PKNOX1 - PKNOX1

PKNOX1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X2N
Identifikátory
Aliasy	PKNOX1, PREP1, pkonx1c, pobočková ústředna / vázaný 1 homeobox 1
Externí ID	OMIM: 602100 MGI: 1201409 HomoloGene: 3363 Genové karty: PKNOX1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	43,033,931 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	31,607,693 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • aktivita transkripčního faktoru, vazba specifická pro sekvenci distálního zesilovače RNA polymerázy II; • sekvenčně specifická vazba DNA; • Vazba DNA; • aktivita heterodimerizace proteinu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • komplex regulátoru transkripce; • cytosol;
Biologický proces	• diferenciace erytrocytů; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • vývoj očí typu kamery; • Diferenciace T buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • angiogeneze; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • krvetvorba;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5316
	18771
	ENSG00000160199
	ENSMUSG00000006705
	P55347; Q96I87
	O70477
	NM_001286258; NM_004571; NM_001320694
	NM_016670
NP_001273187; NP_001307623; NP_004562; NP_001273187.1; NP_004562.2;
	NP_001307623.1
	NP_057879
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

PBX / vázané 1 Homeobox 1 (PKNOX1) je a protein že u lidí je kódován PKNOX1 gen.^[5]^[6]

Důležitý paralog tohoto genu je PKNOX2.

Funkce

PKNOX1 patří do třídy prodloužení tří aminokyselinových smyček (TALE) homeodomain transkripční faktory které tvoří transkripčně aktivní komplexy podílející se na vývoji a organogenezi. PKNOX1 je nezbytný pro embryogenezi, ale může také působit jako tumor supresor v dospělosti.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160199 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006705 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Berthelsen J, Viggiano L, Schulz H, Ferretti E, Consalez GG, Rocchi M, Blasi F (leden 1998). „PKNOX1, gen kódující PREP1, nový regulátor aktivity Pbx, mapuje lidský chromozom 21q22.3 a myší chromozom 17B / C“. Genomika. 47 (2): 323–4. doi:10.1006 / geno.1997.5086. PMID 9479508.
^ „Entrez Gene: PKNOX1 PBX / vázaný 1 homeobox 1“.
^ Purushothaman D, Blasi F (2018). „Genetika a molekulární funkce transkripčního faktoru homeodomény PREP1“. International Journal of Developmental Biology. 62 (11–12): 819–825. doi:10.1387 / ijdb.180238fb. PMID 30604851.

Další čtení

Allen TD, Zhu YX, Hawley TS, Hawley RG (říjen 2000). „TALE homeoproteiny jako HOX11 interagující partneři v leukémii T-buněk“. Leukémie a lymfom. 39 (3–4): 241–56. doi:10.3109/10428190009065824. PMID 11342305. S2CID 27407074.
Chang CP, Shen WF, Rozenfeld S, Lawrence HJ, Largman C, Cleary ML (březen 1995). „Proteiny Pbx vykazují kooperativní vazbu DNA závislou na hexapeptidu s podmnožinou proteinů Hox“. Geny a vývoj. 9 (6): 663–74. doi:10,1101 / gad. 9.6.663. PMID 7729685.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S a kol. (Září 1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Výzkum genomu. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Phelan ML, Featherstone MS (březen 1997). „Výrazné zbytky N-koncového ramene HOX jsou zodpovědné za specificitu rozpoznávání DNA monomery HOX a heterodimery HOX.PBX. The Journal of Biological Chemistry. 272 (13): 8635–43. doi:10.1074 / jbc.272.13.8635. PMID 9079695.
Chen H, Rossier C, Nakamura Y, Lynn A, Chakravarti A, Antonarakis SE (duben 1997). „Klonování nového genu obsahujícího homeobox, PKNOX1, a mapování do lidského chromozomu 21q22.3“. Genomika. 41 (2): 193–200. doi:10.1006 / geno.1997.4632. PMID 9143494.
LeBrun DP, Matthews BP, Feldman BJ, Cleary ML (říjen 1997). „Chimérické onkoproteiny E2A-PBX1 a E2A-HLF jsou koncentrovány ve sférických jaderných doménách“. Onkogen. 15 (17): 2059–67. doi:10.1038 / sj.onc.1201367. PMID 9366523.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Berthelsen J, Zappavigna V, Mavilio F, Blasi F (březen 1998). „Prep1, nový funkční partner proteinů Pbx“. Časopis EMBO. 17 (5): 1423–33. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1423. PMC 1170490. PMID 9482739.
Berthelsen J, Zappavigna V, Ferretti E, Mavilio F, Blasi F (březen 1998). „Nový homeoprotein Prep1 moduluje proteinovou kooperativitu Pbx-Hox“. Časopis EMBO. 17 (5): 1434–45. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1434. PMC 1170491. PMID 9482740.
Green NC, Rambaldi I, Teakles J, Featherstone MS (květen 1998). „Konzervovaná C-koncová doména v PBX zvyšuje vazbu DNA na homeodoménu PBX a není primárním kontaktním místem pro YPWM motiv HOXA1“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (21): 13273–9. doi:10.1074 / jbc.273.21.13273. PMID 9582372.
Berthelsen J, Kilstrup-Nielsen C, Blasi F, Mavilio F, Zappavigna V (duben 1999). „Subcelulární lokalizace proteinů PBX1 a EXD závisí na signálech importu a exportu jader a je modulována asociací s PREP1 a HTH.“. Geny a vývoj. 13 (8): 946–53. doi:10,1101 / gad.13.8.946. PMC 316640. PMID 10215622.
Jacobs Y, Schnabel CA, Cleary ML (červenec 1999). „Trimerická asociace proteinů homeodomény Hox a TALE zprostředkovává aktivitu zesilovače zadního mozku Hoxb2“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (7): 5134–42. doi:10,1128 / mcb.19.7.5134. PMC 84356. PMID 10373562.
Knoepfler PS, Bergstrom DA, Uetsuki T, Dac-Korytko I, Sun YH, Wright WE a kol. (Září 1999). „Konzervovaný motiv N-terminálně k doménám vázajícím DNA myogenních bHLH transkripčních faktorů zprostředkovává kooperativní vazbu DNA s pbx-Meis1 / Prep1“. Výzkum nukleových kyselin. 27 (18): 3752–61. doi:10.1093 / nar / 27.18.3752. PMC 148632. PMID 10471746.
Kömüves LG, Shen WF, Kwong A, Stelnicki E, Rozenfeld S, Oda Y a kol. (Srpen 2000). "Změny ve struktuře a lokalizaci proteinů homeodomény HOXB6 během vývoje a diferenciace lidské epidermy". Dynamika vývoje. 218 (4): 636–47. doi:10.1002 / 1097-0177 (2000) 9999: 9999 <:: AID-DVDY1014> 3.0.CO; 2-I. PMID 10906782.
Okada Y, Matsuura E, Nagai R, Sato T, Watanabe A, Morita I, Doi T (květen 2003). "PREP1, homologní protein MEIS1, reguluje expresi genu PF4". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 305 (1): 155–9. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00718-6. PMID 12732210.

externí odkazy

PKNOX1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 21 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160199 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006705 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9479508-5] Berthelsen J, Viggiano L, Schulz H, Ferretti E, Consalez GG, Rocchi M, Blasi F (leden 1998). „PKNOX1, gen kódující PREP1, nový regulátor aktivity Pbx, mapuje lidský chromozom 21q22.3 a myší chromozom 17B / C“. Genomika. 47 (2): 323–4. doi:10.1006 / geno.1997.5086. PMID 9479508.

[entrez-6] „Entrez Gene: PKNOX1 PBX / vázaný 1 homeobox 1“.

[7] Purushothaman D, Blasi F (2018). „Genetika a molekulární funkce transkripčního faktoru homeodomény PREP1“. International Journal of Developmental Biology. 62 (11–12): 819–825. doi:10.1387 / ijdb.180238fb. PMID 30604851.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]