ILF2 - ILF2

ILF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4AT7, 4AT8, 4AT9, 4ATB
Identifikátory
Aliasy	ILF2, NF45, PRO3063, vazebný faktor 2 zesilovač interleukinu
Externí ID	OMIM: 603181 MGI: 1915031 HomoloGene: 26894 Genové karty: ILF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	153,671,028 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	90,488,379 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • Vazba DNA; • dvouvláknová vazba RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jádro; • membrána; • buněčné jádro; • specifický lumen granule; • lumen terciární granule; • lumen granule bohaté na ficolin-1; • extracelulární oblast; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • imunitní odpověď; • transkripce, chráněná DNA; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3608
	67781
	ENSG00000143621
	ENSMUSG00000001016
	Q12905
	Q9CXY6
	NM_004515; NM_001267809
	NM_026374
	NP_001254738; NP_004506
	NP_080650
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vazebný faktor zesilovače interleukinu 2 je protein že u lidí je kódován ILF2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Nukleární faktor aktivovaných T-buněk (NFAT) je transkripční faktor požadovaný pro expresi T-buněk genu pro interleukin 2. NFAT se váže na sekvenci v zesilovači genu interleukinu 2 známém jako prvek odpovědi na antigenový receptor 2. Kromě toho může NFAT vázat RNA a je nezbytnou složkou pro enkapsidace a proteinová aktivace virové polymerázy hepatitidy B. NFAT je heterodimer o 45 kDa a 90 kDa proteinech, z nichž menší je produktem tohoto genu. Kódovaný protein se silně váže na protein 90 kDa a stimuluje jeho schopnost zvýšit genovou expresi.^[6]

Interakce

Ukázalo se, že ILF2 komunikovat s CDC5L^[7] a DNA-PKcs.^[8]

ILF2 a ILF3 byly identifikovány jako autoantigeny u myší s indukovaným lupusem,^[9]^[10] u systémového revmatického autoimunitního onemocnění psa,^[11]^[12] a jako vzácný nález u lidí s autoimunitní chorobou.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143621 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001016 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kao PN, Chen L, Brock G, Ng J, Kenny J, Smith AJ, Corthésy B (srpen 1994). „Klonování a exprese nukleárního faktoru citlivého na cyklosporin A a FK506 aktivovaných T-buněk: NF45 a NF90“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (32): 20691–9. PMID 7519613.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ILF2 interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa“.
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
^ Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (leden 1998). „DNA-dependentní protein kináza interaguje s proteiny NF90 a NF45 vážícími se na proteinový receptor. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2136–45. doi:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID 9442054.
^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (prosinec 1999). „Autoprotilátky definují rodinu proteinů se zachovanými dvouvláknovými doménami vázajícími RNA i s vazebnou aktivitou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (49): 34598–604. doi:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID 10574923.
^ Kuroda Y, Ono N, Akaogi J, Nacionales DC, Yamasaki Y, Barker TT, Reeves WH, Satoh M (únor 2006). „Indukce specifických autoprotilátek souvisejících s lupusem nespecifickým zánětem způsobeným intraperitoneální injekcí n-hexadekanu u myší BALB / c“. Toxikologie. 218 (2–3): 186–96. doi:10.1016 / j.tox.2005.10.011. PMID 16309812.
^ Bremer HD, Landegren N, Sjöberg R, Hallgren Å, Renneker S, Lattwein E, Leonard D, Eloranta ML, Rönnblom L, Nordmark G, Nilsson P, Andersson G, Lilliehöök I, Lindblad-Toh K, Kämpe O, Hansson-Hamlin H (březen 2018). „ILF2 a ILF3 jsou autoantigeny u systémového autoimunitního onemocnění psů“. Vědecké zprávy. 8 (1): 4852. Bibcode:2018NatSR ... 8.4852B. doi:10.1038 / s41598-018-23034-w. PMC 5859008. PMID 29556082.
^ Hanna, Bremer (2018). Psí imunitní onemocnění. Acta Universitatis Agriculturae Sueciae. ISBN 978-91-7760-166-1.
^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (prosinec 1999). „Autoprotilátky definují rodinu proteinů se zachovanými dvouvláknovými doménami vázajícími RNA i s vazebnou aktivitou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (49): 34598–604. doi:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID 10574923.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Marcoulatos P, Koussidis G, Mamuris Z, Velissariou V, Vamvakopoulos NC (prosinec 1996). „Mapování genu pro zvýšení vazebného faktoru 2 pro interleukin (ILF2) na lidský chromozom 1 (1q11-qter a 1p11-p12) amplifikací polymerázové řetězové reakce amplifikačních šablon DNA hybridů somatických buněk s hlodavci“. Journal of Interferon & Cytokine Research. 16 (12): 1035–8. doi:10.1089 / jir.1996.16.1035. PMID 8974006.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (leden 1998). „DNA-dependentní protein kináza interaguje s proteiny NF90 a NF45 vážícími se na proteinový receptor. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2136–45. doi:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID 9442054.
Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (květen 1999). „Nukleární faktor-90 aktivovaných T-buněk: Dvouvláknový protein vázající RNA a substrát pro dvouvláknovou RNA-dependentní proteinovou kinázu, PKR“. Biochemie. 38 (19): 6361–8. doi:10.1021 / bi982410u. PMID 10320367.
Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (prosinec 1999). „Autoprotilátky definují rodinu proteinů se zachovanými dvouvláknovými doménami vázajícími RNA i s vazebnou aktivitou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (49): 34598–604. doi:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID 10574923.
Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.
Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (srpen 2001). „Nukleární faktor 90 je substrát a regulátor eukaryotického iniciačního faktoru 2 kinázy dvouřetězcová RNA aktivovaná protein kináza“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (35): 32522–30. doi:10,1074 / jbc.M104408200. PMID 11438540.
Reichman TW, Muñiz LC, Mathews MB (leden 2002). „Jaderný faktor 90 vázající protein na proteiny RNA funguje jako pozitivní i negativní regulátor genové exprese v buňkách savců“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (1): 343–56. doi:10.1128 / MCB.22.1.343-356.2002. PMC 134226. PMID 11739746.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (leden 2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Aktuální biologie. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Shin HJ, Kim SS, Cho YH, Lee SG, Rho HM (březen 2002). "Proteiny hostitelských buněk vázající se na enkapsidační signál epsilon v RNA viru hepatitidy B". Archivy virologie. 147 (3): 471–91. doi:10.1007 / s007050200001. PMID 11958450. S2CID 23653290.
Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (listopad 2002). "Funkční proteomická analýza lidského nukleolu". Molekulární biologie buňky. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (listopad 2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interagujících proteinů“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Zhao G, Shi L, Qiu D, Hu H, Kao PN (květen 2005). "Exprese tkáně NF45 / ILF2, analýza promotoru a transaktivační funkce interleukinu-2". Experimentální výzkum buněk. 305 (2): 312–23. doi:10.1016 / j.yexcr.2004.12.030. PMID 15817156.
Nie Y, Ding L, Kao PN, Braun R, Yang JH (srpen 2005). „ADAR1 interaguje s NF90 prostřednictvím dvouvláknové RNA a reguluje expresi genu zprostředkovanou NF90 nezávisle na editaci RNA“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (16): 6956–63. doi:10.1128 / MCB.25.16.6956-6963.2005. PMC 1190226. PMID 16055709.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

externí odkazy

ILF2 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro myší interleukinový enhancer-vazebný faktor 2 (ILF2)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000143621 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001016 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7519613-5] Kao PN, Chen L, Brock G, Ng J, Kenny J, Smith AJ, Corthésy B (srpen 1994). „Klonování a exprese nukleárního faktoru citlivého na cyklosporin A a FK506 aktivovaných T-buněk: NF45 a NF90“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (32): 20691–9. PMID 7519613.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ILF2 interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa“.

[pmid11101529-7] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (prosinec 2000). „Funkční analýza lidského komplexu CDC5L a identifikace jeho složek hmotnostní spektrometrií“. Časopis EMBO. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

[pmid9442054-8] Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (leden 1998). „DNA-dependentní protein kináza interaguje s proteiny NF90 a NF45 vážícími se na proteinový receptor. The Journal of Biological Chemistry. 273 (4): 2136–45. doi:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID 9442054.

[9] Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (prosinec 1999). „Autoprotilátky definují rodinu proteinů se zachovanými dvouvláknovými doménami vázajícími RNA i s vazebnou aktivitou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (49): 34598–604. doi:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID 10574923.

[10] Kuroda Y, Ono N, Akaogi J, Nacionales DC, Yamasaki Y, Barker TT, Reeves WH, Satoh M (únor 2006). „Indukce specifických autoprotilátek souvisejících s lupusem nespecifickým zánětem způsobeným intraperitoneální injekcí n-hexadekanu u myší BALB / c“. Toxikologie. 218 (2–3): 186–96. doi:10.1016 / j.tox.2005.10.011. PMID 16309812.

[11] Bremer HD, Landegren N, Sjöberg R, Hallgren Å, Renneker S, Lattwein E, Leonard D, Eloranta ML, Rönnblom L, Nordmark G, Nilsson P, Andersson G, Lilliehöök I, Lindblad-Toh K, Kämpe O, Hansson-Hamlin H (březen 2018). „ILF2 a ILF3 jsou autoantigeny u systémového autoimunitního onemocnění psů“. Vědecké zprávy. 8 (1): 4852. Bibcode:2018NatSR ... 8.4852B. doi:10.1038 / s41598-018-23034-w. PMC 5859008. PMID 29556082.

[12] Hanna, Bremer (2018). Psí imunitní onemocnění. Acta Universitatis Agriculturae Sueciae. ISBN 978-91-7760-166-1.

[13] Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (prosinec 1999). „Autoprotilátky definují rodinu proteinů se zachovanými dvouvláknovými doménami vázajícími RNA i s vazebnou aktivitou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (49): 34598–604. doi:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID 10574923.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]