ACVRL1 - ACVRL1

ACVRL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LCR, 3MY0, 4FAO
Identifikátory
Aliasy	ACVRL1, ACVRLK1, ALK-1, ALK1, HHT, HHT2, ORW2, SKR3, TSR-I, receptor aktivinu A typu 1
Externí ID	OMIM: 601284 MGI: 1338946 HomoloGene: 20058 Genové karty: ACVRL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	51,923,361 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	101,145,336 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • vazba aktivinu; • aktivita receptoru aktivovaného růstovým faktorem beta; • vazba kovových iontů; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • aktivita transmembránového receptorového proteinu serin / threonin kináza; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita BMP receptoru; • ATP vazba; • vazba protein kinázy; • vazba beta transformujícího růstového faktoru; • aktivita receptoru beta transformujícího růstového faktoru, typ I.; • aktivita receptoru aktivinu, typ I; • SMAD vazba; • vazba růstového faktoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • tělo neuronových buněk; • dendrit; • buněčná membrána; • povrch buňky; • receptorový komplex; • komplex aktivinového receptoru;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul transformujícího růstového faktoru beta; • negativní regulace buněčné adheze; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace diferenciace endotelových buněk; • pozitivní regulace proliferace endoteliálních buněk; • morfogeneze krevních cév; • negativní regulace migrace endotelových buněk krevních cév; • lymfangiogeneze; • regulace replikace DNA; • fosforylace; • morfogeneze endotelové trubice; • vývoj vaskulatury sítnice v oku kamerového typu; • hojení ran, šíření epidermálních buněk; • diferenciace lymfatických endoteliálních buněk; • pozitivní regulace fosforylace proteinu SMAD s omezením dráhy; • buněčná odpověď na stimul BMP; • negativní regulace diferenciace endotelových buněk; • v embryonálním vývoji dělohy; • proliferace endoteliálních buněk krevních cév zapojených do klíčení angiogeneze; • krevní oběh; • pozitivní regulace angiogeneze; • vývoj žilních krevních cév; • negativní regulace migrace endoteliálních buněk; • negativní regulace proliferace endoteliálních buněk; • regulace migrace endotelových buněk krevních cév; • regulace krevního tlaku; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • fosforylace bílkovin; • remodelace krevních cév; • negativní regulace buněčné migrace; • transmembránový receptorový protein serin / threonin kinázová signální dráha; • negativní regulace buněčného růstu; • pozitivní regulace diferenciace chondrocytů; • angiogeneze; • vývoj tepen; • regulace proliferace endotelových buněk; • pozitivní regulace signální dráhy BMP; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • negativní regulace sestavy ohniskové adheze; • negativní regulace procesu biosyntézy DNA; • signální transdukce; • negativní regulace buněčné proliferace; • zrání krevních cév; • signální dráha receptoru aktivinu; • reakce na hypoxii; • endokardiální polštář k mezenchymálnímu přechodu; • morfogeneze endokardiálního polštáře; • negativní regulace genové exprese; • morfogeneze hřbetní aorty; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • Signální dráha BMP; • proces specifikace vzoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	94
	11482
	ENSG00000139567
	ENSMUSG00000000530
	P37023
	Q61288
	NM_000020; NM_001077401
	NM_001277255; NM_001277257; NM_001277258; NM_001277259; NM_009612
	NP_000011; NP_001070869
	NP_001264184; NP_001264186; NP_001264187; NP_001264188; NP_033742
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Receptor serin / threonin-protein kinázy R3 je enzym že u lidí je kódován ACVRL1 gen.^[5]^[6]^[7]

ACVRL1 je receptor v Signální dráha TGF beta. Je také známý jako kináza podobná receptoru aktivinu 1nebo ALK1.

Funkce

Tento gen kóduje receptor typu I na povrchu buněk pro nadrodinu ligandů TGF-beta. Sdílí s ostatními receptory typu I vysoký stupeň podobnosti v subdoménách serin-threonin kinázy, oblast bohatou na glycin a serin (nazývanou doména GS) předcházející doméně kinázy a krátký C-koncový ocas. Kódovaný protein, někdy označovaný jako ALK1, sdílí podobné doménové struktury s jinými blízce příbuznými proteiny kinázy podobné ALK nebo aktivinovým receptorům, které tvoří podrodinu receptorových serin / threoninových kináz. Mutace v tomto genu jsou spojeny s hemoragickou telangiektázií typu 2, známou také jako Rendu-Osler-Weberův syndrom 2.^[7]

Patologie

Germinální mutace ACVRL1 jsou spojeny s:

dědičná hemoragická telangiektázie typ 2 (Rendu-Osler-Weberův syndrom 2)^[8]
Plicní arteriovenózní malformace^[9]

Somatická mozaika v ACVRL1 jsou spojeny s těžkou plicní arteriální hypertenze.^[10]

ACVRL1 přímo interaguje s lipoprotein s nízkou hustotou (LDL ), což znamená, že by mohla zahájit rané fáze ateroskleróza.^[11]

Bylo zjištěno, že abnormální aktivita ACVRL1 je úzce spojena s idiopatickou plicní arteriální hypertenze.

Jako drogový cíl

Dalantercept je experimentální ALK1 inhibitor.^[12]

Kinázy blízké / příbuzné rodině

(Nesmí být zaměňována s anaplastická lymfomová kináza (ALK))
ALK4 je ACVR1B, ALK7 je ACVR1C a ALK5 je [součástí] Receptor TGF-β typu I..^[13]

Viz také

Signální dráha TGF beta, viz souhrnná tabulka pro ALK *

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139567 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000530 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (říjen 1993). „Aktivin podobné kinázy: nová podtřída receptorů na buněčném povrchu s předpokládanou aktivitou serin / threonin kinázy“. Onkogen. 8 (10): 2879–87. PMID 8397373.
^ Johnson DW, Berg JN, Baldwin MA, Gallione CJ, Marondel I, Yoon SJ, Stenzel TT, Speer M, Pericak-Vance MA, Diamond A, Guttmacher AE, Jackson CE, Attisano L, Kucherlapati R, Porteous ME, Marchuk DA ( Června 1996). „Mutace v genu kinázy 1 podobném receptoru aktivinu u dědičné hemoragické telangiektázie typu 2“. Genetika přírody. 13 (2): 189–95. doi:10.1038 / ng0696-189. PMID 8640225. S2CID 21379604.
^ ^A ^b „Entrezův gen: ACVRL1 aktivinový receptor typu II typu 1“.
^ Olivieri C, Mira E, Delù G, Pagella F, Zambelli A, Malvezzi L, Buscarini E, Danesino C (červenec 2002). „Identifikace 13 nových mutací v genu ACVRL1 ve skupině 52 neselektovaných italských pacientů postižených dědičnou hemoragickou telangiektázií“. Journal of Medical Genetics. 39 (7): 39e – 39. doi:10,1136 / jmg. 39.7.e39. PMC 1735165. PMID 12114496.
^ Vandenbriele C, Peerlinck K, de Ravel T, Verhamme P, Vanassche T (duben 2014). „Plicní arteriovenózní malformace u pacienta s novou mutací v exonu 10 genu ACVRL1“. Acta Clinica Belgica. 69 (2): 139–41. doi:10.1179 / 0001551213Z.00000000012. PMID 24724759. S2CID 35264961.
^ Jones G, Robertson L, Harrison R, Ridout C, Vasudevan P (srpen 2014). „Somatický mozaikismus v ACVRL1 s přenosem na několik potomků postižených těžkou plicní arteriální hypertenzí“. American Journal of Medical Genetics. Část A. 164A (8): 2121–3. doi:10,1002 / ajmg.a.36568. PMID 24753439. S2CID 5417225.
^ Kraehling JR, Chidlow JH, Rajagopal C, Sugiyama MG, Fowler JW, Lee MY, Zhang X, Ramírez CM, Park EJ, Tao B, Chen K, Kuruvilla L, Larriveé B, Folta-Stogniew E, Ola R, Rotllan N, Zhou W, Nagle MW, Herz J, Williams KJ, Eichmann A, Lee WL, Fernández-Hernando C, Sessa WC (listopad 2016). „Screening RNAi v celém genomu odhaluje, že ALK1 zprostředkovává absorpci LDL a transcytózu v endotelových buňkách“. Příroda komunikace. 7: 13516. Bibcode:2016NatCo ... 713516K. doi:10.1038 / ncomms13516. PMC 5121336. PMID 27869117.
^ Gupta S, Gill D, Pal SK, Agarwal N (2015). "Inhibitory receptoru aktivinu - dalantercept". Aktuální onkologické zprávy. 17 (4): 14. doi:10.1007 / s11912-015-0441-5. PMID 25708802. S2CID 22676858.
^ Laping NJ, Grygielko E, Mathur A, Butter S, Bomberger J, Tweed C, Martin W, Fornwald J, Lehr R, Harling J, Gaster L, Callahan JF, Olson BA (červenec 2002). „Inhibice extracelulární matrice indukované transformujícím růstovým faktorem (TGF) -beta1 novým inhibitorem aktivity kinázy receptoru TGF-beta typu I: SB-431542“. Molekulární farmakologie. 62 (1): 58–64. doi:10,1124 / mol. 62.1.58. PMID 12065755.

Další čtení

Attisano L, Cárcamo J, Ventura F, Weis FM, Massagué J, Wrana JL (listopad 1993). „Identifikace receptorů lidského aktivinu a TGF beta typu I, které tvoří heteromerní kinázové komplexy s receptory typu II“. Buňka. 75 (4): 671–80. doi:10.1016 / 0092-8674 (93) 90488-C. PMID 8242742. S2CID 25408172.
Johnson DW, Berg JN, Gallione CJ, McAllister KA, Warner JP, Helmbold EA, Markel DS, Jackson CE, Porteous ME, Marchuk DA (srpen 1995). „Druhý lokus pro dědičné hemoragické telangiektázie se mapuje na chromozom 12“. Výzkum genomu. 5 (1): 21–8. doi:10.1101 / gr. 5.1.11. PMID 8717052.
Panchenko MP, Williams MC, Brody JS, Yu Q (duben 1996). "Receptor typu I serin-threoninkináza je přednostně exprimován v plicních cévách". Americký žurnál fyziologie. 270 (4 Pt 1): L547-58. doi:10.1152 / ajplung.1996.270.4.L547. PMID 8928814.
Berg JN, Gallione CJ, Stenzel TT, Johnson DW, Allen WP, Schwartz CE, Jackson CE, Porteous ME, Marchuk DA (červenec 1997). „Gen kinázy 1 podobný receptoru aktivinu: genomová struktura a mutace v dědičné hemoragické telangiektázii typu 2“. American Journal of Human Genetics. 61 (1): 60–7. doi:10.1086/513903. PMC 1715857. PMID 9245985.
Stockwell BR, Schreiber SL (červen 1998). „Zkoumání role homomerních a heteromerních receptorových interakcí v signalizaci TGF-beta pomocí dimerizátorů s malými molekulami“. Aktuální biologie. 8 (13): 761–70. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70299-4. PMID 9651680. S2CID 93779.
Lux A, Attisano L, Marchuk DA (duben 1999). „Přiřazení transformujícího růstového faktoru beta1 a beta3 a třetího nového ligandu k receptoru ALK-1 typu I“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (15): 9984–92. doi:10.1074 / jbc.274.15.9984. PMID 10187774.
Klaus DJ, Gallione CJ, Anthony K, Yeh EY, Yu J, Lux A, Johnson DW, Marchuk DA (2000). „Nové missense a frameshift mutace v genu kinázy-1 podobném receptoru aktivinu v dědičné hemoragické telangiektázii. Stručné mutace č. 164. Online“. Lidská mutace. 12 (2): 137–138. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 12: 2 <137 :: AID-HUMU16> 3.0.CO; 2-J. PMID 10694922.
Oh SP, Seki T, Goss KA, Imamura T, Yi Y, Donahoe PK, Li L, Miyazono K, ten Dijke P, Kim S, Li E (březen 2000). „Kináza 1 podobná receptoru aktivinu moduluje signalizaci transformujícího růstového faktoru-beta 1 v regulaci angiogeneze“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2626–31. Bibcode:2000PNAS ... 97.2626O. doi:10.1073 / pnas.97.6.2626. PMC 15979. PMID 10716993.
Abdalla SA, Pece-Barbara N, Vera S, Tapia E, Paez E, Bernabeu C, Letarte M (květen 2000). "Analýza ALK-1 a endoglinu u novorozenců z rodin s dědičnou hemoragickou telangiektázií typu 2". Lidská molekulární genetika. 9 (8): 1227–37. doi:10,1093 / hmg / 9,8,1227. PMID 10767348.
Kjeldsen AD, Brusgaard K, Poulsen L, Kruse T, Rasmussen K, Green A, Vase P (únor 2001). „Mutace v genu ALK-1 a fenotyp dědičné hemoragické telangiektázie ve dvou velkých dánských rodinách“. American Journal of Medical Genetics. 98 (4): 298–302. doi:10.1002 / 1096-8628 (20010201) 98: 4 <298 :: AID-AJMG1093> 3.0.CO; 2-K. PMID 11170071.
Wurthner JU, Frank DB, Felici A, Green HM, Cao Z, Schneider MD, McNally JG, Lechleider RJ, Roberts AB (červen 2001). „Protein 1 transformující růstový faktor-beta receptor je chadon Smad4“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (22): 19495–502. doi:10,1074 / jbc.M006473200. PMID 11278302.
Parks WT, Frank DB, Huff C, Renfrew Haft C, Martin J, Meng X, de Caestecker MP, McNally JG, Reddi A, Taylor SI, Roberts AB, Wang T, Lechleider RJ (červen 2001). „Třídění nexinu 6, nového SNX, interaguje s rodinou transformujících růstových faktorů beta receptorových serin-threoninových kináz“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (22): 19332–9. doi:10,1074 / jbc.M100606200. PMID 11279102.
Birkey Reffey S, Wurthner JU, Parks WT, Roberts AB, Duckett CS (červenec 2001). „X-vázaný inhibitor proteinu apoptózy funguje jako kofaktor při transformaci signalizace růstového faktoru-beta“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (28): 26542–9. doi:10,1074 / jbc.M100331200. PMID 11356828.
Trembath RC, Thomson JR, Machado RD, Morgan NV, Atkinson C, Winship I, Simonneau G, Galie N, Loyd JE, Humbert M, Nichols WC, Morrell NW, Berg J, Manes A, McGaughran J, Pauciulo M, Wheeler L (Srpen 2001). "Klinické a molekulárně genetické vlastnosti plicní hypertenze u pacientů s dědičnou hemoragickou telangiektázií" (PDF). The New England Journal of Medicine. 345 (5): 325–34. doi:10.1056 / NEJM200108023450503. PMID 11484689.
Inman GJ, Nicolás FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (červenec 2002). „SB-431542 je silný a specifický inhibitor transformačních receptorů ALK4, ALK5 a ALK7 transformačního růstového faktoru-beta nadrodiny typu I receptoru kinázy podobné aktivinovým receptorům (ALK).“ Molekulární farmakologie. 62 (1): 65–74. doi:10,1124 / mol. 62.1.65. PMID 12065756.
Olivieri C, Mira E, Delù G, Pagella F, Zambelli A, Malvezzi L, Buscarini E, Danesino C (červenec 2002). „Identifikace 13 nových mutací v genu ACVRL1 u skupiny 52 neselektovaných italských pacientů postižených dědičnou hemoragickou telangiektázií“. Journal of Medical Genetics. 39 (7): 39e – 39. doi:10,1136 / jmg.39.7.e39. PMC 1735165. PMID 12114496.
Mo J, Fang SJ, Chen W, Blobe GC (prosinec 2002). "Regulace signalizace ALK-1 jaderným receptorem LXRbeta". The Journal of Biological Chemistry. 277 (52): 50788–94. doi:10,1074 / jbc.M210376200. PMID 12393874.
Lamouille S, Mallet C, Feige JJ, Bailly S (prosinec 2002). „Kináza 1 podobná receptoru aktivinu je zapojena do fáze zrání angiogeneze“. Krev. 100 (13): 4495–501. doi:10,1182 / krev. V100.13.4495. PMID 12453878.
Mitchell D, Pobre EG, Mulivor AW, Grinberg AV, Castonguay R, Monnell TE, Solban N, Ucran JA, Pearsall RS, Underwood KW, Seehra J, Kumar R (únor 2010). „ALK1-Fc inhibuje více mediátorů angiogeneze a potlačuje růst nádoru“. Molecular Cancer Therapeutics. 9 (2): 379–88. doi:10.1158 / 1535-7163.MCT-09-0650. PMID 20124460.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na dědičnou hemoragickou telangiektázii
Člověk ACVRL1 umístění genomu a ACVRL1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139567 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000530 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8397373-5] ten Dijke P, Ichijo H, Franzén P, Schulz P, Saras J, Toyoshima H, Heldin CH, Miyazono K (říjen 1993). „Aktivin podobné kinázy: nová podtřída receptorů na buněčném povrchu s předpokládanou aktivitou serin / threonin kinázy“. Onkogen. 8 (10): 2879–87. PMID 8397373.

[pmid8640225-6] Johnson DW, Berg JN, Baldwin MA, Gallione CJ, Marondel I, Yoon SJ, Stenzel TT, Speer M, Pericak-Vance MA, Diamond A, Guttmacher AE, Jackson CE, Attisano L, Kucherlapati R, Porteous ME, Marchuk DA ( Června 1996). „Mutace v genu kinázy 1 podobném receptoru aktivinu u dědičné hemoragické telangiektázie typu 2“. Genetika přírody. 13 (2): 189–95. doi:10.1038 / ng0696-189. PMID 8640225. S2CID 21379604.

[entrez-7] A ^b „Entrezův gen: ACVRL1 aktivinový receptor typu II typu 1“.

[pmid12114496-8] Olivieri C, Mira E, Delù G, Pagella F, Zambelli A, Malvezzi L, Buscarini E, Danesino C (červenec 2002). „Identifikace 13 nových mutací v genu ACVRL1 ve skupině 52 neselektovaných italských pacientů postižených dědičnou hemoragickou telangiektázií“. Journal of Medical Genetics. 39 (7): 39e – 39. doi:10,1136 / jmg. 39.7.e39. PMC 1735165. PMID 12114496.

[pmid24724759-9] Vandenbriele C, Peerlinck K, de Ravel T, Verhamme P, Vanassche T (duben 2014). „Plicní arteriovenózní malformace u pacienta s novou mutací v exonu 10 genu ACVRL1“. Acta Clinica Belgica. 69 (2): 139–41. doi:10.1179 / 0001551213Z.00000000012. PMID 24724759. S2CID 35264961.

[Jones_2014-10] Jones G, Robertson L, Harrison R, Ridout C, Vasudevan P (srpen 2014). „Somatický mozaikismus v ACVRL1 s přenosem na několik potomků postižených těžkou plicní arteriální hypertenzí“. American Journal of Medical Genetics. Část A. 164A (8): 2121–3. doi:10,1002 / ajmg.a.36568. PMID 24753439. S2CID 5417225.

[11] Kraehling JR, Chidlow JH, Rajagopal C, Sugiyama MG, Fowler JW, Lee MY, Zhang X, Ramírez CM, Park EJ, Tao B, Chen K, Kuruvilla L, Larriveé B, Folta-Stogniew E, Ola R, Rotllan N, Zhou W, Nagle MW, Herz J, Williams KJ, Eichmann A, Lee WL, Fernández-Hernando C, Sessa WC (listopad 2016). „Screening RNAi v celém genomu odhaluje, že ALK1 zprostředkovává absorpci LDL a transcytózu v endotelových buňkách“. Příroda komunikace. 7: 13516. Bibcode:2016NatCo ... 713516K. doi:10.1038 / ncomms13516. PMC 5121336. PMID 27869117.

[pmid25708802-12] Gupta S, Gill D, Pal SK, Agarwal N (2015). "Inhibitory receptoru aktivinu - dalantercept". Aktuální onkologické zprávy. 17 (4): 14. doi:10.1007 / s11912-015-0441-5. PMID 25708802. S2CID 22676858.

[Grygielko2002-13] Laping NJ, Grygielko E, Mathur A, Butter S, Bomberger J, Tweed C, Martin W, Fornwald J, Lehr R, Harling J, Gaster L, Callahan JF, Olson BA (červenec 2002). „Inhibice extracelulární matrice indukované transformujícím růstovým faktorem (TGF) -beta1 novým inhibitorem aktivity kinázy receptoru TGF-beta typu I: SB-431542“. Molekulární farmakologie. 62 (1): 58–64. doi:10,1124 / mol. 62.1.58. PMID 12065755.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

Enzymy
Aktivita	Aktivní stránky Závazný web Katalytická triáda Oxyanionový otvor Enzymová promiskuita Katalyticky dokonalý enzym Koenzym Kofaktor Enzymatická katalýza
Nařízení	Alosterická regulace Spolupráce Inhibitor enzymu Aktivátor enzymu
Klasifikace	EC číslo Nadčeleď enzymů Rodina enzymů Seznam enzymů
Kinetika	Kinetika enzymů Eadie – Hofsteeův diagram Hanes – Woolfův děj Lineweaver – Burkův graf Kinetika Michaelis – Menten
Typy	EC1 Oxidoreduktázy (seznam ) EC2 Transferázy (seznam ) EC3 Hydrolázy (seznam ) EC4 Lyázy (seznam ) EC5 Izomerázy (seznam ) EC6 Ligázy (seznam ) EC7 Translocases (seznam )