HOXB9 - HOXB9

HOXB9
Identifikátory
Aliasy	HOXB9, HOX-2.5, HOX2, HOX2E, homeobox B9
Externí ID	OMIM: 142964 MGI: 96190 HomoloGene: 7367 Genové karty: HOXB9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	48,626,358 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	96,276,595 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • mitochondrie; • nukleoplazma; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II;
Biologický proces	• buněčná chemotaxe; • kanonická signální cesta Wnt; • vývoj mnohobuněčných organismů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • specifikace předního / zadního vzoru; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj embryonálního kostního systému; • vývoj mléčné žlázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3219
	15417
	ENSG00000170689
	ENSMUSG00000020875
	P17482
	P20615
	NM_024017
	NM_008270
	NP_076922
	NP_032296
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homeoboxový protein Hox-B9 je protein že u lidí je kódován HOXB9 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen je členem rodiny homeoboxů Abd-B a kóduje protein s doménou vázající homeobox DNA. Je obsažen v klastru homeoboxových genů B umístěných na chromozomu 17. Kódovaný jaderný protein funguje jako sekvenčně specifický transkripční faktor, který se podílí na proliferaci a diferenciaci buněk. Zvýšená exprese tohoto genu je spojena s některými případy leukémie, rakoviny prostaty a rakoviny plic.^[7]

Interakce

HOXB9 bylo prokázáno komunikovat s BTG2^[8] a BTG1.^[8]

Viz také

Homeobox

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170689 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020875 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McAlpine PJ, Ukazuje TB (srpen 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (prosinec 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOXB9 homeobox B9“.
^ ^A ^b Prévôt D, Voeltzel T, Birot AM, Morel AP, Rostan MC, Magaud JP, Corbo L (leden 2000). „Protein Btg1 asociovaný s leukémií a protein Btg2 regulovaný p53 interagují s homeoproteinem Hoxb9 a zvyšují jeho transkripční aktivaci.“. J. Biol. Chem. 275 (1): 147–53. doi:10.1074 / jbc.275.1.147. PMID 10617598.

Další čtení

Deguchi Y, Kehrl JH (1991). „Selektivní exprese dvou homeoboxových genů v CD34-pozitivních buňkách z lidské kostní dřeně“. Krev. 78 (2): 323–8. doi:10.1182 / krev.V78.2.323.323. PMID 1712647.
Peverali FA, D'Esposito M, Acampora D, Bunone G, Negri M, Faiella A, Stornaiuolo A, Pannese M, Migliaccio E, Simeone A (1990). "Exprese HOX homeogenů v buněčných kulturních liniích lidského neuroblastomu". Diferenciace. 45 (1): 61–9. doi:10.1111 / j.1432-0436.1990.tb00458.x. PMID 1981366.
Giampaolo A, Acampora D, Zappavigna V, Pannese M, D'Esposito M, Carè A, Faiella A, Stornaiuolo A, Russo G, Simeone A (1989). „Diferenciální exprese lidských genů HOX-2 podél předozadní osy v embryonálním centrálním nervovém systému“. Diferenciace. 40 (3): 191–7. doi:10.1111 / j.1432-0436.1989.tb00598.x. PMID 2570724.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (1989). "Lidská genová rodina HOX". Nucleic Acids Res. 17 (24): 10385–402. doi:10.1093 / nar / 17.24.10385. PMC 335308. PMID 2574852.
Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1989). "Organizace homeoboxních genů lidské třídy I". Genom. 31 (2): 745–56. doi:10,1139 / g89-133. PMID 2576652.
Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). "Jemné mapování lidských shluků genů HOX". Cytogenet. Cell Genet. 73 (1–2): 114–5. doi:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Ohnishi K, Tobita T, Sinjo K, Takeshita A, Ohno R (1998). "Modulace exprese genů homeoboxu B6 a B9 v buněčných liniích lidské leukémie během myelomonocytové diferenciace". Leuku. Lymfom. 31 (5–6): 599–608. doi:10.3109/10428199809057620. PMID 9922051.
Prévôt D, Voeltzel T, Birot AM, Morel AP, Rostan MC, Magaud JP, Corbo L (2000). „Protein Btg1 asociovaný s leukémií a protein Btg2 regulovaný p53 interagují s homeoproteinem Hoxb9 a zvyšují jeho transkripční aktivaci.“. J. Biol. Chem. 275 (1): 147–53. doi:10.1074 / jbc.275.1.147. PMID 10617598.
Calvo R, West J, Franklin W, Erickson P, Bemis L, Li E, Helfrich B, Bunn P, Roche J, Brambilla E, Rosell R, Gemmill RM, Drabkin HA (2000). „Změněná exprese HOX a WNT7A u lidské rakoviny plic“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (23): 12776–81. doi:10.1073 / pnas.97.23.12776. PMC 18840. PMID 11070089.
de Pinieux G, Legrier ME, Poirson-Bichat F, Courty Y, Bras-Gonçalves R, Dutrillaux AM, Némati F, Oudard S, Lidereau R, Broqua P, Junien JL, Dutrillaux B, Poupon MF (2001). „Klinická a experimentální progrese nového modelu lidské rakoviny prostaty a terapeutický přístup“. Dopoledne. J. Pathol. 159 (2): 753–64. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 61746-4. PMC 1850557. PMID 11485933.
Shen WF, Krishnan K, Lawrence HJ, Largman C (2001). „Homeodoménové proteiny HOX blokují aktivitu histon-acetyltransferázy CBP“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7509–22. doi:10.1128 / MCB.21.21.7509-7522.2001. PMC 99922. PMID 11585930.
Kosaki K, Kosaki R, Suzuki T, Yoshihashi H, Takahashi T, Sasaki K, Tomita M, McGinnis W, Matsuo N (2002). "Kompletní panel pro analýzu mutací 39 lidských genů HOX". Teratologie. 65 (2): 50–62. doi:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Hori Y, Gu X, Xie X, Kim SK (2005). „Diferenciace buněk produkujících inzulín od lidských neurálních progenitorových buněk“. PLOS Med. 2 (4): e103. doi:10.1371 / journal.pmed.0020103. PMC 1087208. PMID 15839736.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

externí odkazy

HOXB9 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170689 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020875 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Ukazuje TB (srpen 1990). "Názvosloví pro lidské homeoboxové geny". Genomika. 7 (3): 460. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-X. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Scott MP (prosinec 1992). "Názvosloví genů homeoboxů obratlovců". Buňka. 71 (4): 551–3. doi:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HOXB9 homeobox B9“.

[pmid10617598-8] A ^b Prévôt D, Voeltzel T, Birot AM, Morel AP, Rostan MC, Magaud JP, Corbo L (leden 2000). „Protein Btg1 asociovaný s leukémií a protein Btg2 regulovaný p53 interagují s homeoproteinem Hoxb9 a zvyšují jeho transkripční aktivaci.“. J. Biol. Chem. 275 (1): 147–53. doi:10.1074 / jbc.275.1.147. PMID 10617598.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]