Faktor 2A specifický pro myocyty - Myocyte-specific enhancer factor 2A

MEF2A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1C7U, 1 EGW, 1LEW, 3KOV, 3MU6, 3P57
Identifikátory
Aliasy	MEF2A, ADCAD1, RSRFC4, RSRFC9, mef2, faktor zvyšující hladinu myocytů 2A
Externí ID	OMIM: 600660 MGI: 99532 HomoloGene: 4080 Genové karty: MEF2A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	99,716,466 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	67,372,858 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • Vazba transkripčního faktoru RNA polymerázy II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba histon-deacetylázy; • vazba chromatinu; • aktivace vazby transkripčního faktoru; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vázání histon acetyltransferázy; • aktivita heterodimerizace proteinu; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • SMAD vazba; • vazba protein kinázy; • Vazba DNA specifické pro regulační oblast RNA polymerázy II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • nukleoplazma; • nukleární chromatin; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• buněčná odpověď na iont vápníku; • diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • údržba mitochondriálního genomu; • dendritická morfogeneze; • pozitivní regulace diferenciace svalových buněk; • vývoj svalových orgánů; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • Kaskáda ERK5; • vývoj mnohobuněčných organismů; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj srdce; • srdeční vedení; • distribuce mitochondrií; • sestava komorového srdečního myofibrilu; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • apoptotický proces; • pozitivní regulace hypertrofie srdečního svalu; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Kaskáda MAPK; • pozitivní regulace dovozu glukózy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4205
	17258
	ENSG00000068305
	ENSMUSG00000030557
	Q02078
	Q60929
NM_001130926; NM_001130927; NM_001130928; NM_001171894; NM_005587;
	NM_001319206; NM_001352614; NM_001352615; NM_001352616; NM_001352617; NM_001352618; NM_001365201; NM_001365202; NM_001365203; NM_001365204; NM_001365205; NM_001365206; NM_001365207; NM_001365208; NM_001365209; NM_001365210; NM_001365211
NM_001033713; NM_001291191; NM_001291192; NM_001291195; NM_001291196;
	NM_001357324; NM_001357325
NP_001124398; NP_001124399; NP_001124400; NP_001165365; NP_001306135;
	NP_005578; NP_001339543; NP_001339544; NP_001339545; NP_001339546; NP_001339547; NP_001352130; NP_001352131; NP_001352132; NP_001352133; NP_001352134; NP_001352135; NP_001352136; NP_001352137; NP_001352138; NP_001352139; NP_001352140
NP_001028885; NP_001278120; NP_001278121; NP_001278124; NP_001278125;
	NP_001344253; NP_001344254
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor 2A specifický pro myocyty je protein že u lidí je kódován MEF2A gen.^[5]^[6] MEF2A je a transkripční faktor v Mef2 rodina. U lidí se nachází na chromozom 15q26. Určitý mutace v MEF2A způsobit autosomálně dominantní druh ischemická choroba srdeční a infarkt myokardu.

Funkce

Proces diferenciace od mezodermálních prekurzorových buněk k myoblastům vedl k objevení řady tkáňově specifických faktorů, které regulují expresi svalových genů. Myogenní základní proteiny helix-smyčka-helix, včetně myoD (MIM 159970), myogeninu (MIM 159980), MYF5 (MIM 159990) a MRF4 (MIM 159991) jsou 1 třídou identifikovaných faktorů. Druhou rodinou regulačních proteinů vázajících DNA je rodina faktoru 2 (MEF2) specifického pro zesilovač myocytů. Každý z těchto proteinů se váže na cílovou sekvenci DNA MEF2 přítomnou v regulačních oblastech mnoha, ne-li všech, svalových specifických genů. Geny MEF2 jsou členy rodiny genů MADS (pojmenované pro typově specifický transkripční faktor MCM1 pro kvasinkové páření, homeotické geny rostlin „agamous“ a „deficiens“ a lidský sérový reakční faktor SRF (MIM 600589)), rodinu, která také zahrnuje několik homeotických genů a dalších transkripčních faktorů, které všechny sdílejí konzervovanou doménu vázající DNA. [dodáno společností OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že faktor 2A specifický pro myocyty komunikovat s:

ASCL1,^[7]
EP300,^[8]
HDAC4,^[9]^[10]
HDAC9,^[9]^[10]
Histon deacetyláza 5,^[10]
MAPK14,^[11]^[12]
MEF2D,^[13]
Matky proti dekapentaplegickému homologu 2,^[14] a
Receptor hormonu štítné žlázy alfa^[8] a

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000068305 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030557 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Yu YT, Breitbart RE, Smoot LB, Lee Y, Mahdavi V, Nadal-Ginard B (říjen 1992). „Faktor 2 zesilovač specifický pro lidské myocyty zahrnuje skupinu transkripčních faktorů boxu MADS s omezením na tkáň“. Genes Dev. 6 (9): 1783–98. doi:10,1101 / gad 6. 9. 1783. PMID 1516833.
^ ^A ^b „Entrez Gene: MEF2A MADS box transkripční enhancer faktor 2, polypeptid A (faktor stimulující myocyty 2A)“.
^ Mao Z, Nadal-Ginard B (červen 1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.
^ ^A ^b De Luca A, Severino A, De Paolis P, Cottone G, De Luca L, De Falco M, Porcellini A, Volpe M, Condorelli G (únor 2003). „protein p300 / cAMP-response-element-binding-protein ('CREB') - vazebný protein (CBP) moduluje spolupráci mezi faktorem 2A (MEF2A) zesilujícím myocyty a receptorem X-receptoru hormonu štítné žlázy-retinoidu“. Biochem. J. 369 (Pt 3): 477–84. doi:10.1042 / BJ20020057. PMC 1223100. PMID 12371907.
^ ^A ^b Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (září 1999). „HDAC4 deacetyláza se asociuje a potlačuje transkripční faktor MEF2“. EMBO J.. 18 (18): 5099–107. doi:10.1093 / emboj / 18.18.5099. PMC 1171580. PMID 10487761.
^ ^A ^b ^C Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (květen 2000). „histondeacetyláza mHDA1 / HDAC5 interaguje s a potlačuje transkripční aktivitu MEF2A“. J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. doi:10,1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.
^ Zhao M, New L, Kravchenko VV, Kato Y, Gram H, di Padova F, Olson EN, Ulevitch RJ, Han J (leden 1999). "Regulace rodiny transkripčních faktorů MEF2 pomocí p38". Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 21–30. doi:10.1128 / mcb.19.1.21. PMC 83862. PMID 9858528.
^ Yang SH, Galanis A, Sharrocks AD (červen 1999). "Cílení p38 mitogenem aktivovaných proteinových kináz na transkripční faktory MEF2". Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4028–38. doi:10,1128 / mcb.19.6.4028. PMC 104362. PMID 10330143.
^ Ornatsky OI, McDermott JC (říjen 1996). „Exprese proteinu MEF2, specificita vazby DNA a komplexní složení a transkripční aktivita ve svalových a nesvalových buňkách“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. doi:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.
^ Quinn ZA, Yang CC, Wrana JL, McDermott JC (únor 2001). „Smad proteiny fungují jako komodulátory transkripčních regulačních proteinů MEF2“. Nucleic Acids Res. 29 (3): 732–42. doi:10.1093 / nar / 29.3.732. PMC 30396. PMID 11160896.

Další čtení

Wang Q (2005). „Pokroky v genetickém základu ischemické choroby srdeční“. Aktuální zprávy o ateroskleróze. 7 (3): 235–41. doi:10.1007 / s11883-005-0012-6. PMC 1783687. PMID 15811259.
Wang Q (2005). "Molekulární genetika ischemické choroby srdeční". Curr. Opin. Cardiol. 20 (3): 182–8. doi:10.1097 / 01.hco.0000160373.77190.f1. PMC 1579824. PMID 15861005.
Funk WD, Wright WE (1992). „Cyklická amplifikace a výběr cílů pro vícesložkové komplexy: myogenin interaguje s faktory rozpoznávajícími vazebná místa pro základní helix-loop-helix, nukleární faktor 1, myocytově specifický enhancer-vazebný faktor 2 a faktor COMP1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (20): 9484–8. Bibcode:1992PNAS ... 89.9484F. doi:10.1073 / pnas.89.20.9484. PMC 50156. PMID 1329097.
Pollock R, Treisman R (1992). „Lidské proteiny související se SRF: vlastnosti vázání DNA a potenciální regulační cíle“. Genes Dev. 5 (12A): 2327–41. doi:10,1101 / gad. 5.12a.2327. PMID 1748287.
Molkentin JD, Black BL, Martin JF, Olson EN (1996). „Kooperativní aktivace exprese svalového genu MEF2 a myogenními proteiny bHLH“. Buňka. 83 (7): 1125–36. doi:10.1016/0092-8674(95)90139-6. PMID 8548800.
Hobson GM, Krahe R, Garcia E, Siciliano MJ, Funanage VL (1996). „Regionální přiřazení chromozomů pro čtyři členy rodiny genů faktoru 2 (MEF2) zlepšující transkripci domény MADS k lidským chromozomům 15q26, 19p12, 5q14 a 1q12-q23“. Genomika. 29 (3): 704–11. doi:10.1006 / geno.1995.9007. PMID 8575763.
Mao Z, Nadal-Ginard B (1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.
Suzuki E, Lowry J, Sonoda G, Testa JR, Walsh K (1996). "Struktury a umístění chromozomů lidského genu MEF2A a pseudogenu MEF2AP". Cytogenet. Cell Genet. 73 (3): 244–9. doi:10.1159/000134348. PMID 8697817.
Ornatsky OI, McDermott JC (1996). "Exprese proteinu MEF2, specificita vazby DNA a komplexní složení a transkripční aktivita ve svalových a nesvalových buňkách". J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. doi:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.
Black BL, Molkentin JD, Olson EN (1998). „Více rolí pro základní oblast MyoD při přenosu aktivačních signálů transkripce a interakci s MEF2“. Mol. Buňka. Biol. 18 (1): 69–77. doi:10,1128 / mcb.18.1.69. PMC 121453. PMID 9418854.
Yang CC, Ornatsky OI, McDermott JC, Cruz TF, Prody CA (1998). „Interakce faktoru 2 zvyšujícího hladinu myocytů (MEF2) s mitogenem aktivovanou proteinkinázou, ERK5 / BMK1“. Nucleic Acids Res. 26 (20): 4771–7. doi:10.1093 / nar / 26.20.4771. PMC 147902. PMID 9753748.
Zhao M, New L, Kravchenko VV, Kato Y, Gram H, di Padova F, Olson EN, Ulevitch RJ, Han J (1999). "Regulace rodiny transkripčních faktorů MEF2 p38". Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 21–30. doi:10.1128 / mcb.19.1.21. PMC 83862. PMID 9858528.
Yang SH, Galanis A, Sharrocks AD (1999). „Cílení proteinových kináz aktivovaných mitogenem p38 na transkripční faktory MEF2“. Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4028–38. doi:10,1128 / mcb.19.6.4028. PMC 104362. PMID 10330143.
Iida K, Hidaka K, Takeuchi M, Nakayama M, Yutani C, Mukai T, Morisaki T (1999). "Exprese genů MEF2 během vývoje lidského srdce". Tohoku J. Exp. Med. 187 (1): 15–23. doi:10.1620 / tjem.187.15. PMID 10458488.
Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (1999). „HDAC4 deacetyláza se asociuje a potlačuje transkripční faktor MEF2“. EMBO J.. 18 (18): 5099–107. doi:10.1093 / emboj / 18.18.5099. PMC 1171580. PMID 10487761.
Mao Z, Bonni A, Xia F, Nadal-Vicens M, Greenberg ME (1999). "Přežití buněk závislé na neuronové aktivitě zprostředkované transkripčním faktorem MEF2". Věda. 286 (5440): 785–90. doi:10.1126 / science.286.5440.785. PMID 10531066.
Lu J, McKinsey TA, Nicol RL, Olson EN (2000). „Signálně závislá aktivace transkripčního faktoru MEF2 disociací z histon-deacetyláz“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (8): 4070–5. Bibcode:2000PNAS ... 97.4070L. doi:10.1073 / pnas.080064097. PMC 18151. PMID 10737771.
Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (2000). „histondeacetyláza mHDA1 / HDAC5 interaguje s a potlačuje transkripční aktivitu MEF2A“ (PDF). J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. doi:10,1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098. S2CID 39220205.
Youn HD, Grozinger CM, Liu JO (2000). „Vápník reguluje transkripční represi faktoru 2 zvyšujícího hladinu myocytů histon-deacetylázou 4“. J. Biol. Chem. 275 (29): 22563–7. doi:10,1074 / jbc.C000304200. PMID 10825153.

externí odkazy

FactorBook MEF2A

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000068305 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030557 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1516833-5] Yu YT, Breitbart RE, Smoot LB, Lee Y, Mahdavi V, Nadal-Ginard B (říjen 1992). „Faktor 2 zesilovač specifický pro lidské myocyty zahrnuje skupinu transkripčních faktorů boxu MADS s omezením na tkáň“. Genes Dev. 6 (9): 1783–98. doi:10,1101 / gad 6. 9. 1783. PMID 1516833.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: MEF2A MADS box transkripční enhancer faktor 2, polypeptid A (faktor stimulující myocyty 2A)“.

[pmid8662987-7] Mao Z, Nadal-Ginard B (červen 1996). „Funkční a fyzikální interakce mezi savcem achaete-scute homolog 1 a myocyte enhancer factor 2A“. J. Biol. Chem. 271 (24): 14371–5. doi:10.1074 / jbc.271.24.14371. PMID 8662987.

[pmid12371907-8] A ^b De Luca A, Severino A, De Paolis P, Cottone G, De Luca L, De Falco M, Porcellini A, Volpe M, Condorelli G (únor 2003). „protein p300 / cAMP-response-element-binding-protein ('CREB') - vazebný protein (CBP) moduluje spolupráci mezi faktorem 2A (MEF2A) zesilujícím myocyty a receptorem X-receptoru hormonu štítné žlázy-retinoidu“. Biochem. J. 369 (Pt 3): 477–84. doi:10.1042 / BJ20020057. PMC 1223100. PMID 12371907.

[pmid10487761-9] A ^b Miska EA, Karlsson C, Langley E, Nielsen SJ, Pines J, Kouzarides T (září 1999). „HDAC4 deacetyláza se asociuje a potlačuje transkripční faktor MEF2“. EMBO J.. 18 (18): 5099–107. doi:10.1093 / emboj / 18.18.5099. PMC 1171580. PMID 10487761.

[pmid10748098-10] A ^b ^C Lemercier C, Verdel A, Galloo B, Curtet S, Brocard MP, Khochbin S (květen 2000). „histondeacetyláza mHDA1 / HDAC5 interaguje s a potlačuje transkripční aktivitu MEF2A“. J. Biol. Chem. 275 (20): 15594–9. doi:10,1074 / jbc.M908437199. PMID 10748098.

[pmid9858528-11] Zhao M, New L, Kravchenko VV, Kato Y, Gram H, di Padova F, Olson EN, Ulevitch RJ, Han J (leden 1999). "Regulace rodiny transkripčních faktorů MEF2 pomocí p38". Mol. Buňka. Biol. 19 (1): 21–30. doi:10.1128 / mcb.19.1.21. PMC 83862. PMID 9858528.

[pmid10330143-12] Yang SH, Galanis A, Sharrocks AD (červen 1999). "Cílení p38 mitogenem aktivovaných proteinových kináz na transkripční faktory MEF2". Mol. Buňka. Biol. 19 (6): 4028–38. doi:10,1128 / mcb.19.6.4028. PMC 104362. PMID 10330143.

[pmid8798771-13] Ornatsky OI, McDermott JC (říjen 1996). „Exprese proteinu MEF2, specificita vazby DNA a komplexní složení a transkripční aktivita ve svalových a nesvalových buňkách“. J. Biol. Chem. 271 (40): 24927–33. doi:10.1074 / jbc.271.40.24927. PMID 8798771.

[pmid11160896-14] Quinn ZA, Yang CC, Wrana JL, McDermott JC (únor 2001). „Smad proteiny fungují jako komodulátory transkripčních regulačních proteinů MEF2“. Nucleic Acids Res. 29 (3): 732–42. doi:10.1093 / nar / 29.3.732. PMC 30396. PMID 11160896.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]