HLF (gen) - HLF (gene)

HLF
Identifikátory
Aliasy	HLF, Transkripční faktor PAR bZIP, transkripční faktor HLF, člen rodiny PAR bZIP
Externí ID	OMIM: 142385 MGI: 96108 HomoloGene: 31074 Genové karty: HLF
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	55,325,187 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	90,390,895 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • dvouřetězcová vazba DNA; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • Vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • diferenciace buněk kosterního svalstva; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • rytmický proces; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3131
	217082
	ENSG00000108924
	ENSMUSG00000003949
	Q16534
	Q8BW74
	NM_002126; NM_001330375
	NM_172563
	NP_001317304; NP_002117
	NP_766151
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor jaterní leukémie je protein že u lidí je kódován HLF gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena prolin a kyselé -rich (PAR) rodina proteinů, podmnožina bZIP transkripčních faktorů. Kódovaný protein tvoří homodimery nebo heterodimery s dalšími členy rodiny PAR a váže sekvenčně specifické promotorové prvky k aktivaci transkripce. Chromozomální translokace fúzující části tohoto genu s genem E2A způsobují podmnožinu akutních lymfoidních leukémií dětské B linie. Alternativně byly popsány sestřihové varianty transkriptu, ale jejich biologická platnost nebyla stanovena.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108924 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003949 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Inaba T, Roberts WM, Shapiro LH, Jolly KW, Raimondi SC, Smith SD, Look AT (červenec 1992). „Fúze genu HLF pro leucinový zip na gen E2A u lidské akutní leukémie linie B“. Věda. 257 (5069): 531–4. Bibcode:1992Sci ... 257..531I. doi:10.1126 / science.1386162. PMID 1386162.
^ ^A ^b "Entrez Gene: HLF faktor jaterní leukémie".

Další čtení

LeBrun DP (květen 2003). "E2A základní transkripční faktory helix-loop-helix u lidské leukémie". Frontiers in Bioscience. 8: s206-22. doi:10.2741/1030. PMID 12700034.
Hunger SP, Ohyashiki K, Toyama K, Cleary ML (září 1992). „Hlf, nový jaterní bZIP protein, vykazuje po fúzi s E2A u akutní lymfoblastické leukémie změněné vlastnosti vázání DNA“. Geny a vývoj. 6 (9): 1608–20. doi:10,1101 / gad 6.9.1608. PMID 1516826.
Falvey E, Fleury-Olela F, Schibler U (září 1995). „Gen potkaního jaterního leukemického faktoru (HLF) kóduje dva transkripční aktivátory se zřetelnými cirkadiánními rytmy, distribucemi tkání a cílovými preferencemi“. Časopis EMBO. 14 (17): 4307–17. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00105.x. PMC 394515. PMID 7556072.
Hunger SP, Brown R, Cleary ML (září 1994). „Vazba na DNA a transkripční regulační vlastnosti faktoru jaterní leukémie (HLF) a t (17; 19) akutní lymfoblastické leukemické chiméry E2A-HLF“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (9): 5986–96. doi:10,1128 / mcb.14,9.5986. PMC 359124. PMID 8065331.
Inaba T, Shapiro LH, Funabiki T, Sinclair AE, Jones BG, Ashmun RA, Look AT (květen 1994). „DNA-vazebná specificita a trans-aktivační potenciál fúzního proteinu s E2A-faktorem jaterní leukémie asociovaným s leukémií“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (5): 3403–13. doi:10,1128 / mcb.14.5.3403. PMC 358705. PMID 8164688.
Hunger SP (únor 1996). „Chromozomální translokace zahrnující gen E2A u akutní lymfoblastické leukémie: klinické rysy a molekulární patogeneze“. Krev. 87 (4): 1211–24. doi:10.1182 / krev.v87.4.1211.bloodjournal8741211. PMID 8608207.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Hunger SP, Li S, Fall MZ, Naumovski L, Cleary ML (červen 1996). „Protononkogen HLF a související základní protein leucinového zipu TEF vykazují velmi podobné vazebné vlastnosti pro DNA a transkripční regulační vlastnosti“. Krev. 87 (11): 4607–17. doi:10.1182 / krev. V87.11.4607.bloodjournal87114607. PMID 8639829.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Takahata S, Sogawa K, Kobayashi A, Ema M, Mimura J, Ozaki N, Fujii-Kuriyama Y (červenec 1998). "Transkripčně aktivní tvorba heterodimeru proteinu PAS podobného Arnt, Arnt3, s HIF-1a, HLF a hodinami". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 248 (3): 789–94. doi:10.1006 / bbrc.1998.9012. PMID 9704006.
Inukai T, Inaba T, Ikushima S, Podívejte se na (říjen 1998). „Transaktivační domény AD1 a AD2 E2A jsou nezbytné pro antiapoptotickou aktivitu chimérického onkoproteinu E2A-HLF“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (10): 6035–43. doi:10.1128 / mcb.18.10.6035. PMC 109189. PMID 9742120.
Begbie M, Mueller C, Lillicrap D (únor 1999). „Zvýšená vazba heterodimerů HLF / DBP představuje jeden mechanismus transaktivace proteinu PAR genů faktoru VIII a faktoru IX“. DNA a buněčná biologie. 18 (2): 165–73. doi:10.1089/104454999315556. PMID 10073576.
Ema M, Hirota K, Mimura J, Abe H, Yodoi J, Sogawa K, Poellinger L, Fujii-Kuriyama Y (duben 1999). „Molekulární mechanismy aktivace transkripce pomocí HLF a HIF1alfa v reakci na hypoxii: jejich stabilizace a interakce redoxního signálu s CBP / p300“. Časopis EMBO. 18 (7): 1905–14. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1905. PMC 1171276. PMID 10202154.
Honda H, Inaba T, Suzuki T, Oda H, Ebihara Y, Tsuiji K, Nakahata T, Ishikawa T, Yazaki Y, Hirai H (květen 1999). „Exprese E2A-HLF chimérického proteinu vyvolala apoptózu T-buněk, zástavu zrání B-buněk a rozvoj akutní lymfoblastické leukémie“. Krev. 93 (9): 2780–90. doi:10.1182 / krev.v93.9.2780.409a47_2780_2790. PMID 10216071.
Matsunaga T, Inaba T, Matsui H, Okuya M, Miyajima A, Inukai T, Funabiki T, Endo M, Look AT, Kurosawa H (duben 2004). „Regulace anexinu II cytokiny iniciovanými signálními cestami a E2A-HLF onkoproteinem“. Krev. 103 (8): 3185–91. doi:10.1182 / krev-2003-09-3022. PMID 15070701.

externí odkazy

HLF + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108924 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003949 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1386162-5] Inaba T, Roberts WM, Shapiro LH, Jolly KW, Raimondi SC, Smith SD, Look AT (červenec 1992). „Fúze genu HLF pro leucinový zip na gen E2A u lidské akutní leukémie linie B“. Věda. 257 (5069): 531–4. Bibcode:1992Sci ... 257..531I. doi:10.1126 / science.1386162. PMID 1386162.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: HLF faktor jaterní leukémie".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]