FLI1 - FLI1 - Wikipedia

FLI1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FLI, 1X66, 2YTU, 5E8G, 5E8I
Identifikátory
Aliasy	FLI1, EWSR2, SIC-1, protoonkogen Fli-1, transkripční faktor ETS, BDPLT21
Externí ID	OMIM: 193067 MGI: 95554 HomoloGene: 55624 Genové karty: FLI1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	128,813,267 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	32,542,861 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • vazba chromatinu; • sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • cytosol; • jaderné těleso;
Biologický proces	• vývoj megakaryocytů; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • hemostáza; • regulace transkripce, DNA-šablony; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • diferenciace buněk; • morfogeneze zvířecích orgánů; • krevní oběh; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2313
	14247
	ENSG00000151702
	ENSMUSG00000016087
	Q01543
	P26323
	NM_001167681; NM_001271010; NM_001271012; NM_002017
	NM_008026
	NP_001161153; NP_001257939; NP_001257941; NP_002008; NP_001161153.1
	NP_032052
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Integrace leukémie přítele 1 transkripční faktor (FLI1), také známý jako transkripční faktor ERGB, je protein že u lidí je kódován FLI1 gen, což je protoonkogen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Fli-1 je členem Rodina transkripčních faktorů ETS který byl poprvé identifikován v erytroleukémie vyvolané virem Friend Murine Leukemia Virus (F-MuLV ). Fli-1 se aktivuje prostřednictvím retrovir inzerční mutageneze v 90% erytroleukemií vyvolaných F-MuLV. Konstitutivní aktivace fli-1 v erytroblasty vede k dramatickému posunu v EU Epo /Epo-R signální transdukční dráha, blokování diferenciace erytroidů, aktivace Ras a vedoucí k masivní Epo-nezávislé proliferaci erytroblastů. Tyto výsledky naznačují, že nadměrná exprese Fli-1 v erytroblastech mění jejich schopnost reagovat na Epo a spouští abnormální proliferaci přepínáním signálních událostí spojených s terminální diferenciací na proliferaci.^{[Citace je zapotřebí ]}

Klinický význam

Kromě Friend erythroleukemia se provirová integrace na lokusu fli-1 vyskytuje také u leukémií vyvolaných viry 10A1, Graffi a Cas-Br-E. Aberantní exprese Fli-1 je také spojena s chromozomálními abnormalitami u lidí. U pediatrických Ewingův sarkom chromozomální translokace vytváří fúzi 5 'transaktivační domény EWSR1 (také známý jako EWS) s doménou 3 ’Ets Fli-1. Výsledný fúzní onkoprotein, EWS / Fli-1, působí jako aberantní transkripční aktivátor.^[8] se silnými transformačními schopnostmi. EWS / Fli-1 může řídit klinicky důležité geny prostřednictvím interakce s vylepšovač - jako GGAA-mikrosatelity.^[9] Význam Fli-1 ve vývoji lidské leukémie, jako je akutní myelogenní leukémie (AML ), bylo prokázáno ve studiích translokace zahrnujících Tel transkripční faktor, který interaguje s Fli-1 prostřednictvím interakcí protein-protein. Nedávná studie prokázala vysokou hladinu exprese Fli-1 u několika benigních a maligních novotvarů pomocí imunohistochemie.^{[Citace je zapotřebí ]}

Možné spojení s Syndrom Paris-Trousseau bylo navrženo.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151702 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016087 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Baud V, Lipinski M, Rassart E, Poliquin L, Bergeron D (září 1991). „Lidský homolog společné myší virové integrační oblasti, FLI1, se mapuje na 11q23-q24“. Genomika. 11 (1): 223–4. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90124-W. PMID 1765382.
^ Prasad DD, Rao VN, Reddy ES (říjen 1992). "Struktura a exprese lidského genu Fli-1". Výzkum rakoviny. 52 (20): 5833–7. PMID 1394211.
^ Rao VN, Ohno T, Prasad DD, Bhattacharya G, Reddy ES (srpen 1993). "Analýza funkcí vázání DNA a transkripčních aktivací lidského proteinu Fli-1". Onkogen. 8 (8): 2167–73. PMID 8336942.
^ Ohno T, Rao VN, Reddy ES (prosinec 1993). „Chimérický protein EWS / Fli-1 je transkripční aktivátor“. Výzkum rakoviny. 53 (24): 5859–63. PMID 7503813.
^ Musa, Julian; Cidre-Aranaz, Florencia; Aynaud, Marie-Ming; Orth, Martin; Mirabeau, Olivier; Varon, Mor; Grossetete, Sandrine; Surdez, Didier; et al. (2018-12-27). „Spolupráce dominantních onkogenů s regulačními variantami zárodečné linie formuje klinické výsledky u dětské rakoviny“. bioRxiv: 506659. doi:10.1101/506659.
^ Raslova H, Komura E, Le Couédic JP, Larbret F, Debili N, Feunteun J a kol. (Červenec 2004). „Monoallelická exprese FLI1 v kombinaci s její hemizygotní ztrátou je základem trombopenie Paříž-Trousseau / Jacobsen“. The Journal of Clinical Investigation. 114 (1): 77–84. doi:10,1172 / JCI21197. PMC 437972. PMID 15232614.

Další čtení

Ben-David Y, Giddens EB, Bernstein A (únor 1990). "Identifikace a mapování společného provirového integračního místa Fli-1 v erytroleukemických buňkách indukovaných virem myší leukémie". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (4): 1332–6. doi:10.1073 / pnas.87.4.1332. PMC 53469. PMID 2304901.
Ben-David Y, Giddens EB, Letwin K, Bernstein A (červen 1991). „Indukce erytroleukémie virem myší myší leukémie: inzerční aktivace nového člena rodiny genů ets, Fli-1, úzce spojená s c-ets-1“. Geny a vývoj. 5 (6): 908–18. doi:10,1101 / gad. 5.6.6908. PMID 2044959.
Delattre O, Zucman J, Plougastel B, Desmaze C, Melot T, Peter M a kol. (Září 1992). „Genová fúze s doménou vázající DNA ETS způsobenou translokací chromozomů v lidských nádorech“. Příroda. 359 (6391): 162–5. doi:10.1038 / 359162a0. PMID 1522903. S2CID 4331584.
Pereira R, Quang CT, Lesault I, Dolznig H, Beug H, Ghysdael J (únor 1999). „FLI-1 inhibuje diferenciaci a indukuje proliferaci primárních erytroblastů“. Onkogen. 18 (8): 1597–608. doi:10.1038 / sj.onc.1202534. PMID 10102630.
Tamir A, Howard J, Higgins RR, Li YJ, Berger L, Zacksenhaus E a kol. (Červen 1999). „Fli-1, transkripční faktor související s Ets, reguluje proliferaci a diferenciaci erytroidů vyvolanou erytropoetinem: důkazy o přímé transkripční represi genu Rb během diferenciace“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (6): 4452–64. doi:10,1128 / mcb.19.6.4452. PMC 104404. PMID 10330185.
Zochodne B, Truong AH, Stetler K, Higgins RR, Howard J, Dumont D a kol. (Květen 2000). „Epo reguluje proliferaci a diferenciaci erytroidů prostřednictvím odlišných signálních drah: důsledek pro erytropoézu a erytroleukémii vyvolanou virem Friend“. Onkogen. 19 (19): 2296–304. doi:10.1038 / sj.onc.1203590. PMID 10822380.
Starck J, Doubeikovski A, Sarrazin S, Gonnet C, Rao G, Skoultchi A a kol. (Leden 1999). „Spi-1 / PU.1 je pozitivní regulátor genu Fli-1 podílející se na inhibici diferenciace erytroidů v přátelských erytroleukemických buněčných liniích“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (1): 121–35. doi:10.1128 / mcb.19.1.121. PMC 83871. PMID 9858537.
Truong AH, Ben-David Y (prosinec 2000). „Role Fli-1 v normální funkci buněk a maligní transformaci“. Onkogen. 19 (55): 6482–9. doi:10.1038 / sj.onc.1204042. PMID 11175364.
Ohno T, Rao VN, Reddy ES (prosinec 1993). „Chimérický protein EWS / Fli-1 je transkripční aktivátor“. Výzkum rakoviny. 53 (24): 5859–63. PMID 7503813.
Dhulipala PD, Lee L, Rao VN, Reddy ES (září 1998). „Fli-1b je generován použitím diferenciálního sestřihu a alternativního promotoru“. Onkogen. 17 (9): 1149–57. doi:10.1038 / sj.onc.1202030. PMID 9764825.
Rao VN, Ohno T, Prasad DD, Bhattacharya G, Reddy ES (srpen 1993). "Analýza funkcí vázání DNA a transkripčních aktivací lidského proteinu Fli-1". Onkogen. 8 (8): 2167–73. PMID 8336942.
Ban J, Siligan C, Kreppel M, Aryee D, Kovar H (2007). „EWS-FLI1 v Ewingově sarkomu: skutečné cíle a vedlejší škody“. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 587: 41–52. doi:10.1007/978-1-4020-5133-3_4. ISBN 978-1-4020-4966-8. PMID 17163154.
Prasad DD, Rao VN, Reddy ES (říjen 1992). "Struktura a exprese lidského genu Fli-1". Výzkum rakoviny. 52 (20): 5833–7. PMID 1394211.
Watson DK, Smyth FE, Thompson DM, Cheng JQ, Testa JR, Papas TS, Seth A (říjen 1992). „Gen ERGB / Fli-1: izolace a charakterizace nového člena rodiny lidských transkripčních faktorů ETS“. Růst a diferenciace buněk. 3 (10): 705–13. PMID 1445800.
Delattre O, Zucman J, Plougastel B, Desmaze C, Melot T, Peter M a kol. (Září 1992). „Genová fúze s doménou vázající DNA ETS způsobenou translokací chromozomů v lidských nádorech“. Příroda. 359 (6391): 162–5. doi:10.1038 / 359162a0. PMID 1522903. S2CID 4331584.
Baud V, Lipinski M, Rassart E, Poliquin L, Bergeron D (září 1991). „Lidský homolog společné myší virové integrační oblasti, FLI1, se mapuje na 11q23-q24“. Genomika. 11 (1): 223–4. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90124-W. PMID 1765382.
Bergeron D, Poliquin L, Kozak CA, Rassart E (leden 1991). „Identifikace společné oblasti virové integrace v lymfomech indukovaných virem myší leukémie Cas-Br-E non-T, non-B-buněčnými lymfomy“. Journal of Virology. 65 (1): 7–15. doi:10.1128 / JVI.65.1.7-15.1991. PMC 240483. PMID 1845910.
Bhagirath T, Abe S, Nojima T, Yoshida MC (červen 1995). „Molekulární analýza translokačního spojení t (11; 22) v případě Ewingova sarkomu“. Geny, chromozomy a rakovina. 13 (2): 126–32. doi:10,1002 / gcc.2870130209. PMID 7542907. S2CID 36929552.
Liang H, Mao X, Olejniczak ET, Nettesheim DG, Yu L, Meadows RP a kol. (Prosinec 1994). "Struktura řešení ets domény Fli-1 po navázání na DNA". Přírodní strukturní biologie. 1 (12): 871–5. doi:10.1038 / nsb1294-871. PMID 7773776. S2CID 26261743.
May WA, Lessnick SL, Braun BS, Klemsz M, Lewis BC, Lunsford LB, et al. (Prosinec 1993). „Ewingův sarkom EWS / FLI-1 fúzní gen kóduje účinnější transkripční aktivátor a je silnějším transformujícím genem než FLI-1“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (12): 7393–8. doi:10,1128 / mcb.13.12.7393. PMC 364810. PMID 8246959.
Hromas R, May W, Denny C, Raskind W, Moore J, Maki RA a kol. (Únor 1993). „Lidský FLI-1 se lokalizuje na chromozomu 11Q24 a má aberantní transkript v neuroepiteliomu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1172 (1–2): 155–8. doi:10.1016 / 0167-4781 (93) 90283-J. PMID 8439553.
Magnaghi-Jaulin L, Masutani H, Robin P, Lipinski M, Harel-Bellan A (březen 1996). „Prvky SRE jsou vazebná místa pro fúzní protein EWS-FLI-1“. Výzkum nukleových kyselin. 24 (6): 1052–8. doi:10.1093 / nar / 24.6.1052. PMC 145748. PMID 8604338.
Barbeau B, Bergeron D, Beaulieu M, Nadjem Z, Rassart E (červen 1996). "Charakterizace lidských a myších oblastí promotoru Fli-1". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1307 (2): 220–32. doi:10.1016/0167-4781(96)00060-7. PMID 8679708.
Watson DK, Robinson L, Hodge DR, Kola I, Papas TS, Seth A (leden 1997). „FLI1 a EWS-FLI1 fungují jako ternární komplexní faktory a ELK1 a SAP1a fungují jako ternární a kvartérní komplexní faktory na prvcích sérových reakcí promotoru Egr1“. Onkogen. 14 (2): 213–21. doi:10.1038 / sj.onc.1200839. PMID 9010223.
Kwiatkowski BA, Bastian LS, Bauer TR, Tsai S, Zielinska-Kwiatkowska AG, Hickstein DD (červenec 1998). „Člen rodiny ets Tel se váže na onkoprotein Fli-1 a inhibuje jeho transkripční aktivitu.“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (28): 17525–30. doi:10.1074 / jbc.273.28.17525. PMID 9651344.
Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (červen 1998). „Erg proteiny, transkripční faktory rodiny Ets, tvoří homo, heterodimery a ternární komplexy prostřednictvím dvou odlišných domén“. Onkogen. 16 (25): 3261–8. doi:10.1038 / sj.onc.1201868. PMID 9681824.
Zucman-Rossi J, Legoix P, Victor JM, Lopez B, Thomas G (září 1998). „Translokace chromozomů na základě nelegitimní rekombinace v lidských nádorech“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (20): 11786–91. doi:10.1073 / pnas.95.20.11786. PMC 21718. PMID 9751743.
Dalgleish P, Sharrocks AD (leden 2000). "Mechanismus tvorby komplexu mezi transkripčními faktory Fli-1 a SRF". Výzkum nukleových kyselin. 28 (2): 560–9. doi:10.1093 / nar / 28.2.560. PMC 102515. PMID 10606656.
Knoop LL, Baker SJ (srpen 2000). „Faktor sestřihu U1C potlačuje transaktivaci zprostředkovanou EWS / FLI“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (32): 24865–71. doi:10,1074 / jbc.M001661200. PMID 10827180.
Spyropoulos DD, Pharr PN, Lavenburg KR, Jackers P, Papas TS, Ogawa M, Watson DK (srpen 2000). „Krvácení, porucha krvetvorby a letalita v myších embryích nesoucích cílené narušení transkripčního faktoru Fli1“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (15): 5643–52. doi:10.1128 / MCB.20.15.5643-5652.2000. PMC 86032. PMID 10891501.
Mastrangelo T, Modena P, Tornielli S, Bullrich F, Testi MA, Mezzelani A, et al. (Srpen 2000). „Nový gen zinkových prstů je fúzován s EWS v malém nádoru s kulatými buňkami“. Onkogen. 19 (33): 3799–804. doi:10.1038 / sj.onc.1203762. PMID 10949935.

externí odkazy

FLI1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151702 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016087 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1765382-5] Baud V, Lipinski M, Rassart E, Poliquin L, Bergeron D (září 1991). „Lidský homolog společné myší virové integrační oblasti, FLI1, se mapuje na 11q23-q24“. Genomika. 11 (1): 223–4. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90124-W. PMID 1765382.

[pmid1394211-6] Prasad DD, Rao VN, Reddy ES (říjen 1992). "Struktura a exprese lidského genu Fli-1". Výzkum rakoviny. 52 (20): 5833–7. PMID 1394211.

[pmid8336942-7] Rao VN, Ohno T, Prasad DD, Bhattacharya G, Reddy ES (srpen 1993). "Analýza funkcí vázání DNA a transkripčních aktivací lidského proteinu Fli-1". Onkogen. 8 (8): 2167–73. PMID 8336942.

[pmid7503813-8] Ohno T, Rao VN, Reddy ES (prosinec 1993). „Chimérický protein EWS / Fli-1 je transkripční aktivátor“. Výzkum rakoviny. 53 (24): 5859–63. PMID 7503813.

[9] Musa, Julian; Cidre-Aranaz, Florencia; Aynaud, Marie-Ming; Orth, Martin; Mirabeau, Olivier; Varon, Mor; Grossetete, Sandrine; Surdez, Didier; et al. (2018-12-27). „Spolupráce dominantních onkogenů s regulačními variantami zárodečné linie formuje klinické výsledky u dětské rakoviny“. bioRxiv: 506659. doi:10.1101/506659.

[pmid15232614-10] Raslova H, Komura E, Le Couédic JP, Larbret F, Debili N, Feunteun J a kol. (Červenec 2004). „Monoallelická exprese FLI1 v kombinaci s její hemizygotní ztrátou je základem trombopenie Paříž-Trousseau / Jacobsen“. The Journal of Clinical Investigation. 114 (1): 77–84. doi:10,1172 / JCI21197. PMC 437972. PMID 15232614.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]