptidu“. J. Biol. Chem. 276 (2): 1516–22. doi:10,1074 / jbc.M006350200. PMID 11022037.
Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (2001). "Mechanismus transkripční represe pomocí c-Myc na PDGF beta-receptoru". J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID 11282029.

externí odkazy

NFYB + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
FactorBook NF-YB

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000120837 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020248 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1774067-5] Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, Hooft van Huijsduijnen R, Figueroa F, Nadeau J, Benoist C, Mathis D (březen 1992). „Jedna podjednotka transkripčního faktoru NF-Y se mapuje v blízkosti hlavního histokompatibilního komplexu v myších a lidských chromozomech“. Genomika. 11 (3): 630–4. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90070-U. PMID 1774067.

[pmid9612081-6] Maity SN, de Crombrugghe B (červen 1998). "Role CCAAT-vázajícího proteinu CBF / NF-Y v transkripci". Trends Biochem Sci. 23 (5): 174–8. doi:10.1016 / S0968-0004 (98) 01201-8. PMID 9612081.

[entrez-7] „Entrez Gene: NFYB nukleární transkripční faktor Y, beta“.

[pmid11306579-8] Imbriano C, Bolognese F, Gurtner A, Piaggio G, Mantovani R (červenec 2001). „HSP-CBF je NF-Y závislý koaktivátor boxů promotorů tepelného šoku CCAAT“. J. Biol. Chem. 276 (28): 26332–9. doi:10,1074 / jbc.M101553200. PMID 11306579.

[pmid9032250-9] Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (březen 1997). „Fyzická a funkční interakce mezi proteinem Tax1 lidského lymfotropního viru typu 1 Tax1 a proteinem vázajícím CCAAT NF-Y“. Mol. Buňka. Biol. 17 (3): 1236–43. doi:10,1128 / mcb.17.3.1236. PMC 231848. PMID 9032250.

[pmid11282029-10] Izumi H, Molander C, Penn LZ, Ishisaki A, Kohno K, Funa K (duben 2001). "Mechanismus transkripční represe pomocí c-Myc na PDGF beta-receptoru". J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID 11282029.

[pmid9153318-11] Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (červen 1997). „CCAAT vazebné interakce NF-Y-TBP: NF-YB a NF-YC vyžadují krátké domény sousedící s jejich histonovými skládacími motivy pro asociaci s TBP bazickými zbytky“. Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093 / nar / 25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]