Transkripční faktor Sp8 - Sp8 transcription factor

SP8
Identifikátory
Aliasy	SP8, BTD, Sp8 transkripční faktor
Externí ID	OMIM: 608306 MGI: 2443471 HomoloGene: 18548 Genové karty: SP8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	20,786,886 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	118,852,576 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro;
Biologický proces	• tvorba proximálního / distálního vzoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • tvorba hřbetní / břišní struktury; • embryonální morfogeneze končetin; • transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	221833
	320145
	ENSG00000164651
	ENSMUSG00000048562
	Q8IXZ3
	Q8BMJ8
	NM_182700; NM_198956
	NM_177082; NM_001379379; NM_001379380
	NP_874359; NP_945194
	NP_796056; NP_001366308; NP_001366309
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor Sp8 také známý jako specificita proteinu 8 (SP-8) nebo Btd transkripční faktor (knoflíková hlavice)^[5] je protein že u lidí je kódován SP8 gen.^[6]^[7] Sp8 je a transkripční faktor v Rodina Sp / KLF.

Funkce

Sp8 zprostředkovává růst končetin během raného vývoje.^[5] Odstranění Sp8 u myší mělo za následek závažné exencephaly.^[8] Sp8 je transkripční faktor se zinkovým prstem. Strukturální rozdíl mezi Sp8 a Sp9 je pouze jedna aminokyselina. Tyto transkripční faktory jsou Apical Ectodermal Ridge (AER) specifické pro vývoj končetin. Signalizace Apical Ectodermal Ridge je důležitá pro specifikaci struktur distálních končetin. Sp8 a Sp9 zprostředkovávají signalizaci Fgf10, která zase reguluje expresi Fgf8 (Fgf10 ---> Fgf8). Fgf8 je nezbytný pro normální vývoj končetin a bez přítomnosti Fgf8 v časném vývoji by došlo ke zkrácení délky končetinového pupenu a možnému rozvoji tkáně končetiny. Sp8 i Sp9 byly nalezeny u obratlovců. I když zatím bylo prokázáno, že pouze u bezobratlých je přítomen pouze Sp8. V laboratorních podmínkách nahradil Sp8 btd v Drosophile, což ukazuje, že Sp8 i btd mají podobné funkce ve vývoji končetin u obratlovců i bezobratlých. Gene knockdown v zebrafish ukázal, že výraz Fgf8 je nezbytný pro vývoj přívěsků.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164651 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048562 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Treichel D, Schöck F, Jäckle H, Gruss P, Mansouri A (listopad 2003). „mBtd je vyžadována k udržení signalizace během vývoje myší končetiny“ (PDF). Geny a vývoj. 17 (21): 2630–5. doi:10,1101 / gad.274103. PMC 280612. PMID 14597661.
^ Bell SM, Schreiner CM, Waclaw RR, Campbell K, Potter SS, Scott WJ (říjen 2003). „Sp8 je zásadní pro růst končetin a uzavření neuroporů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (21): 12195–200. doi:10.1073 / pnas.2134310100. PMC 218735. PMID 14526104.
^ „Entrez Gene: transkripční faktor Sp8“.
^ Waclaw RR, Allen ZJ, Bell SM, Erdélyi F, Szabó G, Potter SS, Campbell K (únor 2006). „Faktor transkripce se zinkovým prstem Sp8 reguluje tvorbu a rozmanitost interneuronů čichové žárovky“. Neuron. 49 (4): 503–16. doi:10.1016 / j.neuron.2006.01.018. PMID 16476661. S2CID 17734218.
^ Kawakami Y, Esteban CR, Matsui T, Rodríguez-León J, Kato S, Izpisúa Belmonte JC (říjen 2004). „Sp8 a Sp9, dva úzce související transkripční faktory podobné knoflíkové hlavě, regulují expresi Fgf8 a růst končetin v embryích obratlovců“. Rozvoj. 131 (19): 4763–74. doi:10.1242 / dev.01331. PMID 15358670.

Další čtení

Lee MT, Chen CH, Lee CS, Chen CC, Chong MY, Ouyang WC, Chiu NY, Chuo LJ, Chen CY, Tan HK, Lane HY, Chang TJ, Lin CH, Jou SH, Hou YM, Feng J, Lai TJ , Tung CL, Chen TJ, Chang CJ, Lung FW, Chen CK, Shiah IS, Liu CY, Teng PR, Chen KH, Shen LJ, Cheng CS, Chang TP, Li CF, Chou CH, Chen CY, Wang KH, Fann CS, Wu JY, Chen YT, Cheng AT (květen 2011). „Celomanomová asociační studie bipolární poruchy I u čínské populace Han“. Molekulární psychiatrie. 16 (5): 548–56. doi:10.1038 / mp.2010.43. PMID 20386566.
Milona MA, Gough JE, Edgar AJ (listopad 2004). "Genomická struktura a klonování dvou transkriptových izoforem lidského Sp8". BMC Genomics. 5: 86. doi:10.1186/1471-2164-5-86. PMC 534095. PMID 15533246.
Jugessur A, Shi M, Gjessing HK, Lie RT, Wilcox AJ, Weinberg CR, Christensen K, Boyles AL, Daack-Hirsch S, Nguyen TT, Christiansen L, Lidral AC, Murray JC (červenec 2010). „Mateřské geny a rozštěpy obličeje u potomků: komplexní hledání genetických asociací ve dvou populačních rozštěpových studiích ze Skandinávie“. PLOS ONE. 5 (7): e11493. Bibcode:2010PLoSO ... 511493J. doi:10.1371 / journal.pone.0011493. PMC 2901336. PMID 20634891.
Barber MJ, Mangravite LM, Hyde CL, Chasman DI, Smith JD, McCarty CA, Li X, Wilke RA, Rieder MJ, Williams PT, Ridker PM, Chatterjee A, Rotter JI, Nickerson DA, Stephens M, Krauss RM (březen 2010 ). „Celá genomová asociace odpovědi snižující lipidy na statiny v populacích kombinované studie“. PLOS ONE. 5 (3): e9763. Bibcode:2010PLoSO ... 5.9763B. doi:10.1371 / journal.pone.0009763. PMC 2842298. PMID 20339536.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Ravasi T, Suzuki H, Cannistraci CV, Katayama S, Bajic VB, Tan K, Akalin A, Schmeier S, Kanamori-Katayama M, Bertin N, Carninci P, Daub CO, Forrest AR, Gough J, Grimmond S, Han JH, Hashimoto T, Hide W, Hofmann O, Kamburov A, Kaur M, Kawaji H, Kubosaki A, Lassmann T, van Nimwegen E, MacPherson CR, Ogawa C, Radovanovic A, Schwartz A, Teasdale RD, Tegnér J, Lenhard B, Teichmann SA, Arakawa T, Ninomiya N, Murakami K, Tagami M, Fukuda S, Imamura K, Kai C, Ishihara R, Kitazume Y, Kawai J, Hume DA, Ideker T, Hayashizaki Y (březen 2010). „Atlas kombinatorické transkripční regulace u myší a lidí“. Buňka. 140 (5): 744–52. doi:10.1016 / j.cell.2010.01.044. PMC 2836267. PMID 20211142.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164651 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048562 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid14597661-5] A ^b Treichel D, Schöck F, Jäckle H, Gruss P, Mansouri A (listopad 2003). „mBtd je vyžadována k udržení signalizace během vývoje myší končetiny“ (PDF). Geny a vývoj. 17 (21): 2630–5. doi:10,1101 / gad.274103. PMC 280612. PMID 14597661.

[pmid14526104-6] Bell SM, Schreiner CM, Waclaw RR, Campbell K, Potter SS, Scott WJ (říjen 2003). „Sp8 je zásadní pro růst končetin a uzavření neuroporů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (21): 12195–200. doi:10.1073 / pnas.2134310100. PMC 218735. PMID 14526104.

[entrez-7] „Entrez Gene: transkripční faktor Sp8“.

[pmid16476661-8] Waclaw RR, Allen ZJ, Bell SM, Erdélyi F, Szabó G, Potter SS, Campbell K (únor 2006). „Faktor transkripce se zinkovým prstem Sp8 reguluje tvorbu a rozmanitost interneuronů čichové žárovky“. Neuron. 49 (4): 503–16. doi:10.1016 / j.neuron.2006.01.018. PMID 16476661. S2CID 17734218.

[pmid15358670-9] Kawakami Y, Esteban CR, Matsui T, Rodríguez-León J, Kato S, Izpisúa Belmonte JC (říjen 2004). „Sp8 a Sp9, dva úzce související transkripční faktory podobné knoflíkové hlavě, regulují expresi Fgf8 a růst končetin v embryích obratlovců“. Rozvoj. 131 (19): 4763–74. doi:10.1242 / dev.01331. PMID 15358670.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]